{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[211.8166300296228, 581.8000327729757, 0, 1, 0.2669004318553596, 0, 0.001718803615795275, 0.007960975929629015, 0.7330995681446404, 1, 0.001188597347450208],
[212.3375091946364, 581.6713565022825, 0, 1, 0.2674246074170257, 0, 0.001719183846378855, 0.007962737042123642, 0.7325753925829743, 1, 0.0011871554212152],
[211.9341732306652, 581.7132561324075, 0, 1, 0.2670381902462017, 0, 0.001719060017041082, 0.007962163502268171, 0.7329618097537982, 1, 0.001188464044678501],
[212.2221856904891, 581.4252436725836, 0, 1, 0.2674010874839022, 0, 0.001719911563666347, 0.007966107607414558, 0.7325989125160979, 1, 0.001188464044678501],
[211.5521661890259, 582.0952631740469, 1, 0, 0.2665568593333733, 0.00472696648781408, 0, -0.02189387204205947, 1, 0.2665568593333733, 0.001188464044678501],
[211.9601586925801, 581.415969706263, 0, 1, 0.2671622589910144, 0, 0.001719938997384626, 0.007966234672059334, 0.7328377410089856, 1, 0.001188464044678501],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.001188464044678501],
[211.8375091946364, 581.8406867289107, 0, 1, 0.2669060461565738, 0, 0.001718683520779489, 0.007960419686017963, 0.7330939538434262, 1, 0.001188444466325606],
[212.6045344368977, 581.4534488313935, 0, 1, 0.2677443447666519, 0, 0.001719828134152102, 0.007965721187262411, 0.7322556552333481, 1, 0.001190888205385716],
[211.7381379609453, 581.9092914021275, 1, 0, 0.2667911847592978, 0.004722814744807326, 0, -0.02187464243034639, 1, 0.2667911847592979, 0.001188215874781043],
[211.9467678237883, 581.7006615392845, 0, 1, 0.2670540595008066, 0, 0.001719097236977211, 0.007962335893699572, 0.7329459404991934, 1, 0.001188131572254374],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188112016490987],
[211.8634946565513, 582.0461456026745, 0, 1, 0.2668609674362614, 0, 0.001718076835582441, 0.007957609704583101, 0.7331390325637386, 1, 0.001188874047818899],
[212.0662082304068, 581.6804465703591, 0, 1, 0.2671711520896253, 0, 0.00171915698025624, 0.007962612606409469, 0.7328288479103746, 1, 0.001188604432288723],
[211.4060761244042, 582.2105866781941, 1, 0, 0.2663831116874983, 0.00473023301095442, 0, -0.02190900158440791, 1, 0.2663831116874983, 0.001188805397774901],
[212.0662082304068, 581.6804465703591, 0, 1, 0.2671711520896253, 0, 0.00171915698025624, 0.007962612606409469, 0.7328288479103746, 1, 0.001188519374179711],
[211.1416122838073, 579.3269248897025, 0, 0, 0.2671094450372302, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001339508247057602],
[211.1416122838073, 579.3269248897025, 0, 0, 0.2671094450372302, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001550656820229312],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.0008992103120382833],
[210.7779025449109, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2667116850707079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002622515138561228],
[211.7808652247962, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2669061797166827, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2669061797166827, 0.0009261411558569333],
[211.9627200942444, 581.7741553636097, 0, 1, 0.2670440628980192, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137458, 0.7329559371019808, 1, 0.001191491232469764],
[210.599010355348, 580.0484190077248, 0, 0, 0.2663627332918817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002001598518886468],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.0009883233600831694],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001188642822066815],
[212.1445749636926, 581.5028543993801, 1, 0, 0.2673032975536069, 0.004713766544212335, 0, -0.02183273391532977, 1, 0.2673032975536069, 0.001187978394743758],
[211.7808652247962, 581.8665641382765, 1, 0, 0.2668450213399634, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668450213399634, 0.001188311467792104],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001187629121031811],
[211.7221856904891, 581.9252436725836, 0, 1, 0.2667710848133193, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.7332289151866807, 1, 0.001188553698242098],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 0, 0.2670741594467851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004585857915074439],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001189248703356517],
[212.1445749636926, 581.5028543993802, 1, 0, 0.2673032975536068, 0.004713766544212335, 0, -0.02183273391532977, 1, 0.2673032975536068, 0.000959940400410448],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188993855351816],
[211.9627200942444, 581.7741553636098, 0, 1, 0.2670440628980191, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137456, 0.7329559371019809, 1, 0.001187837643717843],
[211.4627200942444, 582.1847092688283, 0, 1, 0.2664441567762022, 0, 0.001717667922360775, 0.007955715742826748, 0.7335558432237979, 1, 0.001188230545381488],
[212.234021058474, 581.4134083045986, 0, 1, 0.2674160001107779, 0, 0.001719946574531192, 0.007966269767099207, 0.7325839998892221, 1, 0.001187848870003369],
[210.8703113195777, 581.1226476462384, 0, 1, 0.2662527601191455, 0, 0.001720807137788158, 0.007970255634543092, 0.7337472398808544, 1, 0.001189883315010756],
[211.1416122838073, 580.5400182144833, 0, 1, 0.2667001533822543, 0, 0.001722534138259088, 0.007978254575814322, 0.7332998466177456, 1, 0.001189854269002321],
[211.1416122838073, 580.2286897469579, 0, 0, 0.2668050743652988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001649286824782504],
[211.1416122838073, 580.2286897469579, 0, 0, 0.2668050743652988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001243943765944006],
[211.9627200942444, 582.0461456026745, 0, 1, 0.2669525861127509, 0, 0.001718076835582441, 0.007957609704583101, 0.7330474138872491, 1, 0.0008992103120382833],
[212.2674743560044, 581.3799550070682, 0, 1, 0.2674581514443458, 0, 0.001720045542312931, 0.007966728155783632, 0.7325418485556542, 1, 0.001187543954769617],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001187765270368094],
[211.4627200942444, 582.1847092688283, 0, 1, 0.2664441567762022, 0, 0.001717667922360775, 0.007955715742826748, 0.7335558432237979, 1, 0.001187765625534971],
[210.8677499179133, 579.2370775167001, 0, 1, 0.2668857885637511, 0, 0.001726408820870361, 0.007996200927986166, 0.7331142114362489, 1, 0.001188389428044174],
[211.2800181434358, 578.8248092911776, 1, 0, 0.2674075778393097, 0.004733055254288696, 0, -0.0219220733577305, 1, 0.2674075778393097, 0.001189613394061148],
[211.9601586925801, 581.415969706263, 0, 1, 0.2671622589910144, 0, 0.001719938997384626, 0.007966234672059334, 0.7328377410089856, 1, 0.001188493803634155],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.00118796813831646],
[211.1416122838073, 579.2345161150357, 0, 1, 0.2671406747968735, 0, 0.00172641645512955, 0.007996236287554345, 0.7328593252031265, 1, 0.001188493783812483],
[211.1416122838073, 579.2345161150357, 0, 1, 0.2671406747968735, 0, 0.00172641645512955, 0.007996236287554345, 0.7328593252031265, 1, 0.001156957826457538],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 0, 0.2670741594467851, 0, 0, 0, 1, 1, 3.059722744687468e-05],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2670490087521035, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002682953889479941],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.0009200784905344447],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2670490087521035, 0, 0, 0, 1, 1, 5.553450159378437e-05],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001132916210701686],
[210.7779025449109, 579.8695268181618, 0, 0, 0.2665889936740941, 0, 0, 0, 1, 1, 5.224149162665853e-05],
[211.7808652247962, 581.8665641382765, 1, 0, 0.2668450213399634, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668450213399634, 0.001136200689768488],
[210.6041331586768, 580.0432962043959, 0, 0, 0.2663692125431112, 0, 0, 0, 1, 1, 5.408396121103356e-05],
[211.6939805316792, 581.9534488313935, 0, 1, 0.2667355461625703, 0, 0.001718350500384654, 0.007958877236768382, 0.7332644538374297, 1, 0.001134369412269479],
[212.3166300296228, 581.5504545721916, 0, 1, 0.2674460676702775, 0, 0.001719541257577787, 0.00796439246216438, 0.7325539323297225, 1, 0.001188597342871472],
[210.7779025449109, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2667116850707079, 0, 0, 0, 1, 1, 5.380153410636633e-05],
[211.7808652247962, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2669061797166827, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2669061797166827, 0.00113464897389867],
[211.1364894804786, 579.1472301436978, 0, 0, 0.2671654296268252, 0, 0, 0, 1, 1, 4.622332883418878e-05],
[211.9601586925801, 581.5054158010445, 0, 1, 0.2671321422203468, 0, 0.001719674439527729, 0.007965009320476757, 0.7328678577796532, 1, 0.001142219603618437],
[210.599010355348, 580.0484190077246, 0, 0, 0.2663627332918818, 0, 0, 0, 1, 1, 4.746123965880967e-05],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001141250236098944],
[210.9627200942444, 579.5377216201776, 0, 0, 0.2668723620656208, 0, 0, 0, 1, 1, 9.806995630023438e-05],
[211.873273999463, 581.7006615392844, 0, 1, 0.2669861805070813, 0, 0.001719097236977212, 0.007962335893699574, 0.7330138194929187, 1, 0.001090409536050503],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2670490087521035, 0, 0, 0, 1, 1, 4.969133982887281e-05],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001138751186657589],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001187765271153378],
[211.7221856904891, 581.9252436725836, 0, 1, 0.2667710848133193, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.7332289151866807, 1, 0.001187765232200876],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001187765639188983],
[211.7221856904891, 581.9252436725836, 0, 1, 0.2667710848133193, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.7332289151866807, 1, 0.001187765636921892],
[211.873273999463, 581.7741553636097, 0, 1, 0.2669614568896141, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137458, 0.7330385431103859, 1, 0.001187765650392609],
[212.1914191300148, 581.6756654717996, 0, 1, 0.267288344920416, 0, 0.001719171110912635, 0.007962678055314972, 0.732711655079584, 1, 0.001188232907889506],
[211.7221856904891, 581.9252436725836, 0, 1, 0.2667710848133193, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.7332289151866807, 1, 0.00118776563968482],
[211.873273999463, 581.7741553636097, 0, 1, 0.2669614568896141, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137458, 0.7330385431103859, 1, 0.001187765637327006],
[211.8375091946364, 581.8406867289106, 0, 1, 0.2669060461565738, 0, 0.00171868352077949, 0.007960419686017964, 0.7330939538434262, 1, 0.001188232880674181],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001186505033374825],
[212.1914191300148, 581.6756654717996, 0, 1, 0.2672883449204159, 0, 0.001719171110912635, 0.007962678055314972, 0.732711655079584, 1, 0.001188232908430121],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.001187765640082419],
[211.873273999463, 581.7741553636097, 0, 1, 0.2669614568896141, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137458, 0.7330385431103859, 1, 0.001188232927767837],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.001187765649614933],
[211.1416122838073, 579.3269248897025, 0, 0, 0.2671094450372302, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005134436742450451],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.0006741548488107865],
[211.873273999463, 581.7741553636097, 0, 1, 0.2669614568896141, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137458, 0.7330385431103859, 1, 0.001187765278406845],
[211.9601586925801, 581.5054158010445, 0, 1, 0.2671321422203468, 0, 0.001719674439527729, 0.007965009320476757, 0.7328678577796532, 1, 0.001187765616704252],
[211.8375091946364, 581.8406867289107, 0, 1, 0.2669060461565738, 0, 0.001718683520779489, 0.007960419686017963, 0.7330939538434262, 1, 0.001188433004795037],
[211.5496047873615, 581.8265236114815, 1, 0, 0.2666447819829185, 0.004727023721009299, 0, -0.02189413712882408, 1, 0.2666447819829185, 0.001188181072692314],
[211.4520766922944, 580.1156859189085, 0, 1, 0.2671307330591153, 0, 0.001723794105680819, 0.007984090361953208, 0.7328692669408847, 1, 0.001189056688184713],
[211.4520766922944, 580.4270143864339, 0, 1, 0.2670257102056404, 0, 0.00172286949989241, 0.00797980786896897, 0.7329742897943596, 1, 0.001189055614580562],
[211.6080541523767, 579.8604830211331, 0, 1, 0.2673612963922367, 0, 0.00172455276619282, 0.007987604246855065, 0.7326387036077633, 1, 0.001189055610593142],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 0, 1, 0.2670334683307811, 0, 0.001723781439309816, 0.007984031695172578, 0.7329665316692189, 1, 0.001188693900198021],
[211.4520766922944, 580.4270143864339, 0, 1, 0.2670257102056403, 0, 0.00172286949989241, 0.00797980786896897, 0.7329742897943596, 1, 0.001188963911807488],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 0, 1, 0.2670334683307811, 0, 0.001723781439309816, 0.007984031695172578, 0.7329665316692189, 1, 0.001188349042505824],
[211.4380346509135, 580.0305025225963, 0, 1, 0.2671464811551454, 0, 0.001724047262430036, 0.007985262907070296, 0.7328535188448546, 1, 0.001188215793395809],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 1, 0, 0.2670334683307811, 0.004731519651168194, 0, -0.02191496091081252, 1, 0.2670334683307811, 0.0009291591035695813],
[211.2493631184389, 580.481384951224, 0, 1, 0.2668197030789708, 0, 0.001722708127985925, 0.007979060443346031, 0.7331802969210293, 1, 0.001190076826902266],
[211.348588556132, 580.3912495816074, 0, 1, 0.2669419654987268, 0, 0.001722975666364509, 0.007980299599799151, 0.7330580345012732, 1, 0.001188796167276679],
[211.2591424613506, 580.2093947121592, 0, 1, 0.2669204555064167, 0, 0.001723515698149111, 0.007982800862886419, 0.7330795444935833, 1, 0.001188712950491816],
[211.0772875919024, 580.3912495816074, 0, 1, 0.2666906865883778, 0, 0.001722975666364509, 0.007980299599799151, 0.7333093134116222, 1, 0.001188350131719143],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 1, 0, 0.2670334683307811, 0.004731519651168194, 0, -0.02191496091081252, 1, 0.2670334683307811, 0.001188564324542743],
[211.5304434255802, 579.9380937479295, 1, 0, 0.26726323724882, 0.00472745191569466, 0, -0.02189612039645979, 1, 0.26726323724882, 0.001189145275743816],
[211.1240064228329, 580.3445307506769, 1, 0, 0.2667497146213776, 0.004736552782146573, 0, -0.02193827284371825, 1, 0.2667497146213775, 0.001188350894823446],
[211.6173281186973, 579.8512090548126, 0, 1, 0.2673730138085141, 0, 0.001724580348172511, 0.007987731998201634, 0.7326269861914859, 1, 0.001187464011497804],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 0, 1, 0.2670334683307811, 0, 0.001723781439309816, 0.007984031695172578, 0.7329665316692189, 1, 0.001189093394683949],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 0, 1, 0.2670334683307811, 0, 0.001723781439309816, 0.007984031695172578, 0.7329665316692189, 1, 0.00118873781427293],
[211.2451004199697, 579.8128828483216, 0, 1, 0.2670412345087539, 0, 0.001724694344643596, 0.007988259995207244, 0.7329587654912462, 1, 0.001188310619947063],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 0, 1, 0.2670334683307811, 0, 0.001723781439309816, 0.007984031695172578, 0.7329665316692189, 1, 0.001188844362148029],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 1, 0, 0.2670334683307811, 0.004731519651168194, 0, -0.02191496091081252, 1, 0.2670334683307811, 0.001188354212403573],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 0, 1, 0.2670334683307811, 0, 0.001723781439309816, 0.007984031695172578, 0.7329665316692189, 1, 0.001188482878196966],
[211.0772875919024, 580.3912495816074, 0, 1, 0.2666906865883778, 0, 0.001722975666364509, 0.007980299599799151, 0.7333093134116222, 1, 0.001188971172007205],
[212.0662082304068, 581.9917750378845, 0, 1, 0.2670664015712756, 0, 0.001718237340957104, 0.007958353116694017, 0.7329335984287244, 1, 0.001188525571337909],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188253836625165],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001188299250316367],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001187765272116818],
[210.7076212948391, 580.3503619734521, 0, 1, 0.2663617911095357, 0, 0.001723097055715707, 0.007980861838378428, 0.7336382088904643, 1, 0.001188673439729034],
[211.6939805316792, 581.9534488313935, 0, 1, 0.2667355461625703, 0, 0.001718350500384654, 0.007958877236768382, 0.7332644538374297, 1, 0.001187765281173376],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188140045427607],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.001188597393495425],
[211.7808652247962, 581.9092914021275, 1, 0, 0.2668306560898228, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668306560898228, 0.001187765279103031],
[211.1467350871361, 579.864404014833, 0, 0, 0.2669326949388474, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001105440872262384],
[211.9652814959088, 581.8640027366121, 0, 1, 0.2670162032392621, 0, 0.001718614651012639, 0.007960100702190415, 0.7329837967607379, 1, 0.001078044947123324],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.00118822563804523],
[211.7221856904891, 581.9252436725836, 0, 1, 0.2667710848133193, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.7332289151866807, 1, 0.00118825370668909],
[211.7221856904891, 581.9252436725836, 0, 1, 0.2667710848133193, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.7332289151866807, 1, 0.001188253579903518],
[211.873273999463, 581.7006615392844, 0, 1, 0.2669861805070813, 0, 0.001719097236977212, 0.007962335893699574, 0.7330138194929187, 1, 0.001188596274228196],
[211.2451004199697, 580.535755516014, 0, 1, 0.2667974337043696, 0, 0.001722546786306283, 0.007978313157724645, 0.7332025662956303, 1, 0.0011889711868719],
[211.9627200942444, 582.0461456026745, 0, 1, 0.2669525861127509, 0, 0.001718076835582441, 0.007957609704583101, 0.7330474138872491, 1, 0.001188597348940184],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001187765277136639],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.00118883451063716],
[211.6939805316792, 581.9534488313935, 0, 1, 0.2667355461625703, 0, 0.001718350500384654, 0.007958877236768382, 0.7332644538374297, 1, 0.001187756056934115],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 1, 0.2670490087521035, 0, 0.001725608217429194, 0.007992492776184683, 0.7329509912478965, 1, 0.0007353384568046397],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 0, 0.2670741594467851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004523860289928529],
[211.7381379609453, 581.9092914021275, 1, 0, 0.2667911847592978, 0.004722814744807326, 0, -0.02187464243034639, 1, 0.2667911847592979, 0.001188253492216289],
[210.8703113195777, 579.7771180434951, 0, 1, 0.2667058710219926, 0, 0.001724800736142504, 0.007988752768293212, 0.7332941289780074, 1, 0.001188357113394156],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.00118794337148259],
[210.7779025449109, 579.9549813458638, 0, 0, 0.2665601833931394, 0, 0, 0, 1, 1, 5.893867147056644e-05],
[211.7808652247962, 581.9092914021275, 1, 0, 0.2668306560898228, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668306560898228, 0.001129586271304849],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2670490087521035, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001500658171696607],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001038330739456292],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188253861328361],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188253836129052],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2670490087521035, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002626603454690628],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.0009260673503645226],
[210.9431614084211, 580.2286897469578, 0, 0, 0.2666211659330051, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001861388058268773],
[211.8634946565513, 582.0461456026745, 0, 1, 0.2668609674362614, 0, 0.001718076835582441, 0.007957609704583101, 0.7331390325637386, 1, 0.001003289334590648],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.001188711592948481],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001187945205500682],
[212.0662082304068, 581.9426574665122, 0, 1, 0.2670829223604092, 0, 0.001718382364945544, 0.00795902482372941, 0.7329170776395908, 1, 0.001188232879962779],
[210.599010355348, 580.0484190077246, 0, 0, 0.2663627332918817, 0, 0, 0, 1, 1, 2.744645602970404e-05],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001161267435300777],
[212.1914191300148, 581.6756654717996, 0, 1, 0.267288344920416, 0, 0.001719171110912635, 0.007962678055314972, 0.732711655079584, 1, 0.00118832748905391],
[210.9597574143591, 579.6876719487136, 1, 0, 0.2668190012130988, 0.004740240566525862, 0, -0.02195535354008599, 1, 0.2668190012130988, 0.0005758004579800533],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 0, 0.2670741594467851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004870621282205035],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188253851782921],
[211.1364894804786, 579.1472301436978, 0, 0, 0.2671654296268252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002241282812586498],
[211.9601586925801, 581.5054158010445, 0, 1, 0.2671321422203468, 0, 0.001719674439527729, 0.007965009320476757, 0.7328678577796532, 1, 0.00096421168892502],
[211.9627200942444, 581.4224983726751, 0, 1, 0.2671624264740222, 0, 0.001719919684564784, 0.007966145220947827, 0.7328375735259778, 1, 0.001188280593766321],
[212.1045344368977, 581.6421203638681, 0, 1, 0.2672194372776752, 0, 0.001719270260851144, 0.007963137287694192, 0.7327805627223248, 1, 0.001187902820039365],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001188187392917705],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188188835435404],
[210.8911904845913, 579.8177719994301, 0, 0, 0.2667115215465298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001505358694999109],
[211.8375091946364, 581.8406867289107, 0, 1, 0.2669060461565738, 0, 0.001718683520779489, 0.007960419686017963, 0.7330939538434262, 1, 0.001038147919294949],
[211.9627200942444, 582.0461456026745, 0, 1, 0.2669525861127509, 0, 0.001718076835582441, 0.007957609704583101, 0.7330474138872491, 1, 0.0011886201490759],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188500279409049],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 1, 0, 0.2670490087521035, 0.004736157828783858, 0, -0.02193644353978556, 1, 0.2670490087521035, 0.001189045121537303],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188424577338526],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188597349415081],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188253493326803],
[211.873273999463, 581.7741553636097, 0, 1, 0.2669614568896141, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137458, 0.7330385431103859, 1, 0.001187956456180666],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188597376743048],
[211.7808652247962, 581.8665641382764, 1, 0, 0.2668450213399634, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668450213399634, 0.001187765625973724],
[211.9627200942444, 581.4134083045986, 0, 1, 0.2671654874744193, 0, 0.001719946574531192, 0.007966269767099207, 0.7328345125255806, 1, 0.001188424630954825],
[212.2221856904891, 581.4252436725836, 0, 1, 0.2674010874839022, 0, 0.001719911563666347, 0.007966107607414558, 0.7325989125160979, 1, 0.0009776723686084525],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 1, 0.2670490087521035, 0, 0.001725608217429194, 0.007992492776184683, 0.7329509912478965, 1, 0.0011883583350061],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188333098825143],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001164888790588711],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 1, 0.2670490087521035, 0, 0.001725608217429194, 0.007992492776184683, 0.7329509912478965, 1, 0.0007166492872101149],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 0, 0.2670741594467851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004710564636258159],
[210.7779025449109, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2667116850707079, 0, 0, 0, 1, 1, 1.833890409717141e-05],
[211.7808652247962, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2669061797166827, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2669061797166827, 0.001170107811061411],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188190084910103],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2670490087521035, 0, 0, 0, 1, 1, 6.052479623084876e-05],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001127916274722214],
[212.0662082304068, 581.9917750378845, 0, 1, 0.2670664015712757, 0, 0.001718237340957104, 0.007958353116694017, 0.7329335984287243, 1, 0.001188295012459811],
[211.7808652247962, 581.8665641382764, 1, 0, 0.2668450213399634, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668450213399634, 0.00118804914432396],
[211.9601586925801, 581.5054158010445, 0, 1, 0.2671321422203468, 0, 0.001719674439527729, 0.007965009320476757, 0.7328678577796532, 1, 0.001187654925802135],
[211.6914191300148, 581.9252436725836, 0, 1, 0.266742659336867, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.733257340663133, 1, 0.001188232879408267],
[211.7381379609453, 581.9092914021275, 1, 0, 0.2667911847592978, 0.004722814744807326, 0, -0.02187464243034639, 1, 0.2667911847592979, 0.001188253492093149],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001188253488993807],
[211.7808652247962, 581.8665641382765, 1, 0, 0.2668450213399634, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668450213399634, 0.001187765266045757],
[212.3166300296228, 581.5504545721916, 0, 1, 0.2674460676702775, 0, 0.001719541257577787, 0.00796439246216438, 0.7325539323297225, 1, 0.001188472792492399],
[212.0662082304068, 581.6804465703591, 0, 1, 0.2671711520896253, 0, 0.00171915698025624, 0.007962612606409469, 0.7328288479103746, 1, 0.001188232896363455],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001187765280709013],
[212.2288982551453, 581.1472301436977, 0, 1, 0.2675009880666014, 0, 0.001720734347736174, 0.007969918493146346, 0.7324990119333986, 1, 0.001190406826790801],
[211.6939805316792, 581.9534488313935, 0, 1, 0.2667355461625703, 0, 0.001718350500384654, 0.007958877236768382, 0.7332644538374297, 1, 0.001188874075887369],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001188359364951405],
[210.9597574143591, 579.7303992125646, 1, 0, 0.2668045828650648, 0.004740240566525862, 0, -0.02195535354008599, 1, 0.2668045828650647, 0.001187983125065671],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 1, 0.2670490087521035, 0, 0.001725608217429194, 0.007992492776184683, 0.7329509912478965, 1, 0.001187959911546766],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 1, 0.2670490087521035, 0, 0.001725608217429194, 0.007992492776184683, 0.7329509912478965, 1, 0.00118905667934865],
[211.2151061081326, 579.4323232549401, 0, 1, 0.2671419627308251, 0, 0.001725827089490859, 0.007993506525049631, 0.7328580372691749, 1, 0.0011923859494216],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 1, 0, 0.2670490087521035, 0.004736157828783858, 0, -0.02193644353978556, 1, 0.2670490087521035, 0.001189420583887479],
[210.9597574143591, 579.6876719487136, 1, 0, 0.2668190012130988, 0.004740240566525862, 0, -0.02195535354008599, 1, 0.2668190012130988, 0.00118865845999155],
[210.901077880052, 579.7463514830207, 0, 1, 0.2667447841447471, 0, 0.00172489226959678, 0.007989176723432441, 0.7332552158552529, 1, 0.001188611704120216],
[211.0164013841993, 579.6617945393476, 0, 1, 0.2668802585832317, 0, 0.001725143884624467, 0.007990342127764003, 0.7331197414167683, 1, 0.001188945954167521],
[210.8843663844577, 579.763062978615, 0, 1, 0.2667236476748445, 0, 0.001724842550096859, 0.00798894643782071, 0.7332763523251555, 1, 0.001188323010331224],
[211.5521661890259, 579.0952631740469, 0, 1, 0.2675682716877324, 0, 0.001726831600243034, 0.007998159113539453, 0.7324317283122677, 1, 0.001187976634334925],
[211.5907765504056, 579.0566528126672, 0, 0, 0.267617105542047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001798117247062506],
[211.3661944171065, 579.2812349459663, 1, 0, 0.2673330571470753, 0.004731125536691155, 0, -0.02191313549234331, 1, 0.2673330571470753, 0.001008812891516368],
[210.8911904845913, 579.8177719994301, 0, 0, 0.2667115215465298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005754553464697913],
[211.0164013841993, 579.6617945393477, 0, 1, 0.2668802585832317, 0, 0.001725143884624467, 0.007990342127764002, 0.7331197414167683, 1, 0.0006126650187359734],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188609333808906],
[211.7808652247962, 581.8665641382765, 1, 0, 0.2668450213399634, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668450213399634, 0.001188354053971509]
],
"NAMES": [
["Node1623"],
["Node150"],
["Node1606"],
["Node1601"],
["Node1596"],
["Node1591"],
["Node1586"],
["Node1581"],
["Node1574"],
["Node1570"],
["Node1567"],
["Node1564"],
["Node180"],
["Node184"],
["Node1561"],
["Node1536"],
["Node1499"],
["Node1498"],
["Node1497"],
["Node1517"],
["Node1516"],
["Node1530"],
["Node1554"],
["Node1553"],
["Node1546"],
["Node1549"],
["Node1485"],
["Node1482"],
["Node1478"],
["Node208"],
["Node1429"],
["Node1439"],
["Node223"],
["Node1415"],
["Node1412"],
["Node1403"],
["Node1301"],
["Node1300"],
["Node1296"],
["Node1295"],
["Node1294"],
["Node1385"],
["Node1380"],
["Node1377"],
["Node1361"],
["Node1366"],
["Node1311"],
["Node1370"],
["Node911"],
["Node910"],
["Node909"],
["Node879"],
["Node878"],
["Node757"],
["Node756"],
["Node752"],
["Node751"],
["Node747"],
["Node746"],
["Node741"],
["Node737"],
["Node736"],
["Node725"],
["Node724"],
["Node720"],
["Node719"],
["Node713"],
["Node712"],
["Node693"],
["Node692"],
["Node335"],
["Node330"],
["Node327"],
["Node319"],
["Node307"],
["Node281"],
["Node284"],
["Node297"],
["Node294"],
["Node290"],
["Node301"],
["Node304"],
["Node311"],
["Node316"],
["Node626"],
["Node625"],
["Node353"],
["Node345"],
["Node618"],
["Node613"],
["Node565"],
["Node548"],
["Node539"],
["Node535"],
["Node411"],
["Node460"],
["Node485"],
["Node479"],
["Node504"],
["Node511"],
["Node531"],
["Node544"],
["Node553"],
["Node560"],
["Node582"],
["Node578"],
["Node575"],
["Node570"],
["Node599"],
["Node598"],
["Node596"],
["Node590"],
["Node593"],
["Node364"],
["Node607"],
["Node56"],
["Node650"],
["Node641"],
["Node640"],
["Node645"],
["Node656"],
["Node665"],
["Node670"],
["Node669"],
["Node674"],
["Node678"],
["Node683"],
["Node705"],
["Node731"],
["Node730"],
["Node763"],
["Node769"],
["Node777"],
["Node783"],
["Node782"],
["Node788"],
["Node795"],
["Node793"],
["Node822"],
["Node821"],
["Node805"],
["Node804"],
["Node810"],
["Node815"],
["Node841"],
["Node840"],
["Node836"],
["Node835"],
["Node832"],
["Node850"],
["Node855"],
["Node860"],
["Node859"],
["Node866"],
["Node887"],
["Node886"],
["Node892"],
["Node898"],
["Node897"],
["Node905"],
["Node927"],
["Node923"],
["Node94"],
["Node937"],
["Node936"],
["Node943"],
["Node954"],
["Node1286"],
["Node1284"],
["Node1277"],
["Node1280"],
["Node1257"],
["Node1262"],
["Node1270"],
["Node1247"],
["Node1252"],
["Node1241"],
["Node1239"],
["Node1236"],
["Node1230"],
["Node1229"],
["Node1223"],
["Node1222"],
["Node1218"],
["Node1213"],
["Node1212"],
["Node1203"],
["Node1198"],
["Node1192"],
["Node1184"],
["Node1166"],
["Node1181"],
["Node1160"],
["Node1155"],
["Node1151"],
["Node1148"],
["Node1145"],
["Node1142"],
["Node1139"],
["Node1128"],
["Node1122"],
["Node1112"],
["Node994"],
["Node990"],
["Node1002"],
["Node1105"],
["Node1102"],
["Node1080"],
["Node1057"],
["Node1068"],
["Node1067"],
["Node1098"],
["Node1097"],
["Node980"],
["Node1133"]
],
"RESOLVED": [
[211.8166300296228, 581.8000327729757, 0, 1, 0.2669004318553596, 0, 0.001718803615795275, 0.007960975929629015, 0.7330995681446404, 1, 0.001188597347450208],
[212.3375091946364, 581.6713565022825, 0, 1, 0.2674246074170257, 0, 0.001719183846378855, 0.007962737042123642, 0.7325753925829743, 1, 0.0011871554212152],
[211.9341732306652, 581.7132561324075, 0, 1, 0.2670381902462017, 0, 0.001719060017041082, 0.007962163502268171, 0.7329618097537982, 1, 0.001188464044678501],
[212.2221856904891, 581.4252436725836, 0, 1, 0.2674010874839022, 0, 0.001719911563666347, 0.007966107607414558, 0.7325989125160979, 1, 0.001188464044678501],
[211.5521661890259, 582.0952631740469, 1, 0, 0.2665568593333733, 0.00472696648781408, 0, -0.02189387204205947, 1, 0.2665568593333733, 0.001188464044678501],
[211.9601586925801, 581.415969706263, 0, 1, 0.2671622589910144, 0, 0.001719938997384626, 0.007966234672059334, 0.7328377410089856, 1, 0.001188464044678501],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.001188464044678501],
[211.8375091946364, 581.8406867289107, 0, 1, 0.2669060461565738, 0, 0.001718683520779489, 0.007960419686017963, 0.7330939538434262, 1, 0.001188444466325606],
[212.6045344368977, 581.4534488313935, 0, 1, 0.2677443447666519, 0, 0.001719828134152102, 0.007965721187262411, 0.7322556552333481, 1, 0.001190888205385716],
[211.7381379609453, 581.9092914021275, 1, 0, 0.2667911847592978, 0.004722814744807326, 0, -0.02187464243034639, 1, 0.2667911847592979, 0.001188215874781043],
[211.9467678237883, 581.7006615392845, 0, 1, 0.2670540595008066, 0, 0.001719097236977211, 0.007962335893699572, 0.7329459404991934, 1, 0.001188131572254374],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188112016490987],
[211.8634946565513, 582.0461456026745, 0, 1, 0.2668609674362614, 0, 0.001718076835582441, 0.007957609704583101, 0.7331390325637386, 1, 0.001188874047818899],
[212.0662082304068, 581.6804465703591, 0, 1, 0.2671711520896253, 0, 0.00171915698025624, 0.007962612606409469, 0.7328288479103746, 1, 0.001188604432288723],
[211.4060761244042, 582.2105866781941, 1, 0, 0.2663831116874983, 0.00473023301095442, 0, -0.02190900158440791, 1, 0.2663831116874983, 0.001188805397774901],
[212.0662082304068, 581.6804465703591, 0, 1, 0.2671711520896253, 0, 0.00171915698025624, 0.007962612606409469, 0.7328288479103746, 1, 0.001188519374179711],
[211.1416122838073, 579.3269248897025, 0, 0, 0.2671094450372302, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001339508247057602],
[211.1416122838073, 579.3269248897025, 0, 0, 0.2671094450372302, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001550656820229312],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.0008992103120382833],
[210.7779025449109, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2667116850707079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002622515138561228],
[211.7808652247962, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2669061797166827, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2669061797166827, 0.0009261411558569333],
[211.9627200942444, 581.7741553636097, 0, 1, 0.2670440628980192, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137458, 0.7329559371019808, 1, 0.001191491232469764],
[210.599010355348, 580.0484190077248, 0, 0, 0.2663627332918817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002001598518886468],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.0009883233600831694],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001188642822066815],
[212.1445749636926, 581.5028543993801, 1, 0, 0.2673032975536069, 0.004713766544212335, 0, -0.02183273391532977, 1, 0.2673032975536069, 0.001187978394743758],
[211.7808652247962, 581.8665641382765, 1, 0, 0.2668450213399634, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668450213399634, 0.001188311467792104],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001187629121031811],
[211.7221856904891, 581.9252436725836, 0, 1, 0.2667710848133193, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.7332289151866807, 1, 0.001188553698242098],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 0, 0.2670741594467851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004585857915074439],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001189248703356517],
[212.1445749636926, 581.5028543993802, 1, 0, 0.2673032975536068, 0.004713766544212335, 0, -0.02183273391532977, 1, 0.2673032975536068, 0.000959940400410448],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188993855351816],
[211.9627200942444, 581.7741553636098, 0, 1, 0.2670440628980191, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137456, 0.7329559371019809, 1, 0.001187837643717843],
[211.4627200942444, 582.1847092688283, 0, 1, 0.2664441567762022, 0, 0.001717667922360775, 0.007955715742826748, 0.7335558432237979, 1, 0.001188230545381488],
[212.234021058474, 581.4134083045986, 0, 1, 0.2674160001107779, 0, 0.001719946574531192, 0.007966269767099207, 0.7325839998892221, 1, 0.001187848870003369],
[210.8703113195777, 581.1226476462384, 0, 1, 0.2662527601191455, 0, 0.001720807137788158, 0.007970255634543092, 0.7337472398808544, 1, 0.001189883315010756],
[211.1416122838073, 580.5400182144833, 0, 1, 0.2667001533822543, 0, 0.001722534138259088, 0.007978254575814322, 0.7332998466177456, 1, 0.001189854269002321],
[211.1416122838073, 580.2286897469579, 0, 0, 0.2668050743652988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001649286824782504],
[211.1416122838073, 580.2286897469579, 0, 0, 0.2668050743652988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001243943765944006],
[211.9627200942444, 582.0461456026745, 0, 1, 0.2669525861127509, 0, 0.001718076835582441, 0.007957609704583101, 0.7330474138872491, 1, 0.0008992103120382833],
[212.2674743560044, 581.3799550070682, 0, 1, 0.2674581514443458, 0, 0.001720045542312931, 0.007966728155783632, 0.7325418485556542, 1, 0.001187543954769617],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001187765270368094],
[211.4627200942444, 582.1847092688283, 0, 1, 0.2664441567762022, 0, 0.001717667922360775, 0.007955715742826748, 0.7335558432237979, 1, 0.001187765625534971],
[210.8677499179133, 579.2370775167001, 0, 1, 0.2668857885637511, 0, 0.001726408820870361, 0.007996200927986166, 0.7331142114362489, 1, 0.001188389428044174],
[211.2800181434358, 578.8248092911776, 1, 0, 0.2674075778393097, 0.004733055254288696, 0, -0.0219220733577305, 1, 0.2674075778393097, 0.001189613394061148],
[211.9601586925801, 581.415969706263, 0, 1, 0.2671622589910144, 0, 0.001719938997384626, 0.007966234672059334, 0.7328377410089856, 1, 0.001188493803634155],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.00118796813831646],
[211.1416122838073, 579.2345161150357, 0, 1, 0.2671406747968735, 0, 0.00172641645512955, 0.007996236287554345, 0.7328593252031265, 1, 0.001188493783812483],
[211.1416122838073, 579.2345161150357, 0, 1, 0.2671406747968735, 0, 0.00172641645512955, 0.007996236287554345, 0.7328593252031265, 1, 0.001156957826457538],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 0, 0.2670741594467851, 0, 0, 0, 1, 1, 3.059722744687468e-05],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2670490087521035, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002682953889479941],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.0009200784905344447],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2670490087521035, 0, 0, 0, 1, 1, 5.553450159378437e-05],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001132916210701686],
[210.7779025449109, 579.8695268181618, 0, 0, 0.2665889936740941, 0, 0, 0, 1, 1, 5.224149162665853e-05],
[211.7808652247962, 581.8665641382765, 1, 0, 0.2668450213399634, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668450213399634, 0.001136200689768488],
[210.6041331586768, 580.0432962043959, 0, 0, 0.2663692125431112, 0, 0, 0, 1, 1, 5.408396121103356e-05],
[211.6939805316792, 581.9534488313935, 0, 1, 0.2667355461625703, 0, 0.001718350500384654, 0.007958877236768382, 0.7332644538374297, 1, 0.001134369412269479],
[212.3166300296228, 581.5504545721916, 0, 1, 0.2674460676702775, 0, 0.001719541257577787, 0.00796439246216438, 0.7325539323297225, 1, 0.001188597342871472],
[210.7779025449109, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2667116850707079, 0, 0, 0, 1, 1, 5.380153410636633e-05],
[211.7808652247962, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2669061797166827, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2669061797166827, 0.00113464897389867],
[211.1364894804786, 579.1472301436978, 0, 0, 0.2671654296268252, 0, 0, 0, 1, 1, 4.622332883418878e-05],
[211.9601586925801, 581.5054158010445, 0, 1, 0.2671321422203468, 0, 0.001719674439527729, 0.007965009320476757, 0.7328678577796532, 1, 0.001142219603618437],
[210.599010355348, 580.0484190077246, 0, 0, 0.2663627332918818, 0, 0, 0, 1, 1, 4.746123965880967e-05],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001141250236098944],
[210.9627200942444, 579.5377216201776, 0, 0, 0.2668723620656208, 0, 0, 0, 1, 1, 9.806995630023438e-05],
[211.873273999463, 581.7006615392844, 0, 1, 0.2669861805070813, 0, 0.001719097236977212, 0.007962335893699574, 0.7330138194929187, 1, 0.001090409536050503],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2670490087521035, 0, 0, 0, 1, 1, 4.969133982887281e-05],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001138751186657589],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001187765271153378],
[211.7221856904891, 581.9252436725836, 0, 1, 0.2667710848133193, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.7332289151866807, 1, 0.001187765232200876],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001187765639188983],
[211.7221856904891, 581.9252436725836, 0, 1, 0.2667710848133193, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.7332289151866807, 1, 0.001187765636921892],
[211.873273999463, 581.7741553636097, 0, 1, 0.2669614568896141, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137458, 0.7330385431103859, 1, 0.001187765650392609],
[212.1914191300148, 581.6756654717996, 0, 1, 0.267288344920416, 0, 0.001719171110912635, 0.007962678055314972, 0.732711655079584, 1, 0.001188232907889506],
[211.7221856904891, 581.9252436725836, 0, 1, 0.2667710848133193, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.7332289151866807, 1, 0.00118776563968482],
[211.873273999463, 581.7741553636097, 0, 1, 0.2669614568896141, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137458, 0.7330385431103859, 1, 0.001187765637327006],
[211.8375091946364, 581.8406867289106, 0, 1, 0.2669060461565738, 0, 0.00171868352077949, 0.007960419686017964, 0.7330939538434262, 1, 0.001188232880674181],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001186505033374825],
[212.1914191300148, 581.6756654717996, 0, 1, 0.2672883449204159, 0, 0.001719171110912635, 0.007962678055314972, 0.732711655079584, 1, 0.001188232908430121],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.001187765640082419],
[211.873273999463, 581.7741553636097, 0, 1, 0.2669614568896141, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137458, 0.7330385431103859, 1, 0.001188232927767837],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.001187765649614933],
[211.1416122838073, 579.3269248897025, 0, 0, 0.2671094450372302, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005134436742450451],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.0006741548488107865],
[211.873273999463, 581.7741553636097, 0, 1, 0.2669614568896141, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137458, 0.7330385431103859, 1, 0.001187765278406845],
[211.9601586925801, 581.5054158010445, 0, 1, 0.2671321422203468, 0, 0.001719674439527729, 0.007965009320476757, 0.7328678577796532, 1, 0.001187765616704252],
[211.8375091946364, 581.8406867289107, 0, 1, 0.2669060461565738, 0, 0.001718683520779489, 0.007960419686017963, 0.7330939538434262, 1, 0.001188433004795037],
[211.5496047873615, 581.8265236114815, 1, 0, 0.2666447819829185, 0.004727023721009299, 0, -0.02189413712882408, 1, 0.2666447819829185, 0.001188181072692314],
[211.4520766922944, 580.1156859189085, 0, 1, 0.2671307330591153, 0, 0.001723794105680819, 0.007984090361953208, 0.7328692669408847, 1, 0.001189056688184713],
[211.4520766922944, 580.4270143864339, 0, 1, 0.2670257102056404, 0, 0.00172286949989241, 0.00797980786896897, 0.7329742897943596, 1, 0.001189055614580562],
[211.6080541523767, 579.8604830211331, 0, 1, 0.2673612963922367, 0, 0.00172455276619282, 0.007987604246855065, 0.7326387036077633, 1, 0.001189055610593142],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 0, 1, 0.2670334683307811, 0, 0.001723781439309816, 0.007984031695172578, 0.7329665316692189, 1, 0.001188693900198021],
[211.4520766922944, 580.4270143864339, 0, 1, 0.2670257102056403, 0, 0.00172286949989241, 0.00797980786896897, 0.7329742897943596, 1, 0.001188963911807488],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 0, 1, 0.2670334683307811, 0, 0.001723781439309816, 0.007984031695172578, 0.7329665316692189, 1, 0.001188349042505824],
[211.4380346509135, 580.0305025225963, 0, 1, 0.2671464811551454, 0, 0.001724047262430036, 0.007985262907070296, 0.7328535188448546, 1, 0.001188215793395809],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 1, 0, 0.2670334683307811, 0.004731519651168194, 0, -0.02191496091081252, 1, 0.2670334683307811, 0.0009291591035695813],
[211.2493631184389, 580.481384951224, 0, 1, 0.2668197030789708, 0, 0.001722708127985925, 0.007979060443346031, 0.7331802969210293, 1, 0.001190076826902266],
[211.348588556132, 580.3912495816074, 0, 1, 0.2669419654987268, 0, 0.001722975666364509, 0.007980299599799151, 0.7330580345012732, 1, 0.001188796167276679],
[211.2591424613506, 580.2093947121592, 0, 1, 0.2669204555064167, 0, 0.001723515698149111, 0.007982800862886419, 0.7330795444935833, 1, 0.001188712950491816],
[211.0772875919024, 580.3912495816074, 0, 1, 0.2666906865883778, 0, 0.001722975666364509, 0.007980299599799151, 0.7333093134116222, 1, 0.001188350131719143],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 1, 0, 0.2670334683307811, 0.004731519651168194, 0, -0.02191496091081252, 1, 0.2670334683307811, 0.001188564324542743],
[211.5304434255802, 579.9380937479295, 1, 0, 0.26726323724882, 0.00472745191569466, 0, -0.02189612039645979, 1, 0.26726323724882, 0.001189145275743816],
[211.1240064228329, 580.3445307506769, 1, 0, 0.2667497146213776, 0.004736552782146573, 0, -0.02193827284371825, 1, 0.2667497146213775, 0.001188350894823446],
[211.6173281186973, 579.8512090548126, 0, 1, 0.2673730138085141, 0, 0.001724580348172511, 0.007987731998201634, 0.7326269861914859, 1, 0.001187464011497804],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 0, 1, 0.2670334683307811, 0, 0.001723781439309816, 0.007984031695172578, 0.7329665316692189, 1, 0.001189093394683949],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 0, 1, 0.2670334683307811, 0, 0.001723781439309816, 0.007984031695172578, 0.7329665316692189, 1, 0.00118873781427293],
[211.2451004199697, 579.8128828483216, 0, 1, 0.2670412345087539, 0, 0.001724694344643596, 0.007988259995207244, 0.7329587654912462, 1, 0.001188310619947063],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 0, 1, 0.2670334683307811, 0, 0.001723781439309816, 0.007984031695172578, 0.7329665316692189, 1, 0.001188844362148029],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 1, 0, 0.2670334683307811, 0.004731519651168194, 0, -0.02191496091081252, 1, 0.2670334683307811, 0.001188354212403573],
[211.348588556132, 580.1199486173778, 0, 1, 0.2670334683307811, 0, 0.001723781439309816, 0.007984031695172578, 0.7329665316692189, 1, 0.001188482878196966],
[211.0772875919024, 580.3912495816074, 0, 1, 0.2666906865883778, 0, 0.001722975666364509, 0.007980299599799151, 0.7333093134116222, 1, 0.001188971172007205],
[212.0662082304068, 581.9917750378845, 0, 1, 0.2670664015712756, 0, 0.001718237340957104, 0.007958353116694017, 0.7329335984287244, 1, 0.001188525571337909],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188253836625165],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001188299250316367],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001187765272116818],
[210.7076212948391, 580.3503619734521, 0, 1, 0.2663617911095357, 0, 0.001723097055715707, 0.007980861838378428, 0.7336382088904643, 1, 0.001188673439729034],
[211.6939805316792, 581.9534488313935, 0, 1, 0.2667355461625703, 0, 0.001718350500384654, 0.007958877236768382, 0.7332644538374297, 1, 0.001187765281173376],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188140045427607],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.001188597393495425],
[211.7808652247962, 581.9092914021275, 1, 0, 0.2668306560898228, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668306560898228, 0.001187765279103031],
[211.1467350871361, 579.864404014833, 0, 0, 0.2669326949388474, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001105440872262384],
[211.9652814959088, 581.8640027366121, 0, 1, 0.2670162032392621, 0, 0.001718614651012639, 0.007960100702190415, 0.7329837967607379, 1, 0.001078044947123324],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.00118822563804523],
[211.7221856904891, 581.9252436725836, 0, 1, 0.2667710848133193, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.7332289151866807, 1, 0.00118825370668909],
[211.7221856904891, 581.9252436725836, 0, 1, 0.2667710848133193, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.7332289151866807, 1, 0.001188253579903518],
[211.873273999463, 581.7006615392844, 0, 1, 0.2669861805070813, 0, 0.001719097236977212, 0.007962335893699574, 0.7330138194929187, 1, 0.001188596274228196],
[211.2451004199697, 580.535755516014, 0, 1, 0.2667974337043696, 0, 0.001722546786306283, 0.007978313157724645, 0.7332025662956303, 1, 0.0011889711868719],
[211.9627200942444, 582.0461456026745, 0, 1, 0.2669525861127509, 0, 0.001718076835582441, 0.007957609704583101, 0.7330474138872491, 1, 0.001188597348940184],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001187765277136639],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.00118883451063716],
[211.6939805316792, 581.9534488313935, 0, 1, 0.2667355461625703, 0, 0.001718350500384654, 0.007958877236768382, 0.7332644538374297, 1, 0.001187756056934115],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 1, 0.2670490087521035, 0, 0.001725608217429194, 0.007992492776184683, 0.7329509912478965, 1, 0.0007353384568046397],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 0, 0.2670741594467851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004523860289928529],
[211.7381379609453, 581.9092914021275, 1, 0, 0.2667911847592978, 0.004722814744807326, 0, -0.02187464243034639, 1, 0.2667911847592979, 0.001188253492216289],
[210.8703113195777, 579.7771180434951, 0, 1, 0.2667058710219926, 0, 0.001724800736142504, 0.007988752768293212, 0.7332941289780074, 1, 0.001188357113394156],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.00118794337148259],
[210.7779025449109, 579.9549813458638, 0, 0, 0.2665601833931394, 0, 0, 0, 1, 1, 5.893867147056644e-05],
[211.7808652247962, 581.9092914021275, 1, 0, 0.2668306560898228, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668306560898228, 0.001129586271304849],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2670490087521035, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001500658171696607],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001038330739456292],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188253861328361],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188253836129052],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2670490087521035, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002626603454690628],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.0009260673503645226],
[210.9431614084211, 580.2286897469578, 0, 0, 0.2666211659330051, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001861388058268773],
[211.8634946565513, 582.0461456026745, 0, 1, 0.2668609674362614, 0, 0.001718076835582441, 0.007957609704583101, 0.7331390325637386, 1, 0.001003289334590648],
[211.9627200942444, 581.5952631740469, 0, 1, 0.2671042627802317, 0, 0.001719408776719597, 0.007963778851095905, 0.7328957372197682, 1, 0.001188711592948481],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001187945205500682],
[212.0662082304068, 581.9426574665122, 0, 1, 0.2670829223604092, 0, 0.001718382364945544, 0.00795902482372941, 0.7329170776395908, 1, 0.001188232879962779],
[210.599010355348, 580.0484190077246, 0, 0, 0.2663627332918817, 0, 0, 0, 1, 1, 2.744645602970404e-05],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001161267435300777],
[212.1914191300148, 581.6756654717996, 0, 1, 0.267288344920416, 0, 0.001719171110912635, 0.007962678055314972, 0.732711655079584, 1, 0.00118832748905391],
[210.9597574143591, 579.6876719487136, 1, 0, 0.2668190012130988, 0.004740240566525862, 0, -0.02195535354008599, 1, 0.2668190012130988, 0.0005758004579800533],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 0, 0.2670741594467851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004870621282205035],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188253851782921],
[211.1364894804786, 579.1472301436978, 0, 0, 0.2671654296268252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002241282812586498],
[211.9601586925801, 581.5054158010445, 0, 1, 0.2671321422203468, 0, 0.001719674439527729, 0.007965009320476757, 0.7328678577796532, 1, 0.00096421168892502],
[211.9627200942444, 581.4224983726751, 0, 1, 0.2671624264740222, 0, 0.001719919684564784, 0.007966145220947827, 0.7328375735259778, 1, 0.001188280593766321],
[212.1045344368977, 581.6421203638681, 0, 1, 0.2672194372776752, 0, 0.001719270260851144, 0.007963137287694192, 0.7327805627223248, 1, 0.001187902820039365],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001188187392917705],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188188835435404],
[210.8911904845913, 579.8177719994301, 0, 0, 0.2667115215465298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001505358694999109],
[211.8375091946364, 581.8406867289107, 0, 1, 0.2669060461565738, 0, 0.001718683520779489, 0.007960419686017963, 0.7330939538434262, 1, 0.001038147919294949],
[211.9627200942444, 582.0461456026745, 0, 1, 0.2669525861127509, 0, 0.001718076835582441, 0.007957609704583101, 0.7330474138872491, 1, 0.0011886201490759],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188500279409049],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 1, 0, 0.2670490087521035, 0.004736157828783858, 0, -0.02193644353978556, 1, 0.2670490087521035, 0.001189045121537303],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188424577338526],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188597349415081],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001188253493326803],
[211.873273999463, 581.7741553636097, 0, 1, 0.2669614568896141, 0, 0.001718880068460584, 0.007961330035137458, 0.7330385431103859, 1, 0.001187956456180666],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188597376743048],
[211.7808652247962, 581.8665641382764, 1, 0, 0.2668450213399634, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668450213399634, 0.001187765625973724],
[211.9627200942444, 581.4134083045986, 0, 1, 0.2671654874744193, 0, 0.001719946574531192, 0.007966269767099207, 0.7328345125255806, 1, 0.001188424630954825],
[212.2221856904891, 581.4252436725836, 0, 1, 0.2674010874839022, 0, 0.001719911563666347, 0.007966107607414558, 0.7325989125160979, 1, 0.0009776723686084525],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 1, 0.2670490087521035, 0, 0.001725608217429194, 0.007992492776184683, 0.7329509912478965, 1, 0.0011883583350061],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188333098825143],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2670741594467851, 0.004717810752548244, 0, -0.02185146545913193, 1, 0.2670741594467851, 0.001164888790588711],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 1, 0.2670490087521035, 0, 0.001725608217429194, 0.007992492776184683, 0.7329509912478965, 1, 0.0007166492872101149],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 0, 0.2670741594467851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004710564636258159],
[210.7779025449109, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2667116850707079, 0, 0, 0, 1, 1, 1.833890409717141e-05],
[211.7808652247962, 581.6847092688283, 1, 0, 0.2669061797166827, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2669061797166827, 0.001170107811061411],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188190084910103],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 0, 0.2670490087521035, 0, 0, 0, 1, 1, 6.052479623084876e-05],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001127916274722214],
[212.0662082304068, 581.9917750378845, 0, 1, 0.2670664015712757, 0, 0.001718237340957104, 0.007958353116694017, 0.7329335984287243, 1, 0.001188295012459811],
[211.7808652247962, 581.8665641382764, 1, 0, 0.2668450213399634, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668450213399634, 0.00118804914432396],
[211.9601586925801, 581.5054158010445, 0, 1, 0.2671321422203468, 0, 0.001719674439527729, 0.007965009320476757, 0.7328678577796532, 1, 0.001187654925802135],
[211.6914191300148, 581.9252436725836, 0, 1, 0.266742659336867, 0, 0.001718433786595866, 0.007959262993184437, 0.733257340663133, 1, 0.001188232879408267],
[211.7381379609453, 581.9092914021275, 1, 0, 0.2667911847592978, 0.004722814744807326, 0, -0.02187464243034639, 1, 0.2667911847592979, 0.001188253492093149],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001188253488993807],
[211.7808652247962, 581.8665641382765, 1, 0, 0.2668450213399634, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668450213399634, 0.001187765266045757],
[212.3166300296228, 581.5504545721916, 0, 1, 0.2674460676702775, 0, 0.001719541257577787, 0.00796439246216438, 0.7325539323297225, 1, 0.001188472792492399],
[212.0662082304068, 581.6804465703591, 0, 1, 0.2671711520896253, 0, 0.00171915698025624, 0.007962612606409469, 0.7328288479103746, 1, 0.001188232896363455],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001187765280709013],
[212.2288982551453, 581.1472301436977, 0, 1, 0.2675009880666014, 0, 0.001720734347736174, 0.007969918493146346, 0.7324990119333986, 1, 0.001190406826790801],
[211.6939805316792, 581.9534488313935, 0, 1, 0.2667355461625703, 0, 0.001718350500384654, 0.007958877236768382, 0.7332644538374297, 1, 0.001188874075887369],
[211.6914191300148, 581.9560102330579, 0, 1, 0.2667323187827924, 0, 0.001718342937294396, 0.007958842206833057, 0.7332676812172076, 1, 0.001188359364951405],
[210.9597574143591, 579.7303992125646, 1, 0, 0.2668045828650648, 0.004740240566525862, 0, -0.02195535354008599, 1, 0.2668045828650647, 0.001187983125065671],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 1, 0.2670490087521035, 0, 0.001725608217429194, 0.007992492776184683, 0.7329509912478965, 1, 0.001187959911546766],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 0, 1, 0.2670490087521035, 0, 0.001725608217429194, 0.007992492776184683, 0.7329509912478965, 1, 0.00118905667934865],
[211.2151061081326, 579.4323232549401, 0, 1, 0.2671419627308251, 0, 0.001725827089490859, 0.007993506525049631, 0.7328580372691749, 1, 0.0011923859494216],
[211.1416122838073, 579.5058170792654, 1, 0, 0.2670490087521035, 0.004736157828783858, 0, -0.02193644353978556, 1, 0.2670490087521035, 0.001189420583887479],
[210.9597574143591, 579.6876719487136, 1, 0, 0.2668190012130988, 0.004740240566525862, 0, -0.02195535354008599, 1, 0.2668190012130988, 0.00118865845999155],
[210.901077880052, 579.7463514830207, 0, 1, 0.2667447841447471, 0, 0.00172489226959678, 0.007989176723432441, 0.7332552158552529, 1, 0.001188611704120216],
[211.0164013841993, 579.6617945393476, 0, 1, 0.2668802585832317, 0, 0.001725143884624467, 0.007990342127764003, 0.7331197414167683, 1, 0.001188945954167521],
[210.8843663844577, 579.763062978615, 0, 1, 0.2667236476748445, 0, 0.001724842550096859, 0.00798894643782071, 0.7332763523251555, 1, 0.001188323010331224],
[211.5521661890259, 579.0952631740469, 0, 1, 0.2675682716877324, 0, 0.001726831600243034, 0.007998159113539453, 0.7324317283122677, 1, 0.001187976634334925],
[211.5907765504056, 579.0566528126672, 0, 0, 0.267617105542047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001798117247062506],
[211.3661944171065, 579.2812349459663, 1, 0, 0.2673330571470753, 0.004731125536691155, 0, -0.02191313549234331, 1, 0.2673330571470753, 0.001008812891516368],
[210.8911904845913, 579.8177719994301, 0, 0, 0.2667115215465298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005754553464697913],
[211.0164013841993, 579.6617945393477, 0, 1, 0.2668802585832317, 0, 0.001725143884624467, 0.007990342127764002, 0.7331197414167683, 1, 0.0006126650187359734],
[211.9627200942444, 581.6847092688283, 0, 1, 0.2670741594467851, 0, 0.001719144381940157, 0.007962554254838546, 0.7329258405532149, 1, 0.001188609333808906],
[211.7808652247962, 581.8665641382765, 1, 0, 0.2668450213399634, 0.004721861906355625, 0, -0.02187022917224692, 1, 0.2668450213399634, 0.001188354053971509]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.001174933195659874, 2.998825066804338, 0, 1, 0.0003916443985532916, 0, 0.3334639326146617, 1.544503581764022, 0.9996083556014467, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.541108573550804, 0, 1, 0.1525419569402856, 0, 0.3935290331190594, 1.822706870919316, 0.8474580430597144, 1, 0.2159036317894472],
[0.7078198707567088, 2.230647008294625, 0, 0, 0.2408806700537745, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8015491246137593, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2861092520461397, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.965623363409528, 2.034376636590471, 2, 0, 0.3218744544698428, 2.071200921380135, 0, -9.593173140320332, 1, 0.1036031644402589, 0.2159036317894472],
[0.8205988701026046, 2.179401129897392, 1, 1, 0.2735329567008685, 1.218622199510174, 0.4588416452032769, -3.519072597388488, 0.9251797215984809, 0.4722456350002177, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.279117157608125, 0, 1, 0.4387663866518707, 0, 0.7817892161418127, 3.621010029623895, 0.5612336133481293, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999294766343038, 1.992600762812357, 0, 1, 0.3341418119869017, 0, 0.5018566782984666, 2.324447597935201, 0.6658581880130983, 1, 0.2159036317894472],
[0.9986761877788549, 2.001323812221142, 0, 1, 0.332892062592952, 0, 0.499669265859663, 2.31431616836788, 0.667107937407048, 1, 0.2159036317894472],
[0.7071306523104006, 2.231505580056617, 0, 1, 0.2406322512878091, 0, 0.4481279405873717, 2.075592415343868, 0.7593677487121909, 1, 0.2159036317894472],
[0.2517823195197926, 2.550313027286395, 1, 1, 0.08985501503607744, 3.971684754939236, 0.3921087291249217, -16.57950816364764, 0.9919260762728663, 0.1716361063450211, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.641413064432355, 0, 0, 0.246675410424212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9680954590876877, 2.031904540912311, 0, 0, 0.3226984863625627, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.2509913496527019, 2.551103865493418, 0, 1, 0.08957274124591572, 0, 0.391987176032359, 1.815565457530753, 0.9104272587540843, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 2, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 1.000000000000001, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999832429936432, 1.819934850404722, 0, 1, 0.3546142866116137, 0, 0.549470218550745, 2.544979044570206, 0.6453857133883862, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.539654672416644, 0, 2, 0.1526159566136812, 0, 0.7875086411243745, 3.647500667762579, 0.7180597169857466, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9994669991284003, 2.000095058080263, 1, 1, 0.333204307851022, 1.00053328511303, 0.4999762366093854, -2.318428107739271, 0.8889748892295212, 0.5553835049315654, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000007, -2.315848028381519, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2159036317894472],
[0.9986767313843915, 2.001323268615605, 0, 1, 0.3328922437947975, 0, 0.4996694015813545, 2.314316796989504, 0.6671077562052025, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000003, 0, -9.263392113526075, 1, 0.1111111111111109, 0.2159036317894472],
[0.4625208748694633, 2.537479125130533, 0, 0, 0.154173624956488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000003, 0, -9.263392113526075, 1, 0.1111111111111109, 0.2159036317894472],
[0.4639884754709577, 2.534515678825763, 0, 1, 0.154739980868822, 0, 0.3945526983140615, 1.827448176966453, 0.845260019131178, 1, 0.2159036317894472],
[0.5410192653513292, 1.640137470663825, 0, 1, 0.2480423604677487, 0, 0.6097049899087192, 2.823968197548959, 0.7519576395322514, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999859100966543, 1.820121542774943, 0, 1, 0.3545914213582219, 0, 0.5494138586346317, 2.544718002568985, 0.645408578641778, 1, 0.2159036317894472],
[0.9995079241382362, 2.000492075861761, 0, 1, 0.3331693080460791, 0, 0.4998770112944464, 2.315278382078977, 0.6668306919539209, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 4.631696056763038, 0.4444444444444445, 1, 0.2159036317894472],
[0.8210287051739036, 2.178971294826094, 1, 1, 0.2736762350579681, 1.217984211390256, 0.4589321586633436, -3.515698399493126, 0.9251013183644958, 0.472453788480432, 0.2159036317894472],
[0.9993678140974923, 1.285400731421278, 0, 2, 0.4374043996962414, 0, 1.555935010079373, 7.206618050764181, 0.3165138094811465, 1, 0.2159036317894472],
[0, 2.499156401568, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985074736332188, 2.001492526366778, 0, 1, 0.3328358245444066, 0, 0.4996271466550297, 2.314121085013866, 0.6671641754555934, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985067271037046, 2.001493272896292, 0, 1, 0.3328355757012352, 0, 0.499626960300963, 2.31412022187847, 0.6671644242987648, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9970135988517316, 2.002986401148266, 0, 2, 0.3323378662839108, 0, 0.9985090257494741, 4.624790317206135, 0.445772724798321, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 4.631696056763038, 0.4444444444444445, 1, 0.2159036317894472],
[0.998471792844973, 2.001528207155023, 0, 1, 0.3328239309483247, 0, 0.4996182399154905, 2.314079831703463, 0.6671760690516753, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.2775226136671276, 2.008882819636657, 0, 4, 0.1213794411195551, 0, 1.991156458156914, 9.222431515643621, 0.595943990208033, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000007, 2.315848028381519, 0.6666666666666667, 1, 0.2159036317894472],
[0.9995079239841272, 2.00049207601587, 1, 1, 0.3331693079947095, 1.000492318273887, 0.4998770112559382, -2.31869794347025, 0.8889982122103264, 0.5553368281997453, 0.2159036317894472],
[0.5382593883255715, 2.263835675123389, 0, 1, 0.1920917656744502, 0, 0.4417281744380565, 2.045950643705879, 0.8079082343255498, 1, 0.2159036317894472],
[0.9668594423427617, 2.033140557657238, 1, 0, 0.3222864807809206, 1.034276499981152, 0, -4.790454386565371, 1, 0.3222864807809207, 0.2159036317894472],
[0.4625208748694633, 2.537479125130533, 0, 0, 0.154173624956488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -4.631696056763038, 1, 0.3333333333333333, 0.2159036317894472],
[0.9995075315298932, 2.000492468470104, 1, 1, 0.3331691771766314, 1.000492711114796, 0.4998769131906605, -2.318700217198496, 0.8889982993794463, 0.5553366537327092, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 2.264069999483222, 0, 0, 0.1918506873245125, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.2515614730405849, 2.551080381989097, 0, 2, 0.08975869413679356, 0, 0.7839815687973677, 3.631164340773663, 0.8285392348995553, 1, 0.2159036317894472],
[0.8015491246137593, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2861092520461397, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.001258652845143366, 2.49910662872649, 0, 1, 0.0005033875867738115, 0, 0.4001429905012041, 1.853340711245794, 0.9994966124132262, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.641413064432355, 0, 0, 0.246675410424212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[1.818834315617174, 1.179672635525658, 1, 0, 0.6065799897258718, 0.5498026903350324, 0, -2.546518952822475, 1, 0.6065799897258718, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999507532092305, 0, 1, 0.3333880609736125, 0, 0.5001231472999704, 2.31641840924519, 0.6666119390263875, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -4.631696056763038, 1, 0.3333333333333333, 0.2159036317894472],
[0.9995079239895402, 2.000492076010457, 1, 2, 0.3331693079965138, 1.000492318268469, 0.9997540225145816, -0.00341956153200566, 0.7409594142766964, 0.7034849494415758, 0.2159036317894472],
[0.2504217992159989, 2.551127325397758, 0, 0, 0.08938690277313054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985056095756445, 2.001494390424353, 0, 1, 0.3328352031918819, 0, 0.4996266813358304, 2.314118929796765, 0.6671647968081181, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985059583169883, 2.001494041683008, 0, 1, 0.3328353194389965, 0, 0.4996267683910385, 2.31411933301003, 0.6671646805610035, 1, 0.2159036317894472],
[0.8201071208227257, 2.179188159296712, 1, 1, 0.2734332715617341, 1.219352904772741, 0.4588864874902447, -3.522249306228049, 0.9252342460030469, 0.4721007891265152, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985063709161405, 2.001493629083857, 0, 1, 0.3328354569720472, 0, 0.4996268713869101, 2.314119810055602, 0.6671645430279528, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.031904540912311, 0, 0, 0.2878038050023652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.7078198707567088, 2.230647008294625, 0, 0, 0.2408806700537745, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[1.815782888844955, 1.184047704772853, 3, 0, 0.6052951432351096, 1.652179904563558, 0, -7.652395149030154, 0.9999999999999999, 0.2217693725373984, 0.2159036317894472],
[0.7078198707567088, 2.230647008294625, 0, 0, 0.2408806700537745, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.7061078796286069, 2.232779666303479, 0, 2, 0.2402636605153467, 0, 0.8957444526136957, 4.148816049038214, 0.5771993055335405, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999859004975641, 1.998520695067309, 0, 1, 0.3334946476278075, 0, 0.5003700999785345, 2.317562218992702, 0.6665053523721924, 1, 0.2159036317894472],
[0.9984533889632671, 2.001546611036729, 0, 1, 0.3328177963210894, 0, 0.4996136460104897, 2.314058554131786, 0.6671822036789106, 1, 0.2159036317894472],
[0.9984466456313518, 2.001553354368645, 0, 1, 0.3328155485437843, 0, 0.4996119627874884, 2.314050757954448, 0.6671844514562157, 1, 0.2159036317894472],
[0.8198859379450506, 2.000493619476555, 1, 1, 0.2907005675131865, 1.219681852949429, 0.4998766255808692, -3.333919033240376, 0.9154931800475115, 0.4968943150738842, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.821107810437106, 0, 0, 0.3544706786108461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178280186673395, 0, 1, 0.2737584504666059, 0, 0.4590777651644395, 2.12630867465972, 0.726241549533394, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985069432009429, 2.001493056799054, 0, 1, 0.332835647733648, 0, 0.4996270142446955, 2.314120471729443, 0.667164352266352, 1, 0.2159036317894472],
[0.7070432052749936, 2.231614514394739, 0, 1, 0.2406007343224907, 0, 0.448106065608388, 2.075491097089967, 0.7593992656775093, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000003, 9.263392113526075, 0.1975308641975309, 1, 0.2159036317894472],
[0.9995075798673668, 2.00008782070534, 1, 1, 0.3332141327048751, 1.00049266272968, 0.4999780457876822, -2.31823157764251, 0.8889683417657379, 0.5553966071754881, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000007, 2.315848028381519, 0.6666666666666667, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9995078449357461, 2.000492155064251, 1, 1, 0.3331692816452491, 1.000492397400128, 0.4998769915035646, -2.318698401445938, 0.8889982297679887, 0.5553367930584868, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.001493821774933, 0, 1, 0.1860179671925067, 0, 0.4996268232860173, 2.314119587266886, 0.8139820328074934, 1, 0.2159036317894472],
[0.9955190156970418, 2.004480984302955, 0, 3, 0.3318396718990143, 0, 1.496646774647867, 6.932012964503635, 0.2982923102567443, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 4.631696056763038, 0.4444444444444445, 1, 0.2159036317894472],
[0.9948926091111031, 1.463599717687203, 0, 1, 0.4046759057437253, 0, 0.6832469205311213, 3.164592067619479, 0.5953240942562747, 1, 0.2159036317894472],
[0.999507730397127, 2.00049226960287, 1, 1, 0.3331692434657094, 1.000492512051585, 0.4998769628829989, -2.3186990650384, 0.8889982552084869, 0.5553367421399056, 0.2159036317894472],
[0.8200614659126199, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2907955999630082, 1.21942078925405, 0, -5.647986461122846, 1, 0.2907955999630082, 0.2159036317894472],
[0.8201073596292346, 2.179892640370762, 1, 0, 0.2733691198764118, 1.219352549710191, 0, -5.647670396296641, 1, 0.2733691198764119, 0.2159036317894472],
[0.7078198707567088, 2.230647008294625, 0, 0, 0.2408806700537745, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.2509917000471125, 1.930161376806606, 0, 1, 0.1150729413311808, 0, 0.518091394852419, 2.399641870580807, 0.8849270586688192, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4625208748694633, 2.537479125130533, 0, 0, 0.154173624956488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8015491246137593, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2861092520461397, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4625208748694633, 2.537479125130533, 0, 0, 0.154173624956488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4625208748694633, 2.537479125130533, 0, 0, 0.154173624956488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.002857221760586763, 2.997142778239411, 0, 2, 0.0009524072535289219, 0, 0.6673022101318927, 3.090741015337143, 0.9980960925725186, 1, 0.2159036317894472],
[0.5129187906879717, 2.487081209312027, 0, 2, 0.170972930229324, 0, 0.8041554865646053, 3.724603796145639, 0.6872858824125533, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.003206801311105567, 2.498367604315971, 0, 2, 0.001281913223884983, 0, 0.800522707925354, 3.707777869647126, 0.9974378168537437, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8200570762237468, 2.033202147800063, 1, 0, 0.2874106458042958, 1.219427316699548, 0, -5.64801669426642, 1, 0.2874106458042958, 0.2159036317894472],
[0.003207105660954459, 2.498367522905361, 0, 2, 0.001282034772951184, 0, 0.8005227340108041, 3.707777990467002, 0.9974375740672566, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 2.264069999483222, 0, 0, 0.1918506873245125, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8191067259148094, 2.03437578532987, 2, 0, 0.2870551064136426, 2.441684260089946, 0, -11.30913935931896, 0.9999999999999999, 0.0824006341181478, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -4.631696056763038, 1, 0.3333333333333333, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 2.262626855072957, 0, 1, 0.1919495650987736, 0, 0.4419641699902637, 2.04704370337445, 0.8080504349012263, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9948771966712461, 1.462520874869462, 0, 0, 0.4048498321020861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985074736247134, 2.001492526375283, 0, 1, 0.3328358245415715, 0, 0.4996271466529065, 2.314121085004032, 0.6671641754584285, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8201073599324007, 2.179892640067596, 1, 1, 0.2733691199774672, 1.219352549259438, 0.458738188119664, -3.522934537208422, 0.9252693242427451, 0.4720075641976795, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9982550538910629, 2.001744946108934, 0, 1, 0.3327516846303546, 0, 0.4995641437456042, 2.313829274686715, 0.6672483153696454, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.031904540912311, 0, 0, 0.2878038050023652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0, 2.499156401568, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9986767313874695, 2.001323268612527, 0, 1, 0.3328922437958236, 0, 0.4996694015821231, 2.314316796993063, 0.6671077562041765, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1556587466755379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2910586427783079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178399768966559, 0, 1, 0.2737475364540844, 0, 0.4590525642932857, 2.126191951884169, 0.7262524635459155, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1556587466755379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4639989350408787, 2.536001064959118, 0, 1, 0.1546663116802931, 0, 0.3943216009714573, 1.826377804315984, 0.8453336883197069, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000007, 2.315848028381519, 0.6666666666666667, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2910586427783079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985072475296809, 2.001492752470316, 0, 1, 0.3328357491765607, 0, 0.4996270902134236, 2.314120823593501, 0.6671642508234393, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999853523713768, 1.82008250301774, 0, 1, 0.354596202520594, 0, 0.5494256432562679, 2.544772585354548, 0.645403797479406, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999859087834578, 1.820121450853582, 0, 1, 0.3545914326155868, 0, 0.5494138863816095, 2.544718131084553, 0.6454085673844132, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985068860433647, 2.001323789159088, 0, 2, 0.3328544155166283, 0, 0.9993385432351035, 4.628632390073341, 0.4450832308956596, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.997042364257923, 2.002957635742074, 0, 2, 0.3323474547526413, 0, 0.9985233658020037, 4.624856735970891, 0.4457599211752764, 1, 0.2159036317894472],
[0.9955624336904215, 2.004437566309575, 0, 1, 0.3318541445634742, 0, 0.4988930644725081, 2.31072103946374, 0.6681458554365258, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4588907029574212, 2.541109297042577, 0, 1, 0.1529635676524738, 0, 0.3935289210754656, 1.822706351967444, 0.8470364323475261, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.000492105841777, 0, 1, 0.2910078802100269, 0, 0.4998770038031292, 2.315278347381472, 0.7089921197899731, 1, 0.2159036317894472],
[0.2515613242131363, 1.931851542356971, 0, 2, 0.1152147301432323, 0, 1.035276239477431, 4.795084876048077, 0.7828449737555131, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 2.264069999483222, 0, 0, 0.1918506873245125, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0, 2.499156401568, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.287569019865829, 0, 1, 0.4371452801273956, 0, 0.7766573943385228, 3.597240990813587, 0.5628547198726044, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985201846932757, 2.001479815306721, 0, 1, 0.3328400615644256, 0, 0.4996303197026011, 2.31413578160579, 0.6671599384355744, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 2.264069999483222, 0, 0, 0.1918506873245125, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1556587466755379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9986758534223413, 2.001324146577656, 0, 1, 0.3328919511407808, 0, 0.499669182381095, 2.314315781720526, 0.6671080488592191, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9948771966712461, 1.462520874869462, 0, 0, 0.4048498321020861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2910586427783079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8200627869443863, 2.179937213055611, 1, 0, 0.2733542623147957, 1.21941882490007, 0, -5.647977362832263, 1, 0.2733542623147958, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.821107810437106, 0, 0, 0.3544706786108461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8201068998685915, 2.179400734779773, 1, 1, 0.2734138397899872, 1.219353233292188, 0.4588417283896388, -3.522458138380057, 0.9252448722112954, 0.4720725517912696, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8200913391558107, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2908031125691498, 1.219376369746063, 0, -5.647780723462862, 1, 0.2908031125691497, 0.2159036317894472],
[0.2504217992159989, 1.93361770813367, 0, 1, 0.1146599218435777, 0, 0.5171653092509177, 2.39535252355211, 0.8853400781564223, 1, 0.2159036317894472],
[1.821107810437106, 1.178892189562891, 0, 0, 0.6070359368123694, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2910586427783079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.821107810437106, 0, 0, 0.3544706786108461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5391553779950375, 1.639736811567853, 0, 1, 0.2474447246989297, 0, 0.6098539673838504, 2.82465821593307, 0.7525552753010702, 1, 0.2159036317894472],
[0.7078198707567088, 2.230647008294625, 0, 0, 0.2408806700537745, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8201068639984024, 2.179893136001595, 1, 0, 0.2733689546661344, 1.219353286624788, 0, -5.647673809461073, 1, 0.2733689546661344, 0.2159036317894472],
[0.9986761876376055, 2.001323812362391, 0, 1, 0.3328920625458688, 0, 0.4996692658243974, 2.31431616820454, 0.6671079374541311, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985068026427696, 2.001493197357227, 0, 1, 0.3328356008809236, 0, 0.4996269791575613, 2.314120309216502, 0.6671643991190764, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999122136296584, 2.000087786370338, 0, 1, 0.3333040712098865, 0, 0.499978054370679, 2.315746382896726, 0.6666959287901135, 1, 0.2159036317894472],
[2.136017067869318, 5.668136201841624, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05995017649223616],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9668594423428897, 2.033140557657109, 1, 0, 0.3222864807809633, 1.034276499981015, 0, -4.790454386564737, 1, 0.3222864807809633, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2910586427783079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.45940031444499, 2.540599685555008, 2, 0, 0.1531334381483301, 4.353501591343569, 0, -20.16409615373759, 1, 0.02344984987912846, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 2.264069999483222, 0, 0, 0.1918506873245125, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.2530521436604626, 2.028051738888166, 0, 2, 0.1109340725761831, 0, 0.9861681344956492, 4.567631059848853, 0.7904382233059716, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000003, 9.263392113526075, 0.1975308641975309, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -4.631696056763038, 1, 0.3333333333333333, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.641413064432355, 0, 0, 0.246675410424212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5203546347454527, 2.479645365254545, 1, 0, 0.1734515449151511, 1.921766297881022, 0, -8.901037383915618, 1, 0.173451544915151, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.17840011354734, 0, 1, 0.2737475050062129, 0, 0.4590524916800453, 2.12619161556171, 0.7262524949937872, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9680954590876877, 2.031904540912311, 0, 0, 0.3226984863625627, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000003, 9.263392113526075, 0.1975308641975309, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.821107810437106, 0, 0, 0.3544706786108461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -4.631696056763038, 1, 0.3333333333333333, 0.2159036317894472],
[0.9989066768361493, 1.281109846522044, 0, 2, 0.4381137884759179, 0, 1.561146380561822, 7.230755534878067, 0.3157161147008856, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[1.002259009922584, 1.997740990077412, 0, 1, 0.3340863366408618, 0, 0.5005653910926913, 2.318466748076063, 0.6659136633591382, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999507923988397, 0, 1, 0.3333880174153083, 0, 0.5001230492776996, 2.316417955235824, 0.6666119825846917, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4582066259626426, 2.541793374037355, 1, 0, 0.1527355419875477, 2.182421517583051, 0, -10.10831313718421, 1, 0.1527355419875477, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9972493153179244, 2.002750684682072, 0, 1, 0.3324164384393085, 0, 0.4993132733137702, 2.312667319096831, 0.6675835615606915, 1, 0.2159036317894472],
[0.9972482386342144, 2.002751761365782, 0, 1, 0.3324160795447385, 0, 0.4993130048818667, 2.312666075801842, 0.6675839204552615, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9973525206373856, 2.002647479362612, 0, 2, 0.3324508402124621, 0, 0.9986780102889329, 4.6255730022312, 0.4456218807330477, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9991957418137937, 2.000634881451468, 1, 1, 0.3330840528343521, 1.000804905538075, 0.4998413300054512, -2.320311017376361, 0.8890550137474427, 0.5552231194161467, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000007, 2.315848028381519, 0.6666666666666667, 1, 0.2159036317894472],
[0.706441252444582, 2.232364377816142, 0, 2, 0.2403837957741724, 0, 0.8959110886532523, 4.149587856525543, 0.5770167777224542, 1, 0.2159036317894472]
],
"RESOLVED": [
[0.001174933195659874, 2.998825066804338, 0, 1, 0.0003916443985532916, 0, 0.3334639326146617, 1.544503581764022, 0.9996083556014467, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.541108573550804, 0, 1, 0.1525419569402856, 0, 0.3935290331190594, 1.822706870919316, 0.8474580430597144, 1, 0.2159036317894472],
[0.7078198707567088, 2.230647008294625, 0, 0, 0.2408806700537745, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8015491246137593, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2861092520461397, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.965623363409528, 2.034376636590471, 2, 0, 0.3218744544698428, 2.071200921380135, 0, -9.593173140320332, 1, 0.1036031644402589, 0.2159036317894472],
[0.8205988701026046, 2.179401129897392, 1, 1, 0.2735329567008685, 1.218622199510174, 0.4588416452032769, -3.519072597388488, 0.9251797215984809, 0.4722456350002177, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.279117157608125, 0, 1, 0.4387663866518707, 0, 0.7817892161418127, 3.621010029623895, 0.5612336133481293, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999294766343038, 1.992600762812357, 0, 1, 0.3341418119869017, 0, 0.5018566782984666, 2.324447597935201, 0.6658581880130983, 1, 0.2159036317894472],
[0.9986761877788549, 2.001323812221142, 0, 1, 0.332892062592952, 0, 0.499669265859663, 2.31431616836788, 0.667107937407048, 1, 0.2159036317894472],
[0.7071306523104006, 2.231505580056617, 0, 1, 0.2406322512878091, 0, 0.4481279405873717, 2.075592415343868, 0.7593677487121909, 1, 0.2159036317894472],
[0.2517823195197926, 2.550313027286395, 1, 1, 0.08985501503607744, 3.971684754939236, 0.3921087291249217, -16.57950816364764, 0.9919260762728663, 0.1716361063450211, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.641413064432355, 0, 0, 0.246675410424212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9680954590876877, 2.031904540912311, 0, 0, 0.3226984863625627, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.2509913496527019, 2.551103865493418, 0, 1, 0.08957274124591572, 0, 0.391987176032359, 1.815565457530753, 0.9104272587540843, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 2, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 1.000000000000001, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999832429936432, 1.819934850404722, 0, 1, 0.3546142866116137, 0, 0.549470218550745, 2.544979044570206, 0.6453857133883862, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.539654672416644, 0, 2, 0.1526159566136812, 0, 0.7875086411243745, 3.647500667762579, 0.7180597169857466, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9994669991284003, 2.000095058080263, 1, 1, 0.333204307851022, 1.00053328511303, 0.4999762366093854, -2.318428107739271, 0.8889748892295212, 0.5553835049315654, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000007, -2.315848028381519, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2159036317894472],
[0.9986767313843915, 2.001323268615605, 0, 1, 0.3328922437947975, 0, 0.4996694015813545, 2.314316796989504, 0.6671077562052025, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000003, 0, -9.263392113526075, 1, 0.1111111111111109, 0.2159036317894472],
[0.4625208748694633, 2.537479125130533, 0, 0, 0.154173624956488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000003, 0, -9.263392113526075, 1, 0.1111111111111109, 0.2159036317894472],
[0.4639884754709577, 2.534515678825763, 0, 1, 0.154739980868822, 0, 0.3945526983140615, 1.827448176966453, 0.845260019131178, 1, 0.2159036317894472],
[0.5410192653513292, 1.640137470663825, 0, 1, 0.2480423604677487, 0, 0.6097049899087192, 2.823968197548959, 0.7519576395322514, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999859100966543, 1.820121542774943, 0, 1, 0.3545914213582219, 0, 0.5494138586346317, 2.544718002568985, 0.645408578641778, 1, 0.2159036317894472],
[0.9995079241382362, 2.000492075861761, 0, 1, 0.3331693080460791, 0, 0.4998770112944464, 2.315278382078977, 0.6668306919539209, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 4.631696056763038, 0.4444444444444445, 1, 0.2159036317894472],
[0.8210287051739036, 2.178971294826094, 1, 1, 0.2736762350579681, 1.217984211390256, 0.4589321586633436, -3.515698399493126, 0.9251013183644958, 0.472453788480432, 0.2159036317894472],
[0.9993678140974923, 1.285400731421278, 0, 2, 0.4374043996962414, 0, 1.555935010079373, 7.206618050764181, 0.3165138094811465, 1, 0.2159036317894472],
[0, 2.499156401568, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985074736332188, 2.001492526366778, 0, 1, 0.3328358245444066, 0, 0.4996271466550297, 2.314121085013866, 0.6671641754555934, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985067271037046, 2.001493272896292, 0, 1, 0.3328355757012352, 0, 0.499626960300963, 2.31412022187847, 0.6671644242987648, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9970135988517316, 2.002986401148266, 0, 2, 0.3323378662839108, 0, 0.9985090257494741, 4.624790317206135, 0.445772724798321, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 4.631696056763038, 0.4444444444444445, 1, 0.2159036317894472],
[0.998471792844973, 2.001528207155023, 0, 1, 0.3328239309483247, 0, 0.4996182399154905, 2.314079831703463, 0.6671760690516753, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.2775226136671276, 2.008882819636657, 0, 4, 0.1213794411195551, 0, 1.991156458156914, 9.222431515643621, 0.595943990208033, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000007, 2.315848028381519, 0.6666666666666667, 1, 0.2159036317894472],
[0.9995079239841272, 2.00049207601587, 1, 1, 0.3331693079947095, 1.000492318273887, 0.4998770112559382, -2.31869794347025, 0.8889982122103264, 0.5553368281997453, 0.2159036317894472],
[0.5382593883255715, 2.263835675123389, 0, 1, 0.1920917656744502, 0, 0.4417281744380565, 2.045950643705879, 0.8079082343255498, 1, 0.2159036317894472],
[0.9668594423427617, 2.033140557657238, 1, 0, 0.3222864807809206, 1.034276499981152, 0, -4.790454386565371, 1, 0.3222864807809207, 0.2159036317894472],
[0.4625208748694633, 2.537479125130533, 0, 0, 0.154173624956488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -4.631696056763038, 1, 0.3333333333333333, 0.2159036317894472],
[0.9995075315298932, 2.000492468470104, 1, 1, 0.3331691771766314, 1.000492711114796, 0.4998769131906605, -2.318700217198496, 0.8889982993794463, 0.5553366537327092, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 2.264069999483222, 0, 0, 0.1918506873245125, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.2515614730405849, 2.551080381989097, 0, 2, 0.08975869413679356, 0, 0.7839815687973677, 3.631164340773663, 0.8285392348995553, 1, 0.2159036317894472],
[0.8015491246137593, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2861092520461397, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.001258652845143366, 2.49910662872649, 0, 1, 0.0005033875867738115, 0, 0.4001429905012041, 1.853340711245794, 0.9994966124132262, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.641413064432355, 0, 0, 0.246675410424212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[1.818834315617174, 1.179672635525658, 1, 0, 0.6065799897258718, 0.5498026903350324, 0, -2.546518952822475, 1, 0.6065799897258718, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999507532092305, 0, 1, 0.3333880609736125, 0, 0.5001231472999704, 2.31641840924519, 0.6666119390263875, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -4.631696056763038, 1, 0.3333333333333333, 0.2159036317894472],
[0.9995079239895402, 2.000492076010457, 1, 2, 0.3331693079965138, 1.000492318268469, 0.9997540225145816, -0.00341956153200566, 0.7409594142766964, 0.7034849494415758, 0.2159036317894472],
[0.2504217992159989, 2.551127325397758, 0, 0, 0.08938690277313054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985056095756445, 2.001494390424353, 0, 1, 0.3328352031918819, 0, 0.4996266813358304, 2.314118929796765, 0.6671647968081181, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985059583169883, 2.001494041683008, 0, 1, 0.3328353194389965, 0, 0.4996267683910385, 2.31411933301003, 0.6671646805610035, 1, 0.2159036317894472],
[0.8201071208227257, 2.179188159296712, 1, 1, 0.2734332715617341, 1.219352904772741, 0.4588864874902447, -3.522249306228049, 0.9252342460030469, 0.4721007891265152, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985063709161405, 2.001493629083857, 0, 1, 0.3328354569720472, 0, 0.4996268713869101, 2.314119810055602, 0.6671645430279528, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.031904540912311, 0, 0, 0.2878038050023652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.7078198707567088, 2.230647008294625, 0, 0, 0.2408806700537745, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[1.815782888844955, 1.184047704772853, 3, 0, 0.6052951432351096, 1.652179904563558, 0, -7.652395149030154, 0.9999999999999999, 0.2217693725373984, 0.2159036317894472],
[0.7078198707567088, 2.230647008294625, 0, 0, 0.2408806700537745, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.7061078796286069, 2.232779666303479, 0, 2, 0.2402636605153467, 0, 0.8957444526136957, 4.148816049038214, 0.5771993055335405, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999859004975641, 1.998520695067309, 0, 1, 0.3334946476278075, 0, 0.5003700999785345, 2.317562218992702, 0.6665053523721924, 1, 0.2159036317894472],
[0.9984533889632671, 2.001546611036729, 0, 1, 0.3328177963210894, 0, 0.4996136460104897, 2.314058554131786, 0.6671822036789106, 1, 0.2159036317894472],
[0.9984466456313518, 2.001553354368645, 0, 1, 0.3328155485437843, 0, 0.4996119627874884, 2.314050757954448, 0.6671844514562157, 1, 0.2159036317894472],
[0.8198859379450506, 2.000493619476555, 1, 1, 0.2907005675131865, 1.219681852949429, 0.4998766255808692, -3.333919033240376, 0.9154931800475115, 0.4968943150738842, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.821107810437106, 0, 0, 0.3544706786108461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178280186673395, 0, 1, 0.2737584504666059, 0, 0.4590777651644395, 2.12630867465972, 0.726241549533394, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985069432009429, 2.001493056799054, 0, 1, 0.332835647733648, 0, 0.4996270142446955, 2.314120471729443, 0.667164352266352, 1, 0.2159036317894472],
[0.7070432052749936, 2.231614514394739, 0, 1, 0.2406007343224907, 0, 0.448106065608388, 2.075491097089967, 0.7593992656775093, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000003, 9.263392113526075, 0.1975308641975309, 1, 0.2159036317894472],
[0.9995075798673668, 2.00008782070534, 1, 1, 0.3332141327048751, 1.00049266272968, 0.4999780457876822, -2.31823157764251, 0.8889683417657379, 0.5553966071754881, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000007, 2.315848028381519, 0.6666666666666667, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9995078449357461, 2.000492155064251, 1, 1, 0.3331692816452491, 1.000492397400128, 0.4998769915035646, -2.318698401445938, 0.8889982297679887, 0.5553367930584868, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.001493821774933, 0, 1, 0.1860179671925067, 0, 0.4996268232860173, 2.314119587266886, 0.8139820328074934, 1, 0.2159036317894472],
[0.9955190156970418, 2.004480984302955, 0, 3, 0.3318396718990143, 0, 1.496646774647867, 6.932012964503635, 0.2982923102567443, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 4.631696056763038, 0.4444444444444445, 1, 0.2159036317894472],
[0.9948926091111031, 1.463599717687203, 0, 1, 0.4046759057437253, 0, 0.6832469205311213, 3.164592067619479, 0.5953240942562747, 1, 0.2159036317894472],
[0.999507730397127, 2.00049226960287, 1, 1, 0.3331692434657094, 1.000492512051585, 0.4998769628829989, -2.3186990650384, 0.8889982552084869, 0.5553367421399056, 0.2159036317894472],
[0.8200614659126199, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2907955999630082, 1.21942078925405, 0, -5.647986461122846, 1, 0.2907955999630082, 0.2159036317894472],
[0.8201073596292346, 2.179892640370762, 1, 0, 0.2733691198764118, 1.219352549710191, 0, -5.647670396296641, 1, 0.2733691198764119, 0.2159036317894472],
[0.7078198707567088, 2.230647008294625, 0, 0, 0.2408806700537745, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.2509917000471125, 1.930161376806606, 0, 1, 0.1150729413311808, 0, 0.518091394852419, 2.399641870580807, 0.8849270586688192, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4625208748694633, 2.537479125130533, 0, 0, 0.154173624956488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8015491246137593, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2861092520461397, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4625208748694633, 2.537479125130533, 0, 0, 0.154173624956488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4625208748694633, 2.537479125130533, 0, 0, 0.154173624956488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.002857221760586763, 2.997142778239411, 0, 2, 0.0009524072535289219, 0, 0.6673022101318927, 3.090741015337143, 0.9980960925725186, 1, 0.2159036317894472],
[0.5129187906879717, 2.487081209312027, 0, 2, 0.170972930229324, 0, 0.8041554865646053, 3.724603796145639, 0.6872858824125533, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.003206801311105567, 2.498367604315971, 0, 2, 0.001281913223884983, 0, 0.800522707925354, 3.707777869647126, 0.9974378168537437, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8200570762237468, 2.033202147800063, 1, 0, 0.2874106458042958, 1.219427316699548, 0, -5.64801669426642, 1, 0.2874106458042958, 0.2159036317894472],
[0.003207105660954459, 2.498367522905361, 0, 2, 0.001282034772951184, 0, 0.8005227340108041, 3.707777990467002, 0.9974375740672566, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 2.264069999483222, 0, 0, 0.1918506873245125, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8191067259148094, 2.03437578532987, 2, 0, 0.2870551064136426, 2.441684260089946, 0, -11.30913935931896, 0.9999999999999999, 0.0824006341181478, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -4.631696056763038, 1, 0.3333333333333333, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 2.262626855072957, 0, 1, 0.1919495650987736, 0, 0.4419641699902637, 2.04704370337445, 0.8080504349012263, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9948771966712461, 1.462520874869462, 0, 0, 0.4048498321020861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985074736247134, 2.001492526375283, 0, 1, 0.3328358245415715, 0, 0.4996271466529065, 2.314121085004032, 0.6671641754584285, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8201073599324007, 2.179892640067596, 1, 1, 0.2733691199774672, 1.219352549259438, 0.458738188119664, -3.522934537208422, 0.9252693242427451, 0.4720075641976795, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9982550538910629, 2.001744946108934, 0, 1, 0.3327516846303546, 0, 0.4995641437456042, 2.313829274686715, 0.6672483153696454, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.031904540912311, 0, 0, 0.2878038050023652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0, 2.499156401568, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9986767313874695, 2.001323268612527, 0, 1, 0.3328922437958236, 0, 0.4996694015821231, 2.314316796993063, 0.6671077562041765, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1556587466755379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2910586427783079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178399768966559, 0, 1, 0.2737475364540844, 0, 0.4590525642932857, 2.126191951884169, 0.7262524635459155, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1556587466755379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4639989350408787, 2.536001064959118, 0, 1, 0.1546663116802931, 0, 0.3943216009714573, 1.826377804315984, 0.8453336883197069, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000007, 2.315848028381519, 0.6666666666666667, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2910586427783079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985072475296809, 2.001492752470316, 0, 1, 0.3328357491765607, 0, 0.4996270902134236, 2.314120823593501, 0.6671642508234393, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999853523713768, 1.82008250301774, 0, 1, 0.354596202520594, 0, 0.5494256432562679, 2.544772585354548, 0.645403797479406, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999859087834578, 1.820121450853582, 0, 1, 0.3545914326155868, 0, 0.5494138863816095, 2.544718131084553, 0.6454085673844132, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985068860433647, 2.001323789159088, 0, 2, 0.3328544155166283, 0, 0.9993385432351035, 4.628632390073341, 0.4450832308956596, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.997042364257923, 2.002957635742074, 0, 2, 0.3323474547526413, 0, 0.9985233658020037, 4.624856735970891, 0.4457599211752764, 1, 0.2159036317894472],
[0.9955624336904215, 2.004437566309575, 0, 1, 0.3318541445634742, 0, 0.4988930644725081, 2.31072103946374, 0.6681458554365258, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4588907029574212, 2.541109297042577, 0, 1, 0.1529635676524738, 0, 0.3935289210754656, 1.822706351967444, 0.8470364323475261, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.000492105841777, 0, 1, 0.2910078802100269, 0, 0.4998770038031292, 2.315278347381472, 0.7089921197899731, 1, 0.2159036317894472],
[0.2515613242131363, 1.931851542356971, 0, 2, 0.1152147301432323, 0, 1.035276239477431, 4.795084876048077, 0.7828449737555131, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 2.264069999483222, 0, 0, 0.1918506873245125, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0, 2.499156401568, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.287569019865829, 0, 1, 0.4371452801273956, 0, 0.7766573943385228, 3.597240990813587, 0.5628547198726044, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985201846932757, 2.001479815306721, 0, 1, 0.3328400615644256, 0, 0.4996303197026011, 2.31413578160579, 0.6671599384355744, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 2.264069999483222, 0, 0, 0.1918506873245125, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1556587466755379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9986758534223413, 2.001324146577656, 0, 1, 0.3328919511407808, 0, 0.499669182381095, 2.314315781720526, 0.6671080488592191, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9948771966712461, 1.462520874869462, 0, 0, 0.4048498321020861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2910586427783079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8200627869443863, 2.179937213055611, 1, 0, 0.2733542623147957, 1.21941882490007, 0, -5.647977362832263, 1, 0.2733542623147958, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.821107810437106, 0, 0, 0.3544706786108461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8201068998685915, 2.179400734779773, 1, 1, 0.2734138397899872, 1.219353233292188, 0.4588417283896388, -3.522458138380057, 0.9252448722112954, 0.4720725517912696, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8200913391558107, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2908031125691498, 1.219376369746063, 0, -5.647780723462862, 1, 0.2908031125691497, 0.2159036317894472],
[0.2504217992159989, 1.93361770813367, 0, 1, 0.1146599218435777, 0, 0.5171653092509177, 2.39535252355211, 0.8853400781564223, 1, 0.2159036317894472],
[1.821107810437106, 1.178892189562891, 0, 0, 0.6070359368123694, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2910586427783079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.821107810437106, 0, 0, 0.3544706786108461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5391553779950375, 1.639736811567853, 0, 1, 0.2474447246989297, 0, 0.6098539673838504, 2.82465821593307, 0.7525552753010702, 1, 0.2159036317894472],
[0.7078198707567088, 2.230647008294625, 0, 0, 0.2408806700537745, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8201068639984024, 2.179893136001595, 1, 0, 0.2733689546661344, 1.219353286624788, 0, -5.647673809461073, 1, 0.2733689546661344, 0.2159036317894472],
[0.9986761876376055, 2.001323812362391, 0, 1, 0.3328920625458688, 0, 0.4996692658243974, 2.31431616820454, 0.6671079374541311, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9985068026427696, 2.001493197357227, 0, 1, 0.3328356008809236, 0, 0.4996269791575613, 2.314120309216502, 0.6671643991190764, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999122136296584, 2.000087786370338, 0, 1, 0.3333040712098865, 0, 0.499978054370679, 2.315746382896726, 0.6666959287901135, 1, 0.2159036317894472],
[2.136017067869318, 5.668136201841624, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05995017649223616],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9668594423428897, 2.033140557657109, 1, 0, 0.3222864807809633, 1.034276499981015, 0, -4.790454386564737, 1, 0.3222864807809633, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2910586427783079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.45940031444499, 2.540599685555008, 2, 0, 0.1531334381483301, 4.353501591343569, 0, -20.16409615373759, 1, 0.02344984987912846, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 2.264069999483222, 0, 0, 0.1918506873245125, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.2530521436604626, 2.028051738888166, 0, 2, 0.1109340725761831, 0, 0.9861681344956492, 4.567631059848853, 0.7904382233059716, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000003, 9.263392113526075, 0.1975308641975309, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -4.631696056763038, 1, 0.3333333333333333, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.641413064432355, 0, 0, 0.246675410424212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5203546347454527, 2.479645365254545, 1, 0, 0.1734515449151511, 1.921766297881022, 0, -8.901037383915618, 1, 0.173451544915151, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.17840011354734, 0, 1, 0.2737475050062129, 0, 0.4590524916800453, 2.12619161556171, 0.7262524949937872, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9680954590876877, 2.031904540912311, 0, 0, 0.3226984863625627, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000003, 9.263392113526075, 0.1975308641975309, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.821107810437106, 0, 0, 0.3544706786108461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -4.631696056763038, 1, 0.3333333333333333, 0.2159036317894472],
[0.9989066768361493, 1.281109846522044, 0, 2, 0.4381137884759179, 0, 1.561146380561822, 7.230755534878067, 0.3157161147008856, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 2.542601928459288, 0, 0, 0.1524660238469034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[1.002259009922584, 1.997740990077412, 0, 1, 0.3340863366408618, 0, 0.5005653910926913, 2.318466748076063, 0.6659136633591382, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999507923988397, 0, 1, 0.3333880174153083, 0, 0.5001230492776996, 2.316417955235824, 0.6666119825846917, 1, 0.2159036317894472],
[0.5189311924893744, 2.481068807510624, 0, 0, 0.1729770641631249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4573980715407099, 1.999999999999998, 0, 0, 0.1861310452050353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.4582066259626426, 2.541793374037355, 1, 0, 0.1527355419875477, 2.182421517583051, 0, -10.10831313718421, 1, 0.1527355419875477, 0.2159036317894472],
[0.5374791251305358, 1.739648207177028, 0, 0, 0.2360338473412783, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9972493153179244, 2.002750684682072, 0, 1, 0.3324164384393085, 0, 0.4993132733137702, 2.312667319096831, 0.6675835615606915, 1, 0.2159036317894472],
[0.9972482386342144, 2.002751761365782, 0, 1, 0.3324160795447385, 0, 0.4993130048818667, 2.312666075801842, 0.6675839204552615, 1, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9973525206373856, 2.002647479362612, 0, 2, 0.3324508402124621, 0, 0.9986780102889329, 4.6255730022312, 0.4456218807330477, 1, 0.2159036317894472],
[0.8211078104371078, 2.178892189562889, 0, 0, 0.2737026034790362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2159036317894472],
[0.9991957418137937, 2.000634881451468, 1, 1, 0.3330840528343521, 1.000804905538075, 0.4998413300054512, -2.320311017376361, 0.8890550137474427, 0.5552231194161467, 0.2159036317894472],
[0.9999999999999988, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000007, 2.315848028381519, 0.6666666666666667, 1, 0.2159036317894472],
[0.706441252444582, 2.232364377816142, 0, 2, 0.2403837957741724, 0, 0.8959110886532523, 4.149587856525543, 0.5770167777224542, 1, 0.2159036317894472]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1002":{
"Global MG94xREV":0.00118865845999155,
"Nucleotide GTR":0.001213200927057904,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTT", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1031":{
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1057":{
"Global MG94xREV":0.001187976634334925,
"Nucleotide GTR":0.001212505023611667,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "L", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CTA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1067":{
"Global MG94xREV":0.001008812891516368,
"Nucleotide GTR":0.001029642051447077,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATC", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1068":{
"Global MG94xREV":0.0001798117247062506,
"Nucleotide GTR":0.0001835243330628839,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATC", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1080":{
"Global MG94xREV":0.001188323010331224,
"Nucleotide GTR":0.001212858551301885,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "M", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "ATG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1097":{
"Global MG94xREV":0.0006126650187359734,
"Nucleotide GTR":0.0006253148349372922,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "F", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTT", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1098":{
"Global MG94xREV":0.0005754553464697913,
"Nucleotide GTR":0.0005873368871850213,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "F", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTT", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1102":{
"Global MG94xREV":0.001188945954167521,
"Nucleotide GTR":0.001213494357183169,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1105":{
"Global MG94xREV":0.001188611704120216,
"Nucleotide GTR":0.001213153205808819,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1112":{
"Global MG94xREV":0.00118905667934865,
"Nucleotide GTR":0.001213607368529082,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1122":{
"Global MG94xREV":0.001187959911546766,
"Nucleotide GTR":0.001212487955544782,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1128":{
"Global MG94xREV":0.001187983125065671,
"Nucleotide GTR":0.001212511648357817,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGT", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1133":{
"Global MG94xREV":0.001188354053971509,
"Nucleotide GTR":0.001212890235906371,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAT", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1139":{
"Global MG94xREV":0.001188359364951405,
"Nucleotide GTR":0.001212895656543123,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "F", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "TTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1142":{
"Global MG94xREV":0.001188874075887369,
"Nucleotide GTR":0.001213420994817905,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "I", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "ATA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1145":{
"Global MG94xREV":0.001190406826790801,
"Nucleotide GTR":0.001214985392733355,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "L", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "TTA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1148":{
"Global MG94xREV":0.001187765280709013,
"Nucleotide GTR":0.001212289306125504,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "L", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CTT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1151":{
"Global MG94xREV":0.001188232896363455,
"Nucleotide GTR":0.001212766576733144,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "N", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAT", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1155":{
"Global MG94xREV":0.001188472792492399,
"Nucleotide GTR":0.001213011426045063,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "L", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TTG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1160":{
"Global MG94xREV":0.001187765266045757,
"Nucleotide GTR":0.001212289291159493,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAT", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1166":{
"Global MG94xREV":0.001188253492093149,
"Nucleotide GTR":0.001212787597706956,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1181":{
"Global MG94xREV":0.001188253488993807,
"Nucleotide GTR":0.001212787594543622,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1184":{
"Global MG94xREV":0.001188232879408267,
"Nucleotide GTR":0.001212766559427878,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1192":{
"Global MG94xREV":0.001187654925802135,
"Nucleotide GTR":0.001212176672698968,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "L", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TTA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1198":{
"Global MG94xREV":0.00118804914432396,
"Nucleotide GTR":0.001212579030728831,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAT", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1203":{
"Global MG94xREV":0.001188295012459811,
"Nucleotide GTR":0.001212829975352866,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1212":{
"Global MG94xREV":0.001127916274722214,
"Nucleotide GTR":0.001151204585837395,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "S", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "TCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1213":{
"Global MG94xREV":6.052479623084876e-05,
"Nucleotide GTR":6.177446370741214e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "S", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "TCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1218":{
"Global MG94xREV":0.001188190084910103,
"Nucleotide GTR":0.001212722881343219,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "V", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GTT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1222":{
"Global MG94xREV":0.001170107811061411,
"Nucleotide GTR":0.001194267259198652,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1223":{
"Global MG94xREV":1.833890409717141e-05,
"Nucleotide GTR":1.871755108870594e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1229":{
"Global MG94xREV":0.0004710564636258159,
"Nucleotide GTR":0.0004807824598930804,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1230":{
"Global MG94xREV":0.0007166492872101149,
"Nucleotide GTR":0.0007314460872342406,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "L", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CTT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1236":{
"Global MG94xREV":0.001164888790588711,
"Nucleotide GTR":0.001188940480574742,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1239":{
"Global MG94xREV":0.001188333098825143,
"Nucleotide GTR":0.00121286884809494,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "V", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GTT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1241":{
"Global MG94xREV":0.0011883583350061,
"Nucleotide GTR":0.001212894605332332,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "V", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GTT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1247":{
"Global MG94xREV":0.001188424630954825,
"Nucleotide GTR":0.001212962270106666,
"amino-acid": [
["M", "Y", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "TAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1252":{
"Global MG94xREV":0.0009776723686084525,
"Nucleotide GTR":0.0009978585639840601,
"amino-acid": [
["I", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATT", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1257":{
"Global MG94xREV":0.001187956456180666,
"Nucleotide GTR":0.001212484428835054,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "F", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "TTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1262":{
"Global MG94xREV":0.001188597376743048,
"Nucleotide GTR":0.00121313858261145,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "S", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "TCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1270":{
"Global MG94xREV":0.001187765625973724,
"Nucleotide GTR":0.001212289658518964,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTT", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1277":{
"Global MG94xREV":0.001188597349415081,
"Nucleotide GTR":0.00121313855471924,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1280":{
"Global MG94xREV":0.001188253493326803,
"Nucleotide GTR":0.00121278759896608,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTT", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1284":{
"Global MG94xREV":0.001188424577338526,
"Nucleotide GTR":0.001212962215383339,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"Node1286":{
"Global MG94xREV":0.001189045121537303,
"Nucleotide GTR":0.00121359557208131,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1294":{
"Global MG94xREV":0.0008992103120382833,
"Nucleotide GTR":0.0009177764857641515,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1295":{
"Global MG94xREV":0.0001243943765944006,
"Nucleotide GTR":0.0001269627719691575,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1296":{
"Global MG94xREV":0.0001649286824782504,
"Nucleotide GTR":0.000168333997709043,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1300":{
"Global MG94xREV":0.001189854269002321,
"Nucleotide GTR":0.001214421426174582,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1301":{
"Global MG94xREV":0.001189883315010756,
"Nucleotide GTR":0.001214451071901719,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1311":{
"Global MG94xREV":0.001188493803634155,
"Nucleotide GTR":0.001213032871008029,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1361":{
"Global MG94xREV":0.001188389428044174,
"Nucleotide GTR":0.001212926340354532,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1366":{
"Global MG94xREV":0.001189613394061148,
"Nucleotide GTR":0.001214175577840707,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAA", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1370":{
"Global MG94xREV":0.00118796813831646,
"Nucleotide GTR":0.001212496352174222,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1377":{
"Global MG94xREV":0.001187765625534971,
"Nucleotide GTR":0.001212289658071153,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "M", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ATG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1380":{
"Global MG94xREV":0.001187765270368094,
"Nucleotide GTR":0.001212289295571074,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1385":{
"Global MG94xREV":0.001187543954769617,
"Nucleotide GTR":0.001212063410425523,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "R", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CGA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1403":{
"Global MG94xREV":0.001187848870003369,
"Nucleotide GTR":0.001212374621304606,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "R", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CGT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1412":{
"Global MG94xREV":0.001188230545381488,
"Nucleotide GTR":0.001212764177209985,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "M", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ATG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1415":{
"Global MG94xREV":0.001187837643717843,
"Nucleotide GTR":0.001212363163227735,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "H", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "CAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1429":{
"Global MG94xREV":0.001189248703356517,
"Nucleotide GTR":0.001213803357294739,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "S", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "AGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1439":{
"Global MG94xREV":0.000959940400410448,
"Nucleotide GTR":0.0009797604803204532,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAC", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1478":{
"Global MG94xREV":0.001188553698242098,
"Nucleotide GTR":0.001213094002271826,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "I", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "ATT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1482":{
"Global MG94xREV":0.001187629121031811,
"Nucleotide GTR":0.001212150335132433,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "L", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CTT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1485":{
"Global MG94xREV":0.001188311467792104,
"Nucleotide GTR":0.00121284677044167,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAT", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1497":{
"Global MG94xREV":0.0008992103120382833,
"Nucleotide GTR":0.0009177764857641515,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1498":{
"Global MG94xREV":0.0001550656820229312,
"Nucleotide GTR":0.000158267353926395,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1499":{
"Global MG94xREV":0.0001339508247057602,
"Nucleotide GTR":0.0001367165339607766,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node150":{
"Global MG94xREV":0.0011871554212152,
"Nucleotide GTR":0.001211666854741719,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "G", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GGG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1516":{
"Global MG94xREV":0.0009261411558569333,
"Nucleotide GTR":0.0009452633760585001,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAT", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1517":{
"Global MG94xREV":0.0002622515138561228,
"Nucleotide GTR":0.0002676662728962942,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAT", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1530":{
"Global MG94xREV":0.001191491232469764,
"Nucleotide GTR":0.00121609218835153,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "N", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "AAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1536":{
"Global MG94xREV":0.001188519374179711,
"Nucleotide GTR":0.001213058969513713,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "N", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAT", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1546":{
"Global MG94xREV":0.001188642822066815,
"Nucleotide GTR":0.001213184966253835,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "F", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "TTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1549":{
"Global MG94xREV":0.001187978394743758,
"Nucleotide GTR":0.001212506820368009,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1553":{
"Global MG94xREV":0.0009883233600831694,
"Nucleotide GTR":0.001008729468593029,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "F", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "TTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1554":{
"Global MG94xREV":0.0002001598518886468,
"Nucleotide GTR":0.000204292592064507,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "F", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "TTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1561":{
"Global MG94xREV":0.001188805397774901,
"Nucleotide GTR":0.001213350898694822,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "TTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1564":{
"Global MG94xREV":0.001188112016490987,
"Nucleotide GTR":0.001212643201029965,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGT", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1567":{
"Global MG94xREV":0.001188131572254374,
"Nucleotide GTR":0.00121266316056508,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "I", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ATC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1570":{
"Global MG94xREV":0.001188215874781043,
"Nucleotide GTR":0.001212749203702743,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATT", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1574":{
"Global MG94xREV":0.001190888205385716,
"Nucleotide GTR":0.001215476710447629,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "L", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CTA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1581":{
"Global MG94xREV":0.001188444466325606,
"Nucleotide GTR":0.001212982515022281,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "F", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTT", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1586":{
"Global MG94xREV":0.001188464044678501,
"Nucleotide GTR":0.001213002497613314,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "Y", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "TAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1591":{
"Global MG94xREV":0.001188464044678501,
"Nucleotide GTR":0.001213002497613314,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "L", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "TTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1596":{
"Global MG94xREV":0.001188464044678501,
"Nucleotide GTR":0.001213002497613314,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTT", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1601":{
"Global MG94xREV":0.001188464044678501,
"Nucleotide GTR":0.001213002497613314,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1606":{
"Global MG94xREV":0.001188464044678501,
"Nucleotide GTR":0.001213002497613314,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "S", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGT", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1623":{
"Global MG94xREV":0.001188597347450208,
"Nucleotide GTR":0.001213138552713795,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "L", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "TTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node180":{
"Global MG94xREV":0.001188874047818899,
"Nucleotide GTR":0.0012134209661699,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node184":{
"Global MG94xREV":0.001188604432288723,
"Nucleotide GTR":0.001213145783834377,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAT", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node208":{
"Global MG94xREV":0.0004585857915074439,
"Nucleotide GTR":0.0004680543033331614,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node223":{
"Global MG94xREV":0.001188993855351816,
"Nucleotide GTR":0.00121354324739272,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCC", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node281":{
"Global MG94xREV":0.001188232907889506,
"Nucleotide GTR":0.001212766588497175,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "C", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGT", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node284":{
"Global MG94xREV":0.00118776563968482,
"Nucleotide GTR":0.001212289672513155,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "I", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ATT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node290":{
"Global MG94xREV":0.001186505033374825,
"Nucleotide GTR":0.00121100303821456,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTT", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node294":{
"Global MG94xREV":0.001188232880674181,
"Nucleotide GTR":0.00121276656071993,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node297":{
"Global MG94xREV":0.001187765637327006,
"Nucleotide GTR":0.001212289670106659,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "F", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TTC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node301":{
"Global MG94xREV":0.001188232908430121,
"Nucleotide GTR":0.001212766589048954,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "C", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGT", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node304":{
"Global MG94xREV":0.001187765640082419,
"Nucleotide GTR":0.001212289672918965,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "S", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "TCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node307":{
"Global MG94xREV":0.001187765650392609,
"Nucleotide GTR":0.001212289683442032,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "F", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TTC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node311":{
"Global MG94xREV":0.001188232927767837,
"Nucleotide GTR":0.00121276660878594,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "F", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "TTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node316":{
"Global MG94xREV":0.001187765649614933,
"Nucleotide GTR":0.001212289682648298,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "Y", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "TAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node319":{
"Global MG94xREV":0.001187765636921892,
"Nucleotide GTR":0.001212289669693182,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node327":{
"Global MG94xREV":0.001187765639188983,
"Nucleotide GTR":0.001212289672007083,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACT", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node330":{
"Global MG94xREV":0.001187765232200876,
"Nucleotide GTR":0.00121228925661581,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node335":{
"Global MG94xREV":0.001187765271153378,
"Nucleotide GTR":0.001212289296372571,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "S", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "TCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node345":{
"Global MG94xREV":0.001187765616704252,
"Nucleotide GTR":0.001212289649058106,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node353":{
"Global MG94xREV":0.001187765278406845,
"Nucleotide GTR":0.001212289303775803,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "F", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "TTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node364":{
"Global MG94xREV":0.001188525571337909,
"Nucleotide GTR":0.001213065294625864,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node411":{
"Global MG94xREV":0.001188963911807488,
"Nucleotide GTR":0.001213512685598092,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "H", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAT", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node460":{
"Global MG94xREV":0.001188349042505824,
"Nucleotide GTR":0.001212885120967959,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "L", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CTT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node479":{
"Global MG94xREV":0.0009291591035695813,
"Nucleotide GTR":0.0009483436359363662,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTA", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node485":{
"Global MG94xREV":0.001188215793395809,
"Nucleotide GTR":0.001212749120637132,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "L", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "CTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node504":{
"Global MG94xREV":0.001190076826902266,
"Nucleotide GTR":0.001214648579271646,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node511":{
"Global MG94xREV":0.001188796167276679,
"Nucleotide GTR":0.001213341477612672,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "H", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "CAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node531":{
"Global MG94xREV":0.001188712950491816,
"Nucleotide GTR":0.001213256542634342,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "F", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "TTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node535":{
"Global MG94xREV":0.001188693900198021,
"Nucleotide GTR":0.00121323709900535,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "S", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "TCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node539":{
"Global MG94xREV":0.001189055610593142,
"Nucleotide GTR":0.001213606277706768,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node544":{
"Global MG94xREV":0.001188350131719143,
"Nucleotide GTR":0.001212886232670481,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node548":{
"Global MG94xREV":0.001189055614580562,
"Nucleotide GTR":0.001213606281776515,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node553":{
"Global MG94xREV":0.001188564324542743,
"Nucleotide GTR":0.001213104847975809,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node56":{
"Global MG94xREV":0.001188299250316367,
"Nucleotide GTR":0.001212834300709287,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "F", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "TTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node560":{
"Global MG94xREV":0.001189145275743816,
"Nucleotide GTR":0.001213697794191597,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node565":{
"Global MG94xREV":0.001189056688184713,
"Nucleotide GTR":0.001213607377547583,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAT", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node570":{
"Global MG94xREV":0.00118873781427293,
"Nucleotide GTR":0.001213281919782877,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node575":{
"Global MG94xREV":0.001189093394683949,
"Nucleotide GTR":0.001213644841933194,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "ACT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node578":{
"Global MG94xREV":0.001187464011497804,
"Nucleotide GTR":0.001211981816549116,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "V", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "GTA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node582":{
"Global MG94xREV":0.001188350894823446,
"Nucleotide GTR":0.001212887011530751,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATT", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node590":{
"Global MG94xREV":0.001188482878196966,
"Nucleotide GTR":0.00121302171999117,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node593":{
"Global MG94xREV":0.001188971172007205,
"Nucleotide GTR":0.001213520095700592,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "F", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "TTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node596":{
"Global MG94xREV":0.001188354212403573,
"Nucleotide GTR":0.001212890397609612,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node598":{
"Global MG94xREV":0.001188844362148029,
"Nucleotide GTR":0.001213390667573092,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node599":{
"Global MG94xREV":0.001188310619947063,
"Nucleotide GTR":0.001212845905091004,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node607":{
"Global MG94xREV":0.001188253836625165,
"Nucleotide GTR":0.001212787949352591,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "V", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GTT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node613":{
"Global MG94xREV":0.001188181072692314,
"Nucleotide GTR":0.001212713683048382,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "TTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node618":{
"Global MG94xREV":0.001188433004795037,
"Nucleotide GTR":0.001212970816843214,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node625":{
"Global MG94xREV":0.0006741548488107865,
"Nucleotide GTR":0.0006880742577339176,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node626":{
"Global MG94xREV":0.0005134436742450451,
"Nucleotide GTR":0.0005240448476600537,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node640":{
"Global MG94xREV":0.001187765281173376,
"Nucleotide GTR":0.001212289306599455,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "I", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ATA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node641":{
"Global MG94xREV":0.001188673439729034,
"Nucleotide GTR":0.001213216216085001,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "I", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ATA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node645":{
"Global MG94xREV":0.001188140045427607,
"Nucleotide GTR":0.001212671808685601,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCT", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node650":{
"Global MG94xREV":0.001187765272116818,
"Nucleotide GTR":0.001212289297355904,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node656":{
"Global MG94xREV":0.001188597393495425,
"Nucleotide GTR":0.001213138599709718,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node665":{
"Global MG94xREV":0.001187765279103031,
"Nucleotide GTR":0.001212289304486364,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGT", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node669":{
"Global MG94xREV":0.001078044947123324,
"Nucleotide GTR":0.00110030355504255,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "S", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TCA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node670":{
"Global MG94xREV":0.0001105440872262384,
"Nucleotide GTR":0.0001128265129283609,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "S", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TCA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node674":{
"Global MG94xREV":0.00118822563804523,
"Nucleotide GTR":0.001212759168550982,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "V", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GTT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node678":{
"Global MG94xREV":0.00118825370668909,
"Nucleotide GTR":0.001212787816733702,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node683":{
"Global MG94xREV":0.001188253579903518,
"Nucleotide GTR":0.001212787687330363,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node692":{
"Global MG94xREV":0.001138751186657589,
"Nucleotide GTR":0.001162263208349266,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node693":{
"Global MG94xREV":4.969133982887281e-05,
"Nucleotide GTR":5.071732678162775e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node705":{
"Global MG94xREV":0.001188596274228196,
"Nucleotide GTR":0.001213137457332756,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node712":{
"Global MG94xREV":0.001090409536050503,
"Nucleotide GTR":0.001112923438090579,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node713":{
"Global MG94xREV":9.806995630023438e-05,
"Nucleotide GTR":0.000100094826146123,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node719":{
"Global MG94xREV":0.001141250236098944,
"Nucleotide GTR":0.001164813856160275,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "F", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "TTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node720":{
"Global MG94xREV":4.746123965880967e-05,
"Nucleotide GTR":4.844118129087697e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "F", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "TTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node724":{
"Global MG94xREV":0.001142219603618437,
"Nucleotide GTR":0.001165803238403276,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "L", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TTA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node725":{
"Global MG94xREV":4.622332883418878e-05,
"Nucleotide GTR":4.717771107584501e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "L", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TTA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node730":{
"Global MG94xREV":0.001188597348940184,
"Nucleotide GTR":0.001213138554234536,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "V", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GTA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node731":{
"Global MG94xREV":0.0011889711868719,
"Nucleotide GTR":0.001213520110872201,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "V", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GTA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node736":{
"Global MG94xREV":0.00113464897389867,
"Nucleotide GTR":0.001158076296389588,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node737":{
"Global MG94xREV":5.380153410636633e-05,
"Nucleotide GTR":5.491238505587646e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node741":{
"Global MG94xREV":0.001188597342871472,
"Nucleotide GTR":0.001213138548040521,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "L", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TTG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node746":{
"Global MG94xREV":0.001134369412269479,
"Nucleotide GTR":0.001157790962595972,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node747":{
"Global MG94xREV":5.408396121103356e-05,
"Nucleotide GTR":5.520064348901042e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node751":{
"Global MG94xREV":0.001136200689768488,
"Nucleotide GTR":0.001159660050844849,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node752":{
"Global MG94xREV":5.224149162665853e-05,
"Nucleotide GTR":5.332013206956054e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node756":{
"Global MG94xREV":0.001132916210701686,
"Nucleotide GTR":0.001156307756487078,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCT", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node757":{
"Global MG94xREV":5.553450159378437e-05,
"Nucleotide GTR":5.668113346684699e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCT", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node763":{
"Global MG94xREV":0.001187765277136639,
"Nucleotide GTR":0.001212289302479372,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "F", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "TTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node769":{
"Global MG94xREV":0.00118883451063716,
"Nucleotide GTR":0.001213380612656126,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "T", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "ACT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node777":{
"Global MG94xREV":0.001187756056934115,
"Nucleotide GTR":0.001212279891905497,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node782":{
"Global MG94xREV":0.0004523860289928529,
"Nucleotide GTR":0.0004617265330918307,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node783":{
"Global MG94xREV":0.0007353384568046397,
"Nucleotide GTR":0.0007505211358215206,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node788":{
"Global MG94xREV":0.001188253492216289,
"Nucleotide GTR":0.001212787597832638,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATT", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node793":{
"Global MG94xREV":0.00118794337148259,
"Nucleotide GTR":0.001212471073974619,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node795":{
"Global MG94xREV":0.001188357113394156,
"Nucleotide GTR":0.001212893358497523,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node804":{
"Global MG94xREV":0.001038330739456292,
"Nucleotide GTR":0.001059769360250082,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node805":{
"Global MG94xREV":0.0001500658171696607,
"Nucleotide GTR":0.0001531642558714709,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node810":{
"Global MG94xREV":0.001188253861328361,
"Nucleotide GTR":0.00121278797456584,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGT", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node815":{
"Global MG94xREV":0.001188253836129052,
"Nucleotide GTR":0.001212787948846235,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTT", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node821":{
"Global MG94xREV":0.001129586271304849,
"Nucleotide GTR":0.001152909063170819,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGT", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node822":{
"Global MG94xREV":5.893867147056644e-05,
"Nucleotide GTR":6.015558991449966e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGT", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node832":{
"Global MG94xREV":0.001188711592948481,
"Nucleotide GTR":0.001213255157061539,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "S", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "TCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node835":{
"Global MG94xREV":0.001003289334590648,
"Nucleotide GTR":0.001024004448545577,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "R", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "AGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node836":{
"Global MG94xREV":0.0001861388058268773,
"Nucleotide GTR":0.0001899820506827707,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "R", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "AGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node840":{
"Global MG94xREV":0.0009260673503645226,
"Nucleotide GTR":0.0009451880466894452,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "S", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "TCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node841":{
"Global MG94xREV":0.0002626603454690628,
"Nucleotide GTR":0.0002680835457366634,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "S", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "TCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node850":{
"Global MG94xREV":0.001187945205500682,
"Nucleotide GTR":0.001212472945860046,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node855":{
"Global MG94xREV":0.001188232879962779,
"Nucleotide GTR":0.00121276655999384,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node859":{
"Global MG94xREV":0.001161267435300777,
"Nucleotide GTR":0.001185244354445661,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "F", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "TTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node860":{
"Global MG94xREV":2.744645602970404e-05,
"Nucleotide GTR":2.801314845302799e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "F", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "TTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node866":{
"Global MG94xREV":0.00118832748905391,
"Nucleotide GTR":0.001212863122497647,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node878":{
"Global MG94xREV":0.0009200784905344447,
"Nucleotide GTR":0.0009390755336821982,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "L", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CTT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node879":{
"Global MG94xREV":0.0002682953889479941,
"Nucleotide GTR":0.0002738349370763586,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "L", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CTT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node886":{
"Global MG94xREV":0.0004870621282205035,
"Nucleotide GTR":0.0004971185966203546,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node887":{
"Global MG94xREV":0.0005758004579800533,
"Nucleotide GTR":0.0005876891242811097,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node892":{
"Global MG94xREV":0.001188253851782921,
"Nucleotide GTR":0.001212787964823313,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "S", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "TCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node897":{
"Global MG94xREV":0.00096421168892502,
"Nucleotide GTR":0.0009841199589764574,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node898":{
"Global MG94xREV":0.0002241282812586498,
"Nucleotide GTR":0.0002287559023513127,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node905":{
"Global MG94xREV":0.001188280593766321,
"Nucleotide GTR":0.001212815258953749,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "E", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "GAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node909":{
"Global MG94xREV":3.059722744687468e-05,
"Nucleotide GTR":3.122897447279665e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node910":{
"Global MG94xREV":0.001156957826457538,
"Nucleotide GTR":0.001180845764253563,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "Y", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "TAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node911":{
"Global MG94xREV":0.001188493783812483,
"Nucleotide GTR":0.001213032850777095,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "H", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "CAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node923":{
"Global MG94xREV":0.001188187392917705,
"Nucleotide GTR":0.001212720133768721,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "F", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "TTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node927":{
"Global MG94xREV":0.001187902820039365,
"Nucleotide GTR":0.001212429685257699,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "N", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAC", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node936":{
"Global MG94xREV":0.001038147919294949,
"Nucleotide GTR":0.001059582765364595,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node937":{
"Global MG94xREV":0.0001505358694999109,
"Nucleotide GTR":0.0001536440134654473,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node94":{
"Global MG94xREV":0.001188188835435404,
"Nucleotide GTR":0.001212721606070371,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "A", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "GCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node943":{
"Global MG94xREV":0.0011886201490759,
"Nucleotide GTR":0.001213161825129178,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "V", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GTA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node954":{
"Global MG94xREV":0.001188500279409049,
"Nucleotide GTR":0.001213039480489533,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCT", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node980":{
"Global MG94xREV":0.001188609333808906,
"Nucleotide GTR":0.001213150786557221,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node990":{
"Global MG94xREV":0.001189420583887479,
"Nucleotide GTR":0.001213978786677126,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node994":{
"Global MG94xREV":0.0011923859494216,
"Nucleotide GTR":0.001217005378701792,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "I", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "ATC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229105363267331,
"Nucleotide GTR":0.001212850670684702,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "G", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GGA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002462168229462981,
"Nucleotide GTR":0.002429606507048683,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "V", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "V", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GTG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GTC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228601012991264,
"Nucleotide GTR":0.001212352990348364,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "CTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001244059635560914,
"Nucleotide GTR":0.001227607175475032,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "-", "-", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "Y", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "NNN", "NNN", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TAT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229759234913918,
"Nucleotide GTR":0.001213495894998912,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Q", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAA", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229543237604679,
"Nucleotide GTR":0.001213282754214399,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "L", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TTG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002364503604057089,
"Nucleotide GTR":0.0002333233478368033,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAC", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228333806153797,
"Nucleotide GTR":0.001212089317272222,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTG", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "S", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "AGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTK", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "PL", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CYT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001294667909763191,
"Nucleotide GTR":0.001277546164550192,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "-", "-", "-", "-", "-", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACG", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229941828984187,
"Nucleotide GTR":0.001213676074296153,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "K", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "AAA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "L", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TTA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "A", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "GCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229589052906646,
"Nucleotide GTR":0.001213327963617415,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "V", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GTT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416423_Connecticut_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "H", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "CAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416423_Connecticut_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229127042166339,
"Nucleotide GTR":0.001212872062884256,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "V", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GTT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "M", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ATG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KQE", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "SG", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "NAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "RGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229469119200506,
"Nucleotide GTR":0.001213209616012501,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTC", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "LF", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "YTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCW", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002460443057549629,
"Nucleotide GTR":0.002427904150216888,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "C", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "F", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "TGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TTC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228334002483171,
"Nucleotide GTR":0.001212089511005177,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "V", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "GTC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229946480257671,
"Nucleotide GTR":0.0012136806640574,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "M", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ATG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229885296965787,
"Nucleotide GTR":0.001213620289903308,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACT", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229212145444093,
"Nucleotide GTR":0.001212956040686799,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "F", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "TTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "HY", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "YAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229941530769589,
"Nucleotide GTR":0.001213675780025388,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "I", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "ATT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418300_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229110125402953,
"Nucleotide GTR":0.001212855369841957,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418300_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229070834014073,
"Nucleotide GTR":0.001212816598074475,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00123008009447904,
"Nucleotide GTR":0.001213812511255244,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "H", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CAT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418698_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "RI", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "TI", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AKA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "AYT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418698_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418713_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001231707222926155,
"Nucleotide GTR":0.001215418121227628,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCT", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418713_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418728_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "AV", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GYT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418728_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418730_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229704998471318,
"Nucleotide GTR":0.001213442375823299,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418730_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418738_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00123171110294042,
"Nucleotide GTR":0.001215421949929416,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATT", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418738_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229767505112754,
"Nucleotide GTR":0.001213504055825888,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "P", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "CCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229615697848943,
"Nucleotide GTR":0.001213354256185246,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "F", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "P", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "TTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CCA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229228412879982,
"Nucleotide GTR":0.001212972092988838,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "V", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GTC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230389594432831,
"Nucleotide GTR":0.001214117918129016,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "Y", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TAT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229572943215865,
"Nucleotide GTR":0.001213312066974335,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "D", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GAT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229457748007076,
"Nucleotide GTR":0.001213198395201015,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "Y", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "TAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229783764367999,
"Nucleotide GTR":0.001213520100055471,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001230671094307171,
"Nucleotide GTR":0.001214395695219242,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCA", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "HD", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "SAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "LF", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "YTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "HY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCY", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "YAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "GV", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GKA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAY", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTY", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KQ", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "MAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229730929302059,
"Nucleotide GTR":0.001213467963723569,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "D", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "GAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAY", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "PS", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "YCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229469120660094,
"Nucleotide GTR":0.001213209617452787,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGC", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "NK", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAS", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAY", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAR", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229295382543178,
"Nucleotide GTR":0.001213038176990542,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228527984212325,
"Nucleotide GTR":0.001212280927361605,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAG", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230030631615592,
"Nucleotide GTR":0.001213763702529074,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTA", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230117863610361,
"Nucleotide GTR":0.001213849780896742,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAT", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420291_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001227986949999248,
"Nucleotide GTR":0.001211747048226584,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "N", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAT", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420291_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229609306215902,
"Nucleotide GTR":0.001213347949080378,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "TI", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "AYT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420518_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "PL", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "TS", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CYT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "AST", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122960516636652,
"Nucleotide GTR":0.001213343863979743,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "V", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GTT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420671_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "SL"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TYG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_420671_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420685_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "SF", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TYC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420685_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420704_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229166040865597,
"Nucleotide GTR":0.001212910545832881,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "V", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "GTA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420704_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "YTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420706_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229946054799517,
"Nucleotide GTR":0.001213680244225851,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "V", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GTC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "PL", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CYT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228596424085912,
"Nucleotide GTR":0.00121234846213044,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "L", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TTG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230175591880946,
"Nucleotide GTR":0.001213906745721556,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "Y", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TAT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "S", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TCA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00122856985122477,
"Nucleotide GTR":0.001212322240690504,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGT", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0012297348317759,
"Nucleotide GTR":0.001213471814587909,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "T", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "ACT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228570054412663,
"Nucleotide GTR":0.001212322441191276,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "A", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GCT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAT", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421663_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001241112624705659,
"Nucleotide GTR":0.001224699138296828,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "A", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "F", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "GCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTC", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421663_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229489095833797,
"Nucleotide GTR":0.001213229328458487,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGC", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCY", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421775_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "L", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TTG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421827_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421830_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "HY", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "YAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421830_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "KE", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "RAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421860_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228921057817079,
"Nucleotide GTR":0.001212668802640165,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "M", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ATG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421866_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "QP", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CMA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421871_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTY", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421872_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "F", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTT", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421893_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00123887308260485,
"Nucleotide GTR":0.001222489213728789,
"amino-acid": [
["IM", "D", "MLV", "F", "M", "R", "I", "LF", "T", "I", "G", "TPAS", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATN", "GAT", "NTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTN", "ACA", "ATA", "GGA", "NCT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[3, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421932_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "AS", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "KCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421932_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421956_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229127042166339,
"Nucleotide GTR":0.001212872062884256,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "Y", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "TAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421956_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["IM", "DY", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATN", "KAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421963_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421972_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "PL", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CYT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421972_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229530208493402,
"Nucleotide GTR":0.001213269897410725,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "Y", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "TAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421990_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422006_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229083550076532,
"Nucleotide GTR":0.001212829145969343,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAT", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422006_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229041976836748,
"Nucleotide GTR":0.001212788122528018,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "HY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "YAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229389269712856,
"Nucleotide GTR":0.001213130822519655,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "P", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "CCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122942116482202,
"Nucleotide GTR":0.001213162295821859,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTC", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001268225564663918,
"Nucleotide GTR":0.001251453514606109,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGC", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228559343871688,
"Nucleotide GTR":0.001212311872295237,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "L", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CTT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "F", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "TTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "VF", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "KTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "PL", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGY", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CYA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422436_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "H", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAT", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228798554036563,
"Nucleotide GTR":0.001212547918949637,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCT", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122833380614822,
"Nucleotide GTR":0.001212089317266722,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTG", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.02257185122700319,
"Nucleotide GTR":0.02227334264207569,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "P", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "F", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "S", "F", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "F", "H", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "G", "I", "N", "F", "V", "E", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "-", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "T", "N", "A", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CCA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTT", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TCG", "TTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGT", "CTG", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "TTT", "CAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "GGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "GAA", "ATA", "ATT", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTG", "NNN", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "ACA", "AAT", "GCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229683331701769,
"Nucleotide GTR":0.001213420995592795,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACA", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002492546525867255,
"Nucleotide GTR":0.002459583056064985,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "L", "T", "-", "-", "-", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTA", "ACT", "NNN", "NNN", "NNN", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423047_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229095565681179,
"Nucleotide GTR":0.001212841002669828,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "P", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "CCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423047_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229397105837526,
"Nucleotide GTR":0.001213138555013015,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "S", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "TCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423060_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423080_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001230885499018541,
"Nucleotide GTR":0.0012146072644677,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "I", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "H", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "ATC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "CAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423080_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423166_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCY", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423166_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423175_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229802423203439,
"Nucleotide GTR":0.001213538512131243,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423175_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423239_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["MV", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["RTG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423239_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423290_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "PS", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "PL", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "YCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CYT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423290_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423291_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "DY", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "AS", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "KAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "KCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423291_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423309_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "IV", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "RTA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423309_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229397152026288,
"Nucleotide GTR":0.001213138600590939,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "F", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTT", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423319_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423338_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "V", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GTT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423338_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423340_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "VL", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "TI", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "KTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "AYA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423340_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423341_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "VL", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "KTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423341_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001227921195754931,
"Nucleotide GTR":0.001211682163570065,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "R", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CGA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423363_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423364_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACK", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423364_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423396_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTT", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423396_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423410_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGT", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423410_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423431_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCR", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423431_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423505_England_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "TI", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "AYA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423505_England_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423517_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002461535628324545,
"Nucleotide GTR":0.002428982271944062,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "F", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "TTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423517_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "PS", "S", "D", "CF", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "YCT", "TCA", "GAT", "TKT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423531_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "KE", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "RAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423558_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423561_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "F", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "TTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423561_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423564_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "LF", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "EG", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "ACT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "YTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GRA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423564_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "MI", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "LF", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATK", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "YTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423567_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423572_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTK", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423572_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTK", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423575_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423586_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423586_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423619_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCY", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423619_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423633_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "CF", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "ILVF", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAY", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TKT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "NTY", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423633_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00123102612506505,
"Nucleotide GTR":0.001214746030760584,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "AS", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAY", "KCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAC", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423659_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423663_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "AV", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GYC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423663_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACK", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423687_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423712_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "GV", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GKT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423712_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423726_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "DY", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "KAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423726_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "TI", "QE", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "AYT", "SAR", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423802_England_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423821_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "KR", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "ARA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423821_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423840_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "DY", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "KAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423840_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423846_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "WC", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGK", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423846_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTW", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423863_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423876_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229488677603565,
"Nucleotide GTR":0.001213228915759274,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "CGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423876_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423897_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "VF", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "KTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423897_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "TI", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "AYA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423913_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423914_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "LF", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTK", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423914_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423919_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423919_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423926_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228495281359029,
"Nucleotide GTR":0.001212248656997537,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423926_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423952_England_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "TI", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "AYA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423952_England_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423957_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "LF"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTK"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_423957_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423995_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002462058747434497,
"Nucleotide GTR":0.002429498472899906,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "A", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GCT", "GCA", "CTC", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423995_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423998_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001241446479002709,
"Nucleotide GTR":0.001225028577432146,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "E", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "GAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423998_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424021_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATY", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424021_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424037_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002460328518741508,
"Nucleotide GTR":0.002427791126163458,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "I", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATT", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAT", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424037_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424115_England_20200312_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "AS", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "KCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424115_England_20200312_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424122_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "TPAS", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "RG", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "AS", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "NCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "NGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "KCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424122_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCM", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424154_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229389269712856,
"Nucleotide GTR":0.001213130822519655,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGC", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001228570054322542,
"Nucleotide GTR":0.001212322441102346,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAT", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229621069210647,
"Nucleotide GTR":0.001213359556511678,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228798555226857,
"Nucleotide GTR":0.001212547920124189,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424305_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002472273372173342,
"Nucleotide GTR":0.002439578011103507,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "-", "L", "I", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "NNN", "CTT", "ATT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424305_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001231974925113765,
"Nucleotide GTR":0.001215682283102997,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTA", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29":{
"Global MG94xREV":0.001228334002163688,
"Nucleotide GTR":0.00121208951068992,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "C", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TGT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229226852041768,
"Nucleotide GTR":0.001212970552792421,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "R", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CGC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228974523317383,
"Nucleotide GTR":0.001212721561069051,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "C", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TGT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122959060672325,
"Nucleotide GTR":0.001213329496885079,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122879854733483,
"Nucleotide GTR":0.001212547912336532,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "I", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ATT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230575052806583,
"Nucleotide GTR":0.001214300923849853,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAY", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229148951532466,
"Nucleotide GTR":0.001212893682503042,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAT", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425280_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229767504471245,
"Nucleotide GTR":0.001213504055192865,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACC", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425280_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425439_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229683281826576,
"Nucleotide GTR":0.001213420946377195,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "I", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "ATT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425439_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425585_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425602_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228846893378091,
"Nucleotide GTR":0.001212595619012256,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425602_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425639_England_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229155087919378,
"Nucleotide GTR":0.001212899737737364,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425639_England_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001239971039013802,
"Nucleotide GTR":0.001223572649865981,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "E", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "GAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001241636984983536,
"Nucleotide GTR":0.001225216564006381,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "H", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "CAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "AV", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GYT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATC", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230504059055739,
"Nucleotide GTR":0.00121423086897832,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGA", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229602658393649,
"Nucleotide GTR":0.001213341389174353,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "S", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "TCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229735050795675,
"Nucleotide GTR":0.001213472030711189,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "CTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228738395605707,
"Nucleotide GTR":0.001212488556102973,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "L", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TTA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002461201288153332,
"Nucleotide GTR":0.002428652353360183,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "F", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTT", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "TTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003710203546528555,
"Nucleotide GTR":0.003661136786371006,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "NTSIHPRLDAGVYCF", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "H", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "NNT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "CAC", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 24, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229946481517135,
"Nucleotide GTR":0.001213680665300206,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "L", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CTA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229119100012499,
"Nucleotide GTR":0.00121286422576394,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "S", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "TCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001231711104706508,
"Nucleotide GTR":0.001215421951672148,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCT", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229626462713019,
"Nucleotide GTR":0.001213364878685972,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATC", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001229135169734446,
"Nucleotide GTR":0.001212880082966768,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00123328090225229,
"Nucleotide GTR":0.001216970988933837,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "K", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "AAG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229085499591792,
"Nucleotide GTR":0.001212831069702624,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229941809026274,
"Nucleotide GTR":0.00121367605460218,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "I", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "ATT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001236535472203344,
"Nucleotide GTR":0.001220182517795311,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "EDAGV", "-", "NHDY", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "S", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GNN", "NNN", "NAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "TCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228690826914362,
"Nucleotide GTR":0.001212441616498834,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "F", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTT", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229783760603904,
"Nucleotide GTR":0.001213520096341154,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "F", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TTC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228567781841509,
"Nucleotide GTR":0.001212320198674457,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "F", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "TTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230124958775357,
"Nucleotide GTR":0.001213856782229485,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229447647407594,
"Nucleotide GTR":0.001213188428180105,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "F", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "TTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229127043600907,
"Nucleotide GTR":0.001212872064299851,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "C", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGT", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230867139988342,
"Nucleotide GTR":0.001214589148232304,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "PL", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGT", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CYT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002471117006612213,
"Nucleotide GTR":0.002438436938264446,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "IM", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "F", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "AT-", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "TTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228569852687987,
"Nucleotide GTR":0.001212322242134372,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAT", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001231504005534431,
"Nucleotide GTR":0.001215217591348568,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "K", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "AAA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229768001295666,
"Nucleotide GTR":0.001213504545446873,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "I", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "ATT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229272303358788,
"Nucleotide GTR":0.001213015403024124,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "C", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGT", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229421164861658,
"Nucleotide GTR":0.001213162295860973,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATC", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229221005302181,
"Nucleotide GTR":0.001212964783374892,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "T", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ACT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001229767298462757,
"Nucleotide GTR":0.0012135038519088,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAC", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "LV", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "STT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "TI", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "AYA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001229005078079977,
"Nucleotide GTR":0.001212751711750525,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTT", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "I", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "ATA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228798557710537,
"Nucleotide GTR":0.001212547922575023,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACT", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229166109323459,
"Nucleotide GTR":0.001212910613385401,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTG", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229767122631881,
"Nucleotide GTR":0.001213503678403254,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAC", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00123090110536945,
"Nucleotide GTR":0.001214622664427487,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "T", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "ACT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228874088028169,
"Nucleotide GTR":0.001212622454018083,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001228333806171502,
"Nucleotide GTR":0.001212089317289694,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "E", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "GAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228925569361769,
"Nucleotide GTR":0.001212673254520506,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001229767299007952,
"Nucleotide GTR":0.001213503852446784,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAC", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229212145669405,
"Nucleotide GTR":0.00121295604090913,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCT", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "G", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GGG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "H", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "CAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00123001892366069,
"Nucleotide GTR":0.001213752149409726,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "L", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "CTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001228537296788761,
"Nucleotide GTR":0.00121229011678093,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "V", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "GTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229161246908721,
"Nucleotide GTR":0.001212905815275204,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "M", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATG", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228997619373534,
"Nucleotide GTR":0.001212744351684105,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122862386434262,
"Nucleotide GTR":0.001212375539494796,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230058030613743,
"Nucleotide GTR":0.00121379073918051,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "L", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CTG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228464933746398,
"Nucleotide GTR":0.001212218710726507,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "V", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "GTA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAY", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "V", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GTA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "S", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "TCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429010_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "S", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGT", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429010_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429020_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229161247620884,
"Nucleotide GTR":0.00121290581597795,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACG", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429020_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122959806822666,
"Nucleotide GTR":0.001213336859711478,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "A", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "GCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229767504471245,
"Nucleotide GTR":0.001213504055192865,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "P", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "CCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229064931427868,
"Nucleotide GTR":0.001212810773548888,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001230040748379207,
"Nucleotide GTR":0.00121377368550035,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "L", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "CTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229522605374393,
"Nucleotide GTR":0.001213262394841567,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "C", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGT", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229175699788105,
"Nucleotide GTR":0.001212920077017913,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "S", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AGT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229041852701279,
"Nucleotide GTR":0.001212788000034217,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "I", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ATA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229793307297895,
"Nucleotide GTR":0.001213529516781871,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "C", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TGC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228798570905808,
"Nucleotide GTR":0.001212547935595789,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "F", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "TTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230489948816736,
"Nucleotide GTR":0.001214216945344633,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "P", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "CCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001229127042440717,
"Nucleotide GTR":0.001212872063155005,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "L", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CTT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230179420446039,
"Nucleotide GTR":0.001213910523654578,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "T", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "ACA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229679288231927,
"Nucleotide GTR":0.001213417005597101,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATT", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229226852156851,
"Nucleotide GTR":0.001212970552905983,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAG", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122879856747137,
"Nucleotide GTR":0.00121254793220677,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228798570844464,
"Nucleotide GTR":0.001212547935535256,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "TTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122940619716299,
"Nucleotide GTR":0.00121314752610737,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "T", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ACA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001276078804030545,
"Nucleotide GTR":0.001259202896325134,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGG", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002694476388841092,
"Nucleotide GTR":0.0002658842433705356,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTA", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229126520229405,
"Nucleotide GTR":0.001212871547849841,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "F", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTT", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "I", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "ATT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00122912704344896,
"Nucleotide GTR":0.001212872064149915,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "C", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "TGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228798556166785,
"Nucleotide GTR":0.001212547921051686,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229783772482068,
"Nucleotide GTR":0.001213520108062232,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "C", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGT", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00123532389130366,
"Nucleotide GTR":0.0012189869598304,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "T", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "-", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "ACT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "NNN", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001242057324451933,
"Nucleotide GTR":0.001225631344562544,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "L", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228779811468548,
"Nucleotide GTR":0.001212529424248639,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "Y", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "TAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230010121048805,
"Nucleotide GTR":0.001213743463210765,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "S", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TCC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7":{
"Global MG94xREV":0.00122969430642793,
"Nucleotide GTR":0.001213431825180219,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAC", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001239966467151964,
"Nucleotide GTR":0.001223568138466177,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "AV", "G", "L", "E", "A", "PL", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "YSCF", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "GV", "T", "TI", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "TI", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GYT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CYT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGY", "CGN", "TNC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GKC", "ACA", "AYA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "AYC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "LF", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "EA", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "LF", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACN", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTK", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GMA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "YTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCM", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "YAG", "CTG", "TAC", "TMA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "VF", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "KTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228919135125805,
"Nucleotide GTR":0.001212666905376131,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "F", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "TTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "VF", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "KTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGY", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "QH", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAK", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "HL", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CWT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "LF", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "PS", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "YTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "YCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "AV", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GYT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "GC", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "KNTRSIM", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTY", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "KGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "YAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "ANN", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "LF", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "LF", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "ILVF", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "YTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "YTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "NTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "GC", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "KGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001228717522918224,
"Nucleotide GTR":0.001212467959452947,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "R", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AGG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "PR", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CST", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "HY", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "YAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "HY", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "YAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCY", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001229153664073026,
"Nucleotide GTR":0.001212898332721119,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "L", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TTG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "SL", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TYG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "PLSF", "Y", "L", "Y", "TPAS", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "LF", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "YYC", "TAT", "CTT", "TAT", "NCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "YTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "NHDY", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGY", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "NAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["TM", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "QH", "-", "KQE", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "ILVF", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "SRGC", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["AYG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAN", "NNN", "NAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "NTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "NGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228914603872355,
"Nucleotide GTR":0.001212662434047673,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "P", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "CCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "SF", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "PL", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TYC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CYA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228606074775075,
"Nucleotide GTR":0.001212357985191013,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "V", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GTT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001240699947717701,
"Nucleotide GTR":0.001224291918886208,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "G", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GGT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "TI", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "AYT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228334000284594,
"Nucleotide GTR":0.001212089508835674,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "R", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AGG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "F", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "TTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "R", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "AGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122871752344344,
"Nucleotide GTR":0.001212467959971218,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACG", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230389455399191,
"Nucleotide GTR":0.001214117780934069,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "Y", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TAC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431089_Connecticut_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228570054312221,
"Nucleotide GTR":0.001212322441092163,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCT", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431089_Connecticut_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431911_Wales_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "AS", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "KCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431911_Wales_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431943_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228075231663166,
"Nucleotide GTR":0.00121183416238172,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "L", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "TTA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431943_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431959_Wales_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001233876451575513,
"Nucleotide GTR":0.001217558662226692,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "F", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTT", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TTT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431959_Wales_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "L", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CTA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001241013754069436,
"Nucleotide GTR":0.001224601575206603,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "T", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "ACT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432036_Wales_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229024355589019,
"Nucleotide GTR":0.001212770734318053,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "V", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GTT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432036_Wales_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432064_Wales_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "SL", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TYA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432064_Wales_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432068_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "SL", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TYA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432068_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "PL", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CYT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432190_Wales_20200323_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "HY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "YAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432190_Wales_20200323_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "LF", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "YTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432269_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229695053182189,
"Nucleotide GTR":0.00121343256205879,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "L", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CTT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432269_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432279_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "MI", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATK", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432279_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432288_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTK", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432288_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432411_Wales_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "C", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGT", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432411_Wales_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432425_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "WC", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGK", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432425_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432443_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00123725593435814,
"Nucleotide GTR":0.001220893451970493,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "-", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "NNN", "GTT", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432443_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432472_England_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432472_England_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432529_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228148365410934,
"Nucleotide GTR":0.001211906328949108,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "I", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ATT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432529_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432692_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAT", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432692_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432744_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122906311781761,
"Nucleotide GTR":0.001212808983923292,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "S", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "TCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432744_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432755_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229127041902499,
"Nucleotide GTR":0.001212872062623905,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "I", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "ATA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432755_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432780_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "V", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GTT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432780_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432813_England_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGT", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432813_England_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432815_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "N", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAT", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432815_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432954_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228862715765629,
"Nucleotide GTR":0.001212611232151625,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "V", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GTT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432954_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432960_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432960_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432966_England_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432966_England_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432979_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229000136581595,
"Nucleotide GTR":0.00121274683560255,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432979_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433035_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00123005487674446,
"Nucleotide GTR":0.001213787627020568,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "V", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GTA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433035_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433037_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "L", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CTT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433037_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433154_Scotland_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229127043503547,
"Nucleotide GTR":0.00121287206420378,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433154_Scotland_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433358_Scotland_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001228570054412663,
"Nucleotide GTR":0.001212322441191276,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "L", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CTT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433358_Scotland_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433407_Scotland_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229767504471245,
"Nucleotide GTR":0.001213504055192865,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "T", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ACG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433407_Scotland_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433409_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433409_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433410_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122908886806632,
"Nucleotide GTR":0.001212834393629694,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "L", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TTG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433410_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433419_Scotland_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229019158331447,
"Nucleotide GTR":0.001212765605793257,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "S", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "TCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433419_Scotland_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433442_Scotland_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229885297890191,
"Nucleotide GTR":0.001213620290815489,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "H", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAT", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433442_Scotland_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCT", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433523_Scotland_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433523_Scotland_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433530_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "RG", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "RGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433530_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433561_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122861710194546,
"Nucleotide GTR":0.001212368866529097,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "TTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433561_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433645_Scotland_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228334002465463,
"Nucleotide GTR":0.001212089510987704,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "G", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GGA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433645_Scotland_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433764_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "V", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GTT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433764_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433841_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "I", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ATT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433841_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433870_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229481725781992,
"Nucleotide GTR":0.001213222055874265,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "S", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TCG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433870_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433876_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "R", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CGT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433876_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433929_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229126520271094,
"Nucleotide GTR":0.001212871547890979,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "M", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "ATG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433929_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434006_England_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229528545954358,
"Nucleotide GTR":0.001213268256858452,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434006_England_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434135_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229767122435391,
"Nucleotide GTR":0.001213503678209364,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "T", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ACC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434135_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434168_Washington_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230202858010977,
"Nucleotide GTR":0.001213933651262027,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "V", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GTA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGC", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434168_Washington_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434214_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229161247712198,
"Nucleotide GTR":0.001212905816068055,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "E", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAG", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434214_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434216_Washington_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228779809734152,
"Nucleotide GTR":0.001212529422537181,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGT", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434216_Washington_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434269_Washington_20200330_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434269_Washington_20200330_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434305_Washington_20200331_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434305_Washington_20200331_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434356_Ghent_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230389594021273,
"Nucleotide GTR":0.001214117917722901,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "N", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "AAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434356_Ghent_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228806469792109,
"Nucleotide GTR":0.001212555730020769,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "R", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CGA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434464_Athens_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229593185527838,
"Nucleotide GTR":0.001213332041585451,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434464_Athens_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434528_Louisiana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228798553000139,
"Nucleotide GTR":0.001212547917926918,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "S", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "TCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434528_Louisiana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001232223354884766,
"Nucleotide GTR":0.001215927427435923,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCT", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001231974925196161,
"Nucleotide GTR":0.001215682283184304,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATA", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434555_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229161249327761,
"Nucleotide GTR":0.001212905817662254,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "W", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TGG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434555_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434558_Manila_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "F", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TTC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434558_Manila_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434593_Virginia_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "I", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ATA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434593_Virginia_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434662_Vastra_Gotaland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001233368580706692,
"Nucleotide GTR":0.001217057507856789,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "N", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "AAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434662_Vastra_Gotaland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434665_Uppsala_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228464933606212,
"Nucleotide GTR":0.001212218710588174,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "C", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TGT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434665_Uppsala_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229148685659392,
"Nucleotide GTR":0.00121289342014609,
"amino-acid": [
["M", "Y", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "TAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434848_Texas_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229732135224491,
"Nucleotide GTR":0.001213469153697899,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "L", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACC", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CTT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434848_Texas_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434912_Texas_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228465136245022,
"Nucleotide GTR":0.001212218910547124,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434912_Texas_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434919_Texas_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229783756670639,
"Nucleotide GTR":0.001213520092459906,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434919_Texas_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229575918913868,
"Nucleotide GTR":0.001213315003319277,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "A", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GCA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434940_Texas_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230011701727627,
"Nucleotide GTR":0.0012137450229854,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACT", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434940_Texas_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434943_Texas_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229380739684258,
"Nucleotide GTR":0.001213122405299116,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "I", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ATA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434943_Texas_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434967_Texas_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCT", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434967_Texas_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00123090222615269,
"Nucleotide GTR":0.001214623770388575,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "R", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "AGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001242408542592319,
"Nucleotide GTR":0.001225977917907561,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "ILVF", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "-", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KN", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "ED", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "L", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "AC-", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CT-", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CC-", "TTT", "-TC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTT", "NNN", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AA-", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GA-", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CTG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.008900112413825038,
"Nucleotide GTR":0.008782410062536793,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "-", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "K", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "-", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "YSCWLF", "-", "NHDY", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "I", "L", "K", "Y", "K", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "NNN", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "AAG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "NNN", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TNN", "NNN", "NAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACA", "NNN", "ATC", "TTA", "AAA", "TAC", "AAA", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 14, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1.5, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435061_Delhi_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "TTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435061_Delhi_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435071_Delhi_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "DA", "SL", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GMT", "TNA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435071_Delhi_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435072_Delhi_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "TA", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "RCT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435072_Delhi_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435076_Haryana_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230238088826411,
"Nucleotide GTR":0.0012139684161564,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "T", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "TPAS", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "ACC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "NCT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435076_Haryana_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230800846107972,
"Nucleotide GTR":0.001214523731076319,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "KN", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "A", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "HY", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAM", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GCA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "YAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435087_Tamil_Nadu_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "TI", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "AYA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435087_Tamil_Nadu_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCC", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "QPRL", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "ILVF", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCC", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CNA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "NTT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KTRI", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCC", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "ANA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "TI", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "AYA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435156_Kinshasa_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230389594938301,
"Nucleotide GTR":0.0012141179186278,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "K", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "AAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435156_Kinshasa_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435313_Hanoi_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228415884041338,
"Nucleotide GTR":0.001212170309694783,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "C", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TGT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435313_Hanoi_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435461_Louisiana_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228798554492943,
"Nucleotide GTR":0.00121254791939998,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "L", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CTT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435461_Louisiana_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435477_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAT", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435477_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435484_New_York_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229525580841444,
"Nucleotide GTR":0.001213265330958612,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "L", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "TTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435484_New_York_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435520_New_York_20200420_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435520_New_York_20200420_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435540_New_York_20200421_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001228567488937015,
"Nucleotide GTR":0.001212319909643573,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAG", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435540_New_York_20200421_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435558_Louisiana_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228654392915291,
"Nucleotide GTR":0.001212405664332704,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "V", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "GTG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435558_Louisiana_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435621_California_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229032820046565,
"Nucleotide GTR":0.001212779086834702,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "H", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAC", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435621_California_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435641_California_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228570054412663,
"Nucleotide GTR":0.001212322441191276,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "TTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435641_California_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435663_California_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "L", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CTA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435663_California_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435671_California_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228627424205457,
"Nucleotide GTR":0.001212379052279102,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435671_California_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435680_Singapore_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "RS", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGK", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435680_Singapore_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "SF", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TYT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435711_Connecticut_20200321_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATT", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435711_Connecticut_20200321_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436103_New_Taipei_City_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122981460395548,
"Nucleotide GTR":0.001213550531795074,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "P", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CCC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436103_New_Taipei_City_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAY", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436127_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCY", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436127_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436139_Karnataka_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACT", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436139_Karnataka_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436217_Comunitat_Valenciana_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229127042166339,
"Nucleotide GTR":0.001212872062884256,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "V", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GTC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436217_Comunitat_Valenciana_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436259_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122979360353887,
"Nucleotide GTR":0.001213529809105116,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "S", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TCG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436259_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436293_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "NTSIHPRLDAGVYCF", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCN", "NNT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 24, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436293_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436325_Comunitat_Valenciana_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001234165010920468,
"Nucleotide GTR":0.001217843405427331,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "-", "V", "D", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "NNN", "GTT", "GAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436325_Comunitat_Valenciana_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436332_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002458335254617562,
"Nucleotide GTR":0.002425824222591293,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "I", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ATT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436332_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436370_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229127042440717,
"Nucleotide GTR":0.001212872063155005,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "F", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "TTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436370_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436423_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "IM", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "LF", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "CF", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "ND", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATN", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "YTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATM", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TKC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "RAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436423_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "HPRL", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "IV", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "ED", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "KAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CNT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "RTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TRG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAN", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "TI", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATM", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTR", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "AYT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "KAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "YS", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TMC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436442_Maharashtra_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "TP", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "QPRL", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "MCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "YAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CNA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436442_Maharashtra_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "LF", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "DY", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTM", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "KAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436459_Madhya_Pradesh_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230091599016558,
"Nucleotide GTR":0.001213823863647366,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "H", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CAT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436459_Madhya_Pradesh_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436545_Florida_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001230005471845314,
"Nucleotide GTR":0.001213738875492137,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "H", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "CAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436545_Florida_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436553_Florida_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001228798576991769,
"Nucleotide GTR":0.001212547941601264,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCT", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436553_Florida_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436608_Wisconsin_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "V", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GTT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436608_Wisconsin_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436622_Wisconsin_20200426_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228798554321081,
"Nucleotide GTR":0.001212547919230391,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436622_Wisconsin_20200426_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436629_Wisconsin_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229783759856718,
"Nucleotide GTR":0.00121352009560385,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "F", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "TTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436629_Wisconsin_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436721_Abruzzo_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "LF", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTW", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436721_Abruzzo_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436722_Abruzzo_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "ED", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAW", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436722_Abruzzo_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436723_Abruzzo_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "AS", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "KCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436723_Abruzzo_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436724_Abruzzo_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "S", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "TCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436724_Abruzzo_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436731_Abruzzo_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "WL", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TKG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436731_Abruzzo_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "KN", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAK", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436816_Michigan_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "LF", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "YTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436816_Michigan_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436818_Michigan_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "PS", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "YCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436818_Michigan_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436822_Michigan_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "NS", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "ARC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436822_Michigan_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436826_Michigan_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCT", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436826_Michigan_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436832_Michigan_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229421164460454,
"Nucleotide GTR":0.001213162295465075,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTC", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436832_Michigan_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436840_Michigan_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "F", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "TTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436840_Michigan_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436843_Michigan_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230030632031307,
"Nucleotide GTR":0.001213763702939293,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "Y", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TAT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436843_Michigan_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436850_Michigan_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229667134111811,
"Nucleotide GTR":0.001213405012212991,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAT", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436850_Michigan_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436865_Michigan_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "PL", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CYC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436865_Michigan_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436911_Utah_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "L", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "TTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436911_Utah_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436928_Utah_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436928_Utah_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436945_LA_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228976990632703,
"Nucleotide GTR":0.001212723995754579,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "F", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "TTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436945_LA_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437065_California_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437065_California_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437078_California_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "-", "-", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "NNN", "NNN", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCR", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437078_California_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437106_Michigan_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "TI", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "AYA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437106_Michigan_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437109_Michigan_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAY", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437109_Michigan_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437113_Michigan_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229103742439391,
"Nucleotide GTR":0.001212849071291914,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATT", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437113_Michigan_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437122_Michigan_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "L", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "TTA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437122_Michigan_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437123_Michigan_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229872202520556,
"Nucleotide GTR":0.00121360736862971,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTT", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437123_Michigan_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437139_Michigan_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "KR", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "ARA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437139_Michigan_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437170_Michigan_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228384490388935,
"Nucleotide GTR":0.001212139331217664,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAT", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437170_Michigan_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437220_Bavaria_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228798573552999,
"Nucleotide GTR":0.001212547938207972,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437220_Bavaria_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437267_Bavaria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002182063208212659,
"Nucleotide GTR":0.000215320582323545,
"amino-acid": [
["I", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATT", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437267_Bavaria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437281_Bavaria_20200401_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "F", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "TTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437281_Bavaria_20200401_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437304_Nevsehir_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437304_Nevsehir_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437316_Denizli_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "SL", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KQE", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TYA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "NAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437316_Denizli_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437352_Kinshasa_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "F", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "TTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437352_Kinshasa_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437365_Minnesota_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122871752143928,
"Nucleotide GTR":0.001212467957993564,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "C", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TGT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437365_Minnesota_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437376_Minnesota_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229783804921116,
"Nucleotide GTR":0.00121352014007228,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437376_Minnesota_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437454_Gujarat_20200426_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001228798580689406,
"Nucleotide GTR":0.00121254794525,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437454_Gujarat_20200426_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437477_Makkah_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228798553300903,
"Nucleotide GTR":0.001212547918223705,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "S", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "TCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437477_Makkah_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437513_Alaska_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229528855750281,
"Nucleotide GTR":0.001213268562557383,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437513_Alaska_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437523_Oregon_20200407_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001229421375973033,
"Nucleotide GTR":0.00121316250418044,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "A", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GCA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437523_Oregon_20200407_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437529_Oregon_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228777977683366,
"Nucleotide GTR":0.00121252761471493,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "H", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "CAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437529_Oregon_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437548_Louisiana_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00123120422279052,
"Nucleotide GTR":0.001214921773176361,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "F", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "TTC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437548_Louisiana_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437556_California_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229469120438836,
"Nucleotide GTR":0.001213209617234456,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTC", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437556_California_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437557_California_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228798539941985,
"Nucleotide GTR":0.001212547905041457,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "Y", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "TAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437557_California_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437586_California_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228798553944909,
"Nucleotide GTR":0.001212547918859195,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTT", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437586_California_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437634_Unknown_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228798556007956,
"Nucleotide GTR":0.001212547920894957,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "F", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "TTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437634_Unknown_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437785_Virginia_20200417_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001230417252667227,
"Nucleotide GTR":0.001214145210588343,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "D", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GAT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437785_Virginia_20200417_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "F", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "TTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437802_Virginia_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229718279265271,
"Nucleotide GTR":0.001213455480981193,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "F", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "TTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437802_Virginia_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437848_Washington_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229241816660258,
"Nucleotide GTR":0.001212985319506583,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "S", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TCA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437848_Washington_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437860_Washington_20200404_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "V", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GTA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437860_Washington_20200404_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437895_Athens_20200307_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001230584598223882,
"Nucleotide GTR":0.001214310343030761,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "I", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATA", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437895_Athens_20200307_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437896_Athens_20200308_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00122978376751917,
"Nucleotide GTR":0.001213520103164966,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437896_Athens_20200308_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437897_Athens_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001231711104882104,
"Nucleotide GTR":0.001215421951845424,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "V", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GTA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437897_Athens_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437918_Ischgl_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229584704819196,
"Nucleotide GTR":0.001213323673032623,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCT", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437918_Ischgl_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437947_Ramsau_im_Zillertal_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437947_Ramsau_im_Zillertal_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438059_Vienna_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "PS", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "YCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438059_Vienna_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438082_Vienna_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "L", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "CTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438082_Vienna_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438157_Washington_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229783842310712,
"Nucleotide GTR":0.001213520176967405,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "F", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "TTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438157_Washington_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438175_Washington_20200429_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228797409478141,
"Nucleotide GTR":0.00121254678952779,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438175_Washington_20200429_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438183_Washington_20200418_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001228798555776246,
"Nucleotide GTR":0.001212547920666312,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438183_Washington_20200418_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438208_Washington_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229783766870632,
"Nucleotide GTR":0.001213520102525007,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438208_Washington_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438220_Washington_20200421_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229767297549929,
"Nucleotide GTR":0.001213503851008045,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "R", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "CGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438220_Washington_20200421_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "L", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "TTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438277_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "L", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CTT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438277_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438282_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230544687780605,
"Nucleotide GTR":0.001214270960395764,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "I", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "ATT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438282_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438297_England_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":2.464438713737197e-05,
"Nucleotide GTR":2.431846964585575e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438297_England_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438300_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228751591705025,
"Nucleotide GTR":0.001212501577686304,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "Y", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "TAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438300_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438312_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "SL", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TYA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438312_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438331_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "SF", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TYT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438331_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438335_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTY", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438335_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438353_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATY", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438353_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438397_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTY", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438397_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438508_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229786010253399,
"Nucleotide GTR":0.001213522316239448,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438508_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438534_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTM", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438534_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438536_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "RG", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "RGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438536_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438564_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "Y", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "TAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438564_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438573_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "F", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "TTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438573_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438585_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122954696466473,
"Nucleotide GTR":0.001213286431984765,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "A", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GCA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438585_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438588_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229187481031069,
"Nucleotide GTR":0.001212931702456105,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAT", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438588_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438638_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001233280902632177,
"Nucleotide GTR":0.0012169709893087,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "H", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CAC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438638_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438653_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228570054412663,
"Nucleotide GTR":0.001212322441191276,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "C", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "TGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438653_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438698_England_20200425_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229161246927042,
"Nucleotide GTR":0.001212905815293282,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "G", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GGT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438698_England_20200425_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438704_England_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "S", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "TCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438704_England_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438783_Scotland_20200331_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438783_Scotland_20200331_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438808_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001227915429572757,
"Nucleotide GTR":0.001211676473644592,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "N", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "F", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAC", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "TTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438808_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438879_Scotland_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KQE", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "NAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438879_Scotland_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438923_Scotland_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "Y", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "TAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438923_Scotland_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229285434202057,
"Nucleotide GTR":0.001213028360214404,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAT", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438991_Scotland_20200421_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001229040922489581,
"Nucleotide GTR":0.001212787082124399,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438991_Scotland_20200421_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438998_Scotland_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229271571919931,
"Nucleotide GTR":0.001213014681258414,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "CTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438998_Scotland_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439000_Scotland_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "H", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "CAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439000_Scotland_20200422_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439007_Scotland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229332313816437,
"Nucleotide GTR":0.001213074619854499,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAT", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439007_Scotland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439012_Scotland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230197551021142,
"Nucleotide GTR":0.001213928414456158,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "R", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "AGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439012_Scotland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439020_Scotland_20200424_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "L", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TTA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439020_Scotland_20200424_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439031_Scotland_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229175971874591,
"Nucleotide GTR":0.001212920345506106,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "S", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "TCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439031_Scotland_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439034_Scotland_20200425_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "L", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CTT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439034_Scotland_20200425_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439151_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230262535724362,
"Nucleotide GTR":0.001213992539748618,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAA", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439151_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439185_Scotland_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230068793397999,
"Nucleotide GTR":0.001213801359628922,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "Y", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TAC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439185_Scotland_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439199_Scotland_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229680502377887,
"Nucleotide GTR":0.001213418203686203,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "N", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "AAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439199_Scotland_20200422_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439230_Scotland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229782633102757,
"Nucleotide GTR":0.001213518983751003,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "S", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "TCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439230_Scotland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439274_Scotland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122833400219755,
"Nucleotide GTR":0.001212089510723333,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "C", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TGC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439274_Scotland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439327_Scotland_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229382717169105,
"Nucleotide GTR":0.001213124356632089,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "F", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "TTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439327_Scotland_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439343_Scotland_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230389455425941,
"Nucleotide GTR":0.001214117780960465,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "K", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "AAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439343_Scotland_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439362_Scotland_20200501_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "E", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "GAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439362_Scotland_20200501_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439366_Scotland_20200502_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001229452620857036,
"Nucleotide GTR":0.001213193335856592,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439366_Scotland_20200502_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439386_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "HD", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "SAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439386_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439398_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "DV", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GWT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439398_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439414_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229941833206621,
"Nucleotide GTR":0.001213676078462746,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "Y", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TAT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439414_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439471_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "ACT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439471_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439478_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "VL", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "GV", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "KTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GKA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439478_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439493_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCY", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439493_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439509_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "TA", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "AV", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "RCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GYT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439509_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439512_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "V", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GTT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439512_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439532_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "QH", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAK", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439532_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439542_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTY", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439542_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439546_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229397104840493,
"Nucleotide GTR":0.001213138554029168,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "A", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "GCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439546_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439668_Scotland_20200430_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAA", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439668_Scotland_20200430_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439687_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001241152338819518,
"Nucleotide GTR":0.001224738327198829,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAC", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439687_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439689_England_20200407_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001229127042283346,
"Nucleotide GTR":0.001212872062999715,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "L", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "TTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439689_England_20200407_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439698_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122871464582744,
"Nucleotide GTR":0.001212465120411162,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGT", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439698_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439744_England_20200409_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229156195069964,
"Nucleotide GTR":0.001212900830246088,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTT", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439744_England_20200409_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439777_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228123575752256,
"Nucleotide GTR":0.001211881867129113,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "N", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "H", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAC", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "CAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439777_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439780_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229488878685117,
"Nucleotide GTR":0.00121322911418156,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "T", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "ACA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439780_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439789_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229715474265029,
"Nucleotide GTR":0.001213452713076564,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "T", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "ACG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439789_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439804_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229271569399029,
"Nucleotide GTR":0.001213014678770849,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "F", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "TTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439804_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439849_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00122958916237879,
"Nucleotide GTR":0.001213328071641811,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "T", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "ACC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439849_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439891_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTT", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439891_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439926_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGT", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439926_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440028_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGY", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440028_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440044_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCR", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440044_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440076_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229813409909247,
"Nucleotide GTR":0.001213549353539882,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "N", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AAT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440076_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440132_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "EG", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GRA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440132_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440152_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "RG", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "SGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440152_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440230_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "LF", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "PL", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "LF", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTK", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CYT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTN", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440230_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440251_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228569732932555,
"Nucleotide GTR":0.001212322123962684,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "L", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TTA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440251_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440292_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGY", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440292_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440310_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "M", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "ATG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440310_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440326_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229179500246025,
"Nucleotide GTR":0.001212923827215477,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440326_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440370_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "RM", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AKG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440370_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440371_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229813410034636,
"Nucleotide GTR":0.001213549353663612,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "N", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "AAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440371_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440378_England_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "LF", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "YTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440378_England_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440379_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "VF", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "KTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440379_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440394_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATY", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440394_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440470_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTR", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440470_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440472_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122790113541941,
"Nucleotide GTR":0.001211662368528796,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "V", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "GTG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440472_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440488_England_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "LF", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "YTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440488_England_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440560_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "F", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "TTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440560_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440561_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122976750450216,
"Nucleotide GTR":0.001213504055223369,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACC", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440561_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440580_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "RC", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "YGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440580_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440598_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229127043238338,
"Nucleotide GTR":0.001212872063942078,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "Y", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "TAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440598_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440610_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGY", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440610_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440644_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230295546710957,
"Nucleotide GTR":0.001214025114170982,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "I", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "ATC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATC", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440644_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440650_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229801331216655,
"Nucleotide GTR":0.001213537434585779,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "I", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ATT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440650_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440699_England_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAT", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440699_England_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440730_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228527594845161,
"Nucleotide GTR":0.001212280543143752,
"amino-acid": [
["M", "G", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GGT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440730_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440742_England_20200403_null_32":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440742_England_20200403_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440755_England_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440755_England_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440761_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230622578041114,
"Nucleotide GTR":0.001214347820571888,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "I", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "ATA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440761_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440766_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "S", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "TCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440766_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440792_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "TM", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "AYG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440792_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440832_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440832_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440943_England_20200423_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "M", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ATG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440943_England_20200423_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440956_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAT", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440956_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441052_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "SL", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TYG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441052_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441086_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "VL", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "KTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441086_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441148_England_20200404_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001229574979748867,
"Nucleotide GTR":0.001213314076574562,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "N", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAT", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441148_England_20200404_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441170_England_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "I", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ATC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441170_England_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441207_England_20200404_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441207_England_20200404_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441225_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGW", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441225_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441277_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229783757750985,
"Nucleotide GTR":0.001213520093525966,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "S", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "TCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441277_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441293_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229217487583619,
"Nucleotide GTR":0.00121296131217751,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCT", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441293_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441295_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "YTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441295_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441327_England_20200402_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001228603300630727,
"Nucleotide GTR":0.001212355247734214,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "V", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GTT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441327_England_20200402_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441345_England_20200402_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "N", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "AAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441345_England_20200402_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441378_Northern_Ireland_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "F", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "TTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441378_Northern_Ireland_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441394_Northern_Ireland_20200310_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001229735053148927,
"Nucleotide GTR":0.001213472033033319,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAC", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441394_Northern_Ireland_20200310_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0007542008486740816,
"Nucleotide GTR":0.0007442266810338364,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "F", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "TTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441408_Northern_Ireland_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229381882959682,
"Nucleotide GTR":0.001213123533454933,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "S", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "TCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441408_Northern_Ireland_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441424_Northern_Ireland_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "KN", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAK", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441424_Northern_Ireland_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441530_England_20200424_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441530_England_20200424_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441531_England_20200424_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "Y", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "TAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441531_England_20200424_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441533_England_20200425_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228187912893291,
"Nucleotide GTR":0.001211945353423279,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "I", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ATT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTT", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441533_England_20200425_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441582_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441582_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441583_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "SL", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TYA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441583_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441620_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGR", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441620_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441627_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACY", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441627_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441646_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228892457270618,
"Nucleotide GTR":0.001212640580330676,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441646_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441653_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "AV", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GYT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441653_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441660_England_20200407_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441660_England_20200407_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441665_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "N", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGY", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "AAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441665_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441703_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "I", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ATA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441703_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441718_England_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001230417246925149,
"Nucleotide GTR":0.001214145204922204,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "N", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "AAT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441718_England_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441723_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001230050587617336,
"Nucleotide GTR":0.001213783394616363,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "S", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "AGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441723_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441732_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "KT", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "AMA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441732_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441737_Northern_Ireland_20200327_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001229464601058072,
"Nucleotide GTR":0.001213205157621672,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATT", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441737_Northern_Ireland_20200327_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441755_England_20200406_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441755_England_20200406_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441776_Northern_Ireland_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCY", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441776_Northern_Ireland_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441787_England_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229079606640772,
"Nucleotide GTR":0.001212825254684797,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "V", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GTT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441787_England_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441791_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229612193015408,
"Nucleotide GTR":0.00121335079770249,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGT", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441791_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441805_England_20200401_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441805_England_20200401_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441820_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "TI", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "AYA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441820_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441840_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00122916830582726,
"Nucleotide GTR":0.001212912780840843,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "S", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "TCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441840_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441858_England_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATT", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441858_England_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441892_England_20200430_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441892_England_20200430_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441977_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228529267659494,
"Nucleotide GTR":0.001212282193835423,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "V", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "GTT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441977_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441995_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229257148235223,
"Nucleotide GTR":0.001213000448324286,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "S", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TCT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441995_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442083_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "AS", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "KCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442083_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442087_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "PL", "CF", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CYT", "TKC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442087_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442090_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442090_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442143_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001232042735931221,
"Nucleotide GTR":0.001215749197134853,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "D", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAT", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442143_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442157_England_20200405_null_54":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442157_England_20200405_null_54",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442195_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "TS", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "WCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442195_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442211_England_20200405_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442211_England_20200405_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442220_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229711070161821,
"Nucleotide GTR":0.001213448367216812,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442220_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442227_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "V", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GTT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442227_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442234_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122987637529772,
"Nucleotide GTR":0.001213611486222663,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "T", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ACA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442234_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442263_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229793604261514,
"Nucleotide GTR":0.0012135298098182,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTC", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442263_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442278_England_20200404_null_31":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442278_England_20200404_null_31",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442292_England_20200404_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001229605502716651,
"Nucleotide GTR":0.001213344195881707,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "I", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ATT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442292_England_20200404_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442313_England_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00122939551793704,
"Nucleotide GTR":0.00121313698811222,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442313_England_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442318_England_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442318_England_20200405_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442320_England_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAT", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442320_England_20200405_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442337_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228798554295577,
"Nucleotide GTR":0.001212547919205225,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGT", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442337_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442353_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229311412519819,
"Nucleotide GTR":0.001213053994973689,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "S", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "F", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGC", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "TTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442353_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442366_England_20200409_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0012283340003935,
"Nucleotide GTR":0.001212089508943142,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "G", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GGT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442366_England_20200409_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442481_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228536485040851,
"Nucleotide GTR":0.001212289315768237,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGT", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442481_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442530_England_20200406_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001229127042506771,
"Nucleotide GTR":0.001212872063220186,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "N", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAT", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442530_England_20200406_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442537_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "QL", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CWG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442537_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442585_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228717522371724,
"Nucleotide GTR":0.001212467958913677,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "G", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GGT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442585_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442591_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228778297861456,
"Nucleotide GTR":0.001212527930658723,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAC", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442591_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442621_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGY", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442621_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442676_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002461641127173321,
"Nucleotide GTR":0.00242908637558995,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "Y", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "TAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442676_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442678_England_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442678_England_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442698_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "MI", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "F", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATK", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "TTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442698_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442712_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122877981013172,
"Nucleotide GTR":0.001212529422929491,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "F", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "TTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442712_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442756_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229069484757243,
"Nucleotide GTR":0.001212815266661318,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442756_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442826_England_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "F", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "TTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442826_England_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442848_England_20200411_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTY", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442848_England_20200411_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442919_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "VL", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "KTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442919_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442933_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "LV", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "CW", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "STT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGS", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442933_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442934_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228778094705006,
"Nucleotide GTR":0.001212527730188981,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "H", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "CAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442934_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442976_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228778297776996,
"Nucleotide GTR":0.001212527930575379,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTC", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442976_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442978_England_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "VL", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "KTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442978_England_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443005_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "TI", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "AYC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443005_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443026_England_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229488878685848,
"Nucleotide GTR":0.00121322911418228,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "H", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "CAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443026_England_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443036_England_20200410_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTY", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443036_England_20200410_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443057_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "-", "-", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "DY", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "NNN", "NNN", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "KAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443057_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443063_England_20200406_null_24":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443063_England_20200406_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443067_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "CF", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TKC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443067_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443069_England_20200410_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229632542901656,
"Nucleotide GTR":0.001213370878465232,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "S", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "TCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443069_England_20200410_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443077_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "DG", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GRC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443077_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443097_England_20200408_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "T", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "ACT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443097_England_20200408_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443188_Singapore_20200318_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443188_Singapore_20200318_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443190_Singapore_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAY", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443190_Singapore_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443196_Singapore_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "MV", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "RTG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443196_Singapore_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443205_Singapore_20200318_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443205_Singapore_20200318_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229566134018364,
"Nucleotide GTR":0.001213305347827219,
"amino-acid": [
["T", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ACG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443242_Singapore_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "QL", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CWA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443242_Singapore_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443257_Minnesota_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003750937984965623,
"Nucleotide GTR":0.003701332519344646,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "A", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACA", "TCA", "GGA", "GAT", "GCC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443257_Minnesota_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443285_Hauts_de_France_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228798566433317,
"Nucleotide GTR":0.001212547931182446,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443285_Hauts_de_France_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443308_Grand_Est_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229395992861018,
"Nucleotide GTR":0.001213137456755415,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "Y", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "TAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443308_Grand_Est_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443328_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228570054365338,
"Nucleotide GTR":0.001212322441144576,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "Y", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "TAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443328_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443341_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "S", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "TCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443341_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443345_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "ND", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "RAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443345_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443351_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "LF", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTK", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443351_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443354_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "QH", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAK", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443354_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443360_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "S", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "TCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443360_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443375_England_20200416_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001230072655736572,
"Nucleotide GTR":0.001213805170888777,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "P", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "CCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443375_England_20200416_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443381_England_20200412_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443381_England_20200412_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443475_England_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "PL", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CYT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443475_England_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443480_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "DY", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "KAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443480_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443486_England_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "VL", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "KTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443486_England_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443534_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230582440725463,
"Nucleotide GTR":0.001214308214064862,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "N", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "AAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443534_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443558_England_20200413_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "F", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTT", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443558_England_20200413_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443560_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002458926269316708,
"Nucleotide GTR":0.002426407421229639,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "L", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TTA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAT", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443560_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443563_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAR", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443563_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443566_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "AS", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "KCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443566_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443593_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "KQ", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "MAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443593_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443596_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTY", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443596_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443637_England_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228705686042138,
"Nucleotide GTR":0.001212456279117374,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "F", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "TTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443637_England_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443660_England_20200416_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "C", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGT", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443660_England_20200416_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443676_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228777978395961,
"Nucleotide GTR":0.0012125276154181,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "A", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GCC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443676_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443725_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "EG", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GRA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443725_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443733_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "YC", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TRT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443733_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443754_England_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "I", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "ATC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443754_England_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443764_England_20200326_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001229070342266607,
"Nucleotide GTR":0.001212816112830278,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGG", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443764_England_20200326_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443793_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "SL", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TYG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443793_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443794_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230197550964515,
"Nucleotide GTR":0.001213928414400281,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "S", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443794_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443809_England_20200326_null_123":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443809_England_20200326_null_123",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443816_England_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443816_England_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443844_England_20200326_null_39":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443844_England_20200326_null_39",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443879_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "V", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GTA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443879_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443886_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229127042166339,
"Nucleotide GTR":0.001212872062884256,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "I", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "ATA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443886_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443888_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "NT", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "AMT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443888_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443893_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "AV", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GYA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443893_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443907_England_20200326_null_30":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443907_England_20200326_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443910_England_20200325_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "S", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "TCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443910_England_20200325_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443917_England_20200329_null_138":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443917_England_20200329_null_138",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443935_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229769719452605,
"Nucleotide GTR":0.001213506240881502,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "F", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "TTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443935_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443947_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228757257116021,
"Nucleotide GTR":0.00121250716817328,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTC", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443947_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443949_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00246222884914928,
"Nucleotide GTR":0.00242966632505077,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "Q", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "CAG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443949_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443971_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "AV", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GYT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443971_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443975_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGM", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443975_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443978_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229126520161318,
"Nucleotide GTR":0.001212871547782654,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "S", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "TCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443978_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443979_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "LF", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "YTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443979_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443980_England_20200328_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAT", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443980_England_20200328_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443987_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "GC", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "KGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443987_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444023_California_20200501_null_36":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGT", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444023_California_20200501_null_36",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444054_California_20200429_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "TTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444054_California_20200429_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444068_California_20200430_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "L", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TTG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444068_California_20200430_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444071_California_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0012293877930731,
"Nucleotide GTR":0.001213129365408186,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAC", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444071_California_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444080_England_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228533238852041,
"Nucleotide GTR":0.001212286112509678,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444080_England_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444131_England_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "Y", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "TAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444131_England_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444132_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229421502526807,
"Nucleotide GTR":0.001213162629060563,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "KQE", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "G", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "NAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "GGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444132_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444134_England_20200408_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001228797410883833,
"Nucleotide GTR":0.001212546790914892,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444134_England_20200408_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444167_England_20200410_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444167_England_20200410_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444173_England_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229127042166339,
"Nucleotide GTR":0.001212872062884256,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "F", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "TTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444173_England_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444194_England_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001229872215085844,
"Nucleotide GTR":0.001213607381028824,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444194_England_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444215_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229079730428171,
"Nucleotide GTR":0.001212825376835131,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "D", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "GAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444215_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444244_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTT", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444244_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444252_England_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "V", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "GTA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444252_England_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444261_England_20200418_null_62":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444261_England_20200418_null_62",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444264_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "DAGV", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "V", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GNT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "GTA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444264_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444281_England_20200416_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444281_England_20200416_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444284_England_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "F", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "TTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444284_England_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444327_England_20200427_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001229506837503802,
"Nucleotide GTR":0.001213246835498167,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "N", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "AAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444327_England_20200427_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444359_England_20200428_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001228967561217105,
"Nucleotide GTR":0.00121271469104127,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "R", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CGG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444359_England_20200428_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444365_England_20200428_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001229127041134441,
"Nucleotide GTR":0.001212872061866004,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "C", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "TGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444365_England_20200428_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444367_England_20200427_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444367_England_20200427_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444370_England_20200428_null_22":{
"Global MG94xREV":0.0001289051257655476,
"Nucleotide GTR":0.0001272003791634547,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444370_England_20200428_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444377_England_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228777978229712,
"Nucleotide GTR":0.001212527615254049,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTC", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444377_England_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444380_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0012283340003935,
"Nucleotide GTR":0.001212089508943142,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "E", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "GAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444380_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444383_England_20200101_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTT", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444383_England_20200101_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444393_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228950374685072,
"Nucleotide GTR":0.001212697731797966,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444393_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444411_England_20200419_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGT", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444411_England_20200419_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444413_England_20200420_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "S", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "TCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444413_England_20200420_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444416_England_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228493069575363,
"Nucleotide GTR":0.001212246474464302,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "F", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "TTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444416_England_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444421_England_20200419_null_34":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444421_England_20200419_null_34",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444426_England_20200419_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001228333659786888,
"Nucleotide GTR":0.001212089172840989,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "V", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "GTT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444426_England_20200419_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444434_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444434_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444437_England_20200418_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001228798555182903,
"Nucleotide GTR":0.001212547920080815,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444437_England_20200418_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444451_England_20200415_null_591":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444451_England_20200415_null_591",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444467_Gujarat_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "F", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "TTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444467_Gujarat_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444469_Gujarat_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229153663566181,
"Nucleotide GTR":0.001212898332220976,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "S", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "TCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444469_Gujarat_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444493_Montevideo_20200313_null_102":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444493_Montevideo_20200313_null_102",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444516_Quebec_20200406_null_91":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444516_Quebec_20200406_null_91",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444518_Washington_20200313_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "R", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CGA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444518_Washington_20200313_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444522_Illinois_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "N", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAT", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444522_Illinois_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444550_Illinois_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATT", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444550_Illinois_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444570_Illinois_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "L", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CTT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444570_Illinois_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444606_Illinois_20200320_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444606_Illinois_20200320_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444619_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228798549865892,
"Nucleotide GTR":0.001212547914834123,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "F", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TTC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444619_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444625_New_York_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229783771778481,
"Nucleotide GTR":0.00121352010736795,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "F", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "TTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444625_New_York_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444639_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444639_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230092089507978,
"Nucleotide GTR":0.001213824347652127,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAA", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444657_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229783757563439,
"Nucleotide GTR":0.001213520093340899,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "L", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TTG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444657_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444670_New_Jersey_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229958448743157,
"Nucleotide GTR":0.001213692474261865,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "L", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TTG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444670_New_Jersey_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444692_New_York_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTT", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444692_New_York_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444698_New_York_20200330_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001229817096842994,
"Nucleotide GTR":0.001213552991714609,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "I", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ATT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444698_New_York_20200330_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444718_New_York_20200403_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001227648298789068,
"Nucleotide GTR":0.001211412875616431,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "P", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CCA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444718_New_York_20200403_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444745_New_York_20200402_null_29":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "N", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAC", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444745_New_York_20200402_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444753_New_York_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001228798559171228,
"Nucleotide GTR":0.001212547924016397,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "L", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TTA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444753_New_York_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444756_New_York_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228652095080942,
"Nucleotide GTR":0.001212403396886794,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "V", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GTT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444756_New_York_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444772_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228798555431598,
"Nucleotide GTR":0.001212547920326222,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "F", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TTC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444772_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444828_Unknown_20200311_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "L", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CTT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444828_Unknown_20200311_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444847_Unknown_20200331_null_4990":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444847_Unknown_20200331_null_4990",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444857_Unknown_20200405_null_13606":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444857_Unknown_20200405_null_13606",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444860_Unknown_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00122958470483574,
"Nucleotide GTR":0.001213323673048949,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "L", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CTG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444860_Unknown_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444868_Unknown_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444868_Unknown_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229161247688269,
"Nucleotide GTR":0.001212905816044443,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCG", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444925_Unknown_20200328_null_180":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444925_Unknown_20200328_null_180",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444943_Unknown_20200328_null_2273":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444943_Unknown_20200328_null_2273",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444949_Unknown_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001229149015058542,
"Nucleotide GTR":0.001212893745188996,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAT", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444949_Unknown_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":14550.19744827175,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02328393180227693],
[0.01835165973660879],
[0.01213121326316933],
[0.033250150487362],
[0.01699241614054557],
[0.01339288577900991],
[0.008853256649605916],
[0.02426567809143677],
[0.0115076063259724],
[0.009069931894253385],
[0.005995603649522631],
[0.01643320575481517],
[0.02509606316016422],
[0.01977992444552424],
[0.01307535586546202],
[0.0358379282245708],
[0.0144145639368505],
[0.01136110408100421],
[0.007510164120839029],
[0.02058442810174831],
[0.01051962662403572],
[0.008291237493729283],
[0.0054808541404769],
[0.01502234121325861],
[0.007124102945947184],
[0.0056149929617905],
[0.003711744772315763],
[0.01017343192085104],
[0.01553641412701828],
[0.01224531097270262],
[0.008094661791671474],
[0.0221864637014105],
[0.02235019348861919],
[0.01761571668537522],
[0.01164472418086294],
[0.03191674426934948],
[0.01631098183096337],
[0.01285580077599162],
[0.008498221039444328],
[0.0232925695317113],
[0.0110461252919144],
[0.008706207116846908],
[0.00575516638623714],
[0.0157741970461575],
[0.02408965428156029],
[0.01898670474994708],
[0.01255100452995873],
[0.034400746267951],
[0.01977333233032694],
[0.03582598440992482],
[0.01830879039087438],
[0.01443041039182918],
[0.009539103735076326],
[0.02614549986263956],
[0.009772564450982178],
[0.006460073104256431],
[0.01770625890553087],
[0.02704021348319208],
[0.02131224233358541],
[0.01408828196336462],
[0.03861423298957652]
],
"Log Likelihood":-6220.193904874832,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[1.222630489888912, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[1.169651083401967, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":1050
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":15878.93865710486,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2703304324398739],
[0.2105796260467567],
[0.184648480694675],
[0.3344414608186945]
],
"Log Likelihood":-6292.476512715341,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.4308110672268987,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.2038529704795165,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1369013432003262,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.945275063009648,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":2.333267328946849
},
"display order":0,
"estimated parameters":1643
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-14/sequences.ORF3a.compressed.fas",
"number of sequences":819,
"number of sites":276,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_423060_England_20200324_null_1,epi_isl_439849_England_20200417_null_2,epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2,epi_isl_441995_England_20200402_null_1,epi_isl_439199_Scotland_20200422_null_2,epi_isl_443308_Grand_Est_20200415_null_1,epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1,epi_isl_439327_Scotland_20200430_null_1,(epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3,epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1)Node1623,epi_isl_439274_Scotland_20200413_null_1,epi_isl_421956_England_20200331_null_2,epi_isl_433358_Scotland_20200327_null_4,epi_isl_423876_England_20200318_null_3,epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1,epi_isl_443676_England_20200417_null_2,epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1,epi_isl_439185_Scotland_20200422_null_1,epi_isl_434356_Ghent_20200327_null_1,epi_isl_437897_Athens_20200323_null_1,epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1,epi_isl_436370_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1,epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3,epi_isl_440598_England_20200404_null_1,epi_isl_433154_Scotland_20200417_null_2,epi_isl_440251_England_20200318_null_2,epi_isl_444365_England_20200428_null_9,epi_isl_444426_England_20200419_null_4,epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1,epi_isl_443026_England_20200407_null_3,epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1,epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1,(epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1,epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1)Node150,epi_isl_439007_Scotland_20200424_null_1,epi_isl_435641_California_20200312_null_2,epi_isl_436217_Comunitat_Valenciana_20200313_null_1,epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2,epi_isl_439780_England_20200409_null_1,epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1,epi_isl_432755_England_20200331_null_1,epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1,epi_isl_435156_Kinshasa_20200410_null_1,epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29,epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1,(epi_isl_429010_California_20200328_null_1,epi_isl_435680_Singapore_20200401_null_2)Node1606,epi_isl_439012_Scotland_20200424_null_1,(epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_432279_Wales_20200405_null_1)Node1601,epi_isl_443794_England_20200330_null_1,(epi_isl_432288_Wales_20200331_null_1,epi_isl_444692_New_York_20200330_null_6)Node1596,epi_isl_442934_England_20200410_null_1,(epi_isl_436911_Utah_20200408_null_2,epi_isl_441086_England_20200403_null_1)Node1591,epi_isl_444377_England_20200428_null_1,(epi_isl_438923_Scotland_20200415_null_1,epi_isl_443480_England_20200417_null_1)Node1586,epi_isl_442591_England_20200412_null_1,(epi_isl_443351_England_20200416_null_2,epi_isl_443558_England_20200413_null_8)Node1581,epi_isl_442976_England_20200411_null_1,(epi_isl_443242_Singapore_20200318_null_1,epi_isl_435663_California_20200316_null_1,epi_isl_444718_New_York_20200403_null_7)Node1574,epi_isl_437529_Oregon_20200409_null_1,(epi_isl_435711_Connecticut_20200321_null_4,epi_isl_438353_England_20200329_null_1)Node1570,(epi_isl_441170_England_20200403_null_3,epi_isl_443005_England_20200409_null_1)Node1567,(epi_isl_423410_England_20200330_null_1,epi_isl_440610_England_20200402_null_1)Node1564,(epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5,epi_isl_434305_Washington_20200331_null_8)Node180,epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1,epi_isl_441732_England_20200406_null_1,(epi_isl_441394_Northern_Ireland_20200310_null_12,epi_isl_441424_Northern_Ireland_20200320_null_1,epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5)Node184,epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_439398_England_20200330_null_1,epi_isl_440730_England_20200402_null_1,(epi_isl_435061_Delhi_20200316_null_1,epi_isl_441295_England_20200402_null_1)Node1561,(epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1,epi_isl_444522_Illinois_20200317_null_3)Node1536,epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1,epi_isl_441737_Northern_Ireland_20200327_null_6,epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1,(((epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1,epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1,epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1,epi_isl_432068_Wales_20200329_null_1,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1,epi_isl_432036_Wales_20200401_null_3,epi_isl_443917_England_20200329_null_138)Node1499,epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1)Node1498,epi_isl_432190_Wales_20200323_null_18)Node1497,((epi_isl_437170_Michigan_20200326_null_2,epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2,epi_isl_443980_England_20200328_null_5)Node1517,epi_isl_437109_Michigan_20200316_null_2)Node1516,epi_isl_436731_Abruzzo_20200426_null_1,epi_isl_443949_England_20200330_null_2,(epi_isl_441665_England_20200406_null_1,epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_441345_England_20200402_null_5)Node1530,epi_isl_442481_England_20200408_null_1,epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2,epi_isl_436722_Abruzzo_20200320_null_3,epi_isl_432954_England_20200330_null_1,((epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_442353_England_20200411_null_1,epi_isl_442826_England_20200406_null_7)Node1554,epi_isl_440488_England_20200301_null_3)Node1553,epi_isl_435621_California_20200309_null_1,(epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1,epi_isl_438573_England_20200418_null_1)Node1546,(epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18,epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1)Node1549,(epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1,epi_isl_442320_England_20200405_null_4)Node1485,(epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1,epi_isl_433037_England_20200403_null_1)Node1482,(epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4,epi_isl_432443_Wales_20200406_null_1)Node1478,epi_isl_437065_California_20200413_null_2,epi_isl_423309_England_20200325_null_1,epi_isl_441820_England_20200403_null_1,epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_2,epi_isl_436721_Abruzzo_20200320_null_1,epi_isl_442083_England_20200406_null_1,epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_435087_Tamil_Nadu_20200329_null_1,epi_isl_439532_England_20200330_null_1,(epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_1)Node208,epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_439804_England_20200413_null_1,epi_isl_436865_Michigan_20200325_null_1,epi_isl_437139_Michigan_20200320_null_1,epi_isl_420706_England_20200328_null_1,epi_isl_423575_England_20200331_null_1,epi_isl_443196_Singapore_20200311_null_1,epi_isl_423239_England_20200324_null_1,epi_isl_441052_England_20200403_null_1,epi_isl_443975_England_20200325_null_1,epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1,(epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1,epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1)Node1429,epi_isl_435313_Hanoi_20200313_null_1,epi_isl_443077_England_20200408_null_1,epi_isl_440028_England_20200321_null_1,(epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1,epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1)Node1439,epi_isl_425439_England_20200101_null_1,epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1,epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1,epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1,epi_isl_423531_England_20200326_null_1,epi_isl_423802_England_20200223_null_1,epi_isl_440292_England_20200304_null_1,epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1,epi_isl_444857_Unknown_20200405_null_13606,epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1,epi_isl_433407_Scotland_20200322_null_1,epi_isl_421830_England_20200325_null_1,epi_isl_443888_England_20200329_null_1,(epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_4,epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1,epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1)Node223,epi_isl_443067_England_20200406_null_1,epi_isl_423821_England_20200323_null_1,epi_isl_420671_England_20200328_null_1,epi_isl_435072_Delhi_20200326_null_1,epi_isl_435076_Haryana_20200329_null_1,epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1,epi_isl_441627_England_20200406_null_1,(epi_isl_416423_Connecticut_20200312_null_1,epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1)Node1415,(epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2,epi_isl_440792_England_20200404_null_1)Node1412,epi_isl_444359_England_20200428_null_3,epi_isl_439789_England_20200412_null_1,(epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_433876_England_20200408_null_1)Node1403,epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1,epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1,epi_isl_439414_England_20200331_null_1,epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1,epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1,epi_isl_443345_England_20200416_null_1,epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_443593_England_20200415_null_2,(((((epi_isl_438783_Scotland_20200331_null_7,epi_isl_438879_Scotland_20200412_null_1)Node1301,epi_isl_433523_Scotland_20200330_null_1)Node1300,epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2,epi_isl_444925_Unknown_20200328_null_180)Node1296,epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1)Node1295,epi_isl_439478_England_20200331_null_1)Node1294,(epi_isl_423363_England_20200329_null_1,epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1,epi_isl_444518_Washington_20200313_null_7)Node1385,(epi_isl_425602_England_20200325_null_1,epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1,epi_isl_444261_England_20200418_null_62)Node1380,(epi_isl_421866_England_20200327_null_1,epi_isl_440943_England_20200423_null_9)Node1377,(epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_442978_England_20200407_null_3,epi_isl_423340_England_20200327_null_2,epi_isl_423567_England_20200401_null_1,epi_isl_443534_England_20200416_null_1,epi_isl_438335_England_20200328_null_1,epi_isl_438300_England_20200330_null_2,epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_438312_England_20200329_null_1,epi_isl_442263_England_20200405_null_1,epi_isl_433530_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_443971_England_20200327_null_1,epi_isl_444451_England_20200415_null_591,epi_isl_440650_England_20200402_null_1,epi_isl_439031_Scotland_20200425_null_1,epi_isl_421860_England_20200327_null_1,epi_isl_423431_England_20200329_null_1,epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_443563_England_20200412_null_1,epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_442537_England_20200408_null_1,epi_isl_442087_England_20200404_null_1,epi_isl_443375_England_20200416_null_6,epi_isl_433410_Scotland_20200407_null_1,epi_isl_442234_England_20200406_null_1,(epi_isl_423952_England_20200319_null_3,epi_isl_441977_England_20200328_null_1,epi_isl_443907_England_20200326_null_30)Node1361,(epi_isl_439151_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_439668_Scotland_20200430_null_9)Node1366)Node1311,(epi_isl_439366_Scotland_20200502_null_5,epi_isl_421932_England_20200331_null_1,epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1,epi_isl_444434_England_20200101_null_2)Node1370,(((epi_isl_439386_England_20200331_null_1,epi_isl_436545_Florida_20200417_null_2,epi_isl_439000_Scotland_20200422_null_2)Node911,epi_isl_441531_England_20200424_null_5,epi_isl_443057_England_20200412_null_1)Node910,epi_isl_423726_England_20200322_null_1)Node909,((epi_isl_423290_England_20200326_null_1,epi_isl_435461_Louisiana_20200403_null_1,epi_isl_438277_England_20200328_null_1)Node879,epi_isl_421972_England_20200401_null_1)Node878,((epi_isl_434967_Texas_20200330_null_1,epi_isl_436553_Florida_20200417_null_3)Node757,epi_isl_423166_England_20200319_null_1)Node756,((epi_isl_438183_Washington_20200418_null_7,epi_isl_442211_England_20200405_null_6)Node752,epi_isl_438397_England_20200329_null_1)Node751,((epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2,epi_isl_443188_Singapore_20200318_null_5)Node747,epi_isl_423505_England_20200330_null_7)Node746,(epi_isl_433870_England_20200407_null_1,epi_isl_421827_England_20200324_null_2,epi_isl_444657_New_York_20200330_null_1)Node741,epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_434214_Washington_20200331_null_1,((epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1,epi_isl_444437_England_20200418_null_14)Node737,epi_isl_443190_Singapore_20200409_null_1)Node736,((epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_444753_New_York_20200402_null_2)Node725,epi_isl_441583_England_20200404_null_1)Node724,((epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1,epi_isl_436629_Wisconsin_20200324_null_2)Node720,epi_isl_440379_England_20200316_null_1)Node719,((epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1,epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1,epi_isl_423926_England_20200318_null_1)Node713,epi_isl_440580_England_20200403_null_1)Node712,((epi_isl_437220_Bavaria_20200406_null_2,epi_isl_444393_England_20200420_null_1,epi_isl_425639_England_20200330_null_3,epi_isl_440832_England_20200401_null_4)Node693,epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2)Node692,(epi_isl_434528_Louisiana_20200326_null_1,epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_443341_England_20200413_null_1)Node335,(epi_isl_438175_Washington_20200429_null_2,epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_435671_California_20200321_null_1)Node330,(epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2,epi_isl_436139_Karnataka_20200423_null_2)Node327,(epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1,epi_isl_441408_Northern_Ireland_20200321_null_2,epi_isl_441892_England_20200430_null_11)Node319,(epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2,epi_isl_444619_New_York_20200330_null_1)Node307,(epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1,epi_isl_432411_Wales_20200327_null_2)Node281,(epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1,epi_isl_433841_England_20200408_null_2)Node284,(epi_isl_434558_Manila_20200328_null_3,epi_isl_444772_New_York_20200410_null_1)Node297,(epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1,epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1)Node294,(epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1,epi_isl_431959_Wales_20200331_null_2)Node290,epi_isl_443381_England_20200412_null_14,epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1,epi_isl_431089_Connecticut_20200413_null_1,(epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1,epi_isl_443660_England_20200416_null_4)Node301,(epi_isl_437477_Makkah_20200409_null_2,epi_isl_444413_England_20200420_null_4)Node304,(epi_isl_444625_New_York_20200330_null_2,epi_isl_437352_Kinshasa_20200417_null_3,epi_isl_442698_England_20200406_null_1)Node311,(epi_isl_437557_California_20200330_null_1,epi_isl_438564_England_20200420_null_1)Node316,epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_439343_Scotland_20200430_null_1,epi_isl_421775_England_20200325_null_1,epi_isl_439687_England_20200407_null_2,((epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2,epi_isl_436622_Wisconsin_20200426_null_2,epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_421990_England_20200331_null_1,epi_isl_441582_England_20200407_null_1,epi_isl_444327_England_20200427_null_8)Node626,epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1)Node625,(epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1,epi_isl_444416_England_20200420_null_2,epi_isl_436840_Michigan_20200323_null_1,epi_isl_443637_England_20200413_null_2)Node353,(epi_isl_437454_Gujarat_20200426_null_5,epi_isl_444080_England_20200404_null_2,epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1,epi_isl_444167_England_20200410_null_18)Node345,epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_443978_England_20200329_null_2,epi_isl_444380_England_20200427_null_1,(epi_isl_437376_Minnesota_20200412_null_2,epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1,epi_isl_423919_England_20200320_null_1,epi_isl_436293_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1)Node618,(epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1,epi_isl_433561_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_444054_California_20200429_null_3)Node613,epi_isl_423619_England_20200320_null_1,((epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7,epi_isl_435477_New_York_20200330_null_1)Node565,epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1,(epi_isl_436928_Utah_20200415_null_2,epi_isl_444071_California_20200430_null_1)Node548,epi_isl_444670_New_Jersey_20200330_null_2,(epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1,epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2)Node539,epi_isl_436816_Michigan_20200314_null_1,(epi_isl_436818_Michigan_20200316_null_2,epi_isl_438704_England_20200425_null_1)Node535,epi_isl_442292_England_20200404_null_6,epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1,epi_isl_434940_Texas_20200328_null_1,epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1,epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1,epi_isl_444949_Unknown_20200330_null_1,epi_isl_441620_England_20200404_null_1,epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1,epi_isl_442712_England_20200407_null_1,epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1,epi_isl_420704_England_20200328_null_1,epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1,epi_isl_436459_Madhya_Pradesh_20200420_null_1,epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1,epi_isl_435558_Louisiana_20200424_null_1,epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2,epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1,epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1,epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1,epi_isl_434912_Texas_20200327_null_1,epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2,epi_isl_436832_Michigan_20200322_null_1,epi_isl_434216_Washington_20200406_null_1,epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1,epi_isl_436103_New_Taipei_City_20200324_null_1,(epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1,epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1)Node411,epi_isl_434665_Uppsala_20200404_null_1,epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1,epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1,epi_isl_438638_England_20200422_null_1,epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1,epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1,epi_isl_437556_California_20200326_null_1,epi_isl_437548_Louisiana_20200331_null_1,epi_isl_442585_England_20200410_null_1,epi_isl_436843_Michigan_20200323_null_1,epi_isl_437918_Ischgl_20200309_null_1,epi_isl_444469_Gujarat_20200429_null_1,epi_isl_444860_Unknown_20200327_null_3,epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1,epi_isl_437365_Minnesota_20200405_null_1,epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1,epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1,epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1,epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3,epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1,epi_isl_435484_New_York_20200330_null_3,(epi_isl_434848_Texas_20200322_null_1,epi_isl_444570_Illinois_20200316_null_5)Node460,epi_isl_443257_Minnesota_20200330_null_1,(epi_isl_438082_Vienna_20200321_null_3,epi_isl_440378_England_20200312_null_2)Node485,epi_isl_423863_England_20200317_null_1,epi_isl_424305_Washington_20200324_null_1,epi_isl_444847_Unknown_20200331_null_4990,epi_isl_443893_England_20200330_null_1,epi_isl_436822_Michigan_20200318_null_1,epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_423633_England_20200321_null_1,(epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1,epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1)Node479,epi_isl_437123_Michigan_20200318_null_2,epi_isl_442919_England_20200408_null_1,(epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1,epi_isl_444868_Unknown_20200328_null_1)Node504,epi_isl_443733_England_20200325_null_1,epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1,(epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1,epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1)Node511,epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1,epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_444194_England_20200414_null_3,epi_isl_441718_England_20200406_null_4,epi_isl_444698_New_York_20200330_null_5,(epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_11,epi_isl_437802_Virginia_20200413_null_1)Node531,epi_isl_437513_Alaska_20200323_null_1,(epi_isl_437304_Nevsehir_20200326_null_3,epi_isl_442143_England_20200405_null_2)Node544,epi_isl_435540_New_York_20200421_null_3,(epi_isl_443596_England_20200417_null_1,epi_isl_423558_England_20200331_null_1,epi_isl_442278_England_20200404_null_31)Node553,epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1,(epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_444639_New_York_20200330_null_1)Node560,epi_isl_434919_Texas_20200327_null_3,(epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1,epi_isl_444550_Illinois_20200315_null_1)Node582,((epi_isl_444252_England_20200419_null_2,epi_isl_444264_England_20200419_null_1)Node578,(epi_isl_423564_England_20200401_null_1,epi_isl_439471_England_20200330_null_2)Node575,epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1,epi_isl_443809_England_20200326_null_123)Node570,epi_isl_437785_Virginia_20200417_null_9,epi_isl_436325_Comunitat_Valenciana_20200326_null_2,epi_isl_436423_Delhi_20200405_null_1,(epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1,((epi_isl_442676_England_20200405_null_1,epi_isl_444215_England_20200415_null_2,epi_isl_444421_England_20200419_null_34)Node599,epi_isl_425585_England_20200324_null_1)Node598,epi_isl_435520_New_York_20200420_null_4)Node596,(epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_442090_England_20200406_null_3)Node590,(epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_444467_Gujarat_20200429_null_1)Node593)Node364,(epi_isl_441327_England_20200402_null_8,epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1,epi_isl_433764_England_20200405_null_1)Node607,epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1,epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3,epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1,epi_isl_443886_England_20200330_null_1,epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6,epi_isl_434555_Manila_20200326_null_1,epi_isl_443764_England_20200326_null_8,(epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1,epi_isl_441378_Northern_Ireland_20200321_null_1)Node56,epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1,epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5,epi_isl_434135_Washington_20200326_null_1,(epi_isl_443285_Hauts_de_France_20200402_null_2,epi_isl_433409_Scotland_20200407_null_1,epi_isl_441646_England_20200404_null_1)Node650,((epi_isl_434593_Virginia_20200411_null_1,epi_isl_434943_Texas_20200401_null_1)Node641,epi_isl_441703_England_20200406_null_3)Node640,(epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1,epi_isl_436826_Michigan_20200319_null_3,epi_isl_441293_England_20200401_null_2)Node645,epi_isl_421665_India_20200310_null_3,epi_isl_438653_England_20200422_null_1,(epi_isl_437896_Athens_20200308_null_4,epi_isl_438508_England_20200329_null_1,epi_isl_440755_England_20200403_null_3,epi_isl_434662_Vastra_Gotaland_20200407_null_1,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1)Node656,(epi_isl_432813_England_20200330_null_7,epi_isl_439698_England_20200408_null_1)Node665,((epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,epi_isl_437848_Washington_20200403_null_1)Node670,epi_isl_435071_Delhi_20200325_null_1)Node669,(epi_isl_432780_England_20200415_null_2,epi_isl_444756_New_York_20200402_null_1)Node674,epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4,epi_isl_439689_England_20200407_null_6,(epi_isl_444134_England_20200408_null_5,epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1,epi_isl_438991_Scotland_20200421_null_7)Node678,(epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1,epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1,epi_isl_432744_England_20200401_null_1,epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1,epi_isl_444516_Quebec_20200406_null_91)Node683,epi_isl_425280_England_20200101_null_1,epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_2,(epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1,epi_isl_440326_England_20200317_null_1,epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_444281_England_20200416_null_5)Node705,epi_isl_441723_England_20200406_null_2,epi_isl_443987_England_20200329_null_1,((epi_isl_434168_Washington_20200330_null_1,epi_isl_437860_Washington_20200404_null_17)Node731,epi_isl_443879_England_20200327_null_1)Node730,epi_isl_443725_England_20200325_null_1,epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1,epi_isl_444173_England_20200411_null_2,(epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3,epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2,epi_isl_444284_England_20200416_null_3)Node763,(epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1,epi_isl_443097_England_20200408_null_9)Node769,epi_isl_433419_Scotland_20200408_null_1,epi_isl_418738_England_20200317_null_1,epi_isl_438220_Washington_20200421_null_3,(epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1,epi_isl_441805_England_20200401_null_18)Node777,epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_437106_Michigan_20200314_null_1,((epi_isl_418728_England_20200318_null_1,epi_isl_441660_England_20200407_null_6)Node783,epi_isl_441653_England_20200405_null_1)Node782,(epi_isl_437113_Michigan_20200317_null_1,epi_isl_441858_England_20200420_null_3)Node788,epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1,(epi_isl_431911_Wales_20200405_null_3,(epi_isl_442756_England_20200406_null_1,epi_isl_443816_England_20200326_null_5)Node795,epi_isl_442157_England_20200405_null_54)Node793,epi_isl_439509_England_20200331_null_1,epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1,epi_isl_440561_England_20200402_null_1,epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3,epi_isl_438698_England_20200425_null_3,((epi_isl_442337_England_20200406_null_1,epi_isl_444411_England_20200419_null_20)Node822,epi_isl_442621_England_20200412_null_1)Node821,((epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1,epi_isl_444367_England_20200427_null_6)Node805,epi_isl_439542_England_20200324_null_1)Node804,(epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2,epi_isl_444023_California_20200501_null_36)Node810,epi_isl_423319_England_20200326_null_2,(epi_isl_437586_California_20200324_null_2,epi_isl_441533_England_20200425_null_2,epi_isl_444383_England_20200101_null_12)Node815,epi_isl_438534_England_20200331_null_2,((epi_isl_423659_England_20200323_null_1,epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2,epi_isl_441277_England_20200402_null_2)Node841,epi_isl_443566_England_20200416_null_2)Node840,((epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2,epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1)Node836,epi_isl_424122_England_20200312_null_1)Node835,(epi_isl_439230_Scotland_20200424_null_1,epi_isl_443910_England_20200325_null_13)Node832,epi_isl_424115_England_20200312_null_6,epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1,epi_isl_433929_England_20200412_null_1,epi_isl_442366_England_20200409_null_3,(epi_isl_438331_England_20200330_null_1,epi_isl_423517_England_20200330_null_1,epi_isl_434269_Washington_20200330_null_8)Node850,(epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1,epi_isl_437947_Ramsau_im_Zillertal_20200324_null_4)Node855,((epi_isl_438157_Washington_20200419_null_2,epi_isl_440560_England_20200402_null_1)Node860,epi_isl_423897_England_20200318_null_1)Node859,epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2,epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1,epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1,(epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1,epi_isl_432425_Wales_20200401_null_1,epi_isl_438208_Washington_20200416_null_2,epi_isl_442220_England_20200405_null_1,epi_isl_442678_England_20200406_null_4,epi_isl_444132_England_20200408_null_1)Node866,epi_isl_442933_England_20200407_null_1,((epi_isl_437078_California_20200407_null_1,epi_isl_444370_England_20200428_null_22)Node887,epi_isl_442848_England_20200411_null_9)Node886,epi_isl_442530_England_20200406_null_10,epi_isl_443328_England_20200416_null_1,(epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1,epi_isl_440766_England_20200403_null_2)Node892,epi_isl_436442_Maharashtra_20200409_null_1,((epi_isl_432064_Wales_20200301_null_2,epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2,epi_isl_441207_England_20200404_null_6)Node898,epi_isl_437316_Denizli_20200325_null_1)Node897,epi_isl_429020_California_20200331_null_1,epi_isl_433645_Scotland_20200405_null_1,(epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2,epi_isl_439362_Scotland_20200501_null_4)Node905,epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1,epi_isl_440472_England_20200319_null_1,epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1,(epi_isl_438808_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_439777_England_20200408_null_1,epi_isl_444745_New_York_20200402_null_29)Node927,(epi_isl_423561_England_20200331_null_2,epi_isl_437634_Unknown_20200401_null_1)Node923,epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1,(epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1,epi_isl_421663_India_20200310_null_1)Node94,epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2,((epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2,epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1,epi_isl_432966_England_20200331_null_5)Node937,epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1)Node936,(epi_isl_438585_England_20200421_null_1,epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2,epi_isl_433035_England_20200403_null_1)Node943,epi_isl_439744_England_20200409_null_3,epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1,epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1,(epi_isl_441776_Northern_Ireland_20200326_null_2,epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_4)Node954,epi_isl_424154_England_20200320_null_1,(epi_isl_423572_England_20200401_null_1,(epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8,epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1)Node1286,epi_isl_442318_England_20200405_null_4)Node1284,epi_isl_440044_England_20200321_null_1,(epi_isl_436850_Michigan_20200324_null_1,epi_isl_444606_Illinois_20200320_null_10)Node1277,(epi_isl_423396_England_20200328_null_2,epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8)Node1280,(epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2,epi_isl_436945_LA_20200406_null_1)Node1257,(epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1,epi_isl_436723_Abruzzo_20200320_null_2,epi_isl_436724_Abruzzo_20200321_null_2,epi_isl_443069_England_20200410_null_3)Node1262,(epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1,epi_isl_439891_England_20200328_null_1)Node1270,epi_isl_443947_England_20200327_null_1,(epi_isl_423291_England_20200326_null_1,epi_isl_434720_Texas_20200315_null_1,epi_isl_444131_England_20200408_null_3)Node1247,(epi_isl_421963_England_20200401_null_1,epi_isl_437267_Bavaria_20200327_null_2)Node1252,(epi_isl_423712_England_20200322_null_1,(epi_isl_439512_England_20200331_null_1,epi_isl_442227_England_20200404_null_1)Node1241,epi_isl_436608_Wisconsin_20200416_null_1)Node1239,(epi_isl_423364_England_20200328_null_1,epi_isl_438297_England_20200329_null_6)Node1236,((epi_isl_432133_Wales_20200404_null_1,epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1,epi_isl_444828_Unknown_20200311_null_5)Node1230,epi_isl_443475_England_20200413_null_2)Node1229,((epi_isl_418300_England_20200315_null_1,epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_443063_England_20200406_null_24)Node1223,epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1)Node1222,(epi_isl_423338_England_20200327_null_1,epi_isl_441787_England_20200402_null_3)Node1218,epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2,((epi_isl_441840_England_20200401_null_2,epi_isl_443360_England_20200416_null_2)Node1213,epi_isl_438059_Vienna_20200317_null_1)Node1212,(epi_isl_443354_England_20200416_null_1,epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1,epi_isl_423175_England_20200324_null_1,epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_440742_England_20200403_null_32)Node1203,(epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_424037_England_20200320_null_1,epi_isl_432692_England_20200407_null_1)Node1198,(epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_439020_Scotland_20200424_null_5,epi_isl_443560_England_20200414_null_2)Node1192,epi_isl_443486_England_20200413_null_3,epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2,(epi_isl_442313_England_20200405_null_5,epi_isl_434464_Athens_20200316_null_1,epi_isl_443205_Singapore_20200318_null_8)Node1184,(epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1,epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6,epi_isl_444493_Montevideo_20200313_null_102,epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1,epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_438998_Scotland_20200422_null_1,epi_isl_436127_Victoria_20200413_null_1,epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1)Node1166,(epi_isl_423586_England_20200402_null_2,epi_isl_436332_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1)Node1181,(epi_isl_422006_England_20200403_null_1,epi_isl_440956_England_20200327_null_1)Node1160,epi_isl_421872_England_20200327_null_1,(epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1,epi_isl_444068_California_20200430_null_4)Node1155,epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1,(epi_isl_432815_England_20200330_null_2,epi_isl_441148_England_20200404_null_4)Node1151,(epi_isl_432269_Wales_20200407_null_1,epi_isl_439034_Scotland_20200425_null_4)Node1148,(epi_isl_431943_Wales_20200330_null_1,epi_isl_437122_Michigan_20200318_null_1)Node1145,(epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2,epi_isl_440761_England_20200404_null_1)Node1142,(epi_isl_437281_Bavaria_20200401_null_6,epi_isl_443935_England_20200329_null_1)Node1139,epi_isl_443844_England_20200326_null_39,(epi_isl_418730_England_20200318_null_1,(epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_439926_England_20200324_null_2)Node1128,epi_isl_432979_England_20200401_null_2,(epi_isl_432529_England_20200331_null_1,epi_isl_420291_England_20200315_null_1,epi_isl_432472_England_20200322_null_5)Node1122,epi_isl_423840_England_20200324_null_1,epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1,epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2,epi_isl_434006_England_20200413_null_3,epi_isl_440152_England_20200321_null_1,(epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1,epi_isl_441530_England_20200424_null_2)Node1112,(epi_isl_423080_England_20200323_null_2,epi_isl_443754_England_20200326_null_5)Node994,(epi_isl_423687_England_20200323_null_1,epi_isl_441755_England_20200406_null_10)Node990,epi_isl_441791_England_20200403_null_1,epi_isl_443036_England_20200410_null_3,epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1,(epi_isl_421917_England_20200327_null_1,epi_isl_444244_England_20200419_null_1)Node1002,epi_isl_440470_England_20200312_null_1,epi_isl_438536_England_20200401_null_1,(epi_isl_420518_England_20200323_null_1,epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1)Node1105,(epi_isl_423957_England_20200319_null_1,epi_isl_432960_England_20200330_null_1)Node1102,(epi_isl_440310_England_20200320_null_1,epi_isl_440370_England_20200318_null_1)Node1080,epi_isl_440371_England_20200320_null_1,epi_isl_444943_Unknown_20200328_null_2273,epi_isl_440076_England_20200323_null_1,epi_isl_423998_England_20200321_null_1,epi_isl_438282_England_20200331_null_1,epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6,epi_isl_433442_Scotland_20200412_null_2,epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_440132_England_20200322_null_1,epi_isl_441225_England_20200403_null_1,epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1,epi_isl_423341_England_20200327_null_1,epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1,epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1,epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1,epi_isl_437523_Oregon_20200407_null_8,epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1,epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1,epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1,epi_isl_437895_Athens_20200307_null_2,epi_isl_436259_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1,epi_isl_418713_England_20200317_null_1,epi_isl_423995_England_20200321_null_2,epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2,epi_isl_423047_England_20200324_null_1,epi_isl_439546_England_20200328_null_1,epi_isl_443793_England_20200326_null_1,epi_isl_442195_England_20200405_null_1,(epi_isl_422436_England_20200327_null_1,epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1)Node1057,epi_isl_423663_England_20200323_null_1,((epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5,epi_isl_440644_England_20200404_null_1)Node1068,epi_isl_440394_England_20200318_null_1)Node1067,epi_isl_443979_England_20200326_null_1,((epi_isl_421893_England_20200327_null_1,epi_isl_440230_England_20200323_null_1)Node1098,epi_isl_423914_England_20200318_null_1)Node1097,epi_isl_421871_England_20200327_null_1,epi_isl_423913_England_20200318_null_1,epi_isl_423846_England_20200324_null_1,epi_isl_424021_England_20200320_null_1,epi_isl_439493_England_20200330_null_1,epi_isl_418698_England_20200317_null_1,epi_isl_420685_England_20200329_null_1)Node980,(epi_isl_438588_England_20200422_null_1,epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1,epi_isl_440699_England_20200402_null_3)Node1133)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1002":"test",
"Node1057":"test",
"Node1067":"test",
"Node1068":"test",
"Node1080":"test",
"Node1097":"test",
"Node1098":"test",
"Node1102":"test",
"Node1105":"test",
"Node1112":"test",
"Node1122":"test",
"Node1128":"test",
"Node1133":"test",
"Node1139":"test",
"Node1142":"test",
"Node1145":"test",
"Node1148":"test",
"Node1151":"test",
"Node1155":"test",
"Node1160":"test",
"Node1166":"test",
"Node1181":"test",
"Node1184":"test",
"Node1192":"test",
"Node1198":"test",
"Node1203":"test",
"Node1212":"test",
"Node1213":"test",
"Node1218":"test",
"Node1222":"test",
"Node1223":"test",
"Node1229":"test",
"Node1230":"test",
"Node1236":"test",
"Node1239":"test",
"Node1241":"test",
"Node1247":"test",
"Node1252":"test",
"Node1257":"test",
"Node1262":"test",
"Node1270":"test",
"Node1277":"test",
"Node1280":"test",
"Node1284":"test",
"Node1286":"test",
"Node1294":"test",
"Node1295":"test",
"Node1296":"test",
"Node1300":"test",
"Node1301":"test",
"Node1311":"test",
"Node1361":"test",
"Node1366":"test",
"Node1370":"test",
"Node1377":"test",
"Node1380":"test",
"Node1385":"test",
"Node1403":"test",
"Node1412":"test",
"Node1415":"test",
"Node1429":"test",
"Node1439":"test",
"Node1478":"test",
"Node1482":"test",
"Node1485":"test",
"Node1497":"test",
"Node1498":"test",
"Node1499":"test",
"Node150":"test",
"Node1516":"test",
"Node1517":"test",
"Node1530":"test",
"Node1536":"test",
"Node1546":"test",
"Node1549":"test",
"Node1553":"test",
"Node1554":"test",
"Node1561":"test",
"Node1564":"test",
"Node1567":"test",
"Node1570":"test",
"Node1574":"test",
"Node1581":"test",
"Node1586":"test",
"Node1591":"test",
"Node1596":"test",
"Node1601":"test",
"Node1606":"test",
"Node1623":"test",
"Node180":"test",
"Node184":"test",
"Node208":"test",
"Node223":"test",
"Node281":"test",
"Node284":"test",
"Node290":"test",
"Node294":"test",
"Node297":"test",
"Node301":"test",
"Node304":"test",
"Node307":"test",
"Node311":"test",
"Node316":"test",
"Node319":"test",
"Node327":"test",
"Node330":"test",
"Node335":"test",
"Node345":"test",
"Node353":"test",
"Node364":"test",
"Node411":"test",
"Node460":"test",
"Node479":"test",
"Node485":"test",
"Node504":"test",
"Node511":"test",
"Node531":"test",
"Node535":"test",
"Node539":"test",
"Node544":"test",
"Node548":"test",
"Node553":"test",
"Node56":"test",
"Node560":"test",
"Node565":"test",
"Node570":"test",
"Node575":"test",
"Node578":"test",
"Node582":"test",
"Node590":"test",
"Node593":"test",
"Node596":"test",
"Node598":"test",
"Node599":"test",
"Node607":"test",
"Node613":"test",
"Node618":"test",
"Node625":"test",
"Node626":"test",
"Node640":"test",
"Node641":"test",
"Node645":"test",
"Node650":"test",
"Node656":"test",
"Node665":"test",
"Node669":"test",
"Node670":"test",
"Node674":"test",
"Node678":"test",
"Node683":"test",
"Node692":"test",
"Node693":"test",
"Node705":"test",
"Node712":"test",
"Node713":"test",
"Node719":"test",
"Node720":"test",
"Node724":"test",
"Node725":"test",
"Node730":"test",
"Node731":"test",
"Node736":"test",
"Node737":"test",
"Node741":"test",
"Node746":"test",
"Node747":"test",
"Node751":"test",
"Node752":"test",
"Node756":"test",
"Node757":"test",
"Node763":"test",
"Node769":"test",
"Node777":"test",
"Node782":"test",
"Node783":"test",
"Node788":"test",
"Node793":"test",
"Node795":"test",
"Node804":"test",
"Node805":"test",
"Node810":"test",
"Node815":"test",
"Node821":"test",
"Node822":"test",
"Node832":"test",
"Node835":"test",
"Node836":"test",
"Node840":"test",
"Node841":"test",
"Node850":"test",
"Node855":"test",
"Node859":"test",
"Node860":"test",
"Node866":"test",
"Node878":"test",
"Node879":"test",
"Node886":"test",
"Node887":"test",
"Node892":"test",
"Node897":"test",
"Node898":"test",
"Node905":"test",
"Node909":"test",
"Node910":"test",
"Node911":"test",
"Node923":"test",
"Node927":"test",
"Node936":"test",
"Node937":"test",
"Node94":"test",
"Node943":"test",
"Node954":"test",
"Node980":"test",
"Node990":"test",
"Node994":"test",
"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1":"background",
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":"background",
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":"background",
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":"background",
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":"background",
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1":"background",
"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1":"background",
"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2":"background",
"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1":"background",
"epi_isl_416423_Connecticut_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2":"background",
"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_418300_England_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_418698_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418713_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418728_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_418730_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_418738_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2":"background",
"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2":"background",
"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_420291_England_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_420671_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420685_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_420704_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"background",
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2":"background",
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5":"background",
"epi_isl_421663_India_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_3":"background",
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_421830_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421932_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_421956_England_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_421972_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_422006_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_423047_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423080_England_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_423166_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423175_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423239_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423290_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_423291_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_423309_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_423338_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_423340_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_423341_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423364_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_423396_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_423410_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423431_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423505_England_20200330_null_7":"background",
"epi_isl_423517_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423561_England_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_423564_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_423572_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423586_England_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_423619_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_423633_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423663_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423712_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_423726_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":"background",
"epi_isl_423821_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423840_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423846_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_423876_England_20200318_null_3":"background",
"epi_isl_423897_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423914_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423919_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_423926_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423952_England_20200319_null_3":"background",
"epi_isl_423957_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423995_England_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_423998_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424021_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424037_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424115_England_20200312_null_6":"background",
"epi_isl_424122_England_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3":"background",
"epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_424305_Washington_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29":"background",
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2":"background",
"epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_425280_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_425439_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_425602_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_425639_England_20200330_null_3":"background",
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5":"background",
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6":"background",
"epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5":"background",
"epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8":"background",
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8":"background",
"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2":"background",
"epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3":"background",
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6":"background",
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1":"background",
"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3":"background",
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_429010_California_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429020_California_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3":"background",
"epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5":"background",
"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4":"background",
"epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3":"background",
"epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7":"background",
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3":"background",
"epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18":"background",
"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6":"background",
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2":"background",
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2":"background",
"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_431089_Connecticut_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_431911_Wales_20200405_null_3":"background",
"epi_isl_431943_Wales_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_431959_Wales_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_432036_Wales_20200401_null_3":"background",
"epi_isl_432064_Wales_20200301_null_2":"background",
"epi_isl_432068_Wales_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432190_Wales_20200323_null_18":"background",
"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_432269_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_432279_Wales_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_432288_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432411_Wales_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_432425_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432443_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_432472_England_20200322_null_5":"background",
"epi_isl_432529_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432692_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_432744_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432755_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432780_England_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_432813_England_20200330_null_7":"background",
"epi_isl_432815_England_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_432954_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432960_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432966_England_20200331_null_5":"background",
"epi_isl_432979_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_433035_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_433037_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_433154_Scotland_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_433358_Scotland_20200327_null_4":"background",
"epi_isl_433407_Scotland_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_433409_Scotland_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_433410_Scotland_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_433419_Scotland_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_433442_Scotland_20200412_null_2":"background",
"epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_4":"background",
"epi_isl_433523_Scotland_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_433530_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_433561_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433645_Scotland_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_433764_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_433841_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_433870_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_433876_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_433929_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_434006_England_20200413_null_3":"background",
"epi_isl_434135_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434168_Washington_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_434214_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_434216_Washington_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_434269_Washington_20200330_null_8":"background",
"epi_isl_434305_Washington_20200331_null_8":"background",
"epi_isl_434356_Ghent_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_434464_Athens_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_434528_Louisiana_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434555_Manila_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434558_Manila_20200328_null_3":"background",
"epi_isl_434593_Virginia_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_434662_Vastra_Gotaland_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_434665_Uppsala_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_434848_Texas_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_434912_Texas_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_434919_Texas_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_434940_Texas_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_434943_Texas_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_434967_Texas_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_435061_Delhi_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_435071_Delhi_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_435072_Delhi_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_435076_Haryana_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435087_Tamil_Nadu_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_4":"background",
"epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_435156_Kinshasa_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_435313_Hanoi_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_435461_Louisiana_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_435477_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_435484_New_York_20200330_null_3":"background",
"epi_isl_435520_New_York_20200420_null_4":"background",
"epi_isl_435540_New_York_20200421_null_3":"background",
"epi_isl_435558_Louisiana_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_435621_California_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_435641_California_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_435663_California_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_435671_California_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_435680_Singapore_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_435711_Connecticut_20200321_null_4":"background",
"epi_isl_436103_New_Taipei_City_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_436127_Victoria_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_436139_Karnataka_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_436217_Comunitat_Valenciana_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_436259_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_436293_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_436325_Comunitat_Valenciana_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_436332_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_436370_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_436423_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_436442_Maharashtra_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436459_Madhya_Pradesh_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_436545_Florida_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_436553_Florida_20200417_null_3":"background",
"epi_isl_436608_Wisconsin_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_436622_Wisconsin_20200426_null_2":"background",
"epi_isl_436629_Wisconsin_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_436721_Abruzzo_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_436722_Abruzzo_20200320_null_3":"background",
"epi_isl_436723_Abruzzo_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_436724_Abruzzo_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_436731_Abruzzo_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_436816_Michigan_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_436818_Michigan_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_436822_Michigan_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_436826_Michigan_20200319_null_3":"background",
"epi_isl_436832_Michigan_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_436840_Michigan_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_436843_Michigan_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_436850_Michigan_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_436865_Michigan_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_436911_Utah_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_436928_Utah_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_436945_LA_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437065_California_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_437078_California_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_437106_Michigan_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_437109_Michigan_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_437113_Michigan_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_437122_Michigan_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_437123_Michigan_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_437139_Michigan_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_437170_Michigan_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_437220_Bavaria_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_437267_Bavaria_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_437281_Bavaria_20200401_null_6":"background",
"epi_isl_437304_Nevsehir_20200326_null_3":"background",
"epi_isl_437316_Denizli_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_437352_Kinshasa_20200417_null_3":"background",
"epi_isl_437365_Minnesota_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_437376_Minnesota_20200412_null_2":"background",
"epi_isl_437454_Gujarat_20200426_null_5":"background",
"epi_isl_437477_Makkah_20200409_null_2":"background",
"epi_isl_437513_Alaska_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_437523_Oregon_20200407_null_8":"background",
"epi_isl_437529_Oregon_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_437548_Louisiana_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_437556_California_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_437557_California_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_437586_California_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_437634_Unknown_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_437785_Virginia_20200417_null_9":"background",
"epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_11":"background",
"epi_isl_437802_Virginia_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_437848_Washington_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_437860_Washington_20200404_null_17":"background",
"epi_isl_437895_Athens_20200307_null_2":"background",
"epi_isl_437896_Athens_20200308_null_4":"background",
"epi_isl_437897_Athens_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_437918_Ischgl_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_437947_Ramsau_im_Zillertal_20200324_null_4":"background",
"epi_isl_438059_Vienna_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_438082_Vienna_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_438157_Washington_20200419_null_2":"background",
"epi_isl_438175_Washington_20200429_null_2":"background",
"epi_isl_438183_Washington_20200418_null_7":"background",
"epi_isl_438208_Washington_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_438220_Washington_20200421_null_3":"background",
"epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_438277_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_438282_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_438297_England_20200329_null_6":"background",
"epi_isl_438300_England_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_438312_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438331_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438335_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_438353_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438397_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438508_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438534_England_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_438536_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_438564_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_438573_England_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_438585_England_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_438588_England_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_438638_England_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_438653_England_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_438698_England_20200425_null_3":"background",
"epi_isl_438704_England_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_438783_Scotland_20200331_null_7":"background",
"epi_isl_438808_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_438879_Scotland_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_438923_Scotland_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_438991_Scotland_20200421_null_7":"background",
"epi_isl_438998_Scotland_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_439000_Scotland_20200422_null_2":"background",
"epi_isl_439007_Scotland_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_439012_Scotland_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_439020_Scotland_20200424_null_5":"background",
"epi_isl_439031_Scotland_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_439034_Scotland_20200425_null_4":"background",
"epi_isl_439151_Scotland_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_439185_Scotland_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_439199_Scotland_20200422_null_2":"background",
"epi_isl_439230_Scotland_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_439274_Scotland_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_439327_Scotland_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_439343_Scotland_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_439362_Scotland_20200501_null_4":"background",
"epi_isl_439366_Scotland_20200502_null_5":"background",
"epi_isl_439386_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439398_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_439414_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439471_England_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_439478_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439493_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_439509_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439512_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439532_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_439542_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_439546_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_439668_Scotland_20200430_null_9":"background",
"epi_isl_439687_England_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_439689_England_20200407_null_6":"background",
"epi_isl_439698_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_439744_England_20200409_null_3":"background",
"epi_isl_439777_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_439780_England_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_439789_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_439804_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_439849_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_439891_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_439926_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_440028_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440044_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440076_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440132_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_440152_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440230_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440251_England_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_440292_England_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_440310_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_440326_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_440370_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_440371_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_440378_England_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_440379_England_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_440394_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_440470_England_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_440472_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_440488_England_20200301_null_3":"background",
"epi_isl_440560_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440561_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440580_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_440598_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_440610_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440644_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_440650_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440699_England_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_440730_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440742_England_20200403_null_32":"background",
"epi_isl_440755_England_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_440761_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_440766_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_440792_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_440832_England_20200401_null_4":"background",
"epi_isl_440943_England_20200423_null_9":"background",
"epi_isl_440956_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_441052_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441086_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441148_England_20200404_null_4":"background",
"epi_isl_441170_England_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_441207_England_20200404_null_6":"background",
"epi_isl_441225_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441277_England_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_441293_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_441295_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441327_England_20200402_null_8":"background",
"epi_isl_441345_England_20200402_null_5":"background",
"epi_isl_441378_Northern_Ireland_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_441394_Northern_Ireland_20200310_null_12":"background",
"epi_isl_441403_Northern_Ireland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_441408_Northern_Ireland_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_441424_Northern_Ireland_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_441530_England_20200424_null_2":"background",
"epi_isl_441531_England_20200424_null_5":"background",
"epi_isl_441533_England_20200425_null_2":"background",
"epi_isl_441582_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_441583_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_441620_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_441627_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441646_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_441653_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_441660_England_20200407_null_6":"background",
"epi_isl_441665_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441703_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_441718_England_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_441723_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_441732_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441737_Northern_Ireland_20200327_null_6":"background",
"epi_isl_441755_England_20200406_null_10":"background",
"epi_isl_441776_Northern_Ireland_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_441787_England_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_441791_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441805_England_20200401_null_18":"background",
"epi_isl_441820_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441840_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_441858_England_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_441892_England_20200430_null_11":"background",
"epi_isl_441977_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_441995_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_442083_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442087_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442090_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_442143_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_442157_England_20200405_null_54":"background",
"epi_isl_442195_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442211_England_20200405_null_6":"background",
"epi_isl_442220_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442227_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442234_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442263_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442278_England_20200404_null_31":"background",
"epi_isl_442292_England_20200404_null_6":"background",
"epi_isl_442313_England_20200405_null_5":"background",
"epi_isl_442318_England_20200405_null_4":"background",
"epi_isl_442320_England_20200405_null_4":"background",
"epi_isl_442337_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442353_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442366_England_20200409_null_3":"background",
"epi_isl_442481_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442530_England_20200406_null_10":"background",
"epi_isl_442537_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442585_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442591_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_442621_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_442676_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442678_England_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_442698_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442712_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442756_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442826_England_20200406_null_7":"background",
"epi_isl_442848_England_20200411_null_9":"background",
"epi_isl_442919_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442933_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442934_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442976_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442978_England_20200407_null_3":"background",
"epi_isl_443005_England_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_443026_England_20200407_null_3":"background",
"epi_isl_443036_England_20200410_null_3":"background",
"epi_isl_443057_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_443063_England_20200406_null_24":"background",
"epi_isl_443067_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_443069_England_20200410_null_3":"background",
"epi_isl_443077_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443097_England_20200408_null_9":"background",
"epi_isl_443188_Singapore_20200318_null_5":"background",
"epi_isl_443190_Singapore_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_443196_Singapore_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_443205_Singapore_20200318_null_8":"background",
"epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_443242_Singapore_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_443257_Minnesota_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_443285_Hauts_de_France_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_443308_Grand_Est_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_443328_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_443341_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_443345_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_443351_England_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_443354_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_443360_England_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_443375_England_20200416_null_6":"background",
"epi_isl_443381_England_20200412_null_14":"background",
"epi_isl_443475_England_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_443480_England_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_443486_England_20200413_null_3":"background",
"epi_isl_443534_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_443558_England_20200413_null_8":"background",
"epi_isl_443560_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443563_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_443566_England_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_443593_England_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_443596_England_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_443637_England_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_443660_England_20200416_null_4":"background",
"epi_isl_443676_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_443725_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_443733_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_443754_England_20200326_null_5":"background",
"epi_isl_443764_England_20200326_null_8":"background",
"epi_isl_443793_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443794_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_443809_England_20200326_null_123":"background",
"epi_isl_443816_England_20200326_null_5":"background",
"epi_isl_443844_England_20200326_null_39":"background",
"epi_isl_443879_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_443886_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_443888_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_443893_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_443907_England_20200326_null_30":"background",
"epi_isl_443910_England_20200325_null_13":"background",
"epi_isl_443917_England_20200329_null_138":"background",
"epi_isl_443935_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_443947_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_443949_England_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_443971_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_443975_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_443978_England_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_443979_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443980_England_20200328_null_5":"background",
"epi_isl_443987_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_444023_California_20200501_null_36":"background",
"epi_isl_444054_California_20200429_null_3":"background",
"epi_isl_444068_California_20200430_null_4":"background",
"epi_isl_444071_California_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_444080_England_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_444131_England_20200408_null_3":"background",
"epi_isl_444132_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_444134_England_20200408_null_5":"background",
"epi_isl_444167_England_20200410_null_18":"background",
"epi_isl_444173_England_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_444194_England_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_444215_England_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_444244_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_444252_England_20200419_null_2":"background",
"epi_isl_444261_England_20200418_null_62":"background",
"epi_isl_444264_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_444281_England_20200416_null_5":"background",
"epi_isl_444284_England_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_444327_England_20200427_null_8":"background",
"epi_isl_444359_England_20200428_null_3":"background",
"epi_isl_444365_England_20200428_null_9":"background",
"epi_isl_444367_England_20200427_null_6":"background",
"epi_isl_444370_England_20200428_null_22":"background",
"epi_isl_444377_England_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_444380_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_444383_England_20200101_null_12":"background",
"epi_isl_444393_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_444411_England_20200419_null_20":"background",
"epi_isl_444413_England_20200420_null_4":"background",
"epi_isl_444416_England_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_444421_England_20200419_null_34":"background",
"epi_isl_444426_England_20200419_null_4":"background",
"epi_isl_444434_England_20200101_null_2":"background",
"epi_isl_444437_England_20200418_null_14":"background",
"epi_isl_444451_England_20200415_null_591":"background",
"epi_isl_444467_Gujarat_20200429_null_1":"background",
"epi_isl_444469_Gujarat_20200429_null_1":"background",
"epi_isl_444493_Montevideo_20200313_null_102":"background",
"epi_isl_444516_Quebec_20200406_null_91":"background",
"epi_isl_444518_Washington_20200313_null_7":"background",
"epi_isl_444522_Illinois_20200317_null_3":"background",
"epi_isl_444550_Illinois_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_444570_Illinois_20200316_null_5":"background",
"epi_isl_444606_Illinois_20200320_null_10":"background",
"epi_isl_444619_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444625_New_York_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_444639_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444657_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444670_New_Jersey_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_444692_New_York_20200330_null_6":"background",
"epi_isl_444698_New_York_20200330_null_5":"background",
"epi_isl_444718_New_York_20200403_null_7":"background",
"epi_isl_444745_New_York_20200402_null_29":"background",
"epi_isl_444753_New_York_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_444756_New_York_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_444772_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_444828_Unknown_20200311_null_5":"background",
"epi_isl_444847_Unknown_20200331_null_4990":"background",
"epi_isl_444857_Unknown_20200405_null_13606":"background",
"epi_isl_444860_Unknown_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_444868_Unknown_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_444925_Unknown_20200328_null_180":"background",
"epi_isl_444943_Unknown_20200328_null_2273":"background",
"epi_isl_444949_Unknown_20200330_null_1":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":46
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":202
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":249
}
}
}