{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[287.8252466965218, 708.978213029911, 0, 1, 0.2887482420812563, 0, 0.001410480578417734, 0.005862014531253089, 0.7112517579187437, 1, 0.0009737547083034491],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009732907358635251],
[287.9742844836689, 708.8203177233599, 0, 1, 0.2889003249476447, 0, 0.001410794774071759, 0.005863320341143515, 0.7110996750523553, 1, 0.000973541956235272],
[287.9742844836689, 708.8203177233601, 0, 1, 0.2889003249476447, 0, 0.001410794774071759, 0.005863320341143514, 0.7110996750523553, 1, 0.0009734159333958134],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009732745184289448],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009735139779501026],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.0009742756935232295],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009732745184383745],
[287.8252466965218, 709.324130228115, 0, 1, 0.2886480735556587, 0, 0.001409792727167487, 0.00585915579353916, 0.7113519264443413, 1, 0.0009742839754695027],
[287.9650520104217, 708.8295501966072, 0, 1, 0.2888910627854834, 0, 0.001410776398532808, 0.005863243971657827, 0.7111089372145165, 1, 0.0009734789511523234],
[287.9934878650376, 708.6939157720005, 0, 1, 0.2889506647862841, 0, 0.001411046402043217, 0.005864366117205751, 0.7110493352137159, 1, 0.0009739137376773311],
[287.9296869393312, 709.2801603201043, 0, 1, 0.288735302534997, 0, 0.00140988012346023, 0.005859519016078962, 0.711264697465003, 1, 0.0009815345875183734],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153307, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846693, 1, 0.0009737940570638119],
[287.6332931789375, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2885706611600425, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7114293388399575, 1, 0.0009739137376773311],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153307, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846693, 1, 0.0009742886908927833],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009735013724946007],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009739807551875927],
[287.8252466965218, 708.8934580823176, 0, 1, 0.2887727954903656, 0, 0.001410649214770831, 0.005862715390781024, 0.7112272045096344, 1, 0.0009736971016617081],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009735013724946007],
[287.8252466965218, 708.978213029911, 1, 0, 0.2887482420812563, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887482420812563, 0.0009732394855903422],
[287.7758568200189, 709.01874538701, 1, 0, 0.2887012591990836, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2887012591990836, 0.0009732268890320974],
[287.7180481265309, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098673, 0.003475624857430654, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009739875282120933],
[287.8131179346034, 709.2432149544341, 0.5, 2.5, 0.2886628452583473, 0.001737238398263728, 0.003524883914695771, 0.007429527321680359, 0.579032326618934, 0.6400630100900183, 0.00293716968069355],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.7180481265309, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098673, 0.003475624857430654, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009739137376773311],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009735013724946007],
[287.8252466965218, 708.92643978007, 0, 1, 0.2887632402348398, 0, 0.001410583586514603, 0.00586244263708448, 0.7112367597651602, 1, 0.0009755119960277297],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009732745184559114],
[287.7758568200189, 709.01874538701, 1, 0, 0.2887012591990836, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2887012591990836, 0.0009734789446114674],
[287.8224883693404, 709.0325841724872, 0, 1, 0.2887305249251901, 0, 0.001410372417745937, 0.00586156501111117, 0.7112694750748099, 1, 0.0009742886908927833],
[288.0601159445431, 708.7344862624858, 0, 1, 0.2889864324172118, 0, 0.001410965628713094, 0.005864030419967403, 0.7110135675827882, 1, 0.00097420927587594],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009740047481922111],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009732520945619523],
[287.4650520104217, 709.3295501966072, 0, 1, 0.2883894549327794, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883388, 0.7116105450672205, 1, 0.0009738998685729414],
[287.5811449752532, 709.1276257709014, 0, 1, 0.2885307658725273, 0, 0.001410183391054449, 0.005860779408509298, 0.7114692341274726, 1, 0.0009736973090346002],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6332931789375, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2885706611600425, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7114293388399575, 1, 0.0009740243617726035],
[287.9650520104217, 708.8295501966072, 0, 1, 0.2888910627854834, 0, 0.001410776398532808, 0.005863243971657827, 0.7111089372145165, 1, 0.0009733529160713231],
[287.7180481265309, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098673, 0.003475624857430654, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009739137306169982],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0009742886908927833],
[287.8252466965218, 709.0900912231363, 0, 1, 0.2887158374924289, 0, 0.001410258036852641, 0.005861089639476241, 0.7112841625075712, 1, 0.0009738614459784562],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.0009739137377057886],
[287.877394900206, 708.8567369720241, 0, 1, 0.2888206450394824, 0, 0.001410722291039559, 0.005863019098719815, 0.7111793549605177, 1, 0.0009759550506891278],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009737940570638119],
[287.8252466965218, 708.978213029911, 1, 0, 0.2887482420812563, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887482420812563, 0.0009732520945794952],
[287.8681624269589, 708.92643978007, 0, 1, 0.288793861633663, 0, 0.001410583586514603, 0.00586244263708448, 0.7112061383663371, 1, 0.0009742886981446451],
[287.8252466965218, 709.0900912231363, 0, 1, 0.2887158374924289, 0, 0.001410258036852641, 0.005861089639476241, 0.7112841625075712, 1, 0.0009738614459604981],
[288.2464839811468, 708.1642111907137, 0, 1, 0.2892848153656462, 0, 0.00141210186027135, 0.005868752644439885, 0.7107151846343538, 1, 0.0009736973090346002],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.9934878650376, 708.6091608244071, 0, 1, 0.2889752382694905, 0, 0.001411215173730726, 0.005865067539188997, 0.7110247617305095, 1, 0.0009738398813559608],
[287.4650520104217, 709.3295501966072, 0, 1, 0.2883894549327793, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883388, 0.7116105450672207, 1, 0.0009742004042537898],
[287.9742844836689, 708.8203177233599, 0, 1, 0.2889003249476447, 0, 0.001410794774071759, 0.005863320341143515, 0.7110996750523553, 1, 0.0009732745183947049],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.000973794057123478],
[287.8252466965218, 709.0541104581006, 0, 1, 0.2887262582285353, 0, 0.001410329600027179, 0.005861387058934164, 0.7112737417714647, 1, 0.0009736971089424406],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009732520945451379],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.0009743016950228235],
[287.5782428126309, 709.0244058768137, 1, 0, 0.288558577674666, 0.003477314522196108, 0, -0.01445186028843989, 1, 0.288558577674666, 0.0009737800544694741],
[287.718048126531, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2886743095945745, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886743095945745, 0.000973913737663019],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009759402288236616],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009735013724946007],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.000973239492012677],
[287.4907295378562, 709.3038726691727, 1, 0, 0.2884152150315777, 0.003478373030001728, 0, -0.01445625948984184, 1, 0.2884152150315777, 0.000974660185599285],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0009740243618156988],
[287.9934878650376, 708.6939157720005, 0, 1, 0.2889506647862841, 0, 0.001411046402043217, 0.005864366117205751, 0.7110493352137159, 1, 0.0009739875282120933],
[287.7459117174205, 709.0486904896084, 0, 1, 0.2886712178018568, 0, 0.001410340380587242, 0.00586143186337934, 0.7113287821981431, 1, 0.0009739807622621792],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009736971089999554],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0009738614531862918],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009732745184289448],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0009743017022809214],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009737800544277118],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009739137376773311],
[288.0144418869246, 708.840630654903, 0, 1, 0.2889230840271815, 0, 0.001410754345551683, 0.005863152318573203, 0.7110769159728185, 1, 0.0009736959132989846],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009737940642822938],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009732745184559114],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009735139779501026],
[288.1332931789375, 709.2400029168487, 0, 1, 0.2888921272575015, 0, 0.00140995995133856, 0.005859850783981288, 0.7111078727424985, 1, 0.0009742886981481687],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009732520945451379],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.000975511986210163],
[287.7180481265309, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2886743095945744, 0.003475624857430654, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886743095945744, 0.000973794057123478],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009738998686015438],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009733529160713231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.5854484753387, 1, 0, 0.288862060685607, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2888620606856069, 0.0009746506628224074],
[287.8252466965218, 708.5854484753387, 0, 0, 0.288862060685607, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004469091708609767],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0005269905312667886],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009744267723615462],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009740848712633654],
[287.6854413826218, 709.1091608244071, 0, 1, 0.2886105530122755, 0, 0.001410220111720746, 0.005860932021088815, 0.7113894469877244, 1, 0.0009732268889707272],
[287.6850664287785, 709.1095357782503, 1, 0, 0.2886101768526911, 0.003476023320965698, 0, -0.01444649400372017, 1, 0.2886101768526912, 0.0009739414671937411],
[287.8802970628283, 709.0955111916284, 0, 1, 0.2887535431445023, 0, 0.001410247257551397, 0.005861044840262772, 0.7112464568554977, 1, 0.0009734440731901653],
[287.2758568200189, 709.6999514344377, 1, 2, 0.2881472694136806, 0.003480974736510871, 0.002818092344458559, -0.002754966125858715, 0.7987625255575455, 0.6392797977139743, 0.002925643407029959],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009732745184559114],
[287.8252466965218, 708.978213029911, 0, 1, 0.2887482420812563, 0, 0.001410480578417734, 0.005862014531253089, 0.7112517579187437, 1, 0.0009733529096037421],
[287.9742844836689, 708.8203177233601, 0, 1, 0.2889003249476447, 0, 0.001410794774071759, 0.005863320341143514, 0.7110996750523553, 1, 0.0009736959132768448],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009735013725373663],
[287.7758568200189, 709.0187453870101, 1, 0, 0.2887012591990836, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2887012591990836, 0.0009732521010150384],
[287.7758568200189, 709.1677831741572, 1, 0, 0.2886580998918856, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2886580998918856, 0.0009734915440536039],
[287.9440979885347, 708.807588488057, 0, 1, 0.2888824788512629, 0, 0.00141082011005706, 0.005863425638526742, 0.7111175211487371, 1, 0.0009742886908927833],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009739137306169982],
[287.9100016441152, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2888358353934162, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7111641646065838, 1, 0.0009736021955208362],
[288.1305348517561, 709.3032315788287, 0, 2, 0.2888718474840286, 0, 0.002819668529562775, 0.01171865685109684, 0.5057032493007787, 1, 0.001949404897094474],
[286.9100016441151, 709.8846005629138, 0, 1, 0.2878326196880082, 0, 0.001408679663155159, 0.005854529854327859, 0.7121673803119919, 1, 0.0009742839674296952],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009737940571054978],
[287.9100016441151, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2888358353934162, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7111641646065838, 1, 0.000973239492012677],
[289.0512965585255, 707.7003899180663, 1, 1, 0.2899932856700652, 0.003459593545872663, 0.001413027340730693, -0.008505612212804704, 0.91590389426628, 0.4958904656064103, 0.00194803869377865],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.3252466965218, 708.4693555105072, 0, 1, 0.2892524157515834, 0, 0.001411493654908224, 0.005866224918265429, 0.7107475842484166, 1, 0.0009737956157492203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009741509250477757],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.00097420927587594],
[287.6762089093746, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2886012908501142, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7113987091498858, 1, 0.0009742558283825109],
[288.6006864350284, 708.1939157720005, 0, 1, 0.2895287412231468, 0, 0.001412042630880134, 0.005868506484686042, 0.7104712587768531, 1, 0.0009738468316133069],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 0, 0.2887508078988795, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004074354047614252],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0005665686717361731],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.4231439666477, 708.2856267795071, 0, 1, 0.2893755452264444, 0, 0.001411859795245153, 0.005867746612366289, 0.7106244547735556, 1, 0.0009739958547200553],
[287.8709957629634, 708.8377749831914, 0, 1, 0.2888215737757157, 0, 0.001410760029011875, 0.005863175939264436, 0.7111784262242844, 1, 0.0009748910867248265],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.9440979885347, 708.8075884880571, 0, 1, 0.2888824788512629, 0, 0.00141082011005706, 0.005863425638526741, 0.7111175211487371, 1, 0.0009737688103493873],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.0396438365034, 708.7549583705255, 0, 0, 0.2889658944769036, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003970291488078845],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0005764333211658822],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009739778069785422],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6108495565401, 709.1837526504888, 0, 1, 0.2885357213208553, 0, 0.001410071785010049, 0.005860315569259004, 0.7114642786791447, 1, 0.000974469531676681],
[287.7180481265309, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098673, 0.003475624857430654, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009738500196429469],
[287.6762089093746, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2886012908501142, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7113987091498858, 1, 0.0009739807622621792],
[287.9324452665126, 708.8621569405162, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009732619164165286],
[287.7758568200189, 708.8267918694258, 1, 1, 0.2887568653348963, 0.00347492667053519, 0.001410781888425306, -0.008578669492147225, 0.9166194727219646, 0.494133203391757, 0.001949057784049119],
[288.4440979885347, 708.9291981072515, 0, 1, 0.2892037506093736, 0, 0.001410578098165331, 0.005862419827282149, 0.7107962493906264, 1, 0.0009739260045252262],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.8486197978781, 0, 1, 0.2887857867778648, 0, 0.001410738445516253, 0.005863086237380619, 0.7112142132221353, 1, 0.0009734915505557657],
[287.8224883693404, 709.0325841724872, 0, 1, 0.2887305249251901, 0, 0.001410372417745937, 0.00586156501111117, 0.7112694750748099, 1, 0.000974275693503036],
[287.6360515061189, 709.0980803661113, 0, 1, 0.2885785108671191, 0, 0.001410242148002565, 0.005861023604770442, 0.7114214891328809, 1, 0.0009747591188282709],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.3252466965217, 709.4693555105072, 0, 1, 0.2882492000461754, 0, 0.001409504148745703, 0.005857956449905658, 0.7117507999538246, 1, 0.0009743322665862144],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.4413396613533, 709.3532625456756, 0, 0, 0.2883656663317818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911122567005153],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153307, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846693, 1, 0.0005827122782559935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 0, 0.2887508078988795, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911122581900134],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0005827122782559935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 0, 0.2887508078988795, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911122567151094],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0005827122782559935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 0, 0.2887508078988795, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911122584955933],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0005827122782559935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6108495565401, 709.1837526504888, 0, 0, 0.2885357213208553, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911122566829006],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0005827122782559935],
[288.2091537316903, 708.5854484753387, 0, 0, 0.2891359494659771, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003887722057744662],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0005848249376135076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.0396438365034, 708.7549583705254, 0, 0, 0.2889658944769036, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003887714252341262],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0005848249376135076],
[287.4413396613533, 709.3532625456756, 0, 0, 0.2883656663317818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911122567005153],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0005827122782559935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.4413396613533, 709.2674310848014, 0, 0, 0.28839049890789, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911264414797851],
[287.6332931789375, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2885706611600425, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7114293388399575, 1, 0.0005827002042203031],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6108495565401, 709.1837526504888, 0, 0, 0.2885357213208553, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003908924015973246],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.000582945906321258],
[287.8252466965218, 708.6145807928993, 0, 2, 0.2888536153976418, 0, 0.002822408759585661, 0.01173004535829001, 0.5057291803330052, 1, 0.001948465873701333],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6762089093746, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2886012908501142, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7113987091498858, 1, 0.0009739807551875927],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.000973868523642361],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009743523459711936],
[287.8252466965218, 709.150561557935, 1, 0, 0.2886983257903291, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2886983257903291, 0.0009734663446704034],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.2968108419059, 709.6897448827073, 0, 1, 0.2881651805556171, 0, 0.00140906643672197, 0.00585613730096955, 0.7118348194443829, 1, 0.0009831837017534792],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009766910748686553],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.7124742083083, 707.106440672673, 1, 1.75, 0.2884956906285535, 0.003487814762023432, 0.002474874925952051, -0.004209819071026564, 0.8294857642619738, 0.6078174908614675, 0.001949986887972862],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.969335547269, 707.198728312022, 1, 0.75, 0.2886527398931666, 0.003484692878745862, 0.001060522269023501, -0.01007495144411729, 0.942257562232984, 0.4490110231538115, 0.0009745190694676366],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.4522862685002, 707.4399002803618, 0.25, 1.5, 0.2882126352790454, 0.0008727456961738738, 0.002120321456855265, 0.005184975496902943, 0.6492989989954652, 0.44841432325898, 0.0009756885024142628],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.4650520104217, 709.3295501966072, 0, 1, 0.2883894549327793, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883388, 0.7116105450672207, 1, 0.0009745210583446654],
[287.6570055280059, 709.3295501966072, 0, 1, 0.2885264639490909, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883388, 0.711473536050909, 1, 0.0009741813758673464],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 0, 0.2887508078988795, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003984523696678042],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0005754778365400758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6108495565401, 709.1837526504888, 0, 1, 0.2885357213208553, 0, 0.001410071785010049, 0.005860315569259004, 0.7114642786791447, 1, 0.0009746803390348482],
[287.7180481265309, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098673, 0.003475624857430654, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009741483259368974],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009739137376773311],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009740572305423375],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009744991974383142],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.7043060269244, 709.4525033179918, 0, 1, 0.2885246365774027, 0, 0.00140953762982464, 0.005858095598628622, 0.7114753634225973, 1, 0.0009745262946411859],
[287.7647763617231, 709.1505615579349, 0, 1, 0.2886551800499174, 0, 0.001410137782029104, 0.005860589855548826, 0.7113448199500827, 1, 0.0009741491481227027],
[287.8252466965218, 709.0900912231363, 0, 1, 0.2887158374924289, 0, 0.001410258036852641, 0.005861089639476241, 0.7112841625075712, 1, 0.0009742507251488949],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 0, 0, 0.2885654195994594, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000388786392688335],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.7758568200189, 709.1677831741572, 1, 0, 0.2886580998918856, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2886580998918856, 0.0005848128197416443],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.017200214106, 708.7344862624858, 0, 1, 0.288955819309637, 0, 0.001410965628713094, 0.005864030419967403, 0.711044180690363, 1, 0.000973354528011431],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009732428110982052],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.2404917489284, 708.5541104581006, 0, 1, 0.2891673882570467, 0, 0.001411324816609237, 0.005865523219442177, 0.7108326117429533, 1, 0.0009738860059847082],
[287.9742844836689, 708.6508078281731, 0, 1, 0.2889494622452896, 0, 0.001411132237419915, 0.005864722852515118, 0.7110505377547104, 1, 0.0009743703222188666],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.0009743129085502974],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009738443786286812],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 2, 0, 0.2888583511878915, 0.006946073750559037, 0, -0.02886816442847433, 1, 0.08343914705098709, 0.001947058366655457],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009739260045076634],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8224883693404, 709.3873588900951, 0, 1, 0.2886278040277515, 0, 0.00140966707042059, 0.00585863355899901, 0.7113721959722485, 1, 0.0009740476984184942],
[288.5271711222275, 708.2674310848014, 0, 0, 0.289454989506757, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003821663585819735],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.1762089093746, 708.6183932976543, 0, 1, 0.2891028987028182, 0, 0.001411196787238842, 0.005864991124182472, 0.7108971012971819, 1, 0.0005917370988329199],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009732630308154247],
[287.8746365730246, 708.9199656340043, 1, 0, 0.2888003565986753, 0.00347373430290491, 0, -0.01443698075175487, 1, 0.2888003565986753, 0.0009732733450456152],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.726466943516, 709.0681352635129, 1, 0, 0.2886517104992878, 0.003475523161365309, 0, -0.01444441532012091, 1, 0.2886517104992878, 0.000973211918719384],
[287.726466943516, 709.0681352635129, 0, 0, 0.2886517104992878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004412475795237758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.7758568200189, 709.01874538701, 1, 0, 0.2887012591990836, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2887012591990836, 0.0005321862849333367],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009741377941562716],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009750359752647536],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009732619164165286],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.9697755159691, 708.4409196558913, 0, 1, 0.2890071101317316, 0, 0.001411550310343065, 0.005866460380552109, 0.7109928898682685, 1, 0.0009742270017280853],
[288.1617290335533, 708.2489661383071, 0, 0, 0.2891997551108696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003900385882331418],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.9934878650375, 708.6091608244071, 0, 1, 0.2889752382694905, 0, 0.001411215173730726, 0.005865067539188997, 0.7110247617305095, 1, 0.0005840790059310265],
[287.6854413826218, 709.1091608244071, 0, 1, 0.2886105530122755, 0, 0.001410220111720746, 0.005860932021088815, 0.7113894469877244, 1, 0.0009743112201347157],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009732899055621042],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.00097390578447895],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009766655242779223],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009745992925991984],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.4650520104217, 709.3295501966072, 0, 1, 0.2883894549327793, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883388, 0.7116105450672207, 1, 0.0009740203739737203],
[286.6376869663268, 707.1686848361518, 0, 1.5, 0.2884240784715926, 0, 0.002121134648867468, 0.008815521691446485, 0.6002495813887008, 1, 0.0009751729980481597],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009732627272063706],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009732196679700958],
[287.8252466965218, 709.1505615579349, 1, 0, 0.2886983257903291, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2886983257903291, 0.0009732520945451379],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009732520881189305],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.2120558943125, 709.5825463127163, 1, 0, 0.2881356452556914, 0.003481747995870958, 0, -0.01447028598497451, 1, 0.2881356452556914, 0.0009738148341293776],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.4650520104217, 709.3295501966071, 0, 1, 0.2883894549327794, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883389, 0.7116105450672205, 1, 0.0009744706148220268],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009745091106799327],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009738754538157583],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009815190013738085],
[287.5601540779294, 708.8192030766929, 0, 1, 0.2886050900322944, 0, 0.001410796992603207, 0.005863329561450256, 0.7113949099677056, 1, 0.0009739946222439128],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009739946106593363],
[288.2404917489284, 708.5541104581006, 0, 1, 0.2891673882570467, 0, 0.001411324816609237, 0.005865523219442177, 0.7108326117429533, 1, 0.0009740482046776245],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 0, 1, 0.2885654195994594, 0, 0.00140970909626346, 0.005858808220107686, 0.7114345804005406, 1, 0.0009735909551353274],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.077429156369, 709.0152486249542, 0, 1, 0.2889174051477174, 0, 0.001410406901599612, 0.005861708327406644, 0.7110825948522825, 1, 0.0009733367243032609],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 0, 1, 0.2885654195994594, 0, 0.00140970909626346, 0.005858808220107686, 0.7114345804005406, 1, 0.000972846151128027],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 1, 0, 0.2885654195994594, 0.003475523161365309, 0, -0.01444441532012091, 1, 0.2885654195994594, 0.0009755126862530217],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 0, 1, 0.2885654195994594, 0, 0.00140970909626346, 0.005858808220107686, 0.7114345804005406, 1, 0.0009737547147293759],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 0, 1, 0.2885654195994594, 0, 0.00140970909626346, 0.005858808220107686, 0.7114345804005406, 1, 0.0009726301079714651],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 1, 0, 0.2885654195994594, 0.003475523161365309, 0, -0.01444441532012091, 1, 0.2885654195994594, 0.0009726301014862134],
[287.7758568200189, 709.1677831741572, 1, 0, 0.2886580998918856, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2886580998918856, 0.0009737396980230897],
[287.5614596800373, 709.3821803141389, 1, 0, 0.2884430454681642, 0.003477517470917959, 0, -0.01445270375156501, 1, 0.2884430454681641, 0.000973879445115777],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009737705050474177],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009732520945794952],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009755119861532516],
[287.7647763617231, 709.1505615579349, 0, 1, 0.2886551800499174, 0, 0.001410137782029104, 0.005860589855548826, 0.7113448199500827, 1, 0.0009738614459604981],
[287.9324452665126, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2888272897511953, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888272897511952, 0.0009732745183947049],
[287.8802970628283, 709.0955111916284, 0, 1, 0.2887535431445023, 0, 0.001410247257551397, 0.005861044840262772, 0.7112464568554977, 1, 0.0009735666433424633],
[287.7758568200189, 709.01874538701, 1, 0, 0.2887012591990836, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2887012591990836, 0.0009735164564350636],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.000973913737663019],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009740572295712542],
[287.8681624269589, 708.92643978007, 0, 1, 0.288793861633663, 0, 0.001410583586514603, 0.00586244263708448, 0.7112061383663371, 1, 0.0009744991974383142],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.000973899868540658],
[287.6762089093747, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2886012908501143, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7113987091498857, 1, 0.0009740017370936509],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009736021955071343],
[287.8252466965218, 708.8416848324766, 0, 2, 0.2887877961948288, 0, 0.002821504495002531, 0.01172628719798103, 0.5058227988414082, 1, 0.001956050070018609],
[287.9324452665126, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2888272897511953, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888272897511952, 0.0009732745184383745],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0009738614459350584],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009742886981481687],
[287.9742844836689, 708.8203177233599, 0, 1, 0.2889003249476447, 0, 0.001410794774071759, 0.005863320341143515, 0.7110996750523553, 1, 0.0009732520945794952],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.0009759550506284998],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009734663446704034],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009739807552201386],
[287.8746365730246, 708.9199656340043, 1, 0, 0.2888003565986753, 0.00347373430290491, 0, -0.01443698075175487, 1, 0.2888003565986753, 0.0009740572300462238],
[287.8224883693404, 709.0325841724872, 0, 1, 0.2887305249251901, 0, 0.001410372417745937, 0.00586156501111117, 0.7112694750748099, 1, 0.0009744991974383142],
[287.9100016441152, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2888358353934162, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7111641646065838, 1, 0.000973239492012677],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009737197526685404],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009740243552902615],
[287.4650520104217, 709.3295501966072, 0, 1, 0.2883894549327793, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883388, 0.7116105450672207, 1, 0.0009739875282303256],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009732745184559114],
[287.7758568200189, 709.1677831741572, 1, 0, 0.2886580998918856, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2886580998918856, 0.0009734789511201513],
[287.8252466965218, 709.1505615579349, 1, 0, 0.2886983257903291, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2886983257903291, 0.0009736959133165864],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.0009739137376449774],
[287.8224883693404, 709.1533198851163, 0, 1, 0.2886955590961339, 0, 0.001410132297148382, 0.005860567060161927, 0.711304440903866, 1, 0.0009743016950228235],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0009737940571054978],
[287.7758568200189, 709.01874538701, 1, 0, 0.2887012591990836, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2887012591990836, 0.0009732520945451379],
[287.6854413826218, 709.0486904896084, 0, 1, 0.2886280625729588, 0, 0.001410340380587242, 0.00586143186337934, 0.7113719374270413, 1, 0.0009741270829142877],
[287.4650520104217, 709.3295501966071, 0, 1, 0.2883894549327794, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883389, 0.7116105450672205, 1, 0.0009740322800989241]
],
"NAMES": [
["epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2"],
["epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1"],
["epi_isl_429175_Bangkok_20200328_null_1"],
["epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1"],
["epi_isl_438515_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1"],
["epi_isl_437819_USA_20200401_null_1"],
["epi_isl_438629_England_20200421_null_2"],
["epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1"],
["epi_isl_438501_England_20200328_null_3"],
["epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1"],
["epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4"],
["epi_isl_438396_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_423354_England_20200329_null_2"],
["epi_isl_433000_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2"],
["epi_isl_425585_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4"],
["epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_432532_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_423927_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_438880_Scotland_20200411_null_14945"],
["epi_isl_436679_California_20200404_null_1"],
["epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1"],
["epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4"],
["epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_433931_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_438502_England_20200330_null_2"],
["epi_isl_423752_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_437694_MAKKAH_20200405_null_1"],
["Node146"],
["epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2"],
["epi_isl_432187_Wales_20200404_null_3"],
["epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_432558_England_20200402_null_2"],
["Node155"],
["epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3"],
["epi_isl_434341_Washington_20200330_null_33"],
["epi_isl_437610_Thailand_20200312_null_4"],
["epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3"],
["epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_24"],
["epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_432485_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1"],
["epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1"],
["epi_isl_438931_Scotland_20200415_null_37"],
["Node181"],
["epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1"],
["epi_isl_420725_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_434000_England_20200413_null_3"],
["epi_isl_438520_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1"],
["epi_isl_417240_England_20200303_null_4"],
["epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1"],
["epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1"],
["epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3"],
["epi_isl_433733_England_20200405_null_2"],
["epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5"],
["epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7"],
["Node206"],
["epi_isl_437910_Athens_20200401_null_5"],
["epi_isl_433819_England_20200327_null_3"],
["epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_436741_New_York_20200318_null_16"],
["epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1"],
["epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2"],
["epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2"],
["epi_isl_433804_England_20200406_null_5"],
["epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1"],
["epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3"],
["epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1"],
["epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10"],
["epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2"],
["epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1"],
["epi_isl_428704_Madrid_20200311_null_3"],
["epi_isl_433495_England_20200416_null_12"],
["epi_isl_432757_England_20200402_null_2"],
["epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1"],
["epi_isl_421669_India_20200312_null_1"],
["epi_isl_433699_England_20200331_null_1"],
["Node246"],
["epi_isl_437043_California_20200401_null_1"],
["Node245"],
["epi_isl_438885_Scotland_20200318_null_16"],
["epi_isl_417236_England_20200301_null_1"],
["epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1"],
["epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_438362_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1"],
["epi_isl_438473_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1"],
["epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1"],
["epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_434866_Texas_20200323_null_7"],
["epi_isl_437289_Bavaria_20200403_null_13"],
["epi_isl_433551_Scotland_20200331_null_1"],
["epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2"],
["epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1"],
["epi_isl_433015_England_20200403_null_4"],
["epi_isl_432745_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1"],
["epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1"],
["Node285"],
["epi_isl_423412_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2"],
["epi_isl_437669_Unknown_20200330_null_5"],
["epi_isl_438587_England_20200422_null_3"],
["epi_isl_423548_England_20200331_null_3"],
["epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_435637_California_20200311_null_3"],
["Node315"],
["epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1"],
["epi_isl_421775_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_421895_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_425336_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_423453_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_423446_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_438840_Scotland_20200404_null_70"],
["Node303"],
["epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2"],
["epi_isl_438738_England_20200426_null_146"],
["Node295"],
["epi_isl_433719_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1"],
["Node298"],
["epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1"],
["epi_isl_438282_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2"],
["epi_isl_418677_England_20200315_null_1"],
["epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1"],
["epi_isl_434231_Washington_20200406_null_4"],
["epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3"],
["epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1"],
["epi_isl_437978_Ischgl_20200311_null_4"],
["epi_isl_423227_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_438728_England_20200426_null_5"],
["Node531"],
["epi_isl_423373_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_437889_Athens_20200317_null_7"],
["Node528"],
["epi_isl_423481_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_436355_Comunitat_Valenciana_20200326_null_6"],
["Node525"],
["epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1"],
["epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_6"],
["Node522"],
["epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_437437_Alaska_20200412_null_33"],
["Node519"],
["epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1"],
["epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1"],
["Node516"],
["epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_433832_England_20200407_null_1"],
["Node513"],
["epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_2"],
["epi_isl_438855_Scotland_20200407_null_1"],
["Node499"],
["epi_isl_420726_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_429207_Switzerland_20200403_null_4"],
["Node496"],
["epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1"],
["epi_isl_438085_Vienna_20200322_null_7"],
["Node493"],
["epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1"],
["epi_isl_438488_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_414010_England_20200226_null_1"],
["epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_423740_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423780_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1"],
["epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1"],
["epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1"],
["epi_isl_423328_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_423579_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_424138_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_425023_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423068_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423130_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2"],
["epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1"],
["Node39"],
["epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1"],
["epi_isl_438393_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_438461_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1"],
["epi_isl_436118_Victoria_20200411_null_1"],
["epi_isl_421963_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_421956_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421953_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421948_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421947_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1"],
["epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_420694_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1"],
["epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1"],
["epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1"],
["epi_isl_423648_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2"],
["epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1"],
["epi_isl_423052_England_20200319_null_5"],
["epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1"],
["epi_isl_418715_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_417312_England_20200308_null_1"],
["epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_422002_England_20200330_null_2"],
["epi_isl_432594_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_424007_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_424062_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_438922_Scotland_20200319_null_103"],
["epi_isl_423639_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_417288_England_20200305_null_1"],
["epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1"],
["Node434"],
["epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1"],
["Node433"],
["epi_isl_436997_Unknown_20200324_null_4"],
["epi_isl_438534_England_20200331_null_1"],
["Node444"],
["epi_isl_437467_Makkah_20200323_null_6"],
["epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24"],
["epi_isl_429525_Unknown_20200312_null_4"],
["epi_isl_421847_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1"],
["epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1"],
["Node458"],
["epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_423825_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_423933_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_436415_Delhi_20200331_null_1"],
["epi_isl_436426_Delhi_20220405_null_1"],
["epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2"],
["epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2"],
["epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_430709_Victoria_20200407_null_3"],
["epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2"],
["epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1"],
["epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1"],
["epi_isl_425240_England_20200331_null_4"],
["epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1"],
["Node510"],
["epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1"],
["epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1"],
["Node505"],
["epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1"],
["Node504"],
["epi_isl_423060_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_429008_California_20200328_null_1"],
["epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1"],
["epi_isl_432351_Wales_20200331_null_2"],
["Node54"],
["epi_isl_433408_Scotland_20200407_null_2"],
["epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2"],
["epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1"],
["epi_isl_421964_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1"],
["epi_isl_433226_Scotland_20200401_null_4"],
["epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2"],
["epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1"],
["Node549"],
["epi_isl_421954_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_436439_Bihar_20200409_null_1"],
["Node545"],
["epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1"],
["epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_2"],
["epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1"],
["Node557"],
["epi_isl_423772_England_20200322_null_1"],
["Node556"],
["epi_isl_432269_Wales_20200407_null_3"],
["epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2"],
["epi_isl_432350_Wales_20200401_null_2"],
["epi_isl_438911_Scotland_20200319_null_67"],
["epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1"],
["epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1"],
["Node564"],
["epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1"],
["Node563"],
["epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_425485_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2"],
["Node575"],
["epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1"],
["epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1"],
["epi_isl_423324_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6"],
["Node586"],
["epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1"],
["epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1"],
["epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1"],
["epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1"],
["epi_isl_425404_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_437436_Novi_Pazar_20200404_null_11"],
["Node593"],
["epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1"],
["epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1"],
["epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1"],
["epi_isl_437875_Athens_20200314_null_6"],
["epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3"],
["epi_isl_438494_England_20200329_null_4"],
["epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1"],
["epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2"],
["epi_isl_438895_Scotland_20200413_null_732"],
["epi_isl_420697_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_420696_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1"],
["epi_isl_437571_California_20200425_null_1"],
["epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5"],
["epi_isl_438293_England_20200329_null_1"],
["Node605"],
["epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1"],
["epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1"],
["Node624"],
["epi_isl_423913_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1"],
["epi_isl_432908_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1"],
["epi_isl_437852_USA_20200405_null_5"],
["epi_isl_432760_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_437343_Kinshasa_20200415_null_2"],
["epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6"],
["epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1"],
["epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1"],
["epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1"],
["epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4"],
["epi_isl_437925_Ischgl_20200309_null_15"],
["epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3"],
["epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1"],
["epi_isl_438260_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1"],
["epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1"],
["epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1"],
["epi_isl_434279_Washington_20200327_null_3"],
["epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1"],
["Node104"],
["epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4"],
["epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2"],
["epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_8"],
["epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1"],
["epi_isl_438460_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1"],
["epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2"],
["epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4"]
],
"RESOLVED": [
[287.8252466965218, 708.978213029911, 0, 1, 0.2887482420812563, 0, 0.001410480578417734, 0.005862014531253089, 0.7112517579187437, 1, 0.0009737547083034491],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009732907358635251],
[287.9742844836689, 708.8203177233599, 0, 1, 0.2889003249476447, 0, 0.001410794774071759, 0.005863320341143515, 0.7110996750523553, 1, 0.000973541956235272],
[287.9742844836689, 708.8203177233601, 0, 1, 0.2889003249476447, 0, 0.001410794774071759, 0.005863320341143514, 0.7110996750523553, 1, 0.0009734159333958134],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009732745184289448],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009735139779501026],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.0009742756935232295],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009732745184383745],
[287.8252466965218, 709.324130228115, 0, 1, 0.2886480735556587, 0, 0.001409792727167487, 0.00585915579353916, 0.7113519264443413, 1, 0.0009742839754695027],
[287.9650520104217, 708.8295501966072, 0, 1, 0.2888910627854834, 0, 0.001410776398532808, 0.005863243971657827, 0.7111089372145165, 1, 0.0009734789511523234],
[287.9934878650376, 708.6939157720005, 0, 1, 0.2889506647862841, 0, 0.001411046402043217, 0.005864366117205751, 0.7110493352137159, 1, 0.0009739137376773311],
[287.9296869393312, 709.2801603201043, 0, 1, 0.288735302534997, 0, 0.00140988012346023, 0.005859519016078962, 0.711264697465003, 1, 0.0009815345875183734],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153307, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846693, 1, 0.0009737940570638119],
[287.6332931789375, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2885706611600425, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7114293388399575, 1, 0.0009739137376773311],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153307, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846693, 1, 0.0009742886908927833],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009735013724946007],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009739807551875927],
[287.8252466965218, 708.8934580823176, 0, 1, 0.2887727954903656, 0, 0.001410649214770831, 0.005862715390781024, 0.7112272045096344, 1, 0.0009736971016617081],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009735013724946007],
[287.8252466965218, 708.978213029911, 1, 0, 0.2887482420812563, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887482420812563, 0.0009732394855903422],
[287.7758568200189, 709.01874538701, 1, 0, 0.2887012591990836, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2887012591990836, 0.0009732268890320974],
[287.7180481265309, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098673, 0.003475624857430654, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009739875282120933],
[287.8131179346034, 709.2432149544341, 0.5, 2.5, 0.2886628452583473, 0.001737238398263728, 0.003524883914695771, 0.007429527321680359, 0.579032326618934, 0.6400630100900183, 0.00293716968069355],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.7180481265309, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098673, 0.003475624857430654, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009739137376773311],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009735013724946007],
[287.8252466965218, 708.92643978007, 0, 1, 0.2887632402348398, 0, 0.001410583586514603, 0.00586244263708448, 0.7112367597651602, 1, 0.0009755119960277297],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009732745184559114],
[287.7758568200189, 709.01874538701, 1, 0, 0.2887012591990836, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2887012591990836, 0.0009734789446114674],
[287.8224883693404, 709.0325841724872, 0, 1, 0.2887305249251901, 0, 0.001410372417745937, 0.00586156501111117, 0.7112694750748099, 1, 0.0009742886908927833],
[288.0601159445431, 708.7344862624858, 0, 1, 0.2889864324172118, 0, 0.001410965628713094, 0.005864030419967403, 0.7110135675827882, 1, 0.00097420927587594],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009740047481922111],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009732520945619523],
[287.4650520104217, 709.3295501966072, 0, 1, 0.2883894549327794, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883388, 0.7116105450672205, 1, 0.0009738998685729414],
[287.5811449752532, 709.1276257709014, 0, 1, 0.2885307658725273, 0, 0.001410183391054449, 0.005860779408509298, 0.7114692341274726, 1, 0.0009736973090346002],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6332931789375, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2885706611600425, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7114293388399575, 1, 0.0009740243617726035],
[287.9650520104217, 708.8295501966072, 0, 1, 0.2888910627854834, 0, 0.001410776398532808, 0.005863243971657827, 0.7111089372145165, 1, 0.0009733529160713231],
[287.7180481265309, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098673, 0.003475624857430654, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009739137306169982],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0009742886908927833],
[287.8252466965218, 709.0900912231363, 0, 1, 0.2887158374924289, 0, 0.001410258036852641, 0.005861089639476241, 0.7112841625075712, 1, 0.0009738614459784562],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.0009739137377057886],
[287.877394900206, 708.8567369720241, 0, 1, 0.2888206450394824, 0, 0.001410722291039559, 0.005863019098719815, 0.7111793549605177, 1, 0.0009759550506891278],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009737940570638119],
[287.8252466965218, 708.978213029911, 1, 0, 0.2887482420812563, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887482420812563, 0.0009732520945794952],
[287.8681624269589, 708.92643978007, 0, 1, 0.288793861633663, 0, 0.001410583586514603, 0.00586244263708448, 0.7112061383663371, 1, 0.0009742886981446451],
[287.8252466965218, 709.0900912231363, 0, 1, 0.2887158374924289, 0, 0.001410258036852641, 0.005861089639476241, 0.7112841625075712, 1, 0.0009738614459604981],
[288.2464839811468, 708.1642111907137, 0, 1, 0.2892848153656462, 0, 0.00141210186027135, 0.005868752644439885, 0.7107151846343538, 1, 0.0009736973090346002],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.9934878650376, 708.6091608244071, 0, 1, 0.2889752382694905, 0, 0.001411215173730726, 0.005865067539188997, 0.7110247617305095, 1, 0.0009738398813559608],
[287.4650520104217, 709.3295501966072, 0, 1, 0.2883894549327793, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883388, 0.7116105450672207, 1, 0.0009742004042537898],
[287.9742844836689, 708.8203177233599, 0, 1, 0.2889003249476447, 0, 0.001410794774071759, 0.005863320341143515, 0.7110996750523553, 1, 0.0009732745183947049],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.000973794057123478],
[287.8252466965218, 709.0541104581006, 0, 1, 0.2887262582285353, 0, 0.001410329600027179, 0.005861387058934164, 0.7112737417714647, 1, 0.0009736971089424406],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009732520945451379],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.0009743016950228235],
[287.5782428126309, 709.0244058768137, 1, 0, 0.288558577674666, 0.003477314522196108, 0, -0.01445186028843989, 1, 0.288558577674666, 0.0009737800544694741],
[287.718048126531, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2886743095945745, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886743095945745, 0.000973913737663019],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009759402288236616],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009735013724946007],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.000973239492012677],
[287.4907295378562, 709.3038726691727, 1, 0, 0.2884152150315777, 0.003478373030001728, 0, -0.01445625948984184, 1, 0.2884152150315777, 0.000974660185599285],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0009740243618156988],
[287.9934878650376, 708.6939157720005, 0, 1, 0.2889506647862841, 0, 0.001411046402043217, 0.005864366117205751, 0.7110493352137159, 1, 0.0009739875282120933],
[287.7459117174205, 709.0486904896084, 0, 1, 0.2886712178018568, 0, 0.001410340380587242, 0.00586143186337934, 0.7113287821981431, 1, 0.0009739807622621792],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009736971089999554],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0009738614531862918],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009732745184289448],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0009743017022809214],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009737800544277118],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009739137376773311],
[288.0144418869246, 708.840630654903, 0, 1, 0.2889230840271815, 0, 0.001410754345551683, 0.005863152318573203, 0.7110769159728185, 1, 0.0009736959132989846],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009737940642822938],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009732745184559114],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009735139779501026],
[288.1332931789375, 709.2400029168487, 0, 1, 0.2888921272575015, 0, 0.00140995995133856, 0.005859850783981288, 0.7111078727424985, 1, 0.0009742886981481687],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009732520945451379],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.000975511986210163],
[287.7180481265309, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2886743095945744, 0.003475624857430654, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886743095945744, 0.000973794057123478],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009738998686015438],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009733529160713231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.5854484753387, 1, 0, 0.288862060685607, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2888620606856069, 0.0009746506628224074],
[287.8252466965218, 708.5854484753387, 0, 0, 0.288862060685607, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004469091708609767],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0005269905312667886],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009744267723615462],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009740848712633654],
[287.6854413826218, 709.1091608244071, 0, 1, 0.2886105530122755, 0, 0.001410220111720746, 0.005860932021088815, 0.7113894469877244, 1, 0.0009732268889707272],
[287.6850664287785, 709.1095357782503, 1, 0, 0.2886101768526911, 0.003476023320965698, 0, -0.01444649400372017, 1, 0.2886101768526912, 0.0009739414671937411],
[287.8802970628283, 709.0955111916284, 0, 1, 0.2887535431445023, 0, 0.001410247257551397, 0.005861044840262772, 0.7112464568554977, 1, 0.0009734440731901653],
[287.2758568200189, 709.6999514344377, 1, 2, 0.2881472694136806, 0.003480974736510871, 0.002818092344458559, -0.002754966125858715, 0.7987625255575455, 0.6392797977139743, 0.002925643407029959],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009732745184559114],
[287.8252466965218, 708.978213029911, 0, 1, 0.2887482420812563, 0, 0.001410480578417734, 0.005862014531253089, 0.7112517579187437, 1, 0.0009733529096037421],
[287.9742844836689, 708.8203177233601, 0, 1, 0.2889003249476447, 0, 0.001410794774071759, 0.005863320341143514, 0.7110996750523553, 1, 0.0009736959132768448],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009735013725373663],
[287.7758568200189, 709.0187453870101, 1, 0, 0.2887012591990836, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2887012591990836, 0.0009732521010150384],
[287.7758568200189, 709.1677831741572, 1, 0, 0.2886580998918856, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2886580998918856, 0.0009734915440536039],
[287.9440979885347, 708.807588488057, 0, 1, 0.2888824788512629, 0, 0.00141082011005706, 0.005863425638526742, 0.7111175211487371, 1, 0.0009742886908927833],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009739137306169982],
[287.9100016441152, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2888358353934162, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7111641646065838, 1, 0.0009736021955208362],
[288.1305348517561, 709.3032315788287, 0, 2, 0.2888718474840286, 0, 0.002819668529562775, 0.01171865685109684, 0.5057032493007787, 1, 0.001949404897094474],
[286.9100016441151, 709.8846005629138, 0, 1, 0.2878326196880082, 0, 0.001408679663155159, 0.005854529854327859, 0.7121673803119919, 1, 0.0009742839674296952],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009737940571054978],
[287.9100016441151, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2888358353934162, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7111641646065838, 1, 0.000973239492012677],
[289.0512965585255, 707.7003899180663, 1, 1, 0.2899932856700652, 0.003459593545872663, 0.001413027340730693, -0.008505612212804704, 0.91590389426628, 0.4958904656064103, 0.00194803869377865],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.3252466965218, 708.4693555105072, 0, 1, 0.2892524157515834, 0, 0.001411493654908224, 0.005866224918265429, 0.7107475842484166, 1, 0.0009737956157492203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009741509250477757],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.00097420927587594],
[287.6762089093746, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2886012908501142, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7113987091498858, 1, 0.0009742558283825109],
[288.6006864350284, 708.1939157720005, 0, 1, 0.2895287412231468, 0, 0.001412042630880134, 0.005868506484686042, 0.7104712587768531, 1, 0.0009738468316133069],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 0, 0.2887508078988795, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004074354047614252],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0005665686717361731],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.4231439666477, 708.2856267795071, 0, 1, 0.2893755452264444, 0, 0.001411859795245153, 0.005867746612366289, 0.7106244547735556, 1, 0.0009739958547200553],
[287.8709957629634, 708.8377749831914, 0, 1, 0.2888215737757157, 0, 0.001410760029011875, 0.005863175939264436, 0.7111784262242844, 1, 0.0009748910867248265],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.9440979885347, 708.8075884880571, 0, 1, 0.2888824788512629, 0, 0.00141082011005706, 0.005863425638526741, 0.7111175211487371, 1, 0.0009737688103493873],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.0396438365034, 708.7549583705255, 0, 0, 0.2889658944769036, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003970291488078845],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0005764333211658822],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009739778069785422],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6108495565401, 709.1837526504888, 0, 1, 0.2885357213208553, 0, 0.001410071785010049, 0.005860315569259004, 0.7114642786791447, 1, 0.000974469531676681],
[287.7180481265309, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098673, 0.003475624857430654, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009738500196429469],
[287.6762089093746, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2886012908501142, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7113987091498858, 1, 0.0009739807622621792],
[287.9324452665126, 708.8621569405162, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009732619164165286],
[287.7758568200189, 708.8267918694258, 1, 1, 0.2887568653348963, 0.00347492667053519, 0.001410781888425306, -0.008578669492147225, 0.9166194727219646, 0.494133203391757, 0.001949057784049119],
[288.4440979885347, 708.9291981072515, 0, 1, 0.2892037506093736, 0, 0.001410578098165331, 0.005862419827282149, 0.7107962493906264, 1, 0.0009739260045252262],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.8486197978781, 0, 1, 0.2887857867778648, 0, 0.001410738445516253, 0.005863086237380619, 0.7112142132221353, 1, 0.0009734915505557657],
[287.8224883693404, 709.0325841724872, 0, 1, 0.2887305249251901, 0, 0.001410372417745937, 0.00586156501111117, 0.7112694750748099, 1, 0.000974275693503036],
[287.6360515061189, 709.0980803661113, 0, 1, 0.2885785108671191, 0, 0.001410242148002565, 0.005861023604770442, 0.7114214891328809, 1, 0.0009747591188282709],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.3252466965217, 709.4693555105072, 0, 1, 0.2882492000461754, 0, 0.001409504148745703, 0.005857956449905658, 0.7117507999538246, 1, 0.0009743322665862144],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.4413396613533, 709.3532625456756, 0, 0, 0.2883656663317818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911122567005153],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153307, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846693, 1, 0.0005827122782559935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 0, 0.2887508078988795, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911122581900134],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0005827122782559935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 0, 0.2887508078988795, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911122567151094],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0005827122782559935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 0, 0.2887508078988795, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911122584955933],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0005827122782559935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6108495565401, 709.1837526504888, 0, 0, 0.2885357213208553, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911122566829006],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0005827122782559935],
[288.2091537316903, 708.5854484753387, 0, 0, 0.2891359494659771, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003887722057744662],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0005848249376135076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.0396438365034, 708.7549583705254, 0, 0, 0.2889658944769036, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003887714252341262],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0005848249376135076],
[287.4413396613533, 709.3532625456756, 0, 0, 0.2883656663317818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911122567005153],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0005827122782559935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.4413396613533, 709.2674310848014, 0, 0, 0.28839049890789, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003911264414797851],
[287.6332931789375, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2885706611600425, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7114293388399575, 1, 0.0005827002042203031],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6108495565401, 709.1837526504888, 0, 0, 0.2885357213208553, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003908924015973246],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.000582945906321258],
[287.8252466965218, 708.6145807928993, 0, 2, 0.2888536153976418, 0, 0.002822408759585661, 0.01173004535829001, 0.5057291803330052, 1, 0.001948465873701333],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6762089093746, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2886012908501142, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7113987091498858, 1, 0.0009739807551875927],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.000973868523642361],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009743523459711936],
[287.8252466965218, 709.150561557935, 1, 0, 0.2886983257903291, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2886983257903291, 0.0009734663446704034],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.2968108419059, 709.6897448827073, 0, 1, 0.2881651805556171, 0, 0.00140906643672197, 0.00585613730096955, 0.7118348194443829, 1, 0.0009831837017534792],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009766910748686553],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.7128631169155, 707.1060517640657, 1, 1, 0.2884960819559889, 0.003487810031014273, 0.001414215021219564, -0.008617945021962913, 0.9167700106960432, 0.4937621746080212, 0.001949986887972862],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.9694771050707, 707.1982197992169, 1, 0, 0.2886529888253836, 0.003484691159798368, 0, -0.01448251789371139, 1, 0.2886529888253836, 0.0009745190694676366],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.4527576838321, 707.4394929404592, 0, 1, 0.2882130910105227, 0, 0.001413548451816732, 0.005874764737615481, 0.7117869089894773, 1, 0.0009756885024142628],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.4650520104217, 709.3295501966072, 0, 1, 0.2883894549327793, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883388, 0.7116105450672207, 1, 0.0009745210583446654],
[287.6570055280059, 709.3295501966072, 0, 1, 0.2885264639490909, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883388, 0.711473536050909, 1, 0.0009741813758673464],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 0, 0.2887508078988795, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003984523696678042],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0005754778365400758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.6108495565401, 709.1837526504888, 0, 1, 0.2885357213208553, 0, 0.001410071785010049, 0.005860315569259004, 0.7114642786791447, 1, 0.0009746803390348482],
[287.7180481265309, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098673, 0.003475624857430654, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009741483259368974],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009739137376773311],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009740572305423375],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009744991974383142],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.7043060269244, 709.4525033179918, 0, 1, 0.2885246365774027, 0, 0.00140953762982464, 0.005858095598628622, 0.7114753634225973, 1, 0.0009745262946411859],
[287.7647763617231, 709.1505615579349, 0, 1, 0.2886551800499174, 0, 0.001410137782029104, 0.005860589855548826, 0.7113448199500827, 1, 0.0009741491481227027],
[287.8252466965218, 709.0900912231363, 0, 1, 0.2887158374924289, 0, 0.001410258036852641, 0.005861089639476241, 0.7112841625075712, 1, 0.0009742507251488949],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 0, 0, 0.2885654195994594, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000388786392688335],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.7758568200189, 709.1677831741572, 1, 0, 0.2886580998918856, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2886580998918856, 0.0005848128197416443],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.017200214106, 708.7344862624858, 0, 1, 0.288955819309637, 0, 0.001410965628713094, 0.005864030419967403, 0.711044180690363, 1, 0.000973354528011431],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009732428110982052],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.2404917489284, 708.5541104581006, 0, 1, 0.2891673882570467, 0, 0.001411324816609237, 0.005865523219442177, 0.7108326117429533, 1, 0.0009738860059847082],
[287.9742844836689, 708.6508078281731, 0, 1, 0.2889494622452896, 0, 0.001411132237419915, 0.005864722852515118, 0.7110505377547104, 1, 0.0009743703222188666],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.0009743129085502974],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009738443786286812],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 2, 0, 0.2888583511878915, 0.006946073750559037, 0, -0.02886816442847433, 1, 0.08343914705098709, 0.001947058366655457],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009739260045076634],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8224883693404, 709.3873588900951, 0, 1, 0.2886278040277515, 0, 0.00140966707042059, 0.00585863355899901, 0.7113721959722485, 1, 0.0009740476984184942],
[288.5271711222275, 708.2674310848014, 0, 0, 0.289454989506757, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003821663585819735],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.1762089093746, 708.6183932976543, 0, 1, 0.2891028987028182, 0, 0.001411196787238842, 0.005864991124182472, 0.7108971012971819, 1, 0.0005917370988329199],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009732630308154247],
[287.8746365730246, 708.9199656340043, 1, 0, 0.2888003565986753, 0.00347373430290491, 0, -0.01443698075175487, 1, 0.2888003565986753, 0.0009732733450456152],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.726466943516, 709.0681352635129, 1, 0, 0.2886517104992878, 0.003475523161365309, 0, -0.01444441532012091, 1, 0.2886517104992878, 0.000973211918719384],
[287.726466943516, 709.0681352635129, 0, 0, 0.2886517104992878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004412475795237758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.7758568200189, 709.01874538701, 1, 0, 0.2887012591990836, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2887012591990836, 0.0005321862849333367],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009741377941562716],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009750359752647536],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009732619164165286],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.9697755159691, 708.4409196558913, 0, 1, 0.2890071101317316, 0, 0.001411550310343065, 0.005866460380552109, 0.7109928898682685, 1, 0.0009742270017280853],
[288.1617290335533, 708.2489661383071, 0, 0, 0.2891997551108696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003900385882331418],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.9934878650375, 708.6091608244071, 0, 1, 0.2889752382694905, 0, 0.001411215173730726, 0.005865067539188997, 0.7110247617305095, 1, 0.0005840790059310265],
[287.6854413826218, 709.1091608244071, 0, 1, 0.2886105530122755, 0, 0.001410220111720746, 0.005860932021088815, 0.7113894469877244, 1, 0.0009743112201347157],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009732899055621042],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.00097390578447895],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009766655242779223],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009745992925991984],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.4650520104217, 709.3295501966072, 0, 1, 0.2883894549327793, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883388, 0.7116105450672207, 1, 0.0009740203739737203],
[286.6373460374969, 707.1694147452101, 0, 1, 0.2884236225277293, 0, 0.001414088306350601, 0.005877008394969384, 0.7115763774722708, 1, 0.0009751729980481597],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009732627272063706],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009732196679700958],
[287.8252466965218, 709.1505615579349, 1, 0, 0.2886983257903291, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2886983257903291, 0.0009732520945451379],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009732520881189305],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.2120558943125, 709.5825463127163, 1, 0, 0.2881356452556914, 0.003481747995870958, 0, -0.01447028598497451, 1, 0.2881356452556914, 0.0009738148341293776],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.4650520104217, 709.3295501966071, 0, 1, 0.2883894549327794, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883389, 0.7116105450672205, 1, 0.0009744706148220268],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009745091106799327],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009738754538157583],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009815190013738085],
[287.5601540779294, 708.8192030766929, 0, 1, 0.2886050900322944, 0, 0.001410796992603207, 0.005863329561450256, 0.7113949099677056, 1, 0.0009739946222439128],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009739946106593363],
[288.2404917489284, 708.5541104581006, 0, 1, 0.2891673882570467, 0, 0.001411324816609237, 0.005865523219442177, 0.7108326117429533, 1, 0.0009740482046776245],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 0, 1, 0.2885654195994594, 0, 0.00140970909626346, 0.005858808220107686, 0.7114345804005406, 1, 0.0009735909551353274],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[288.077429156369, 709.0152486249542, 0, 1, 0.2889174051477174, 0, 0.001410406901599612, 0.005861708327406644, 0.7110825948522825, 1, 0.0009733367243032609],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 0, 1, 0.2885654195994594, 0, 0.00140970909626346, 0.005858808220107686, 0.7114345804005406, 1, 0.000972846151128027],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 1, 0, 0.2885654195994594, 0.003475523161365309, 0, -0.01444441532012091, 1, 0.2885654195994594, 0.0009755126862530217],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 0, 1, 0.2885654195994594, 0, 0.00140970909626346, 0.005858808220107686, 0.7114345804005406, 1, 0.0009737547147293759],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 0, 1, 0.2885654195994594, 0, 0.00140970909626346, 0.005858808220107686, 0.7114345804005406, 1, 0.0009726301079714651],
[287.7264669435161, 709.3662108378071, 1, 0, 0.2885654195994594, 0.003475523161365309, 0, -0.01444441532012091, 1, 0.2885654195994594, 0.0009726301014862134],
[287.7758568200189, 709.1677831741572, 1, 0, 0.2886580998918856, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2886580998918856, 0.0009737396980230897],
[287.5614596800373, 709.3821803141389, 1, 0, 0.2884430454681642, 0.003477517470917959, 0, -0.01445270375156501, 1, 0.2884430454681641, 0.000973879445115777],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.718048126531, 709.076554080498, 1, 0, 0.2886432646098674, 0.003475624857430653, 0, -0.01444483797309603, 1, 0.2886432646098673, 0.0009737705050474177],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009732520945794952],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009755119861532516],
[287.7647763617231, 709.1505615579349, 0, 1, 0.2886551800499174, 0, 0.001410137782029104, 0.005860589855548826, 0.7113448199500827, 1, 0.0009738614459604981],
[287.9324452665126, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2888272897511953, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888272897511952, 0.0009732745183947049],
[287.8802970628283, 709.0955111916284, 0, 1, 0.2887535431445023, 0, 0.001410247257551397, 0.005861044840262772, 0.7112464568554977, 1, 0.0009735666433424633],
[287.7758568200189, 709.01874538701, 1, 0, 0.2887012591990836, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2887012591990836, 0.0009735164564350636],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.000973913737663019],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009740572295712542],
[287.8681624269589, 708.92643978007, 0, 1, 0.288793861633663, 0, 0.001410583586514603, 0.00586244263708448, 0.7112061383663371, 1, 0.0009744991974383142],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.000973899868540658],
[287.6762089093747, 709.1183932976543, 0, 1, 0.2886012908501143, 0, 0.001410201751148552, 0.005860855713805575, 0.7113987091498857, 1, 0.0009740017370936509],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009736021955071343],
[287.8252466965218, 708.8416848324766, 0, 2, 0.2887877961948288, 0, 0.002821504495002531, 0.01172628719798103, 0.5058227988414082, 1, 0.001956050070018609],
[287.9324452665126, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2888272897511953, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888272897511952, 0.0009732745184383745],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0009738614459350584],
[287.8252466965218, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2888064235781618, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7111935764218382, 1, 0.0009742886981481687],
[287.9742844836689, 708.8203177233599, 0, 1, 0.2889003249476447, 0, 0.001410794774071759, 0.005863320341143515, 0.7110996750523553, 1, 0.0009732520945794952],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.0009759550506284998],
[288.017200214106, 708.7774019929229, 0, 1, 0.2889433786824283, 0, 0.001410880196219891, 0.005863675359058193, 0.7110566213175717, 1, 0.0009734663446704034],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009739807552201386],
[287.8746365730246, 708.9199656340043, 1, 0, 0.2888003565986753, 0.00347373430290491, 0, -0.01443698075175487, 1, 0.2888003565986753, 0.0009740572300462238],
[287.8224883693404, 709.0325841724872, 0, 1, 0.2887305249251901, 0, 0.001410372417745937, 0.00586156501111117, 0.7112694750748099, 1, 0.0009744991974383142],
[287.9100016441152, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2888358353934162, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7111641646065838, 1, 0.000973239492012677],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 0, 1, 0.2887508078988795, 0, 0.001410498200278248, 0.005862087768420609, 0.7112491921011206, 1, 0.0009737197526685404],
[287.8252466965218, 708.9693555105072, 1, 0, 0.2887508078988795, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2887508078988794, 0.0009740243552902615],
[287.4650520104217, 709.3295501966072, 0, 1, 0.2883894549327793, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883388, 0.7116105450672207, 1, 0.0009739875282303256],
[287.9324452665126, 708.8621569405163, 1, 0, 0.2888583511878915, 0.003473036875279519, 0, -0.01443408221423717, 1, 0.2888583511878915, 0.0009732745184559114],
[287.7758568200189, 709.1677831741572, 1, 0, 0.2886580998918856, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2886580998918856, 0.0009734789511201513],
[287.8252466965218, 709.1505615579349, 1, 0, 0.2886983257903291, 0.003474330384416846, 0, -0.01443945809071171, 1, 0.2886983257903291, 0.0009736959133165864],
[287.8252466965218, 708.8846005629138, 0, 1, 0.2887753617443725, 0, 0.001410666840845345, 0.005862788645462099, 0.7112246382556275, 1, 0.0009739137376449774],
[287.8224883693404, 709.1533198851163, 0, 1, 0.2886955590961339, 0, 0.001410132297148382, 0.005860567060161927, 0.711304440903866, 1, 0.0009743016950228235],
[287.6332931789375, 709.1613090280914, 0, 1, 0.2885582371153306, 0, 0.001410116411131487, 0.005860501037230947, 0.7114417628846694, 1, 0.0009737940571054978],
[287.7758568200189, 709.01874538701, 1, 0, 0.2887012591990836, 0.00347492667053519, 0, -0.01444193628002109, 1, 0.2887012591990836, 0.0009732520945451379],
[287.6854413826218, 709.0486904896084, 0, 1, 0.2886280625729588, 0, 0.001410340380587242, 0.00586143186337934, 0.7113719374270413, 1, 0.0009741270829142877],
[287.4650520104217, 709.3295501966071, 0, 1, 0.2883894549327794, 0, 0.001409781954978228, 0.005859111023883389, 0.7116105450672205, 1, 0.0009740322800989241]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.616092964831519, 2.383733043319534, 0, 1, 0.2053762328740022, 0, 0.4195100633447705, 1.743500849967485, 0.7946237671259978, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917687199596802, 0, 1, 0.2730737158661753, 0, 0.5214614772473073, 2.167215064061023, 0.7269262841338247, 1, 0.2406136270897683],
[0.6163044836194846, 2.383450242123288, 0, 1, 0.205451625204751, 0, 0.4195598390630356, 1.743707719872848, 0.7945483747952491, 1, 0.2406136270897683],
[0.9939204536284676, 2.006079546371534, 0, 1, 0.3313068178761558, 0, 0.4984847195161005, 2.071722726369631, 0.6686931821238442, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9976678531827129, 2.002332146817289, 0, 2, 0.3325559510609041, 0, 0.9988352847348551, 4.151199983208802, 0.4454815584642141, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6166999291188303, 2.383300070881171, 1, 1, 0.20556664303961, 1.621534157509709, 0.4195862754412929, -4.995344181483091, 0.9577423552694256, 0.3688756413486455, 0.2406136270897683],
[0.6215984503708706, 2.257705732237693, 0, 1, 0.2158849537764784, 0, 0.4429275196147304, 1.840824748672621, 0.7841150462235216, 1, 0.2406136270897683],
[0.9997552519015781, 1.640524621031578, 0, 2, 0.3786550290181638, 0, 1.219122209054309, 5.066721381492985, 0.3860695729644189, 1, 0.2406136270897683],
[0.8283200828048003, 2.171336865833905, 1, 1, 0.2761382708048352, 1.207262772881069, 0.4605457659449579, -3.103386187921624, 0.9237476553969154, 0.4760241970065859, 0.2406136270897683],
[0.6165268203820843, 2.383473179617917, 1, 0, 0.2055089401273613, 1.621989452754486, 0, -6.741053997533369, 1, 0.2055089401273613, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 1.637587905144443, 0, 0, 0.3791342832781291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6215984529845423, 1.549592429652845, 0, 1, 0.2862937837273315, 0, 0.645330979207242, 2.682021741713247, 0.7137062162726685, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.002316233769659, 1.995041076432384, 0, 1, 0.3343999830644467, 0, 0.5012428123977487, 2.083185472328816, 0.6656000169355533, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9822849611922778, 2.017715038807722, 0, 0, 0.3274283203974259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7025272788452892, 2.297472721154711, 0, 1, 0.2341757596150964, 0, 0.4352608807026008, 1.808961886186992, 0.7658242403849036, 1, 0.2406136270897683],
[0.6165265740452959, 2.383473425954706, 1, 0, 0.2055088580150985, 1.621990100829831, 0, -6.741056690960808, 1, 0.2055088580150985, 0.2406136270897683],
[0.8304901048131925, 2.169509895186808, 0, 1, 0.2768300349377308, 0, 0.4609335971311132, 1.915658737645594, 0.7231699650622692, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.8304901048131925, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2934085879335738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9956256634050726, 2.004374336594929, 1, 1, 0.331875221135024, 1.004393555485469, 0.4989088024838814, -2.100815149646538, 0.889858837596579, 0.5536092798666269, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9992227942275382, 2.000777205772463, 0, 1, 0.3330742647425126, 0, 0.4998057740336553, 2.077213082562391, 0.6669257352574874, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.381218473780258, 0, 1, 0.2055485315589581, 0, 0.4199530664704062, 1.745341988937849, 0.7944514684410419, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7200115518959785, 1.918309453676017, 1, 1, 0.2729052114490056, 1.388866605496452, 0.5212923275145837, -3.605673911636738, 0.9255227455639736, 0.4713331684619847, 0.2406136270897683],
[1.237231168693878, 1.676873295002576, 0.25, 0.5, 0.4245665123221037, 0.2020640979033209, 0.2981739893467812, 0.3994366096630242, 0.7737919294000578, 0.3393121058999133, 0.2406136270897683],
[0.6165265740452959, 2.383473425954706, 1, 0, 0.2055088580150985, 1.621990100829831, 0, -6.741056690960808, 1, 0.2055088580150985, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6169604214054407, 2.383039578594561, 1, 0, 0.2056534738018135, 1.620849515309251, 0, -6.736316371244192, 1, 0.2056534738018134, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9979758860714693, 2.001779299070984, 0, 2, 0.3326857774975651, 0, 0.9991111412372936, 4.152346454029158, 0.4453082715540292, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.6168695917212077, 2.383130408278794, 0, 1, 0.2056231972404025, 0, 0.4196161471172893, 1.743941738431708, 0.7943768027595975, 1, 0.2406136270897683],
[0.6215984500727965, 2.016723201373934, 0, 1, 0.2356037406325879, 0, 0.495853867957055, 2.060788800511542, 0.7643962593674121, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.002495732800411883, 1.758973494357527, 0, 1, 0.001416847232942383, 0, 0.5685133989840219, 2.362764760500952, 0.9985831527670577, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6218096841149496, 2.257249646287673, 1, 0, 0.2159766829216376, 1.608209112123022, 0, -6.683782342564623, 1, 0.2159766829216376, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8304901048131925, 2.169509895186808, 0, 0, 0.2768300349377308, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.001680988324269, 1.997289380670653, 1, 2, 0.3340082978745714, 0.9983218326554429, 1.001357149021859, 0.01261489801358494, 0.739840333056955, 0.704602745578589, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6216096191943495, 2.015978285950093, 0, 0, 0.2356735174520405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.000481250671905, 1.999344975667262, 0, 1, 0.3335130688196031, 0, 0.5001638097328651, 2.078701093459946, 0.6664869311803969, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.2796106277999262, 2.720389372200075, 0, 0, 0.09320354259997535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6171374766194361, 2.382862523380565, 2, 0, 0.2057124922064786, 3.24076899519314, 0, -13.46876747751312, 1, 0.04231762944980044, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.237702584025868, 1.676465955099907, 0, 0, 0.4247189438113858, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.999223085855744, 2.000776914144258, 0, 1, 0.3330743619519145, 0, 0.4998058468840865, 2.07721338533174, 0.6669256380480855, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.830399185212827, 2.169600814787174, 1, 1, 0.2767997284042756, 1.20424010260042, 0.460914281182225, -3.0892922832707, 0.9233819103553194, 0.4769813671638704, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.156040587123184, 0.4444444444444445, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.9822849611922778, 2.017715038807722, 0, 0, 0.3274283203974259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0, 1.756780761611301, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8300562051989595, 2.169943794801041, 1, 0, 0.2766854017329864, 1.204737695756766, 0, -5.006938760402385, 1, 0.2766854017329865, 0.2406136270897683],
[0.8300562585192324, 2.000035831271853, 1, 1, 0.2932965543819128, 1.204737618368105, 0.4999910423425188, -2.928955373598431, 0.9139771311876976, 0.5005702399515233, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8790593304026239, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3053286610386355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383130134639953, 0, 1, 0.2054175179365909, 0, 0.4196161952989955, 1.743941938676835, 0.7945824820634091, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.078020293561592, 0.6666666666666667, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.6173032852898157, 2.382696714710186, 1, 1, 0.2057677617632718, 1.619949259674705, 0.419692524787668, -4.988315705158478, 0.9576596282189331, 0.3691951517454771, 0.2406136270897683],
[0.2796106277999262, 2.720389372200075, 0, 0, 0.09320354259997535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.078020293561592, 0.6666666666666667, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2114129490315415, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8300561723236819, 2.169943827676319, 1, 0, 0.2766853907745606, 1.204737743471713, 0, -5.006938958707641, 1, 0.2766853907745606, 0.2406136270897683],
[0.2836416770161664, 2.716358322983836, 0, 3, 0.09454722567205541, 0, 1.104419830998067, 4.590013642851695, 0.7423306821621226, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6223640701326777, 2.256696341194191, 0, 3, 0.2161691598009399, 0, 1.329376906071674, 5.524944377218124, 0.4815784460379099, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.001680708405773, 1.99797623534761, 0, 2, 0.3339317552601195, 0, 1.001012907269158, 4.160250270844801, 0.4436469066508653, 1, 0.2406136270897683],
[0.9986188034727911, 2.00138119652721, 0, 2, 0.3328729344909302, 0, 0.9993098783332196, 4.153172413465994, 0.4450585215347427, 1, 0.2406136270897683],
[0.7209779127363547, 1.917343185143184, 1, 2, 0.2732714806078064, 1.387005041811423, 1.043110078309034, -1.429241426023173, 0.8167824474920025, 0.6161897123990462, 0.2406136270897683],
[0.9972088618649764, 2.002546164436001, 3, 3, 0.3324300994987056, 3.008396851176604, 1.498092804689435, -6.276884916097058, 0.9007524918616663, 0.3178329607055915, 0.2406136270897683],
[0.7025275398602678, 2.297472460139732, 0, 1, 0.2341758466200893, 0, 0.435260930152425, 1.808962091702468, 0.7658241533799107, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2114129490315415, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.156040587123184, 0.4444444444444445, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.6178209444253121, 2.38217905557469, 0, 2, 0.2059403148084372, 0, 0.8395674520434021, 3.489276406319978, 0.6305307836465238, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8790593304026239, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3053286610386355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9992227450139824, 2.000777254986019, 0, 1, 0.3330742483379939, 0, 0.4998057617398233, 2.077213031468726, 0.6669257516620061, 1, 0.2406136270897683],
[0.6168694236823365, 2.382353555939038, 0, 3, 0.2056764128154989, 0, 1.259258934309399, 5.233531240687352, 0.5011784364806692, 1, 0.2406136270897683],
[0.9984451253932196, 2.001554874606782, 0, 3, 0.3328150417977397, 0, 1.498834749953768, 6.22921805419849, 0.2969878890685461, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.998882836172825, 2.000728183598806, 0, 1.5, 0.3330041227308442, 0, 0.7497270305363908, 3.115895968172584, 0.5447343027212469, 1, 0.2406136270897683],
[0.8295304371283805, 2.170126379127853, 1, 2, 0.2765417805906505, 1.205501275470664, 0.9216053125918756, -1.179883144244661, 0.8128711932303527, 0.6213479037687566, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8787381900567767, 2.000321140345848, 0, 1, 0.3052171175416134, 0, 0.4999197278028586, 2.077686679052256, 0.6947828824583866, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 3, 0, 0.3333333333333333, 2.999999999999999, 0, -12.46812176136955, 1, 0.03703703703703698, 0.2406136270897683],
[0.9992230441391381, 2.000603249076503, 0, 2, 0.3330936349211169, 0, 0.9996984664116779, 4.154787401291738, 0.4447640997827285, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.702527264955819, 2.297472735044181, 0, 1, 0.234175754985273, 0, 0.4352608780712123, 1.808961875250835, 0.765824245014727, 1, 0.2406136270897683],
[0.9985419565124412, 2.00145804348756, 1, 1, 0.3328473188374803, 1.001460172482538, 0.499635754670875, -2.085602648034734, 0.8892126623427008, 0.5549073000176613, 0.2406136270897683],
[0.7196994504497131, 1.917888454694729, 1, 0, 0.2728627353219154, 1.389468894793706, 0, -5.774689121307836, 1, 0.2728627353219154, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6178196688537509, 2.382006724102256, 0, 3, 0.2059518078461053, 0, 1.259442288573159, 5.234293268449362, 0.5006573357384663, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.078020293561592, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.335801172730948, 1.281068961474246, 0, 1, 0.5104575711536647, 0, 0.7805981021109173, 3.244197394604301, 0.4895424288463353, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.999223139616302, 2.0007768603837, 0, 1, 0.3330743798721005, 0, 0.4998058603137907, 2.077213441146136, 0.6669256201278995, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7201895963131588, 1.449320298873648, 1, 0, 0.3319595812450288, 1.388523251542739, 0, -5.770758989575882, 1, 0.3319595812450289, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9994338895613911, 1.638154015583052, 0, 1, 0.3789196514027307, 0, 0.610443212596271, 2.53702676768397, 0.6210803485972693, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7024921755282764, 2.297507824471724, 1, 0, 0.2341640585094255, 1.423503399519001, 0, -5.916137904308799, 1, 0.2341640585094255, 0.2406136270897683],
[0.9985568807328353, 1.641598081043455, 1, 2.75, 0.3782190421356967, 1.001445204870158, 1.675196890003678, 2.800139349057549, 0.5522743304730259, 0.8316782197061902, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.918176395192177, 0, 2, 0.2730230874298236, 0, 1.04265697618473, 4.33332471147087, 0.5284954314100658, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.078020293561592, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2406136270897683],
[1.000584215027983, 1.997085321628628, 0, 2, 0.3337873647486721, 0, 1.001459466122857, 4.162106187565312, 0.4438392753685189, 1, 0.2406136270897683],
[0.7201895497484779, 2.158869780654148, 1, 0, 0.2501475194148785, 1.388523341319302, 0, -5.770759362690918, 1, 0.2501475194148786, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6216096191943495, 1.547900275992459, 0, 0, 0.286520757786553, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8298819959792936, 2.170118004020707, 1, 0, 0.2766273319930978, 1.204990594861575, 0, -5.007989819346417, 1, 0.2766273319930979, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383128804278352, 0, 1, 0.2054176090534203, 0, 0.4196164295462055, 1.743942912217747, 0.7945823909465797, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2355011741225321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6165265796597494, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2356278680493747, 1.621990086059036, 0, -6.741056629572782, 1, 0.2356278680493747, 0.2406136270897683],
[0.6216096191943495, 2.257449711208273, 0, 0, 0.2159071932385014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.382352809609953, 0, 2, 0.2054707709184036, 0, 0.8395062192016163, 3.489021920144252, 0.6312766958649959, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.8304901048131925, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2934085879335738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6216096191943495, 1.547900275992459, 0, 0, 0.286520757786553, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6186207428267652, 2.393688006694199, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2396304433880148],
[0.8826660374399543, 2.008205833013976, 0, 0, 0.3053286610386355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2396304433880148],
[0.6186207428267652, 2.393688006694199, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2396304433880148],
[1.33432306814078, 1.282554247819417, 0, 1, 0.5098913349903009, 0, 0.7796941156291737, 3.240440390095964, 0.4901086650096991, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6165265796597768, 2.383473420340225, 1, 0, 0.2055088598865921, 1.621990086058964, 0, -6.741056629572483, 1, 0.2055088598865922, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 3, 2, 0.3333333333333333, 2.999999999999999, 0.9999999999999996, -8.312081174246368, 0.9547325102880663, 0.2098765432098761, 0.2406136270897683],
[0.7802795773969002, 2.219720422603102, 0, 0, 0.2600931924656333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.450557063911068, 0, 1, 0.3318319421507798, 0, 0.689390321056207, 2.86513415467948, 0.6681680578492202, 1, 0.2406136270897683],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7025279575939497, 2.29747204240605, 0, 1, 0.2341759858646499, 0, 0.4352610092929533, 1.808962420613716, 0.7658240141353501, 1, 0.2406136270897683],
[0.6176134324369186, 2.382386567563083, 1, 1, 0.2058711441456394, 1.619135769204854, 0.4197471617810912, -4.984707732186314, 0.9576170720081655, 0.3693593602994441, 0.2406136270897683],
[0.8291885003398795, 2.170811499660121, 1, 0, 0.2763961667799598, 1.205998394321805, 0, -5.012178274806813, 1, 0.2763961667799597, 0.2406136270897683],
[1.33628251457866, 1.280413430019483, 1, 0, 0.5106755018049599, 0.7483447467808163, 0, -3.110151140781496, 1, 0.5106755018049599, 0.2406136270897683],
[0.7202413164469487, 1.920541534191648, 0.5, 2.5, 0.2727378043494865, 0.694211771224914, 1.301716185509232, 2.524813002622124, 0.6010372183490181, 0.6153435330308186, 0.2406136270897683],
[1.333285063080369, 1.292455924146303, 2, 0, 0.507774784171913, 1.500054306000608, 0, -6.23428657862743, 0.9999999999999998, 0.257835231440833, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.9999999999999996, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2406136270897683],
[0.01305991152169001, 2.986592637236773, 0, 3, 0.004353808085904958, 0, 1.004489183625535, 4.174697816473959, 0.9869953601475921, 1, 0.2406136270897683],
[0.6173030076838286, 2.381919569395062, 1, 3, 0.2058210058838161, 1.619949988178548, 1.25948837170934, -1.498093108146056, 0.8101949785695852, 0.6021919350881673, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8303992050266942, 2.169600794973307, 1, 1, 0.276799735008898, 1.204240073866465, 0.4609142853915221, -3.089292146357206, 0.9233819066990038, 0.4769813767167999, 0.2406136270897683],
[0.7025274444981844, 2.297472555501816, 0, 1, 0.2341758148327281, 0, 0.435260912085881, 1.808962016617178, 0.7658241851672719, 1, 0.2406136270897683],
[0.720954925828988, 1.916632979315454, 0, 1, 0.2733387290800102, 0, 0.5217483006877827, 2.168407113920977, 0.7266612709199898, 1, 0.2406136270897683],
[1.150721771749471, 1.8475973323975, 0, 1, 0.3837889603404486, 0, 0.5412434746819906, 2.249429848293933, 0.6162110396595515, 1, 0.2406136270897683],
[0.6165265796597689, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2356278680493804, 1.621990086058985, 0, -6.74105662957257, 1, 0.2356278680493804, 0.2406136270897683],
[0.720189601487002, 2.158869728915624, 1, 0, 0.2501475373855134, 1.388523241567586, 0, -5.77075894811874, 1, 0.2501475373855134, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2355011741225321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.830056258519259, 2.169599966191828, 1, 1, 0.2767171290100772, 1.204737618368066, 0.4609144614595665, -3.091359229753823, 0.9234276305124205, 0.4768618885325746, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383130079307632, 0, 1, 0.2054175217263151, 0, 0.4196162050417865, 1.74394197916827, 0.7945824782736849, 1, 0.2406136270897683],
[0.9817175478778749, 2.018282452122125, 1, 0, 0.3272391826259584, 1.018622924854145, 0, -4.233438218667958, 1, 0.3272391826259584, 0.2406136270897683],
[0.9993967094079956, 2.000603290592006, 0, 2, 0.3331322364693317, 0, 0.9996984456664433, 4.154787315073701, 0.4447126140363954, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2355011741225321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 1.638320860992939, 1, 0, 0.3790289554181244, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3790289554181244, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 1, 0.2053643216105062, 0, 0.4194794449815133, 1.743373598807077, 0.7946356783894938, 1, 0.2406136270897683],
[0.6169608581623568, 2.383039141837645, 1, 0, 0.2056536193874521, 1.620848367882755, 0, -6.736311602493104, 1, 0.2056536193874521, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 1, 0.2053643216105062, 0, 0.4194794449815133, 1.743373598807077, 0.7946356783894938, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6220356620244508, 1.549168141301155, 0, 1, 0.2864934471244415, 0, 0.6455077233644209, 2.682756297604019, 0.7135065528755584, 1, 0.2406136270897683],
[1.336202685136561, 1.28073415100135, 1, 0, 0.5105979887189542, 0.7483894555247054, 0, -3.110336952135698, 1, 0.5105979887189542, 0.2406136270897683],
[0.9976693894842928, 2.001809547635983, 0, 1, 0.3326142341383234, 0, 0.499548022028839, 2.076141854768962, 0.6673857658616766, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6165267256469834, 2.383473274353018, 1, 0, 0.2055089085489944, 1.621989701988344, 0, -6.741055033359398, 1, 0.2055089085489944, 0.2406136270897683],
[1.829490462945778, 1.169732687841359, 1, 0, 0.6099881105764451, 0.5466002803807115, 0, -2.27169295019515, 1, 0.6099881105764451, 0.2406136270897683],
[1.826784127759381, 1.17321587224062, 0, 1, 0.6089280425864602, 0, 0.8523580558880351, 3.542434675032087, 0.3910719574135398, 1, 0.2406136270897683],
[0.7025273664387439, 2.297472633561256, 0, 1, 0.2341757888129146, 0, 0.4352608972973595, 1.808961955155483, 0.7658242111870853, 1, 0.2406136270897683],
[1, 1.638321022344641, 1, 0, 0.3790289322378644, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3790289322378644, 0.2406136270897683],
[1.830490104813193, 1.169509895186808, 0, 0, 0.6101633682710641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.078020293561592, 0.6666666666666667, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9989110860029395, 2.000845461622991, 0, 1, 0.3329973850022924, 0, 0.4997887239071663, 2.077142221544687, 0.6670026149977076, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.621809399443277, 2.257249930959346, 1, 0, 0.2159765840450116, 1.608209848380111, 0, -6.683785402478965, 1, 0.2159765840450116, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917687199596811, 0, 1, 0.2730737158661744, 0, 0.5214614772473047, 2.167215064061012, 0.7269262841338255, 1, 0.2406136270897683],
[1.000681028759045, 1.829718123504877, 0, 2, 0.3535476711680897, 0, 1.09306454054734, 4.542820594859903, 0.4179006134522003, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383129780176676, 0, 1, 0.2054175422138697, 0, 0.4196162577121015, 1.743942198068236, 0.7945824577861303, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.156040587123184, 0.4444444444444445, 1, 0.2406136270897683],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8303990239490688, 2.169257783148266, 1, 2, 0.2768313435004645, 1.204240336464236, 0.9219743340495844, -1.173108962400304, 0.812523489965886, 0.6218023863679284, 0.2406136270897683],
[0.6162667760382003, 2.383384343815062, 0, 3, 0.2054461507071352, 0, 1.258714318479548, 5.231267795194101, 0.5016144144444936, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9993967094123777, 2.000603290587624, 0, 1, 0.3331322364707924, 0, 0.4998492228343165, 2.077393657541401, 0.6668677635292075, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8304901048131925, 2.168820886325674, 0, 1, 0.2768936289923866, 0, 0.4610800303081544, 1.916267319872678, 0.7231063710076134, 1, 0.2406136270897683],
[0.6186039821648524, 2.008151423491811, 0, 0, 0.2355011741225321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2396369360148996],
[0.8298820877933248, 2.169810776211323, 1, 1, 0.2766556862376291, 1.204990461547402, 0.460869680878849, -3.092596166180296, 0.9234616312723867, 0.4767730037476446, 0.2406136270897683],
[0.2796106277999262, 2.720389372200075, 0, 0, 0.09320354259997535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9985411578265381, 2.001458842173463, 0, 1, 0.3328470526088459, 0, 0.4996355552902904, 2.076505646556277, 0.6671529473911542, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.078020293561592, 0.6666666666666667, 1, 0.2406136270897683],
[0.7199892962591746, 1.449520598927632, 1, 0, 0.3318672562206403, 1.388909536844045, 0, -5.772364406966316, 1, 0.3318672562206404, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.078020293561592, 0.6666666666666667, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.00068097716344, 1.829411055131984, 1, 1, 0.3535860197280616, 0.9993194862508828, 0.5466240062312592, -1.881420788568769, 0.8749769266528669, 0.58214896610899, 0.2406136270897683],
[0.9989110990029637, 2.001088900997038, 0, 1, 0.332970366334321, 0, 0.4997279228832623, 2.076889530021604, 0.6670296336656789, 1, 0.2406136270897683],
[0.6215872717629913, 2.257961977553249, 0, 1, 0.2158626986187472, 0, 0.442877253886981, 1.840615842267953, 0.7841373013812528, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2114129490315415, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2114129490315415, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.078020293561592, 0.6666666666666667, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6168695917212076, 2.383130408278794, 0, 1, 0.2056231972404024, 0, 0.4196161471172892, 1.743941738431708, 0.7943768027595977, 1, 0.2406136270897683],
[0.9992227346339315, 2.00077726536607, 1, 1, 0.333074244877977, 1.000777869977461, 0.4998057591468263, -2.082060425628894, 0.8890615473989654, 0.5552100371549193, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.2796106277999262, 2.720389372200075, 0, 0, 0.09320354259997535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.2796106277999262, 2.720389372200075, 0, 0, 0.09320354259997535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383130069521552, 0, 1, 0.2054175223965661, 0, 0.4196162067648974, 1.743941986329588, 0.7945824776034339, 1, 0.2406136270897683],
[1.336282511993755, 1.280413440404541, 1, 0, 0.5106754992948279, 0.7483447482284146, 0, -3.110151146797773, 1, 0.5106754992948279, 0.2406136270897683],
[0.9992231396163354, 2.000776860383666, 0, 1, 0.3330743798721116, 0, 0.499805860313799, 2.07721344114617, 0.6669256201278884, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9996110913927484, 2.000388908607253, 0, 0.75, 0.3332036971309159, 0, 0.3749270938130618, 1.558212219099227, 0.7378955433827095, 1, 0.2406136270897683],
[0.9990235397666234, 2.000976460233378, 1, 1, 0.3330078465888743, 1.000977414639904, 0.4997560040678179, -2.083096525472724, 0.8891057741102408, 0.5551214672879894, 0.2406136270897683],
[0.6217983889628099, 2.25750584981613, 1, 1, 0.2159543894626791, 1.608238325718484, 0.4429667369772035, -4.842916017830278, 0.9533637016718015, 0.3852724805971597, 0.2406136270897683],
[0.9992227450139824, 2.000777254986019, 0, 1, 0.3330742483379939, 0, 0.4998057617398233, 2.077213031468726, 0.6669257516620061, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.002406302378592, 1.996724811617052, 2, 1, 0.3342322373639473, 1.995198948025602, 0.5008201401524869, -6.210698978057429, 0.9626625195312954, 0.2604586045425206, 0.2406136270897683],
[0.9993966964160363, 2.000603303583965, 0, 1, 0.3331322321386786, 0, 0.4998492195871904, 2.077393644046213, 0.6668677678613214, 1, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8304901048131925, 2.169509895186808, 0, 0, 0.2768300349377308, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2355011741225321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9985420877375225, 2.001457912262479, 0, 1, 0.332847362579174, 0, 0.4996357874293667, 2.0765066113357, 0.6671526374208261, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 1.830525932373821, 1, 0, 0.3532912341705169, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3532912341705169, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.001419721795245589, 2.998580278204755, 0, 1, 0.0004732405984151963, 0, 0.3334911548870382, 1.386002775157116, 0.9995267594015848, 1, 0.2406136270897683],
[0.9989110990029637, 2.001088900997038, 0, 1, 0.332970366334321, 0, 0.4997279228832623, 2.076889530021604, 0.6670296336656789, 1, 0.2406136270897683],
[0.003752246219249133, 1.757714118431498, 0, 2, 0.002130183291914918, 0, 1.137841460694818, 4.728915292359194, 0.9957441710970273, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2114129490315415, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.078020293561592, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.382352141947561, 0, 1, 0.2054708166704856, 0, 0.4197532272380626, 1.74451144897733, 0.7945291833295144, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7207553500456471, 1.916832555098794, 1, 1, 0.2732630630584335, 1.387433336341753, 0.5216939775673101, -3.598047912936586, 0.9253272983679226, 0.4718534244847896, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8300562051989659, 2.000035846062952, 1, 1, 0.2932965395344119, 1.204737695756757, 0.4999910386448767, -2.928955710596361, 0.9139771398971392, 0.5005702189659629, 0.2406136270897683],
[1, 1.999656943753362, 0, 1, 0.3333714550533691, 0, 0.5000857787751319, 2.078376793632555, 0.6666285449466309, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.155797026862494, 0, 1, 0.2504668586274066, 0, 0.4638655622674185, 1.927844103752109, 0.7495331413725934, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683]
],
"RESOLVED": [
[0.616092964831519, 2.383733043319534, 0, 1, 0.2053762328740022, 0, 0.4195100633447705, 1.743500849967485, 0.7946237671259978, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917687199596802, 0, 1, 0.2730737158661753, 0, 0.5214614772473073, 2.167215064061023, 0.7269262841338247, 1, 0.2406136270897683],
[0.6163044836194846, 2.383450242123288, 0, 1, 0.205451625204751, 0, 0.4195598390630356, 1.743707719872848, 0.7945483747952491, 1, 0.2406136270897683],
[0.9939204536284676, 2.006079546371534, 0, 1, 0.3313068178761558, 0, 0.4984847195161005, 2.071722726369631, 0.6686931821238442, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9976678531827129, 2.002332146817289, 0, 2, 0.3325559510609041, 0, 0.9988352847348551, 4.151199983208802, 0.4454815584642141, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6166999291188303, 2.383300070881171, 1, 1, 0.20556664303961, 1.621534157509709, 0.4195862754412929, -4.995344181483091, 0.9577423552694256, 0.3688756413486455, 0.2406136270897683],
[0.6215984503708706, 2.257705732237693, 0, 1, 0.2158849537764784, 0, 0.4429275196147304, 1.840824748672621, 0.7841150462235216, 1, 0.2406136270897683],
[0.9997552519015781, 1.640524621031578, 0, 2, 0.3786550290181638, 0, 1.219122209054309, 5.066721381492985, 0.3860695729644189, 1, 0.2406136270897683],
[0.8283200828048003, 2.171336865833905, 1, 1, 0.2761382708048352, 1.207262772881069, 0.4605457659449579, -3.103386187921624, 0.9237476553969154, 0.4760241970065859, 0.2406136270897683],
[0.6165268203820843, 2.383473179617917, 1, 0, 0.2055089401273613, 1.621989452754486, 0, -6.741053997533369, 1, 0.2055089401273613, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 1.637587905144443, 0, 0, 0.3791342832781291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6215984529845423, 1.549592429652845, 0, 1, 0.2862937837273315, 0, 0.645330979207242, 2.682021741713247, 0.7137062162726685, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.002316233769659, 1.995041076432384, 0, 1, 0.3343999830644467, 0, 0.5012428123977487, 2.083185472328816, 0.6656000169355533, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9822849611922778, 2.017715038807722, 0, 0, 0.3274283203974259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7025272788452892, 2.297472721154711, 0, 1, 0.2341757596150964, 0, 0.4352608807026008, 1.808961886186992, 0.7658242403849036, 1, 0.2406136270897683],
[0.6165265740452959, 2.383473425954706, 1, 0, 0.2055088580150985, 1.621990100829831, 0, -6.741056690960808, 1, 0.2055088580150985, 0.2406136270897683],
[0.8304901048131925, 2.169509895186808, 0, 1, 0.2768300349377308, 0, 0.4609335971311132, 1.915658737645594, 0.7231699650622692, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.8304901048131925, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2934085879335738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9956256634050726, 2.004374336594929, 1, 1, 0.331875221135024, 1.004393555485469, 0.4989088024838814, -2.100815149646538, 0.889858837596579, 0.5536092798666269, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9992227942275382, 2.000777205772463, 0, 1, 0.3330742647425126, 0, 0.4998057740336553, 2.077213082562391, 0.6669257352574874, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.381218473780258, 0, 1, 0.2055485315589581, 0, 0.4199530664704062, 1.745341988937849, 0.7944514684410419, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7200115518959785, 1.918309453676017, 1, 1, 0.2729052114490056, 1.388866605496452, 0.5212923275145837, -3.605673911636738, 0.9255227455639736, 0.4713331684619847, 0.2406136270897683],
[1.237702584025868, 1.676465955099907, 0, 0, 0.4247189438113858, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6165265740452959, 2.383473425954706, 1, 0, 0.2055088580150985, 1.621990100829831, 0, -6.741056690960808, 1, 0.2055088580150985, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6169604214054407, 2.383039578594561, 1, 0, 0.2056534738018135, 1.620849515309251, 0, -6.736316371244192, 1, 0.2056534738018134, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9979758860714693, 2.001779299070984, 0, 2, 0.3326857774975651, 0, 0.9991111412372936, 4.152346454029158, 0.4453082715540292, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.6168695917212077, 2.383130408278794, 0, 1, 0.2056231972404025, 0, 0.4196161471172893, 1.743941738431708, 0.7943768027595975, 1, 0.2406136270897683],
[0.6215984500727965, 2.016723201373934, 0, 1, 0.2356037406325879, 0, 0.495853867957055, 2.060788800511542, 0.7643962593674121, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.002495732800411883, 1.758973494357527, 0, 1, 0.001416847232942383, 0, 0.5685133989840219, 2.362764760500952, 0.9985831527670577, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6218096841149496, 2.257249646287673, 1, 0, 0.2159766829216376, 1.608209112123022, 0, -6.683782342564623, 1, 0.2159766829216376, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8304901048131925, 2.169509895186808, 0, 0, 0.2768300349377308, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.001680988324269, 1.997289380670653, 1, 2, 0.3340082978745714, 0.9983218326554429, 1.001357149021859, 0.01261489801358494, 0.739840333056955, 0.704602745578589, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6216096191943495, 2.015978285950093, 0, 0, 0.2356735174520405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.000481250671905, 1.999344975667262, 0, 1, 0.3335130688196031, 0, 0.5001638097328651, 2.078701093459946, 0.6664869311803969, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.2796106277999262, 2.720389372200075, 0, 0, 0.09320354259997535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6171374766194361, 2.382862523380565, 2, 0, 0.2057124922064786, 3.24076899519314, 0, -13.46876747751312, 1, 0.04231762944980044, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.237702584025868, 1.676465955099907, 0, 0, 0.4247189438113858, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.999223085855744, 2.000776914144258, 0, 1, 0.3330743619519145, 0, 0.4998058468840865, 2.07721338533174, 0.6669256380480855, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.830399185212827, 2.169600814787174, 1, 1, 0.2767997284042756, 1.20424010260042, 0.460914281182225, -3.0892922832707, 0.9233819103553194, 0.4769813671638704, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.156040587123184, 0.4444444444444445, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.9822849611922778, 2.017715038807722, 0, 0, 0.3274283203974259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0, 1.756780761611301, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8300562051989595, 2.169943794801041, 1, 0, 0.2766854017329864, 1.204737695756766, 0, -5.006938760402385, 1, 0.2766854017329865, 0.2406136270897683],
[0.8300562585192324, 2.000035831271853, 1, 1, 0.2932965543819128, 1.204737618368105, 0.4999910423425188, -2.928955373598431, 0.9139771311876976, 0.5005702399515233, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8790593304026239, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3053286610386355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383130134639953, 0, 1, 0.2054175179365909, 0, 0.4196161952989955, 1.743941938676835, 0.7945824820634091, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.078020293561592, 0.6666666666666667, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.6173032852898157, 2.382696714710186, 1, 1, 0.2057677617632718, 1.619949259674705, 0.419692524787668, -4.988315705158478, 0.9576596282189331, 0.3691951517454771, 0.2406136270897683],
[0.2796106277999262, 2.720389372200075, 0, 0, 0.09320354259997535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.078020293561592, 0.6666666666666667, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2114129490315415, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8300561723236819, 2.169943827676319, 1, 0, 0.2766853907745606, 1.204737743471713, 0, -5.006938958707641, 1, 0.2766853907745606, 0.2406136270897683],
[0.2836416770161664, 2.716358322983836, 0, 3, 0.09454722567205541, 0, 1.104419830998067, 4.590013642851695, 0.7423306821621226, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6223640701326777, 2.256696341194191, 0, 3, 0.2161691598009399, 0, 1.329376906071674, 5.524944377218124, 0.4815784460379099, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.001680708405773, 1.99797623534761, 0, 2, 0.3339317552601195, 0, 1.001012907269158, 4.160250270844801, 0.4436469066508653, 1, 0.2406136270897683],
[0.9986188034727911, 2.00138119652721, 0, 2, 0.3328729344909302, 0, 0.9993098783332196, 4.153172413465994, 0.4450585215347427, 1, 0.2406136270897683],
[0.7209779127363547, 1.917343185143184, 1, 2, 0.2732714806078064, 1.387005041811423, 1.043110078309034, -1.429241426023173, 0.8167824474920025, 0.6161897123990462, 0.2406136270897683],
[0.9972088618649764, 2.002546164436001, 3, 3, 0.3324300994987056, 3.008396851176604, 1.498092804689435, -6.276884916097058, 0.9007524918616663, 0.3178329607055915, 0.2406136270897683],
[0.7025275398602678, 2.297472460139732, 0, 1, 0.2341758466200893, 0, 0.435260930152425, 1.808962091702468, 0.7658241533799107, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2114129490315415, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.156040587123184, 0.4444444444444445, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.6178209444253121, 2.38217905557469, 0, 2, 0.2059403148084372, 0, 0.8395674520434021, 3.489276406319978, 0.6305307836465238, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8790593304026239, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3053286610386355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9992227450139824, 2.000777254986019, 0, 1, 0.3330742483379939, 0, 0.4998057617398233, 2.077213031468726, 0.6669257516620061, 1, 0.2406136270897683],
[0.6168694236823365, 2.382353555939038, 0, 3, 0.2056764128154989, 0, 1.259258934309399, 5.233531240687352, 0.5011784364806692, 1, 0.2406136270897683],
[0.9984451253932196, 2.001554874606782, 0, 3, 0.3328150417977397, 0, 1.498834749953768, 6.22921805419849, 0.2969878890685461, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9985419073428975, 2.001458092657104, 0, 1, 0.3328473024476323, 0, 0.4996357423963926, 2.076506424176833, 0.6671526975523676, 1, 0.2406136270897683],
[0.8295304371283805, 2.170126379127853, 1, 2, 0.2765417805906505, 1.205501275470664, 0.9216053125918756, -1.179883144244661, 0.8128711932303527, 0.6213479037687566, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8787381900567767, 2.000321140345848, 0, 1, 0.3052171175416134, 0, 0.4999197278028586, 2.077686679052256, 0.6947828824583866, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 3, 0, 0.3333333333333333, 2.999999999999999, 0, -12.46812176136955, 1, 0.03703703703703698, 0.2406136270897683],
[0.9992230441391381, 2.000603249076503, 0, 2, 0.3330936349211169, 0, 0.9996984664116779, 4.154787401291738, 0.4447640997827285, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.702527264955819, 2.297472735044181, 0, 1, 0.234175754985273, 0, 0.4352608780712123, 1.808961875250835, 0.765824245014727, 1, 0.2406136270897683],
[0.9985419565124412, 2.00145804348756, 1, 1, 0.3328473188374803, 1.001460172482538, 0.499635754670875, -2.085602648034734, 0.8892126623427008, 0.5549073000176613, 0.2406136270897683],
[0.7196994504497131, 1.917888454694729, 1, 0, 0.2728627353219154, 1.389468894793706, 0, -5.774689121307836, 1, 0.2728627353219154, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6178196688537509, 2.382006724102256, 0, 3, 0.2059518078461053, 0, 1.259442288573159, 5.234293268449362, 0.5006573357384663, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.078020293561592, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.335801172730948, 1.281068961474246, 0, 1, 0.5104575711536647, 0, 0.7805981021109173, 3.244197394604301, 0.4895424288463353, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.999223139616302, 2.0007768603837, 0, 1, 0.3330743798721005, 0, 0.4998058603137907, 2.077213441146136, 0.6669256201278995, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7201895963131588, 1.449320298873648, 1, 0, 0.3319595812450288, 1.388523251542739, 0, -5.770758989575882, 1, 0.3319595812450289, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9994338895613911, 1.638154015583052, 0, 1, 0.3789196514027307, 0, 0.610443212596271, 2.53702676768397, 0.6210803485972693, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7024921755282764, 2.297507824471724, 1, 0, 0.2341640585094255, 1.423503399519001, 0, -5.916137904308799, 1, 0.2341640585094255, 0.2406136270897683],
[0.998698438534503, 1.64108956823833, 1, 2, 0.3783252427741052, 1.001303257735545, 1.218702524656806, 0.9035201769355877, 0.6789094079552961, 0.7597354483198352, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.918176395192177, 0, 2, 0.2730230874298236, 0, 1.04265697618473, 4.33332471147087, 0.5284954314100658, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.078020293561592, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2406136270897683],
[1.000584215027983, 1.997085321628628, 0, 2, 0.3337873647486721, 0, 1.001459466122857, 4.162106187565312, 0.4438392753685189, 1, 0.2406136270897683],
[0.7201895497484779, 2.158869780654148, 1, 0, 0.2501475194148785, 1.388523341319302, 0, -5.770759362690918, 1, 0.2501475194148786, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6216096191943495, 1.547900275992459, 0, 0, 0.286520757786553, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8298819959792936, 2.170118004020707, 1, 0, 0.2766273319930978, 1.204990594861575, 0, -5.007989819346417, 1, 0.2766273319930979, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383128804278352, 0, 1, 0.2054176090534203, 0, 0.4196164295462055, 1.743942912217747, 0.7945823909465797, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2355011741225321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6165265796597494, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2356278680493747, 1.621990086059036, 0, -6.741056629572782, 1, 0.2356278680493747, 0.2406136270897683],
[0.6216096191943495, 2.257449711208273, 0, 0, 0.2159071932385014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.382352809609953, 0, 2, 0.2054707709184036, 0, 0.8395062192016163, 3.489021920144252, 0.6312766958649959, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.8304901048131925, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2934085879335738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6216096191943495, 1.547900275992459, 0, 0, 0.286520757786553, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6186207428267652, 2.393688006694199, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2396304433880148],
[0.8826660374399543, 2.008205833013976, 0, 0, 0.3053286610386355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2396304433880148],
[0.6186207428267652, 2.393688006694199, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2396304433880148],
[1.33432306814078, 1.282554247819417, 0, 1, 0.5098913349903009, 0, 0.7796941156291737, 3.240440390095964, 0.4901086650096991, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6165265796597768, 2.383473420340225, 1, 0, 0.2055088598865921, 1.621990086058964, 0, -6.741056629572483, 1, 0.2055088598865922, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 3, 2, 0.3333333333333333, 2.999999999999999, 0.9999999999999996, -8.312081174246368, 0.9547325102880663, 0.2098765432098761, 0.2406136270897683],
[0.7802795773969002, 2.219720422603102, 0, 0, 0.2600931924656333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.450557063911068, 0, 1, 0.3318319421507798, 0, 0.689390321056207, 2.86513415467948, 0.6681680578492202, 1, 0.2406136270897683],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7025279575939497, 2.29747204240605, 0, 1, 0.2341759858646499, 0, 0.4352610092929533, 1.808962420613716, 0.7658240141353501, 1, 0.2406136270897683],
[0.6176134324369186, 2.382386567563083, 1, 1, 0.2058711441456394, 1.619135769204854, 0.4197471617810912, -4.984707732186314, 0.9576170720081655, 0.3693593602994441, 0.2406136270897683],
[0.8291885003398795, 2.170811499660121, 1, 0, 0.2763961667799598, 1.205998394321805, 0, -5.012178274806813, 1, 0.2763961667799597, 0.2406136270897683],
[1.33628251457866, 1.280413430019483, 1, 0, 0.5106755018049599, 0.7483447467808163, 0, -3.110151140781496, 1, 0.5106755018049599, 0.2406136270897683],
[0.7202413164469487, 1.920541534191648, 0.5, 2.5, 0.2727378043494865, 0.694211771224914, 1.301716185509232, 2.524813002622124, 0.6010372183490181, 0.6153435330308186, 0.2406136270897683],
[1.333285063080369, 1.292455924146303, 2, 0, 0.507774784171913, 1.500054306000608, 0, -6.23428657862743, 0.9999999999999998, 0.257835231440833, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.9999999999999996, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2406136270897683],
[0.01305991152169001, 2.986592637236773, 0, 3, 0.004353808085904958, 0, 1.004489183625535, 4.174697816473959, 0.9869953601475921, 1, 0.2406136270897683],
[0.6173030076838286, 2.381919569395062, 1, 3, 0.2058210058838161, 1.619949988178548, 1.25948837170934, -1.498093108146056, 0.8101949785695852, 0.6021919350881673, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8303992050266942, 2.169600794973307, 1, 1, 0.276799735008898, 1.204240073866465, 0.4609142853915221, -3.089292146357206, 0.9233819066990038, 0.4769813767167999, 0.2406136270897683],
[0.7025274444981844, 2.297472555501816, 0, 1, 0.2341758148327281, 0, 0.435260912085881, 1.808962016617178, 0.7658241851672719, 1, 0.2406136270897683],
[0.720954925828988, 1.916632979315454, 0, 1, 0.2733387290800102, 0, 0.5217483006877827, 2.168407113920977, 0.7266612709199898, 1, 0.2406136270897683],
[1.150721771749471, 1.8475973323975, 0, 1, 0.3837889603404486, 0, 0.5412434746819906, 2.249429848293933, 0.6162110396595515, 1, 0.2406136270897683],
[0.6165265796597689, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2356278680493804, 1.621990086058985, 0, -6.74105662957257, 1, 0.2356278680493804, 0.2406136270897683],
[0.720189601487002, 2.158869728915624, 1, 0, 0.2501475373855134, 1.388523241567586, 0, -5.77075894811874, 1, 0.2501475373855134, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2355011741225321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.830056258519259, 2.169599966191828, 1, 1, 0.2767171290100772, 1.204737618368066, 0.4609144614595665, -3.091359229753823, 0.9234276305124205, 0.4768618885325746, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383130079307632, 0, 1, 0.2054175217263151, 0, 0.4196162050417865, 1.74394197916827, 0.7945824782736849, 1, 0.2406136270897683],
[0.9817175478778749, 2.018282452122125, 1, 0, 0.3272391826259584, 1.018622924854145, 0, -4.233438218667958, 1, 0.3272391826259584, 0.2406136270897683],
[0.9993967094079956, 2.000603290592006, 0, 2, 0.3331322364693317, 0, 0.9996984456664433, 4.154787315073701, 0.4447126140363954, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2355011741225321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 1.638320860992939, 1, 0, 0.3790289554181244, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3790289554181244, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 1, 0.2053643216105062, 0, 0.4194794449815133, 1.743373598807077, 0.7946356783894938, 1, 0.2406136270897683],
[0.6169608581623568, 2.383039141837645, 1, 0, 0.2056536193874521, 1.620848367882755, 0, -6.736311602493104, 1, 0.2056536193874521, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 1, 0.2053643216105062, 0, 0.4194794449815133, 1.743373598807077, 0.7946356783894938, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6220356620244508, 1.549168141301155, 0, 1, 0.2864934471244415, 0, 0.6455077233644209, 2.682756297604019, 0.7135065528755584, 1, 0.2406136270897683],
[1.336202685136561, 1.28073415100135, 1, 0, 0.5105979887189542, 0.7483894555247054, 0, -3.110336952135698, 1, 0.5105979887189542, 0.2406136270897683],
[0.9976693894842928, 2.001809547635983, 0, 1, 0.3326142341383234, 0, 0.499548022028839, 2.076141854768962, 0.6673857658616766, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6165267256469834, 2.383473274353018, 1, 0, 0.2055089085489944, 1.621989701988344, 0, -6.741055033359398, 1, 0.2055089085489944, 0.2406136270897683],
[1.829490462945778, 1.169732687841359, 1, 0, 0.6099881105764451, 0.5466002803807115, 0, -2.27169295019515, 1, 0.6099881105764451, 0.2406136270897683],
[1.826784127759381, 1.17321587224062, 0, 1, 0.6089280425864602, 0, 0.8523580558880351, 3.542434675032087, 0.3910719574135398, 1, 0.2406136270897683],
[0.7025273664387439, 2.297472633561256, 0, 1, 0.2341757888129146, 0, 0.4352608972973595, 1.808961955155483, 0.7658242111870853, 1, 0.2406136270897683],
[1, 1.638321022344641, 1, 0, 0.3790289322378644, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3790289322378644, 0.2406136270897683],
[1.830490104813193, 1.169509895186808, 0, 0, 0.6101633682710641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.078020293561592, 0.6666666666666667, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9989110860029395, 2.000845461622991, 0, 1, 0.3329973850022924, 0, 0.4997887239071663, 2.077142221544687, 0.6670026149977076, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.621809399443277, 2.257249930959346, 1, 0, 0.2159765840450116, 1.608209848380111, 0, -6.683785402478965, 1, 0.2159765840450116, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917687199596811, 0, 1, 0.2730737158661744, 0, 0.5214614772473047, 2.167215064061012, 0.7269262841338255, 1, 0.2406136270897683],
[1.000681028759045, 1.829718123504877, 0, 2, 0.3535476711680897, 0, 1.09306454054734, 4.542820594859903, 0.4179006134522003, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383129780176676, 0, 1, 0.2054175422138697, 0, 0.4196162577121015, 1.743942198068236, 0.7945824577861303, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.156040587123184, 0.4444444444444445, 1, 0.2406136270897683],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8303990239490688, 2.169257783148266, 1, 2, 0.2768313435004645, 1.204240336464236, 0.9219743340495844, -1.173108962400304, 0.812523489965886, 0.6218023863679284, 0.2406136270897683],
[0.6162667760382003, 2.383384343815062, 0, 3, 0.2054461507071352, 0, 1.258714318479548, 5.231267795194101, 0.5016144144444936, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9993967094123777, 2.000603290587624, 0, 1, 0.3331322364707924, 0, 0.4998492228343165, 2.077393657541401, 0.6668677635292075, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8304901048131925, 2.168820886325674, 0, 1, 0.2768936289923866, 0, 0.4610800303081544, 1.916267319872678, 0.7231063710076134, 1, 0.2406136270897683],
[0.6186039821648524, 2.008151423491811, 0, 0, 0.2355011741225321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2396369360148996],
[0.8298820877933248, 2.169810776211323, 1, 1, 0.2766556862376291, 1.204990461547402, 0.460869680878849, -3.092596166180296, 0.9234616312723867, 0.4767730037476446, 0.2406136270897683],
[0.2796106277999262, 2.720389372200075, 0, 0, 0.09320354259997535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9985411578265381, 2.001458842173463, 0, 1, 0.3328470526088459, 0, 0.4996355552902904, 2.076505646556277, 0.6671529473911542, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.078020293561592, 0.6666666666666667, 1, 0.2406136270897683],
[0.7199892962591746, 1.449520598927632, 1, 0, 0.3318672562206403, 1.388909536844045, 0, -5.772364406966316, 1, 0.3318672562206404, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.078020293561592, 0.6666666666666667, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.00068097716344, 1.829411055131984, 1, 1, 0.3535860197280616, 0.9993194862508828, 0.5466240062312592, -1.881420788568769, 0.8749769266528669, 0.58214896610899, 0.2406136270897683],
[0.9989110990029637, 2.001088900997038, 0, 1, 0.332970366334321, 0, 0.4997279228832623, 2.076889530021604, 0.6670296336656789, 1, 0.2406136270897683],
[0.6215872717629913, 2.257961977553249, 0, 1, 0.2158626986187472, 0, 0.442877253886981, 1.840615842267953, 0.7841373013812528, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2114129490315415, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2114129490315415, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.078020293561592, 0.6666666666666667, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.6168695917212076, 2.383130408278794, 0, 1, 0.2056231972404024, 0, 0.4196161471172892, 1.743941738431708, 0.7943768027595977, 1, 0.2406136270897683],
[0.9992227346339315, 2.00077726536607, 1, 1, 0.333074244877977, 1.000777869977461, 0.4998057591468263, -2.082060425628894, 0.8890615473989654, 0.5552100371549193, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.2796106277999262, 2.720389372200075, 0, 0, 0.09320354259997535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.2796106277999262, 2.720389372200075, 0, 0, 0.09320354259997535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383130069521552, 0, 1, 0.2054175223965661, 0, 0.4196162067648974, 1.743941986329588, 0.7945824776034339, 1, 0.2406136270897683],
[1.336282511993755, 1.280413440404541, 1, 0, 0.5106754992948279, 0.7483447482284146, 0, -3.110151146797773, 1, 0.5106754992948279, 0.2406136270897683],
[0.9992231396163354, 2.000776860383666, 0, 1, 0.3330743798721116, 0, 0.499805860313799, 2.07721344114617, 0.6669256201278884, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9990235397666234, 2.000976460233378, 1, 1, 0.3330078465888743, 1.000977414639904, 0.4997560040678179, -2.083096525472724, 0.8891057741102408, 0.5551214672879894, 0.2406136270897683],
[0.6217983889628099, 2.25750584981613, 1, 1, 0.2159543894626791, 1.608238325718484, 0.4429667369772035, -4.842916017830278, 0.9533637016718015, 0.3852724805971597, 0.2406136270897683],
[0.9992227450139824, 2.000777254986019, 0, 1, 0.3330742483379939, 0, 0.4998057617398233, 2.077213031468726, 0.6669257516620061, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3333333333333333, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1.002406302378592, 1.996724811617052, 2, 1, 0.3342322373639473, 1.995198948025602, 0.5008201401524869, -6.210698978057429, 0.9626625195312954, 0.2604586045425206, 0.2406136270897683],
[0.9993966964160363, 2.000603303583965, 0, 1, 0.3331322321386786, 0, 0.4998492195871904, 2.077393644046213, 0.6668677678613214, 1, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8304901048131925, 2.169509895186808, 0, 0, 0.2768300349377308, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2355011741225321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.9985420877375225, 2.001457912262479, 0, 1, 0.332847362579174, 0, 0.4996357874293667, 2.0765066113357, 0.6671526374208261, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.917198532944368, 0, 0, 0.2731243083102565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7019244257057448, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2339748085685816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 1.830525932373821, 1, 0, 0.3532912341705169, 0.9999999999999996, 0, -4.156040587123184, 1, 0.3532912341705169, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.001419721795245589, 2.998580278204755, 0, 1, 0.0004732405984151963, 0, 0.3334911548870382, 1.386002775157116, 0.9995267594015848, 1, 0.2406136270897683],
[0.9989110990029637, 2.001088900997038, 0, 1, 0.332970366334321, 0, 0.4997279228832623, 2.076889530021604, 0.6670296336656789, 1, 0.2406136270897683],
[0.003752246219249133, 1.757714118431498, 0, 2, 0.002130183291914918, 0, 1.137841460694818, 4.728915292359194, 0.9957441710970273, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.298075574294255, 0, 0, 0.2114129490315415, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.158669958202552, 0, 0, 0.2502169248798809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.078020293561592, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.382352141947561, 0, 1, 0.2054708166704856, 0, 0.4197532272380626, 1.74451144897733, 0.7945291833295144, 1, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7207553500456471, 1.916832555098794, 1, 1, 0.2732630630584335, 1.387433336341753, 0.5216939775673101, -3.598047912936586, 0.9253272983679226, 0.4718534244847896, 0.2406136270897683],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.616092964831519, 2.383907035168483, 0, 0, 0.2053643216105062, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.8300562051989659, 2.000035846062952, 1, 1, 0.2932965395344119, 1.204737695756757, 0.4999910386448767, -2.928955710596361, 0.9139771398971392, 0.5005702189659629, 0.2406136270897683],
[1, 1.999656943753362, 0, 1, 0.3333714550533691, 0, 0.5000857787751319, 2.078376793632555, 0.6666285449466309, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 2.155797026862494, 0, 1, 0.2504668586274066, 0, 0.4638655622674185, 1.927844103752109, 0.7495331413725934, 1, 0.2406136270897683],
[1.336482337031592, 1.279610627799926, 0, 0, 0.5108695887333133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683],
[0.7203893722000739, 1.449120522986733, 0, 0, 0.3320516646632047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2406136270897683]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node104":{
"Global MG94xREV":0.0009740243552902615,
"Nucleotide GTR":0.0009640002345809,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTT", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node146":{
"Global MG94xREV":0.0009740047481922111,
"Nucleotide GTR":0.0009639808292682759,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "L", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "CTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node155":{
"Global MG94xREV":0.0009740243617726035,
"Nucleotide GTR":0.0009640002409965304,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node181":{
"Global MG94xREV":0.0009738398813559608,
"Nucleotide GTR":0.0009638176591504475,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "L", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "TTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node206":{
"Global MG94xREV":0.0009740243618156988,
"Nucleotide GTR":0.0009640002410391823,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node245":{
"Global MG94xREV":0.0005269905312667886,
"Nucleotide GTR":0.0005215670357767454,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node246":{
"Global MG94xREV":0.0004469091708609767,
"Nucleotide GTR":0.0004423098285031612,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node285":{
"Global MG94xREV":0.0009737956157492203,
"Nucleotide GTR":0.0009637738491008832,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "V", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "GTG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node295":{
"Global MG94xREV":0.0005764333211658822,
"Nucleotide GTR":0.0005705009877895339,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node298":{
"Global MG94xREV":0.0009738500196429469,
"Nucleotide GTR":0.0009638276930997829,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node303":{
"Global MG94xREV":0.0009737688103493873,
"Nucleotide GTR":0.0009637473195674207,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node315":{
"Global MG94xREV":0.0005665686717361731,
"Nucleotide GTR":0.0005607378598834931,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGT", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node375":{
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node39":{
"Global MG94xREV":0.0009743523459711936,
"Nucleotide GTR":0.0009643248497628954,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "Y", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "TAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node433":{
"Global MG94xREV":0.0005754778365400758,
"Nucleotide GTR":0.0005695553364837806,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node434":{
"Global MG94xREV":0.0003984523696678042,
"Nucleotide GTR":0.0003943517179450958,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node444":{
"Global MG94xREV":0.0009741483259368974,
"Nucleotide GTR":0.0009641229293901122,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAT", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node458":{
"Global MG94xREV":0.0009741491481227027,
"Nucleotide GTR":0.0009641237431144342,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "R", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "AGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node493":{
"Global MG94xREV":0.000582945906321258,
"Nucleotide GTR":0.0005769465490154029,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTT", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node496":{
"Global MG94xREV":0.0005827002042203031,
"Nucleotide GTR":0.000576703375544769,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "C", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "TGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node499":{
"Global MG94xREV":0.0005827122782559935,
"Nucleotide GTR":0.0005767153253211521,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "F", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TTT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node504":{
"Global MG94xREV":0.0009732428110982052,
"Nucleotide GTR":0.0009632267336100197,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "G", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "GGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node505":{
"Global MG94xREV":0.000973354528011431,
"Nucleotide GTR":0.0009633373007944786,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "C", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "TGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node510":{
"Global MG94xREV":0.0005848128197416443,
"Nucleotide GTR":0.0005787942491939657,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTG", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node513":{
"Global MG94xREV":0.0005848249376135076,
"Nucleotide GTR":0.0005788062423553845,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAC", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node516":{
"Global MG94xREV":0.0005848249376135076,
"Nucleotide GTR":0.0005788062423553845,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "G", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GGT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node519":{
"Global MG94xREV":0.0005827122782559935,
"Nucleotide GTR":0.0005767153253211521,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTT", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node522":{
"Global MG94xREV":0.0005827122782559935,
"Nucleotide GTR":0.0005767153253211521,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node525":{
"Global MG94xREV":0.0005827122782559935,
"Nucleotide GTR":0.0005767153253211521,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTT", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node528":{
"Global MG94xREV":0.0005827122782559935,
"Nucleotide GTR":0.0005767153253211521,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "V", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GTT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node531":{
"Global MG94xREV":0.0005827122782559935,
"Nucleotide GTR":0.0005767153253211521,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "F", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "TTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node54":{
"Global MG94xREV":0.0009743129085502974,
"Nucleotide GTR":0.0009642858182101528,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node545":{
"Global MG94xREV":0.0009732630308154247,
"Nucleotide GTR":0.0009632467452370784,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "S", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "TCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node549":{
"Global MG94xREV":0.0005917370988329199,
"Nucleotide GTR":0.000585647267429125,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "I", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATT", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node556":{
"Global MG94xREV":0.0005321862849333367,
"Nucleotide GTR":0.000526709317616181,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node557":{
"Global MG94xREV":0.0004412475795237758,
"Nucleotide GTR":0.000436706503137096,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node563":{
"Global MG94xREV":0.0005840790059310265,
"Nucleotide GTR":0.0005780679873897999,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node564":{
"Global MG94xREV":0.0003900385882331418,
"Nucleotide GTR":0.0003860245265020131,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node575":{
"Global MG94xREV":0.0009745992925991984,
"Nucleotide GTR":0.0009645692549525937,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACT", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node586":{
"Global MG94xREV":0.0009732627272063706,
"Nucleotide GTR":0.0009632464447526009,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node593":{
"Global MG94xREV":0.0009744706148220268,
"Nucleotide GTR":0.0009644419014560351,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node605":{
"Global MG94xREV":0.0009737396980230897,
"Nucleotide GTR":0.0009637185068491053,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node624":{
"Global MG94xREV":0.0009737705050474177,
"Nucleotide GTR":0.0009637489968245559,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009759550506284998,
"Nucleotide GTR":0.0009659110602690443,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "Y", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TAC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009735666433424633,
"Nucleotide GTR":0.0009635472331516741,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "D", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAC", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009733529160713231,
"Nucleotide GTR":0.0009633357054435663,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "D", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "GAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "IV", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "RTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414010_England_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009735164564350636,
"Nucleotide GTR":0.0009634975627402082,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAG", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009743112201347157,
"Nucleotide GTR":0.0009642841471708119,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "E", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GAA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009743017022809214,
"Nucleotide GTR":0.000964274727269512,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "F", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "TTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009745091106799327,
"Nucleotide GTR":0.0009644800011358337,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "S", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "TCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009739807551875927,
"Nucleotide GTR":0.0009639570831864072,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "N", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "AAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732520945794952,
"Nucleotide GTR":0.0009632359215508495,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCG", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009734915505557657,
"Nucleotide GTR":0.0009634729131784641,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "E", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "GAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "C", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "TGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009742507251488949,
"Nucleotide GTR":0.0009642242747659736,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "K", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "AAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009742004042537898,
"Nucleotide GTR":0.0009641744717457292,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "I", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "ATA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009736021955071343,
"Nucleotide GTR":0.000963582419433102,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAC", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009736021955208362,
"Nucleotide GTR":0.0009635824194466633,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "L", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "CTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417236_England_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCM", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417236_England_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417240_England_20200303_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009743016950228235,
"Nucleotide GTR":0.00096427472008611,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "Y", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "TAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417240_England_20200303_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009745210583446654,
"Nucleotide GTR":0.0009644918258417983,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "I", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ATA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417288_England_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417312_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCM", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417312_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732520945451379,
"Nucleotide GTR":0.0009632359215168455,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCG", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009741270829142877,
"Nucleotide GTR":0.0009641019049889566,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "K", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "AAA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "HY", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "YAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009733529160713231,
"Nucleotide GTR":0.0009633357054435663,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "G", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GGA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009740848712633654,
"Nucleotide GTR":0.0009640601277570329,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCT", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009759550506891278,
"Nucleotide GTR":0.0009659110603290487,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "K", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAA", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418677_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "TM", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "AYG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418677_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418715_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTR", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418715_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732520945451379,
"Nucleotide GTR":0.0009632359215168455,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "G", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GGT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "Y", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "TAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732745184559114,
"Nucleotide GTR":0.0009632581146531136,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAC", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCW", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001949986887972862,
"Nucleotide GTR":0.001929918699902879,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "DAGV", "F", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GNT", "TTC", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "IV", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "RTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "MV", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "RTG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTY", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009741813758673464,
"Nucleotide GTR":0.000964155639188929,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "V", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "GTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACR", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003887722057744662,
"Nucleotide GTR":0.0003847711769521773,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "G", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GGT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009743016950228235,
"Nucleotide GTR":0.00096427472008611,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "D", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAT", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732745184383745,
"Nucleotide GTR":0.000963258114635758,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAC", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAR", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420694_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420696_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009733367243032609,
"Nucleotide GTR":0.0009633196803122393,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "I", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATT", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420696_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420697_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "PL", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CYA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420697_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420725_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732745183947049,
"Nucleotide GTR":0.0009632581145925387,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "T", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ACT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420725_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420726_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "RC", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "YGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420726_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009815345875183734,
"Nucleotide GTR":0.0009714331756468349,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "H", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAC", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "TI", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "AYT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009742839754695027,
"Nucleotide GTR":0.0009642571828926465,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "K", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "AAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732745184559114,
"Nucleotide GTR":0.0009632581146531136,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "A", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GCT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732733450456152,
"Nucleotide GTR":0.0009632569533189083,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAA", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739807622621792,
"Nucleotide GTR":0.0009639570901881864,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "I", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "ATT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739414671937411,
"Nucleotide GTR":0.000963918199522892,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATT", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739875282120933,
"Nucleotide GTR":0.0009639637865066818,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAT", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009733529096037421,
"Nucleotide GTR":0.0009633356990425476,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "C", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TGC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421669_India_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421669_India_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "DA", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GMT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732745184559114,
"Nucleotide GTR":0.0009632581146531136,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "A", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GCT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001949057784049119,
"Nucleotide GTR":0.001928999157803573,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "Y", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAG", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "TAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAY", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421775_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "RS", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGW", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421847_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421895_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGY", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421895_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421947_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "DV", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GWT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421947_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421948_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGW", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421948_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421953_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "NY", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "WAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421953_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421954_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "S", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "TCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421954_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421956_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "GV", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GKT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421956_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "YAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421963_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421964_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "QH", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAK", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421964_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422002_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "EG", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GRA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422002_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "RM", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AKG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "PS", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "YCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAY", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732521010150384,
"Nucleotide GTR":0.0009632359279201613,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAG", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACT", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "ED", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAM", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGR", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009732520945794952,
"Nucleotide GTR":0.0009632359215508495,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "V", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732745184289448,
"Nucleotide GTR":0.000963258114626425,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAC", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009740572300462238,
"Nucleotide GTR":0.0009640327710080316,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAA", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009743703222188666,
"Nucleotide GTR":0.0009643426410089552,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "V", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "GTT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009739875282303256,
"Nucleotide GTR":0.0009639637865247267,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "I", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ATA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009739137377057886,
"Nucleotide GTR":0.000963890755411514,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "S", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "TCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732196679700958,
"Nucleotide GTR":0.0009632038286582032,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "V", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GTT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423052_England_20200319_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "TI", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "AYT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423052_England_20200319_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TWA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423060_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423068_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "QP", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CMG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423068_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423130_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "PS", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "YCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423130_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423227_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "LF", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "YTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423227_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423324_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009751729980481597,
"Nucleotide GTR":0.0009651370561419318,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "D", "Q", "VL", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GAT", "CAA", "KTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423324_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423328_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "GC", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "KGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423328_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423354_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009742886908927833,
"Nucleotide GTR":0.000964261849787394,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "F", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "TTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423354_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423373_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "AV", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GYT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423373_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTK", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423412_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423446_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "TI", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "AYT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423446_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423453_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009748910867248265,
"Nucleotide GTR":0.0009648580460942381,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "N", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "AAT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423453_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423481_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTY", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423481_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423548_England_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009738468316133069,
"Nucleotide GTR":0.0009638245378795847,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "L", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "CTA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423548_England_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "AG", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GSA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423579_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423639_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "QE", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "SAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423639_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423648_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "NI", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AWT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423648_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423740_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAR", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423740_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423752_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00097420927587594,
"Nucleotide GTR":0.0009641832520660442,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "I", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423752_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423772_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAR", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423772_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423780_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGY", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423780_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "AS", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "KCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423825_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732520945794952,
"Nucleotide GTR":0.0009632359215508495,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACG", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423913_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423927_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00293716968069355,
"Nucleotide GTR":0.002906941952543596,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "I", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "ATT", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423927_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423933_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAY", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423933_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424007_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "AG", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GSA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424007_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424062_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009756885024142628,
"Nucleotide GTR":0.0009656472552218138,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "LF", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "E", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTN", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GAA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424062_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424138_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGY", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424138_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973913737663019,
"Nucleotide GTR":0.0009638907553691835,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAT", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000974660185599285,
"Nucleotide GTR":0.0009646295212755543,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAA", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00097390578447895,
"Nucleotide GTR":0.0009638828840348922,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACC", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000972846151128027,
"Nucleotide GTR":0.0009628341558451804,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "P", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "CCA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24":{
"Global MG94xREV":0.0009740572305423375,
"Nucleotide GTR":0.0009640327714990397,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "N", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "AAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009732520945619523,
"Nucleotide GTR":0.0009632359215334871,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "A", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "GCG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739807552201386,
"Nucleotide GTR":0.0009639570832186187,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "N", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AAT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTY", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739946222439128,
"Nucleotide GTR":0.0009639708075306438,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "Q", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CAG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425023_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "ND", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "RAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425023_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732745183947049,
"Nucleotide GTR":0.0009632581145925387,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAC", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973879445115777,
"Nucleotide GTR":0.0009638568157418991,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425240_England_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000388786392688335,
"Nucleotide GTR":0.0003847852178621647,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTG", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425240_England_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425336_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739958547200553,
"Nucleotide GTR":0.0009639720273228223,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "V", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "GTA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425336_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425404_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009738148341293776,
"Nucleotide GTR":0.0009637928696960864,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTC", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425404_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425485_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732899055621042,
"Nucleotide GTR":0.0009632733434037078,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCG", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425485_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009736971016617081,
"Nucleotide GTR":0.0009636763488659497,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "C", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TGC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425585_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009744991974383142,
"Nucleotide GTR":0.000964470189915822,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "N", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAT", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009737940570638119,
"Nucleotide GTR":0.0009637723064566036,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "F", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TTT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009755119861532516,
"Nucleotide GTR":0.0009654725555686712,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "Y", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "TAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009734663446704034,
"Nucleotide GTR":0.0009634479666981517,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGG", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732394855903422,
"Nucleotide GTR":0.0009632234423264485,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCG", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009742839674296952,
"Nucleotide GTR":0.0009642571749355805,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "M", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "ATG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739807551875927,
"Nucleotide GTR":0.0009639570831864072,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "I", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "ATT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009735909551353274,
"Nucleotide GTR":0.0009635712947409945,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "N", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "AAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000974469531676681,
"Nucleotide GTR":0.0009644408294578227,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "V", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GTC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009737800544277118,
"Nucleotide GTR":0.0009637584479279014,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "V", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GTG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009831837017534792,
"Nucleotide GTR":0.0009730653181090408,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "-", "-", "-", "I", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "---", "---", "---", "ATA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009736959132768448,
"Nucleotide GTR":0.0009636751727112865,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "L", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "CTT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009737800544694741,
"Nucleotide GTR":0.0009637584479692338,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "TTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001947058366655457,
"Nucleotide GTR":0.001927020317309448,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAC", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTC", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "KR", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "ARA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009737547083034491,
"Nucleotide GTR":0.0009637333626519493,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "C", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TGC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAY", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009740482046776245,
"Nucleotide GTR":0.0009640238385235406,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "L", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CTA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009736973090346002,
"Nucleotide GTR":0.0009636765541046747,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "G", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GGA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009747591188282709,
"Nucleotide GTR":0.0009647274363383887,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "K", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "AAG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732907358635251,
"Nucleotide GTR":0.0009632741651601259,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "G", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GGT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000973239492012677,
"Nucleotide GTR":0.0009632234486826877,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTG", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973239492012677,
"Nucleotide GTR":0.0009632234486826877,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "G", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GGC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003911122567005153,
"Nucleotide GTR":0.0003870871453665102,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "F", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TTT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428704_Madrid_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000975511986210163,
"Nucleotide GTR":0.0009654725556249955,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACT", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428704_Madrid_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_24":{
"Global MG94xREV":0.0009737940570638119,
"Nucleotide GTR":0.0009637723064566036,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTT", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732520881189305,
"Nucleotide GTR":0.0009632359151567727,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCG", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429008_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009738860059847082,
"Nucleotide GTR":0.0009638633090899906,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "L", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CTA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429008_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429175_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973541956235272,
"Nucleotide GTR":0.0009635228001105563,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "V", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "GTT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429175_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429207_Switzerland_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0003911264414797851,
"Nucleotide GTR":0.0003871011841638654,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "C", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "TGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429207_Switzerland_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429525_Unknown_20200312_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009744991974383142,
"Nucleotide GTR":0.000964470189915822,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "Y", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "TAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429525_Unknown_20200312_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009737940571054978,
"Nucleotide GTR":0.0009637723064978608,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "F", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009740203739737203,
"Nucleotide GTR":0.0009639962942378719,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "I", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "ATA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009734159333958134,
"Nucleotide GTR":0.0009633980742285589,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "V", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "GTT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009736959132989846,
"Nucleotide GTR":0.0009636751727331995,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "T", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "ACG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009737940642822938,
"Nucleotide GTR":0.0009637723136007977,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "L", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CTC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "R", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "AGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "TI", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "AYC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "IM", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATR", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001949404897094474,
"Nucleotide GTR":0.001929342698553176,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "C", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "N", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGT", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAT", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGY", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009735013724946007,
"Nucleotide GTR":0.0009634826340353295,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTC", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "VF", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "KTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732268889707272,
"Nucleotide GTR":0.000963210975344285,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "M", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATG", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTY", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "KAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "GC", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "KGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "GV", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GKC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "SL", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "C", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TYA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "TGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "VL", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "KTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "AV", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GYT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430709_Victoria_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "GV", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GKT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430709_Victoria_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009759402288236616,
"Nucleotide GTR":0.0009658963910020357,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "T", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "ACT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTR", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "KE", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "RAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973899868540658,
"Nucleotide GTR":0.0009638770289801686,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "Y", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "TAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "DG", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GRT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "KT", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "AMG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "PL", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CYA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432187_Wales_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009738998685729414,
"Nucleotide GTR":0.0009638770290121202,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "I", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ATA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432187_Wales_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACK", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432269_Wales_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009741377941562716,
"Nucleotide GTR":0.0009641125059967548,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCT", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432269_Wales_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "VF", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "KTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432350_Wales_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009732619164165286,
"Nucleotide GTR":0.0009632456423069613,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTC", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432350_Wales_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432351_Wales_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432351_Wales_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432485_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009742886981446451,
"Nucleotide GTR":0.000964261856964625,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "I", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "ATT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432485_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432532_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732268890320974,
"Nucleotide GTR":0.000963210975405024,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAG", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432532_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432558_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432558_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432594_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009745190694676366,
"Nucleotide GTR":0.0009644898574331949,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "EAGV", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATC", "G-A", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432594_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432745_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973239492012677,
"Nucleotide GTR":0.0009632234486826877,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "G", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GGC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432745_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432757_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009738998686015438,
"Nucleotide GTR":0.0009638770290404279,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCT", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432757_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432760_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009740572295712542,
"Nucleotide GTR":0.0009640327705379493,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "N", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AAT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432760_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432908_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009738614459604981,
"Nucleotide GTR":0.0009638390018239855,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "R", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "AGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432908_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433000_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009735013724946007,
"Nucleotide GTR":0.0009634826340353295,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGC", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433000_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433015_England_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009737940571054978,
"Nucleotide GTR":0.0009637723064978608,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "S", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "TCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433015_England_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "G", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "GGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009755126862530217,
"Nucleotide GTR":0.0009654732484634017,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACA", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009740322800989241,
"Nucleotide GTR":0.0009640080778318099,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "I", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ATA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433226_Scotland_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009740476984184942,
"Nucleotide GTR":0.0009640233374745505,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "H", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAT", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433226_Scotland_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433408_Scotland_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009738443786286812,
"Nucleotide GTR":0.0009638221101397194,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "Y", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "TAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433408_Scotland_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009735013725373663,
"Nucleotide GTR":0.0009634826340776551,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTC", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433495_England_20200416_null_12":{
"Global MG94xREV":0.000973794057123478,
"Nucleotide GTR":0.000963772306515657,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAT", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433495_England_20200416_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009734789511523234,
"Nucleotide GTR":0.0009634604434411218,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "G", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GGA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433551_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739137306169982,
"Nucleotide GTR":0.0009638907483956773,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAT", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433551_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433699_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009746506628224074,
"Nucleotide GTR":0.0009646200965018378,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCA", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433699_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433719_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739778069785422,
"Nucleotide GTR":0.0009639541653186963,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433719_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433733_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009735013724946007,
"Nucleotide GTR":0.0009634826340353295,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "L", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "CTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433733_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433804_England_20200406_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009739137376773311,
"Nucleotide GTR":0.0009638907553833469,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "V", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GTC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433804_England_20200406_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433819_England_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009739807622621792,
"Nucleotide GTR":0.0009639570901881864,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "K", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AAA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433819_England_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433832_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003887714252341262,
"Nucleotide GTR":0.0003847704044447277,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAC", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433832_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433931_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009734789446114674,
"Nucleotide GTR":0.0009634604369675827,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAG", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433931_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434000_England_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000973794057123478,
"Nucleotide GTR":0.000963772306515657,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTT", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434000_England_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009741509250477757,
"Nucleotide GTR":0.0009641255017523745,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTA", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009735013724946007,
"Nucleotide GTR":0.0009634826340353295,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "L", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "CTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434231_Washington_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000974275693503036,
"Nucleotide GTR":0.0009642489861596035,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "N", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAT", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434231_Washington_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434279_Washington_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTT", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434279_Washington_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009736971089999554,
"Nucleotide GTR":0.0009636763561286755,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "A", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "GCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434341_Washington_20200330_null_33":{
"Global MG94xREV":0.0009742886908927833,
"Nucleotide GTR":0.000964261849787394,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "F", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "TTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434341_Washington_20200330_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003821663585819735,
"Nucleotide GTR":0.0003782333134905695,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "I", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATT", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001956050070018609,
"Nucleotide GTR":0.001935919483027718,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "C", "T", "V", "K", "Y", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "TGT", "ACA", "GTT", "AAA", "TAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0009734789511201513,
"Nucleotide GTR":0.0009634604434092821,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTG", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "SG", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "RGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00194803869377865,
"Nucleotide GTR":0.001927990555447321,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "L", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "TTG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTC", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009738614459350584,
"Nucleotide GTR":0.0009638390017988064,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "D", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GAT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434866_Texas_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0009734915440536039,
"Nucleotide GTR":0.0009634729067432185,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTG", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434866_Texas_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0009735139779501026,
"Nucleotide GTR":0.0009634951097624443,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTC", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009735139779501026,
"Nucleotide GTR":0.0009634951097624443,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAC", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009737197526685404,
"Nucleotide GTR":0.0009636987667611296,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "A", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTT", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GCT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "DG", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GRT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "MI", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATK", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009738754538157583,
"Nucleotide GTR":0.0009638528655181339,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "T", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "ACT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009750359752647536,
"Nucleotide GTR":0.0009650014435213356,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCA", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009739260045252262,
"Nucleotide GTR":0.0009639028959876195,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "L", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TTG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435637_California_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0004074354047614252,
"Nucleotide GTR":0.0004032423046028784,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGT", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435637_California_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "KQ", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "MAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "V", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "GTG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "KR", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "ARA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "TS", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "WCT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436118_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "YAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436118_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436355_Comunitat_Valenciana_20200326_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0003911122567151094,
"Nucleotide GTR":0.0003870871453809538,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTT", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436355_Comunitat_Valenciana_20200326_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009740017370936509,
"Nucleotide GTR":0.0009639778491582782,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "I", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ATT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436415_Delhi_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "RG", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "RGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436415_Delhi_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436426_Delhi_20220405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "YC", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TRT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436426_Delhi_20220405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "LF", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTK", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436439_Bihar_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "KN", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "S", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAN", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "TCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436439_Bihar_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001948465873701333,
"Nucleotide GTR":0.001928413339070172,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "V", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "Q", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GTA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "CAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436679_California_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739137376773311,
"Nucleotide GTR":0.0009638907553833469,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAT", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436679_California_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAR", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436741_New_York_20200318_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0009738614531862918,
"Nucleotide GTR":0.0009638390089754139,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "S", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "AGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436741_New_York_20200318_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973868523642361,
"Nucleotide GTR":0.0009638460066662545,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "H", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "CAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009739137306169982,
"Nucleotide GTR":0.0009638907483956773,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAT", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009732745184559114,
"Nucleotide GTR":0.0009632581146531136,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTC", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436997_Unknown_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAT", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436997_Unknown_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437043_California_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "DY", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "KAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437043_California_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009742886981481687,
"Nucleotide GTR":0.0009642618569681127,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "C", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGT", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009766910748686553,
"Nucleotide GTR":0.0009666395097542279,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "-", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "---", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTT", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732520945451379,
"Nucleotide GTR":0.0009632359215168455,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGG", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437289_Bavaria_20200403_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0009742886908927833,
"Nucleotide GTR":0.000964261849787394,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "L", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "TTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437289_Bavaria_20200403_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437343_Kinshasa_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009744991974383142,
"Nucleotide GTR":0.000964470189915822,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "I", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "ATT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437343_Kinshasa_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009755119960277297,
"Nucleotide GTR":0.0009654725653415253,
"amino-acid": [
["C", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009742270017280853,
"Nucleotide GTR":0.000964200795493509,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "F", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "TTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973211918719384,
"Nucleotide GTR":0.0009631961591585002,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCT", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437436_Novi_Pazar_20200404_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437436_Novi_Pazar_20200404_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437437_Alaska_20200412_null_33":{
"Global MG94xREV":0.0003911122566829006,
"Nucleotide GTR":0.0003870871453490766,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTT", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437437_Alaska_20200412_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739260045076634,
"Nucleotide GTR":0.0009639028959702378,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "Y", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "TAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009738614459604981,
"Nucleotide GTR":0.0009638390018239855,
"amino-acid": [
["S", "L", "K", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "AAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437467_Makkah_20200323_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009739137376773311,
"Nucleotide GTR":0.0009638907553833469,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "L", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CTT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437467_Makkah_20200323_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0003911122584955933,
"Nucleotide GTR":0.0003870871471431134,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002925643407029959,
"Nucleotide GTR":0.002895534300922574,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "M", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "V", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "ATG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GTA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAG", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437571_California_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009737547147293759,
"Nucleotide GTR":0.0009637333690117449,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "T", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "ACA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437571_California_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009736973090346002,
"Nucleotide GTR":0.0009636765541046747,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "G", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "L", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GGC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "TTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437610_Thailand_20200312_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009738614459784562,
"Nucleotide GTR":0.0009638390018417571,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "K", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "AAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437610_Thailand_20200312_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437669_Unknown_20200330_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00097420927587594,
"Nucleotide GTR":0.0009641832520660442,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTT", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437669_Unknown_20200330_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437694_MAKKAH_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "L", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "CTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437694_MAKKAH_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437819_USA_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009742756935232295,
"Nucleotide GTR":0.0009642489861795896,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "Y", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "TAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437819_USA_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009736959133165864,
"Nucleotide GTR":0.0009636751727506207,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGC", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437852_USA_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000973913737663019,
"Nucleotide GTR":0.0009638907553691835,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "Y", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "TAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437852_USA_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009766655242779223,
"Nucleotide GTR":0.0009666142221160623,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACA", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437875_Athens_20200314_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009739946106593363,
"Nucleotide GTR":0.0009639707960652897,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "Y", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "TAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437875_Athens_20200314_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437889_Athens_20200317_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0003911122581900134,
"Nucleotide GTR":0.000387087146840679,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "V", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GTT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437889_Athens_20200317_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009745262946411859,
"Nucleotide GTR":0.0009644970082492478,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "R", "K", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "AGA", "AAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437910_Athens_20200401_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009739875282120933,
"Nucleotide GTR":0.0009639637865066818,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "L", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TTA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437910_Athens_20200401_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437925_Ischgl_20200309_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0009742886981481687,
"Nucleotide GTR":0.0009642618569681127,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "Y", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "TAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437925_Ischgl_20200309_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "TPAS", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "NCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437978_Ischgl_20200311_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009743322665862144,
"Nucleotide GTR":0.0009643049770238565,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "M", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ATG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437978_Ischgl_20200311_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTY", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009726301079714651,
"Nucleotide GTR":0.000962620336085465,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "S", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AGT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "GV", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GKA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438085_Vienna_20200322_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0003908924015973246,
"Nucleotide GTR":0.0003868695528906146,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTT", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438085_Vienna_20200322_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009732520945451379,
"Nucleotide GTR":0.0009632359215168455,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAG", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009815190013738085,
"Nucleotide GTR":0.0009714177499062624,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "P", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CCT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438260_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009734663446704034,
"Nucleotide GTR":0.0009634479666981517,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "R", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CGT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438260_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438282_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732619164165286,
"Nucleotide GTR":0.0009632456423069613,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAC", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438282_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438293_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009726301014862134,
"Nucleotide GTR":0.0009626203296669568,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCG", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438293_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438362_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009734440731901653,
"Nucleotide GTR":0.0009634259244236878,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "D", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAC", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438362_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438393_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAY", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438393_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438396_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739137376773311,
"Nucleotide GTR":0.0009638907553833469,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "C", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "TGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438396_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438460_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739137376449774,
"Nucleotide GTR":0.0009638907553513277,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "S", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "TCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438460_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438461_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "LF", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTW", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438461_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438473_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "ED", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAM", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438473_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438488_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "RW", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "YGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438488_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438494_England_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTR", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438494_England_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438501_England_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009739137376773311,
"Nucleotide GTR":0.0009638907553833469,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "L", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TTA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438501_England_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438502_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009742886908927833,
"Nucleotide GTR":0.000964261849787394,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "N", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAT", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438502_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438515_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732745184289448,
"Nucleotide GTR":0.000963258114626425,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCC", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438515_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438520_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009736971089424406,
"Nucleotide GTR":0.0009636763560717542,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "A", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "GCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438520_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438534_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009746803390348482,
"Nucleotide GTR":0.0009646494673030885,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAT", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438534_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438587_England_20200422_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009742558283825109,
"Nucleotide GTR":0.0009642293254799278,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "I", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ATT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438587_England_20200422_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438629_England_20200421_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009732745184383745,
"Nucleotide GTR":0.000963258114635758,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTC", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438629_England_20200421_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438728_England_20200426_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0003911122567005153,
"Nucleotide GTR":0.0003870871453665102,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "F", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "TTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438728_England_20200426_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438738_England_20200426_null_146":{
"Global MG94xREV":0.0003970291488078845,
"Nucleotide GTR":0.0003929431440882188,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438738_England_20200426_null_146",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438840_Scotland_20200404_null_70":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438840_Scotland_20200404_null_70",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438855_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "SF", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TYT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438855_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438880_Scotland_20200411_null_14945":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438880_Scotland_20200411_null_14945",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438885_Scotland_20200318_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0009744267723615462,
"Nucleotide GTR":0.0009643985101979442,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCA", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438885_Scotland_20200318_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438895_Scotland_20200413_null_732":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438895_Scotland_20200413_null_732",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438911_Scotland_20200319_null_67":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438911_Scotland_20200319_null_67",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438922_Scotland_20200319_null_103":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438922_Scotland_20200319_null_103",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438931_Scotland_20200415_null_37":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "L", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "TTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438931_Scotland_20200415_null_37",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":7596.114803121407,
"Equilibrium frequencies": [
[0.04183339792277058],
[0.0115459869721447],
[0.01141273874777428],
[0.04677831881230302],
[0.01930174621592741],
[0.005327267719446621],
[0.005265787573481217],
[0.02158331101359929],
[0.01592172013246768],
[0.004394383013375615],
[0.004343668965702732],
[0.01780374861663903],
[0.03561197594109806],
[0.009828879093860057],
[0.009715447414960016],
[0.03982149303731293],
[0.01970698303716235],
[0.005439112783221973],
[0.005376341872232441],
[0.02203644889288912],
[0.009092715489358985],
[0.002509582768661793],
[0.002480620545801025],
[0.0101675208123431],
[0.007500444241996354],
[0.002070117078781445],
[0.002046226576769622],
[0.008387034986584973],
[0.01677617981419218],
[0.004630213255318358],
[0.004576777572754709],
[0.01875920978854186],
[0.04903774876004817],
[0.0135343824896097],
[0.01337818688337513],
[0.05483426064432941],
[0.02262580207599288],
[0.006244704685142075],
[0.006172636717889013],
[0.02530028722143941],
[0.01866368381371115],
[0.005151162967042699],
[0.00509171518484296],
[0.0208698263827759],
[0.04174490277534666],
[0.01152156237672596],
[0.01138859602812574],
[0.04667936308732987],
[0.01026790160782503],
[0.04160018334534619],
[0.01716513551266702],
[0.004737564741220186],
[0.004682890152453502],
[0.0191941420333647],
[0.003907945896465628],
[0.003862845650562355],
[0.01583295906076565],
[0.03166990105788285],
[0.008740869333599894],
[0.008639993997349651],
[0.0354134448072972]
],
"Log Likelihood":-3406.729403790144,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6075871257936039, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":390
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":8305.720619532827,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3313177545487949],
[0.1444099513657234],
[0.195458582749153],
[0.3288137113363288]
],
"Log Likelihood":-3480.553250267657,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2981158273663307,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.09979525633187949,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.05897392733163488,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.643452781836937,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.5874619559272238
},
"display order":0,
"estimated parameters":671
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-12/sequences.endornase.compressed.fas",
"number of sequences":333,
"number of sites":346,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2,epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1,epi_isl_429175_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1,epi_isl_438515_England_20200401_null_1,epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1,epi_isl_437819_USA_20200401_null_1,epi_isl_438629_England_20200421_null_2,epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1,epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1,epi_isl_438501_England_20200328_null_3,epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1,epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4,epi_isl_438396_England_20200330_null_1,epi_isl_423354_England_20200329_null_2,epi_isl_433000_England_20200402_null_1,epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2,epi_isl_425585_England_20200324_null_1,epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4,epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1,epi_isl_432532_England_20200402_null_1,epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1,epi_isl_423927_England_20200318_null_1,epi_isl_438880_Scotland_20200411_null_14945,epi_isl_436679_California_20200404_null_1,epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1,epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4,epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1,epi_isl_433931_England_20200412_null_1,epi_isl_438502_England_20200330_null_2,(epi_isl_423752_England_20200323_null_1,epi_isl_437694_MAKKAH_20200405_null_1)Node146,epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2,epi_isl_432187_Wales_20200404_null_3,(epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1,epi_isl_432558_England_20200402_null_2)Node155,epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3,epi_isl_434341_Washington_20200330_null_33,epi_isl_437610_Thailand_20200312_null_4,epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3,epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1,epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_24,epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_432485_England_20200324_null_2,epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1,(epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1,epi_isl_438931_Scotland_20200415_null_37)Node181,epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1,epi_isl_420725_England_20200328_null_1,epi_isl_434000_England_20200413_null_3,epi_isl_438520_England_20200401_null_2,epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1,epi_isl_417240_England_20200303_null_4,epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1,epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3,epi_isl_433733_England_20200405_null_2,epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5,(epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1,epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7)Node206,epi_isl_437910_Athens_20200401_null_5,epi_isl_433819_England_20200327_null_3,epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1,epi_isl_436741_New_York_20200318_null_16,epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1,epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2,epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2,epi_isl_433804_England_20200406_null_5,epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1,epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3,epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1,epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10,epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2,epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1,epi_isl_428704_Madrid_20200311_null_3,epi_isl_433495_England_20200416_null_12,epi_isl_432757_England_20200402_null_2,epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1,((epi_isl_421669_India_20200312_null_1,epi_isl_433699_England_20200331_null_1)Node246,epi_isl_437043_California_20200401_null_1)Node245,epi_isl_438885_Scotland_20200318_null_16,epi_isl_417236_England_20200301_null_1,epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_438362_England_20200328_null_1,epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1,epi_isl_438473_England_20200331_null_1,epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1,epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1,epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1,epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1,epi_isl_434866_Texas_20200323_null_7,epi_isl_437289_Bavaria_20200403_null_13,epi_isl_433551_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2,epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1,epi_isl_433015_England_20200403_null_4,epi_isl_432745_England_20200401_null_1,(epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1,epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1)Node285,epi_isl_423412_England_20200329_null_1,epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2,epi_isl_437669_Unknown_20200330_null_5,epi_isl_438587_England_20200422_null_3,epi_isl_423548_England_20200331_null_3,(epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_435637_California_20200311_null_3)Node315,epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1,(epi_isl_421775_England_20200325_null_1,epi_isl_421895_England_20200327_null_1,epi_isl_425336_England_20200328_null_1,epi_isl_423453_England_20200329_null_1,epi_isl_423446_England_20200329_null_1,epi_isl_438840_Scotland_20200404_null_70)Node303,(epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2,epi_isl_438738_England_20200426_null_146)Node295,(epi_isl_433719_England_20200404_null_1,epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1,epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1)Node298,epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1,epi_isl_438282_England_20200331_null_1,epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2,epi_isl_418677_England_20200315_null_1,epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1,epi_isl_434231_Washington_20200406_null_4,epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3,epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1,epi_isl_437978_Ischgl_20200311_null_4,(epi_isl_423227_England_20200324_null_1,epi_isl_438728_England_20200426_null_5)Node531,(epi_isl_423373_England_20200328_null_1,epi_isl_437889_Athens_20200317_null_7)Node528,(epi_isl_423481_England_20200331_null_1,epi_isl_436355_Comunitat_Valenciana_20200326_null_6)Node525,(epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1,epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_6)Node522,(epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1,epi_isl_437437_Alaska_20200412_null_33)Node519,(epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1,epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1)Node516,(epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1,epi_isl_433832_England_20200407_null_1)Node513,(epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_2,epi_isl_438855_Scotland_20200407_null_1)Node499,(epi_isl_420726_England_20200327_null_1,epi_isl_429207_Switzerland_20200403_null_4)Node496,(epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1,epi_isl_438085_Vienna_20200322_null_7)Node493,epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1,epi_isl_438488_England_20200330_null_1,epi_isl_414010_England_20200226_null_1,epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1,epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1,epi_isl_423740_England_20200323_null_1,epi_isl_423780_England_20200324_null_1,epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1,epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1,epi_isl_423328_England_20200327_null_2,epi_isl_423579_England_20200331_null_1,epi_isl_424138_England_20200320_null_1,epi_isl_425023_England_20200324_null_1,epi_isl_423068_England_20200323_null_1,epi_isl_423130_England_20200324_null_1,(epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2,epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1)Node39,epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1,epi_isl_438393_England_20200329_null_1,epi_isl_438461_England_20200329_null_1,epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1,epi_isl_436118_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_421963_England_20200401_null_1,epi_isl_421956_England_20200331_null_1,epi_isl_421953_England_20200331_null_1,epi_isl_421948_England_20200331_null_1,epi_isl_421947_England_20200331_null_1,epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1,epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1,epi_isl_420694_England_20200328_null_1,epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1,epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1,epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1,epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1,epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1,epi_isl_423648_England_20200323_null_1,epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2,epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_423052_England_20200319_null_5,epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1,epi_isl_418715_England_20200317_null_1,epi_isl_417312_England_20200308_null_1,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,epi_isl_422002_England_20200330_null_2,epi_isl_432594_England_20200412_null_1,epi_isl_424007_England_20200320_null_1,((epi_isl_424062_England_20200311_null_1,epi_isl_438922_Scotland_20200319_null_103,epi_isl_423639_England_20200321_null_1,epi_isl_417288_England_20200305_null_1,epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1)Node434,epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1)Node433,(epi_isl_436997_Unknown_20200324_null_4,epi_isl_438534_England_20200331_null_1)Node444,epi_isl_437467_Makkah_20200323_null_6,epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24,epi_isl_429525_Unknown_20200312_null_4,epi_isl_421847_England_20200326_null_1,epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1,(epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1,epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1)Node458,epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1,epi_isl_423825_England_20200322_null_1,epi_isl_423933_England_20200319_null_1,epi_isl_436415_Delhi_20200331_null_1,epi_isl_436426_Delhi_20220405_null_1,epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2,epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2,epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_430709_Victoria_20200407_null_3,epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2,epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1,epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1,(epi_isl_425240_England_20200331_null_4,epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1)Node510,((epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1,epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1)Node505,epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1)Node504,epi_isl_423060_England_20200324_null_1,epi_isl_429008_California_20200328_null_1,(epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1,epi_isl_432351_Wales_20200331_null_2)Node54,epi_isl_433408_Scotland_20200407_null_2,epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2,epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1,epi_isl_421964_England_20200401_null_1,epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1,epi_isl_433226_Scotland_20200401_null_4,(epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2,epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1)Node549,(epi_isl_421954_England_20200330_null_1,epi_isl_436439_Bihar_20200409_null_1)Node545,epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1,((epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_2,epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1)Node557,epi_isl_423772_England_20200322_null_1)Node556,epi_isl_432269_Wales_20200407_null_3,epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2,epi_isl_432350_Wales_20200401_null_2,((epi_isl_438911_Scotland_20200319_null_67,epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1)Node564,epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1)Node563,epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1,epi_isl_425485_England_20200317_null_1,(epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1,epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1,epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1,epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2)Node575,epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1,epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1,(epi_isl_423324_England_20200326_null_1,epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6)Node586,epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1,epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1,epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1,(epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1,epi_isl_425404_England_20200319_null_1,epi_isl_437436_Novi_Pazar_20200404_null_11)Node593,epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1,epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1,epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1,epi_isl_437875_Athens_20200314_null_6,epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3,epi_isl_438494_England_20200329_null_4,(epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1,epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2,epi_isl_438895_Scotland_20200413_null_732,epi_isl_420697_England_20200329_null_1,epi_isl_420696_England_20200329_null_1,epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_437571_California_20200425_null_1,epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5,epi_isl_438293_England_20200329_null_1)Node605,(epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1)Node624,epi_isl_423913_England_20200318_null_1,epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_432908_England_20200327_null_1,epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1,epi_isl_437852_USA_20200405_null_5,epi_isl_432760_England_20200322_null_1,epi_isl_437343_Kinshasa_20200415_null_2,epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1,epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6,epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1,epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1,epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1,epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4,epi_isl_437925_Ischgl_20200309_null_15,epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3,epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1,epi_isl_438260_England_20200329_null_1,epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1,epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1,epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1,epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1,(epi_isl_434279_Washington_20200327_null_3,epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1)Node104,epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4,epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2,epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_8,epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1,epi_isl_438460_England_20200330_null_1,epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1,epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2,epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node104":"test",
"Node146":"test",
"Node155":"test",
"Node181":"test",
"Node206":"test",
"Node245":"test",
"Node246":"test",
"Node285":"test",
"Node295":"test",
"Node298":"test",
"Node303":"test",
"Node315":"test",
"Node39":"test",
"Node433":"test",
"Node434":"test",
"Node444":"test",
"Node458":"test",
"Node493":"test",
"Node496":"test",
"Node499":"test",
"Node504":"test",
"Node505":"test",
"Node510":"test",
"Node513":"test",
"Node516":"test",
"Node519":"test",
"Node522":"test",
"Node525":"test",
"Node528":"test",
"Node531":"test",
"Node54":"test",
"Node545":"test",
"Node549":"test",
"Node556":"test",
"Node557":"test",
"Node563":"test",
"Node564":"test",
"Node575":"test",
"Node586":"test",
"Node593":"test",
"Node605":"test",
"Node624":"test",
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2":"test",
"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2":"test",
"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_417236_England_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417240_England_20200303_null_4":"test",
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_417312_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418677_England_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418715_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420696_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420697_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420725_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420726_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421669_India_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421895_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421947_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421948_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421953_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421954_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_421956_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421964_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422002_England_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423052_England_20200319_null_5":"test",
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423068_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423130_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423227_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423324_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423328_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_423354_England_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_423373_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423446_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423453_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423481_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423548_England_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423639_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423648_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423740_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423752_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423772_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423780_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423927_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423933_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424007_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424062_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_424138_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24":"test",
"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_425023_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_425240_England_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_425336_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_425404_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_425485_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_428704_Madrid_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_24":"test",
"epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_429008_California_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429175_Bangkok_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429207_Switzerland_20200403_null_4":"test",
"epi_isl_429525_Unknown_20200312_null_4":"test",
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6":"test",
"epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3":"test",
"epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4":"test",
"epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430709_Victoria_20200407_null_3":"test",
"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3":"test",
"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_432187_Wales_20200404_null_3":"test",
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432269_Wales_20200407_null_3":"test",
"epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432350_Wales_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_432351_Wales_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_432485_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_432532_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_432558_England_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_432594_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_432745_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432757_England_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_432760_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_432908_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_433000_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_433015_England_20200403_null_4":"test",
"epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_433226_Scotland_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_433408_Scotland_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_433495_England_20200416_null_12":"test",
"epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_433551_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_433699_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_433719_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_433733_England_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_433804_England_20200406_null_5":"test",
"epi_isl_433819_England_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_433832_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_433931_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_434000_England_20200413_null_3":"test",
"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2":"test",
"epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_434231_Washington_20200406_null_4":"test",
"epi_isl_434279_Washington_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_434341_Washington_20200330_null_33":"test",
"epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_8":"test",
"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4":"test",
"epi_isl_434866_Texas_20200323_null_7":"test",
"epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10":"test",
"epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2":"test",
"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2":"test",
"epi_isl_435637_California_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_436118_Victoria_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_436355_Comunitat_Valenciana_20200326_null_6":"test",
"epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6":"test",
"epi_isl_436415_Delhi_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_436426_Delhi_20220405_null_1":"test",
"epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_436439_Bihar_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_436679_California_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_436741_New_York_20200318_null_16":"test",
"epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_436997_Unknown_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_437043_California_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_437289_Bavaria_20200403_null_13":"test",
"epi_isl_437343_Kinshasa_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4":"test",
"epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_437436_Novi_Pazar_20200404_null_11":"test",
"epi_isl_437437_Alaska_20200412_null_33":"test",
"epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_437467_Makkah_20200323_null_6":"test",
"epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_6":"test",
"epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_437571_California_20200425_null_1":"test",
"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_437610_Thailand_20200312_null_4":"test",
"epi_isl_437669_Unknown_20200330_null_5":"test",
"epi_isl_437694_MAKKAH_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_437819_USA_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_437852_USA_20200405_null_5":"test",
"epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7":"test",
"epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_437875_Athens_20200314_null_6":"test",
"epi_isl_437889_Athens_20200317_null_7":"test",
"epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_437910_Athens_20200401_null_5":"test",
"epi_isl_437925_Ischgl_20200309_null_15":"test",
"epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_437978_Ischgl_20200311_null_4":"test",
"epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_438085_Vienna_20200322_null_7":"test",
"epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2":"test",
"epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_438260_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_438282_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_438293_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_438362_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_438393_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_438396_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_438460_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_438461_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_438473_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_438488_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_438494_England_20200329_null_4":"test",
"epi_isl_438501_England_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_438502_England_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_438515_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_438520_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_438534_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_438587_England_20200422_null_3":"test",
"epi_isl_438629_England_20200421_null_2":"test",
"epi_isl_438728_England_20200426_null_5":"test",
"epi_isl_438738_England_20200426_null_146":"test",
"epi_isl_438840_Scotland_20200404_null_70":"test",
"epi_isl_438855_Scotland_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_438880_Scotland_20200411_null_14945":"test",
"epi_isl_438885_Scotland_20200318_null_16":"test",
"epi_isl_438895_Scotland_20200413_null_732":"test",
"epi_isl_438911_Scotland_20200319_null_67":"test",
"epi_isl_438922_Scotland_20200319_null_103":"test",
"epi_isl_438931_Scotland_20200415_null_37":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":12
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":12
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":25
}
}
}